153 research outputs found

    "El propone, ella dispone"?

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    Der Titel der vorliegenden Arbeit nimmt Bezug auf ein im kolumbianischen Alltagsdiskurs vielzitiertes Sprichwort. „El propone, ella dispone“ bedeutet ĂŒbersetzt „Er beantragt, sie entscheidet“ und beinhaltet traditionelle und in der Gesellschaft festgeschriebene Rollenanforderungen an die Geschlechter. Ziel der 2009 durchgefĂŒhrten Feldforschung war die Dekodierung dieser Geschlechterrollenideale innerhalb der SexualitĂ€t unter Studierenden der Universidad Nacional de Colombia in BogotĂĄ. Die Konstruktionsprozesse von SexualitĂ€t und Gender stehen in Wechselwirkung mit der stĂ€ndigen Transformation der Gesellschaft, der ein sehr starker machismo zugeschrieben wird. Die Frage nach der Sichtbarkeit traditioneller Vorstellungen von Geschlechterrollenbildern in der sexuellen Praxis und dem Umgang junger MĂ€nner und Frauen mit universitĂ€rem Bildungsstand mit diesen Bildern bildet den Fokus dieser anthropologischen Forschungsarbeit. Die theoretischen Konzepte machismo und marianismo, idealisierte Vorstellungen von MĂ€nnlichkeit und Weiblichkeit, stehen dabei im Zentrum. Diesen liegt das Konzept des binĂ€ren Oppositionspaares Aktiv/Passiv zugrunde, welches sowohl in psychoanalytischen als auch anthropologischen AnsĂ€tzen ErklĂ€rungen findet. 18 qualitative Interviews mit Studierenden der Universidad Nacional wurden in Folge der Feldforschung und teilnehmenden Beobachtung am UniversitĂ€tscampus ausgewertet und auf Vorstellungen jener Rollenideale im Lichte der Transformationen der kolumbianischen Gesellschaft analysiert. Die Studierenden sehen sich selber nicht als reprĂ€sentativ fĂŒr die kolumbianische Gesellschaft, sondern als heterogene Gruppe mit einer kritischen Haltung gegenĂŒber der kolumbianischen Gesellschaft. Es wird daher große Anstrengung an den Tag gelegt, herrschende Vorstellungen von MĂ€nnlichkeit und Weiblichkeit sowie festgeschriebene Bilder einer idealen SexualitĂ€t zu dekonstruieren. Durch das akademische Umfeld und durch den Zugang zu alternativen Ideen besteht ein großes Bewusstsein gegenĂŒber den geforderten Rollen. Dies reicht jedoch oft noch nicht aus, um unsichtbar wirkende soziale Kontrollinstanzen zu bezwingen und es werden Versuche unternommen, trotz allem jenen gesellschaftlich erwarteten Rollenbildern zu entsprechen

    The Improvement of Resilience by Expressive Writing

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    Pennebakers Schreibparadigma unterstĂŒtzt die Resilienz durch Überwindung von Traumata. Es stellt sich die Frage, ob das Schreiben von Romanen, die sich mit fĂŒr den bzw. die Schreibende lebensgeschichtlich relevanten Themen beschĂ€ftigen, auch die Resilienz fördern kann. Drei Texte der in Auschwitz gestorbenen jĂŒdischen Autorin IrĂšne NĂ©mirovsky wurden nach Pennebakers Methode ausgewertet und auch der biographischen Methode unterzogen. Eine Zunahme an emotional positiv bewerteten Wörtern, die Pennebaker als Indiz fĂŒr die Wirksamkeit des Expressiven Schreibens sieht, konnte erhoben werden.Pennebaker's basic writing paradigm supports resilience by overcoming of traumata. The question is whether writing novels, that deal with themes, which are autobiographically relevant for the writer, can also support resilience. Three essays written by jewish author IrĂšne NĂ©mirovsky, who died in Auschwitz, were evaluated by Pennebaker's method and also by the biographic method. The increase of emotionally positive assessed words, which Pennebaker estimates as evidence for the effectiveness of expressive writing, were found

    "Wer nicht sehen kann, muß hören"

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    Die vorliegende Arbeit unternimmt den Versuch, Elfriede Jelineks erste vier Hörspiele "Wien West", "wenn die sonne sinkt ist fĂŒr manche auch noch bĂŒroschluß", "Untergang eines Tauchers" und "FĂŒr den Funk dramatisierte Ballade von drei wichtigen MĂ€nnern sowie dem Personenkreis um sie herum" gattungstheoretisch zu kontextualisieren und in Hinblick auf ihre Nur-Hörbarkeit zu untersuchen. Elfriede Jelineks original fĂŒr den Rundfunk konzipierte Hörspiele entstanden zwischen 1971 und 1977. In dieser Zeit war das Neue Hörspiel gerade populĂ€r geworden und konnte seine grĂ¶ĂŸten Erfolge verzeichnen. Dem Neuen Hörspiel standen aufgrund der damals aufgekommenen Stereofonie neue technische Möglichkeiten zu VerfĂŒgung. Es konnten stereofone RĂ€ume geschaffen werden, der Ton strömte nicht mehr punktuell aus dem Lautsprecher. Man wollte sich von den traditionellen Formen des Hörspiels distanzieren und die HörerInnen zu einem aufmerksamen Zuhören anhalten. Es wurde versucht, das emotionale Einlassen und eine damit einhergehende passive Haltung des Publikums zu verhindern. Ausdrucksmöglichkeiten wurden wieder in frĂŒhen Traditionen, in denen des Dadaismus, der Musique concrĂšte, der Pop-Art sowie in den Radiotheorien Bertolt Brechts oder Walter Benjamins gefunden. Die Technik der Collage ermöglichte es, Klangmaterial miteinander zu verbinden und autonome SchallrĂ€ume herzustellen. Außerdem wollte man durch die Montage heterogenen Sprachmaterials, Denk- und Sprechweisen entlarven. Auch das O-Ton-Hörspiel wollte das Manipulierende in der Sprache erkennbar machen, aber auch der breiten Masse im Medium Hörspiel eine Stimme geben. Zwar strebt Elfriede Jelinek in Wien West eine Parodie auf das Neue Hörspiel an und distanziert sich somit davon, dennoch setzt das erste Hörspiel der Autorin die Ausdrucksmöglichkeiten der neuen Strömung effizient ein. Jelineks Original-Hörspiele fordern die Hörenden zu einer aufmerksamen und kritischen Haltung auf. Die in den Hörspielen auftretenden Figuren sind keine Individuen, vielmehr sind sie reine Sprachkörper, aus denen die von Medien vorgefertigte Sprache spricht. Der V-Effekt entsteht durch chorisches Sprechen, den stereotypen Einsatz von Stimmen, den Stimmentausch oder die Technik der Collage. Das Medium Hörspiel bietet nun den idealen Raum fĂŒr Jelineks Sprachfiguren. GerĂ€usche, Stimme und Musik stehen im Fokus der Aufmerksamkeit. Jelinek lĂ€sst ihre Figuren das auch aussprechen. So weisen diese ironisch auf die grĂ¶ĂŸere Aufmerksamkeit im Hörspiel hin, die im Gegensatz zum Fernsehen gefordert wird. Durch das Nur-Hörbare entsteht eine grĂ¶ĂŸere KĂŒnstlichkeit als im Theater oder in geschriebenen Texten, die zu einer stĂ€ndigen Wachsamkeit des Publikums auffordert und die HörerInnen dazu anhĂ€lt, die eigenen Denk- und Sprachstrukturen zu reflektieren

    A high-throughput LC-MS/MS method for the measurement of the bile acid/salt content in microbiome-derived sample sets

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    Due to the physicochemical properties of bile acids/salts (i.e., hydrophobic and ionizable), the application of reverse-phase liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS)-based methods are ideally suited for the measurement of these compounds in a host of microbiologically-relevant matrices. Here, we provide a detailed bioanalytical protocol that contains several modifications of a method previously described by Wegner et al. [1]. Briefly, this modified method exhibits the following advantages for the measurement of cholic acid (CA), taurocholic acid (TCA), and deoxycholic acid (DCA) in microbiome-relevant sample matrices: i) fecal sample processing has been streamlined by the elimination of lyophilization and manual homogenization steps; ii) the Sciex 6500 QTRAP hybrid triple-quadrupole/linear ion trap mass spectrometer has sufficient sensitivity to perform the measurement of bile acids/salts in negative ion mode – ammonium adducts of bile acids/salts are not required for detection; and, iii) assay throughput has been boosted by more than 5-fold by shortening the chromatographic duty cycle of a single sample injection from 45 min to 8.4 min. Recently, the method was used to perform 508 sequential injections (72 calibration standards, 52 blank-internal standard sample, and 368 MiniBioReactor Array (MBRA)-derived samples) from four separate batches over a 4-day time period

    Comprehensive analysis of the mouse renal cortex using two-dimensional HPLC – tandem mass spectrometry

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    <p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Proteomic methodologies increasingly have been applied to the kidney to map the renal cortical proteome and to identify global changes in renal proteins induced by diseases such as diabetes. While progress has been made in establishing a renal cortical proteome using 1-D or 2-DE and mass spectrometry, the number of proteins definitively identified by mass spectrometry has remained surprisingly small. Low coverage of the renal cortical proteome as well as our interest in diabetes-induced changes in proteins found in the renal cortex prompted us to perform an in-depth proteomic analysis of mouse renal cortical tissue.</p> <p>Results</p> <p>We report a large scale analysis of mouse renal cortical proteome using SCX prefractionation strategy combined with HPLC – tandem mass spectrometry. High-confidence identification of ~2,000 proteins, including cytoplasmic, nuclear, plasma membrane, extracellular and unknown/unclassified proteins, was obtained by separating tryptic peptides of renal cortical proteins into 60 fractions by SCX prior to LC-MS/MS. The identified proteins represented the renal cortical proteome with no discernible bias due to protein physicochemical properties, subcellular distribution, biological processes, or molecular function. The highest ranked molecular functions were characteristic of tubular epithelium, and included binding, catalytic activity, transporter activity, structural molecule activity, and carrier activity. Comparison of this renal cortical proteome with published human urinary proteomes demonstrated enrichment of renal extracellular, plasma membrane, and lysosomal proteins in the urine, with a lack of intracellular proteins. Comparison of the most abundant proteins based on normalized spectral abundance factor (NSAF) in this dataset versus a published glomerular proteome indicated enrichment of mitochondrial proteins in the former and cytoskeletal proteins in the latter.</p> <p>Conclusion</p> <p>A whole tissue extract of the mouse kidney cortex was analyzed by an unbiased proteomic approach, yielding a dataset of ~2,000 unique proteins identified with strict criteria to ensure a high level of confidence in protein identification. As a result of extracting all proteins from the renal cortex, we identified an exceptionally wide range of renal proteins in terms of pI, MW, hydrophobicity, abundance, and subcellular location. Many of these proteins, such as low-abundance proteins, membrane proteins and proteins with extreme values in pI or MW are traditionally under-represented in 2-DE-based proteomic analysis.</p

    Regulation of MMP-9 by p53 in first trimester cytotrophoblastic cells

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    BACKGROUND: The matrix metalloproteinase (MMP) family is known to play a key role in tissue remodelling during embryonic development and in pathological conditions, such as cardiovascular disease, arthritis and cancer metastasis. It has been shown previously that p53 regulates positively or negatively the expression of different MMPs. Because of p53 overexpression in trophoblastic cells, and its potential role in regulating MMP-2 and MMP-9 expression in different cell lines, we hypothesized that the expression of MMP-9 could also be regulated by p53 in first trimester cytotrophoblasts (CTB). METHODS and RESULTS: Transfection experiments in CTB demonstrated that wild-type p53 down-regulates the -670 (P < 0.001) but not the -531 and -90 human MMP-9 promoter/CAT reporter plasmid activity, whereas p53 mutants partially lost this repressive activity. However, endogenous p53 is not able to regulate MMP-9 expression in CTB. The presence of high molecular weight complexes of p53 in CTB suggests a potential mechanism of inactivation of p53 transcriptional activity towards MMPs in these cells. CONCLUSIONS: Although p53 is mutated in trophoblast, it is functionally incompetent towards MMPs in these cells

    Altered Retinoic Acid Metabolism in Diabetic Mouse Kidney Identified by 18O Isotopic Labeling and 2D Mass Spectrometry

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    Numerous metabolic pathways have been implicated in diabetes-induced renal injury, yet few studies have utilized unbiased systems biology approaches for mapping the interconnectivity of diabetes-dysregulated proteins that are involved. We utilized a global, quantitative, differential proteomic approach to identify a novel retinoic acid hub in renal cortical protein networks dysregulated by type 2 diabetes.Total proteins were extracted from renal cortex of control and db/db mice at 20 weeks of age (after 12 weeks of hyperglycemia in the diabetic mice). Following trypsinization, (18)O- and (16)O-labeled control and diabetic peptides, respectively, were pooled and separated by two dimensional liquid chromatography (strong cation exchange creating 60 fractions further separated by nano-HPLC), followed by peptide identification and quantification using mass spectrometry. Proteomic analysis identified 53 proteins with fold change >or=1.5 and p<or=0.05 after Benjamini-Hochberg adjustment (out of 1,806 proteins identified), including alcohol dehydrogenase (ADH) and retinaldehyde dehydrogenase (RALDH1/ALDH1A1). Ingenuity Pathway Analysis identified altered retinoic acid as a key signaling hub that was altered in the diabetic renal cortical proteome. Western blotting and real-time PCR confirmed diabetes-induced upregulation of RALDH1, which was localized by immunofluorescence predominantly to the proximal tubule in the diabetic renal cortex, while PCR confirmed the downregulation of ADH identified with mass spectrometry. Despite increased renal cortical tissue levels of retinol and RALDH1 in db/db versus control mice, all-trans-retinoic acid was significantly decreased in association with a significant decrease in PPARbeta/delta mRNA.Our results indicate that retinoic acid metabolism is significantly dysregulated in diabetic kidneys, and suggest that a shift in all-trans-retinoic acid metabolism is a novel feature in type 2 diabetic renal disease. Our observations provide novel insights into potential links between altered lipid metabolism and other gene networks controlled by retinoic acid in the diabetic kidney, and demonstrate the utility of using systems biology to gain new insights into diabetic nephropathy

    Importance-driven rendering in interventional imaging

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    Zsfassung in engl. SpracheDiese Arbeit prĂ€sentiert eine kombinierte Visualisierung von dichten volumetrischen Daten, wie etwa von einer CTA (Computed Tomography Angiography), kombiniert mit co-regis-trierten Echtzeitbildern welche live wĂ€hrend eines Eingriffes aufgenommen werden.Die Hauptaufgabe dabei ist es, eine Visualisierung zu erzeugen, welche eine ausreichende rĂ€umliche Wahrnehmung der wichtigsten Teile von beiden Eingangsdaten erlaubt. Es ist auch erforderlich, dass keine wichtigen Teile durch weniger wichtige Teile verdeckt werden.Um das zu erreichen, wird ein neuer Ansatz fĂŒr die Definition der Wichtigkeit im volumetrischen Datensatz vorgestellt. Es wird gezeigt wie diese Wichtigkeit verwendet wird um die wichtigen Teile hervorzuheben.Weiters wird die Position des Echtzeitbildes verwendet um daraus einen kontextabhĂ€ngigen Ausschnitt zu erzeugen. Dieser Ausschnitt wird verwendet um die Dichte der Visualisierung zu beeinflussen damit das Echtzeitbild nicht von weniger wichtigen Teilen verdeckt wird.In this thesis a combined visualization of dense clinical data like 3D CTA (Computed Tomography Angiography) combined with co-registered real-time images of medical intervention applications is presented. The main challenge here is to provide a merged visualization that allows sufficient spatial perception of the important parts, as derived from the pre-operative data, while not occluding the information in the real-time image embedded within the volume.This work presents a new approach of importance definition for volumetric data and how this importance can be used to create a feature-emphasized visualization. Furthermore the viewpoint and the position of the intervention image is used to generate a contextual cutaway which influences the density of the visualization to avoid an occlusion of the real-time image by less important parts of the volumetric data.9

    Information-based feature enhancement in scientific visualization

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    Zsfassung in dt. SpracheWissenschaftliche Visualisierung ist ein Forschungsgebiet, das Einblick in gemessene oder simulierte volumetrischen Daten gibt. Die Visualisierung ermöglicht eine schnellere und intuitivere Erforschung der Daten.Durch die rasante Entwicklung der Hardware fĂŒr die Messung und Simulation von wissenschaftlichen Daten nimmt die GrĂ¶ĂŸe und KomplexitĂ€t der Daten stĂ€ndig zu. Dies hat den Vorteil, dass es möglich ist einen genaueren Einblick in die gemessenen oder simulierten PhĂ€nomene zu erhalten. Jedoch wird es zunehmend schwieriger, eine geeignete Darstellung fĂŒr diese Daten zu finden.Da in den meisten FĂ€llen nur bestimmte Teile der Daten erforderlich sind, um eine Entscheidung zu treffen, können Teile der Daten verworfen werden, welche fĂŒr einen bestimmten Anwendungsfall nicht erforderlich sind. Diese Klassifizierung in wichtige und unwichtige Teile der Daten erfolgt durch eine Transfer-Funktion. Die Transfer-Funktion beschreibt eine Abbildung von bestimmten AusprĂ€gungen der Daten auf optische Eigenschaften.In dieser Arbeit werden drei neue AnsĂ€tze vorgestellt, die Techniken aus der Informationstheorie und Statistik verwenden, um Eigenschaften aus den Daten fĂŒr die Klassifizierung zu extrahieren. Durch die Informationstheorie und Statistik ist es möglich, Eigenschaften zu berechnen, welche verschiedene Materialien in den Daten besser unterscheidbar machen als bestehende Methoden.Ein Ansatz extrahiert statistische Eigenschaften - wie den Mittelwert und die Standardabweichung - aus einer lokalen Umgebung um jeden Punkt in den Daten auf eine adaptive Weise. Durch die statistischen Eigenschaften ist es möglich, verschiedene Materialen besser zu unterscheiden, auch wenn die Daten sehr verrauscht sind.Die beiden anderen AnsĂ€tze verwenden Methoden aus der Informationstheorie, um Merkmale aus multimodalen Daten zu extrahieren.Dadurch können Eigenschaften in den Daten hervorgehoben werden die entweder in beiden ModalitĂ€ten sehr Ă€hnlich oder sehr unterschiedlich sind. Durch die Informationstheorie hat der Wertebereich der Daten in beiden ModalitĂ€ten keinen Einfluss auf die Klassifizierung dieser Merkmale.Alle drei in dieser Arbeit vorgestellten AnsĂ€tze definieren Transfer-Funktions RĂ€ume die das Design einer Transfer-Funktion fĂŒr den Benutzer erleichtern. Dies ist möglich, da unterschiedliche Eigenschaften der Daten - wie etwa verschiedene Materialien - in diesen RĂ€umen klar unterscheidbar sind. Daher ist es fĂŒr den Benutzer einfacher, bestimmte Teile der Daten hervorzuheben, welche fĂŒr eine bestimme Aufgabe benötigt werden.In der Arbeit werden fĂŒr jede neue Technik Ergebnisse und Vergleiche zu existierenden Methoden gezeigt, um den Nutzen der Techniken hervorzuheben. Durch die Forschung in diesem Bereich wurde bewiesen, dass die Informationstheorie und Statistik in der Lage ist, aussagekrĂ€ftige Eigenschaften aus den Daten zu extrahieren.Die Einleitung bietet einen Überblick ĂŒber die wissenschaftliche Visualisierung und die Visualisierung-Pipeline. Die Klassifizierung wird im folgenden nĂ€her beschrieben. Da Informationstheorie und Statistik eine wichtige Rolle fĂŒr alle drei Methoden spielen, wird die Einleitung mit einer kurzen EinfĂŒhrung in diese Theorie abgeschlossen.Scientific visualization is a research area which gives insight into volumetric data acquired through measurement or simulation. The visualization allows a faster and more intuitive exploration of the data.Due to the rapid development in hardware for the measurement and simulation of scientific data, the size and complexity of data is constantly increasing. This has the benefit that it is possible to get a more accurate insight into the measured or simulated phenomena. A drawback of the increasing data size and complexity is the problem of generating an expressive representation of the data.Since only certain parts of the data are necessary to make a decision, it is possible to mask parts of the data along the visualization pipeline to enhance only those parts which are important in the visualization. For the masking various properties are extracted from the data which are used to classify a part as important or not. In general a transfer function is used for this classification process which has to be designed by the user.In this thesis three novel approaches are presented which use methods from information theory and statistics to enhance features from the data in the classification process that are important for a certain task.With the tools of information theory and statistics it is possible to extract properties from the data which are able to classify different materials or tissues in the data better than comparable other approaches.One approach adaptively extracts statistical properties, i.e. the mean value and the standard deviation, of the data values in the local neighborhood of each point in the data set. With these statistical properties it is possible to better distinguish between different materials in a data set even though the data is very noisy.The other two approaches in this thesis employ methods from information theory to extract features from multimodal data sets. Thus it is possible to enhance features of the data which are either very similar or very dissimilar in both modalities. Through information theory the variations in the value ranges of both modalities do not influence the classification of these features.All three approaches define novel transfer-function spaces which simplify the design process of a transfer function for the user.Different features of the data, such as different materials, can be clearly depicted in these spaces. Therefore, it is easier for a user to design a transfer function which enhances the features of importance for a certain task.For each of the new approaches results and comparisons to other existing techniques are shown to highlight the usefulness of the proposed methods. Through the described research it is shown that information theory and statistics are tools which are able to extract expressive properties from the data.In the introduction a broad overview over scientific visualization and the visualization pipeline is given. The classification process is described in more detail. Since information theory and statistics play an important role for all three approaches, a brief introduction to these concepts is given as well.9
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