Short communication: An association analysis between one missense polymorphism at the SREBF1 gene and milk yield and composition traits in goats

Sterol regulatory element binding transcription factor 1 (SREBF1) regulates the expression of genes involved in the biosynthesis of fatty acids and cholesterol. Herewith, we have sequenced the near-complete coding region and part of the 3?UTR of the goat SREBF1 gene. In doing so, we have detected a missense c.353CT polymorphism causing a proline to leucine substitution at position 118 (P118L). An association analysis with milk composition traits recorded in MurcianoGranadina goats only revealed a statistical tendency linking SREBF1 genotype and milk omega-3 fatty acid content. The lack of significant associations suggests that the P118L substitution does not involve a functional change.Le facteur de transcription de´nomme´ Sterol regulatory element binding transcription factor 1 (SREBF1) re´gule l’expression des ge`nes implique´s dans la biosynthe`se des acides gras et du choleste´rol. Dans cette e´tude, nous avons se´quence´ la quasi-totalite´ de la re´gion codante et une partie du la re´gion 3?UTR du ge`ne SREBF1 de la che`vre. Ce travail, nous a permis d’identifier un polymorphisme non-synonyme c.353CT causant la substitution d’une Proline en Leucine a` la position 118. L’e´tude d’association avec la composition du lait enregistre´e en che`vres Murciano-Granadina, a re´ve´le´ seulement une tendance statistique reliant SREBF1 ge´notype et l’acide gras ome´ga-3 du lait. L’absence d’associations significatives sugge`re que la substitution P118L n’implique pas un changement fonctionnel

Composición en ácidos grasos y contenidos de vitaminas A y E de la leche de cabra de la raza payoya en sistemas de pastoreo arbustivo-mediterráneo

Apenas hay trabajos sobre el consumo de pastos arbustivo-mediterráneos y su relación con la calidad de los productos caprinos. El objetivo del presente trabajo fue estudiar el efecto del nivel de pastoreo sobre la calidad de la leche de cabras de raza Payoya. Se seleccionaron 16 explotaciones situadas en la Sierra de Cádiz. De enero a mayo se realizó una monitorización para caracterizar el manejo alimenticio. Según el porcentaje de necesidades energéticas cubiertas por el pastoreo (NEP), las explotaciones se clasificaron en tres grupos: alto, medio y bajo pastoreo. Mensualmente se recogieron muestras de leche de tanque y fueron analizados la composición de ácidos grasos (AG) y los contenidos en vitaminas A (retinol) y E (?- y ?+?-tocoferol). Los porcentajes de AG deseables nutricionalmente (?-linolénico, total n-3 PUFA) fueron significativamente mayores, mientras que el índice n-6/n-3 fue menor en el grupo de pastoreo alto en comparación con el grupo de pastoreo bajo. Para el grupo de pastoreo medio estos valores fueron intermedios. Además, se obtuvo una correlación positiva entre el NEP y los contenidos de varios AG n-3 y el total de n-3 (r=0,33), mientras que se obtuvo una correlación negativa con el índice n-6/n-3 (r=-0,45). Los contenidos en los isómeros CLA estudiados no se vieron afectados por el nivel de pastoreo. No se encontraron diferencias significativas entre grupos para la suma de las formas ?- y ?-tocoferol, ni para el retinol. En cambio, sí ha habido diferencias significativas para el contenido de ?-tocoferol (177 ?g/100 g - alto pastoreo; 132 ?g/100 g - medio; 93 ?g/100 g - bajo). Además, existió una correlación positiva entre el NEP y el contenido de ?-tocoferol (r=0.42). En conclusión, el mayor nivel de pastoreo ha tenido un efecto positivo sobre la calidad de la leche, con mayores contenidos en algunos componentes funcionales (?-tocoferol; AG n-3)

Comparative study of neighboring tree-associated belowground microbial communities subjected to different soil management

Trabajo presentado en el Congress of Microbiology and Biotechnology (Microbiotec 19), celebrado en Coimbra del 5 al 7 de diciembre de 2019.It is well-known that different plant species, and even plant varieties, promote different assemblages of the microbial communities associated to them. Here, we investigate how microbial communities (bacteria and fungi) undergo changes within the influence of woody plants (two olive cultivars, one tolerant and another susceptible to the soilborne fungal pathogen Verticillium dahliae, plus wild Holm-oak) grown in the same soilbut with different management (agricultural versus native). By the use of rRNA and ITS Illumina amplicon sequencing we determined that the native Holm-oak trees rhizosphere microbial communities were different from its bulk soil. Moreover, the agricultural management used in the olive orchard led to belowground microbiota differences with respect to the natural conditions both in bulk soils and rhizospheres. However, agricultural management removed the differences in the microbial communities between the two olive cultivars, and these differences were minor respect to the olive bulk soil. According to our results, and at least under the agronomical conditions here examined, the composition and structure of the rhizospheric microbial communities do not seem to play a major role in olive tolerance to V. dahliae.Peer reviewe

Comparative study of neighboring Holm oak and olive trees-belowground microbial communities subjected to different soil management.

It is well-known that different plant species, and even plant varieties, promote different assemblages of the microbial communities associated with them. Here, we investigate how microbial communities (bacteria and fungi) undergo changes within the influence of woody plants (two olive cultivars, one tolerant and another susceptible to the soilborne fungal pathogen Verticillium dahliae, plus wild Holm oak) grown in the same soil but with different management (agricultural versus native). By the use of metabarcoding sequencing we determined that the native Holm oak trees rhizosphere bacterial communities were different from its bulk soil, with differences in some genera like Gp4, Gp6 and Solirubrobacter. Moreover, the agricultural management used in the olive orchard led to belowground microbiota differences with respect to the natural conditions both in bulk soils and rhizospheres. Indeed, Gemmatimonas and Fusarium were more abundant in olive orchard soils. However, agricultural management removed the differences in the microbial communities between the two olive cultivars, and these differences were minor respect to the olive bulk soil. According to our results, and at least under the agronomical conditions here examined, the composition and structure of the rhizospheric microbial communities do not seem to play a major role in olive tolerance to V. dahliae

Estudio comparativo de las comunidades microbianas rizosféricas de encina y olivo: efecto del manejo agrícola y tolerancia a verticilosis

IX Reunión del grupo Microbiología de Plantas - Sociedad Española de Microbiologia (SEM), 16 y 17 de febrero de 2021.La verticilosis del olivo, causada por el hongo Verticillium dahliae Kleb, es considerada como una de las enfermedades más relevantes que afectan a un cultivo de tanta importancia como es el del olivo. Una de las principales técnicas de los agricultores frente a esta plaga es reemplazar los árboles enfermos por árboles de una variedad tolerante a dicha enfermedad: Frantoio. Sin embargo, aunque existen estudios que ahondan en aspectos transcriptómicos, histológicos y bioquímicos subyacentes a esta tolerancia, poco se sabe sobre la influencia del microbioma de la raíz, a pesar de que es bien conocido el papel que juega la especie vegetal, e incluso la variedad, en el ensamblaje de las comunidades microbianas asociadas a la planta. Más allá de esto, el manejo agrícola es un elemento de gran influencia en el desarrollo de la enfermedad y en la salud del árbol y el equilibrio del suelo en general. A pesar de esto, existen escasos estudios que indaguen sobre el efecto del manejo agrícola en comunidades microbianas asociadas a leñosas. Así, se plantearon dos comparaciones en este estudio: (i) Analizar la posible variación de las comunidades microbianas de suelo suelto y rizosférico de olivares en comparación a sistemas sin manejo agrícola, en concreto, bosques autóctonos de encinas que se encuentren rodeando al olivar objeto de estudio (ii) Testar la hipótesis de una posible diferencia en las comunidades microbianas de dos variedades de olivar presentes en el mismo cultivar, pero con susceptibilidades a la verticilosis diferentes (Frantoio, tolerante; Picual, sensible). Estos objetivos se abordaron con el uso de técnicas de secuenciación masiva, mediante la secuenciación de regiones específicas del gen 16S rARN para identificación bacteriana y del ITS2 (espacio intergénico del operón ribosomal) para hongos. Como resultados destacables, hay que resaltar que no se pudo observar la presencia de efecto rizosférico en el suelo sometido a manejo agrícola, mientras que este estaba claramente presente en el caso del encinar. El manejo tuvo una influencia importante, con variaciones claras entre las rizosferas y los suelos sueltos de ambas especies de árboles. Sin embargo, no se encontraron diferencias entre las comunidades rizosféricas de ambas variedades de olivos. De acuerdo a nuestros resultados, y bajo las condiciones analizadas, la composición y estructura de las comunidades microbianas rizosféricas no parecen jugar un papel en la tolerancia del olivo a V. dahliae