Métiers de l’agriculture : plus de 100 étudiants à INRAE pour des rencontres grandeur nature. 21 septembre 2021 visite et ateliers autours de la plateforme CA-SYS au Domaine de Bretenières

National audienceMardi 21 septembre 2021, une centaine d’étudiants en BTS agricole ont été accueillis au sein de la plateforme CA-SYS, dispositif d'expérimentation en agroécologie de 125 ha installé au sein de l’unité expérimentale INRAE du Domaine d’Epoisses, à Bretenière. Objectif de la journée : faire se rencontrer des jeunes issus de l’enseignement agricole et des élèves-ingénieurs d’AgroSup Dijon autour des recherches pour la transition agroécologique conduites par INRAE

FOCUS: Conserver les sols : pourquoi et comment ?

National audiencePour comprendre le fonctionnement et les cycles du sol, il faut pouvoir l’étudier, donc le conserver. Plusieurs Infrastructures participent à une meilleure connaissance et gestion des sols, grâce à une approche pluridisciplinaire : les Observatoires de Recherche de l’Environnement (https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02330284), les zones Ateliers (https://www.za-inee.org/), les Infrastructures de Recherche comme AnaEE ou RARe, les plateformes d’expérimentation en milieux contrôlés ou In Natura, ou encore les groupements scientifiques. En particulier à INRAE, deux structures ont été montées avec comme activité principale la conservation de sols : le Conservatoire Européen des Échantillons de Sols (https://doi.org/10.15454/VCZ6BS Orléans, Centre Val de Loire) et le Centre de Ressource Génétique de la plateforme GenoSol (https://doi.org/10.15454/L7QN45 Dijon, Centre Bourgogne - Franche-Comté)

BRC4Env, a network of Biological Resource Centres for environmental resources

International audienc

BRC4Env, un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections dédié aux ressources environnementales

National audienc

Response of <em>Rhizoctonia solani</em> to soil faunal grazing and organic amendments – different from general microbial dynamics

National audienceIn a four-month microcosm experiment, we studied the effect of enchytraeids and earthworms on dynamics of Rhizoctonia solani in soil amended with different types of organic material. Special focus was on comparing the effects with those on total microbial densities, to see if the development of the pathogen follows the general dynamics of saprophytic bacteria and fungi in the system. We found that animal effects on the density of R. solani and on the densities of culturable fungi and bacteria were dependent not only on type of animal present, but also on the amount and type of organic material available. The highest densities of bacteria and fungi were found in soil amended with fresh organic material in presence of earthworms and the lowest densities in non-amended soil with enchytraeids. While the bacteria and fungi responded similarly to animal and organic material treatments, the response of R. solani showed an opposite pattern with the highest densities observed in the treatments with the lowest densities of fungi and bacteria. These results show that R. solani does not follow the general dynamics of soil microorganisms. As the highest densities of R. solani were found in treatments with a high grazing pressure, our findings also indicate that R. solani may get a competitive advantage from soil faunal grazing

BRC4Env, un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections au service des dispositifs expérimentaux de longue durée

National audienc

Response of Rhizoctonia solani to soil faunal grazing and organic amendments – different from general microbial dynamics

In a four-month microcosm experiment, we studied the effect of enchytraeids and earthworms on dynamics of Rhizoctonia solani in soil amended with different types of organic material. Special focus was on comparing the effects with those on total microbial densities, to see if the development of the pathogen follows the general dynamics of saprophytic bacteria and fungi in the system. We found that animal effects on the density of R. solani and on the densities of culturable fungi and bacteria were dependent not only on type of animal present, but also on the amount and type of organic material available. The highest densities of bacteria and fungi were found in soil amended with fresh organic material in presence of earthworms and the lowest densities in non-amended soil with enchytraeids. While the bacteria and fungi responded similarly to animal and organic material treatments, the response of R. solani showed an opposite pattern with the highest densities observed in the treatments with the lowest densities of fungi and bacteria. These results show that R. solani does not follow the general dynamics of soil microorganisms. As the highest densities of R. solani were found in treatments with a high grazing pressure, our findings also indicate that R. solani may get a competitive advantage from soil faunal grazing

BRC4Env, le réseau de Centres de Ressources Biologiques agro-environnementales de l’infrastructure AgroBRC-RARe pour vos recherches en écotoxicologie et agroécologie

communication oraleNational audienceLe réseau de Centres de Ressources Biologiques BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), collecte, caractérise, conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées) agro-environnementales. Ces ressources sont ouvertes à la recherche fondamentale et appliquée mobilisant des ressources prélevées dans l’environnement, pour caractériser l’évolution de sa dynamique, ou pour proposer des solutions de biocontrôle ou de biostimulation. Ces ressources biologiques sont échantillonnées à partir d’écosystèmes naturels et cultivés.BRC4Env regroupe aujourd’hui 4 centres de ressources biologiques (CRBs) labellisés par le GIS Ibisa et 2 CRBs candidats à la labellisation, répartis sur le territoire métropolitain. D’autres collections sont également candidates pour rejoindre le pilier.-Le centre de ressources génétiques de sols GenoSol (Dijon) et le Conservatoire Européen des Echantillons de Sol (Orléans) conservent des ressources génétiques de sols (ADN) et des sols entiers, respectivement. Ces CRBs intervenant notamment dans des programmes nationaux de suivi des qualités abiotiques et biotiques des sols,-La collection de parasitoïdes oophages EP-Coll (Sophia-Antipolis) maintient une collection vivante de trichogrammes pour des programmes de biocontrôle,-La collection d’arthropodes continentaux CoArCol (Montferrier-sur-Lez) comprend des spécimens d’insectes et d’acariens collectés dans le monde entier depuis un siècle, conservés secs, en solution alcoolique ou sous forme d’ADN,-La collection d’écailles et de tissus de poissons Colisa, répartie sur plusieurs sites (Rennes, Thonon les Bains, Saint-Péesur-Nivelle), regroupe des ressources collectées par plusieurs unités de recherche, notamment dans le cadre de programmes d’observation des cours d’eau, en partenariat avec l’Office Français de la Biodiversité,-La collection internationale de gloméromycètes IBG (Dijon) regroupe des cultures vivantes sur des plantes hôtes de champignons mycorrhiziens à arbuscules.BRC4Env rend ces ressources biologiques disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi du secteur privé et de la société civile. Ces ressources biologiques sont mobilisables, en particulier, dans le cadre de projets de recherche en écotoxicologie et agroécologie. Quelques exemples sont présentés ci-dessous.-Les extraits d’ADN des sols détenus par Genosol sont utilisés pour évaluer l’impact des activités humaines sur l’abondance, la diversité et la composition des communautés microbiennes et fongiques des sols.-Les échantillons de sols du CEES sont mobilisés dans l’étude de la contamination chimique des sols français. Récemment le Projet Phytosol a permis une meilleure connaissance des teneurs des sols français en résidus de pesticides.-Les écailles de poisson de Colisa peuvent être mobilisées pour le suivi non létal de la contamination chimique des eaux et pour la détermination de leur qualité. Les tissus de poissons sont utilisés par exemple pour développer des approches d’évaluation du statut écologique d’estuaires français.-Les champignons endomycorhiziens à arbuscules sont mobilisés dans des études aux visées agroécologiques destinées à diminuer l’apport d’engrais phosphaté aux cultures et à améliorer la tolérance et la résilience des cultures à différents stress liés au changement climatique. -Les spécimens de coléoptères contenus dans la Collection d’Arthropodes Continentaux sont utilisés dans un programme national comme référence taxonomique pour (i) aider à la création de librairies de barcodes moléculaires et mettre à point un protocole de métabarcoding pour identifier les coléoptères des paysages agricoles, afin de faciliter les futurs efforts de surveillance; (ii) étudier les effets potentiels des pratiques agricoles sur la diversité des plantes et des coléoptères et (iii) caractériser les liens entre la diversité des plantes et des coléoptères, y compris des liens trophiques.BRC4Env (https://doi.org/10.15454/TRBJTB) est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de Recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », AgroBRC-RARe (https://www.agrobrc-rare.org/), co-portée par INRAE, l’IRD et le CIRAD. BRC4Env est également associé à des plateformes analytiques pour la caractérisation des ressources (Biochem-Env, Genosol…), et est en relation avec l’Infrastructure « Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes » (AnaEE-France, https://www.anaee-france.fr/) pour l’accès aux écosystèmes

BRC4Env, le réseau de Centres de Ressources Biologiques agro-environnementales de l’infrastructure AgroBRC-RARe pour vos recherches en écotoxicologie et agroécologie

communication oraleNational audienceLe réseau de Centres de Ressources Biologiques BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), collecte, caractérise, conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées) agro-environnementales. Ces ressources sont ouvertes à la recherche fondamentale et appliquée mobilisant des ressources prélevées dans l’environnement, pour caractériser l’évolution de sa dynamique, ou pour proposer des solutions de biocontrôle ou de biostimulation. Ces ressources biologiques sont échantillonnées à partir d’écosystèmes naturels et cultivés.BRC4Env regroupe aujourd’hui 4 centres de ressources biologiques (CRBs) labellisés par le GIS Ibisa et 2 CRBs candidats à la labellisation, répartis sur le territoire métropolitain. D’autres collections sont également candidates pour rejoindre le pilier.-Le centre de ressources génétiques de sols GenoSol (Dijon) et le Conservatoire Européen des Echantillons de Sol (Orléans) conservent des ressources génétiques de sols (ADN) et des sols entiers, respectivement. Ces CRBs intervenant notamment dans des programmes nationaux de suivi des qualités abiotiques et biotiques des sols,-La collection de parasitoïdes oophages EP-Coll (Sophia-Antipolis) maintient une collection vivante de trichogrammes pour des programmes de biocontrôle,-La collection d’arthropodes continentaux CoArCol (Montferrier-sur-Lez) comprend des spécimens d’insectes et d’acariens collectés dans le monde entier depuis un siècle, conservés secs, en solution alcoolique ou sous forme d’ADN,-La collection d’écailles et de tissus de poissons Colisa, répartie sur plusieurs sites (Rennes, Thonon les Bains, Saint-Péesur-Nivelle), regroupe des ressources collectées par plusieurs unités de recherche, notamment dans le cadre de programmes d’observation des cours d’eau, en partenariat avec l’Office Français de la Biodiversité,-La collection internationale de gloméromycètes IBG (Dijon) regroupe des cultures vivantes sur des plantes hôtes de champignons mycorrhiziens à arbuscules.BRC4Env rend ces ressources biologiques disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi du secteur privé et de la société civile. Ces ressources biologiques sont mobilisables, en particulier, dans le cadre de projets de recherche en écotoxicologie et agroécologie. Quelques exemples sont présentés ci-dessous.-Les extraits d’ADN des sols détenus par Genosol sont utilisés pour évaluer l’impact des activités humaines sur l’abondance, la diversité et la composition des communautés microbiennes et fongiques des sols.-Les échantillons de sols du CEES sont mobilisés dans l’étude de la contamination chimique des sols français. Récemment le Projet Phytosol a permis une meilleure connaissance des teneurs des sols français en résidus de pesticides.-Les écailles de poisson de Colisa peuvent être mobilisées pour le suivi non létal de la contamination chimique des eaux et pour la détermination de leur qualité. Les tissus de poissons sont utilisés par exemple pour développer des approches d’évaluation du statut écologique d’estuaires français.-Les champignons endomycorhiziens à arbuscules sont mobilisés dans des études aux visées agroécologiques destinées à diminuer l’apport d’engrais phosphaté aux cultures et à améliorer la tolérance et la résilience des cultures à différents stress liés au changement climatique. -Les spécimens de coléoptères contenus dans la Collection d’Arthropodes Continentaux sont utilisés dans un programme national comme référence taxonomique pour (i) aider à la création de librairies de barcodes moléculaires et mettre à point un protocole de métabarcoding pour identifier les coléoptères des paysages agricoles, afin de faciliter les futurs efforts de surveillance; (ii) étudier les effets potentiels des pratiques agricoles sur la diversité des plantes et des coléoptères et (iii) caractériser les liens entre la diversité des plantes et des coléoptères, y compris des liens trophiques.BRC4Env (https://doi.org/10.15454/TRBJTB) est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de Recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », AgroBRC-RARe (https://www.agrobrc-rare.org/), co-portée par INRAE, l’IRD et le CIRAD. BRC4Env est également associé à des plateformes analytiques pour la caractérisation des ressources (Biochem-Env, Genosol…), et est en relation avec l’Infrastructure « Analyse et Expérimentation sur les Ecosystèmes » (AnaEE-France, https://www.anaee-france.fr/) pour l’accès aux écosystèmes

BRC4Env, le réseau de Centres de Ressources Biologiques agro-environnementales de l’infrastructure AgroBRC-RARe

International audienceLe réseau de Centres de Ressources Biologiques BRC4Env (https://www.brc4env.fr/), collecte, caractérise, conserve et distribue des ressources biologiques (matériel biologique et données associées) agro-environnementales. Ces ressources sont ouvertes à la recherche fondamentale et appliquée mobilisant des ressources pour caractériser l’environnement et l’évolution de sa dynamique, ou de proposer des solutions de biocontrôle. Ces ressources biologiques sont échantillonnées à partir d’écosystèmes naturels et cultivés. Elles concernent notamment des sols et les ADNs de leurs communautés microbiennes, des tissus ichtyologiques, des arthropodes et acariens, des hyménoptères parasitoïdes et des champignons mycorhiziens à arbuscule. BRC4Env rend ces ressources disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi de l'industrie et de la société civile (ONG...). Ces ressources biologiques sont mobilisables dans le cadre de projets de recherche en écotoxicologie et agroécologie.BRC4Env est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de Recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », AgroBRC-RARe (https://www.agrobrc-rare.org/), co-porté par INRAE, l’IRD et le CIRAD