Optimization of pixel size and propagation distance in X-ray phase-contrast virtual histology

X-ray phase-contrast coupled to high-spatial resolution imaging systems provides a high sensitivity for distinguishing soft tissue structures in small samples, thus being suited for X-ray virtual histology. Propagation-based phase-contrast tomography can deliver a considerable gain in signal-to-noise ratio (SNR) at small pixel sizes when it is combined to a suitable phase retrieval filter. We optimized acquisition parameters, namely the propagation distance and the pixel size, with the aim of providing adequate spatial resolution and sensitivity for virtual histology of breast surgery specimens, scanned with a phase-contrast microtomography (mu CT) system employing a commercial sCMOS detector at the SYRMEP beamline of the Italian synchrotron facility Elettra (Trieste, Italy). A pathological breast tissue sample was embedded in paraffin and imaged using a polychromatic synchrotron beam at an average energy of 24 keV. The high numerical optical aperture of the imaging system enabled to adjust the pixel size to 1, 2.5 and 4 mu m. The scans were acquired at five sample-to-detector distances: 4.5, 150, 250, 500 and 1000 mm. SNR was measured in an homogeneous region portion of the mu CT image for each combination of pixel size and propagation distance. Experimental results were compared to a theoretical model taking into account the actual point spread function of the employed imaging system. The measured gain of SNR associated with the application of the phase-retrieval matched the predictions for large Fresnel numbers (N-F > 2). For each pixel size, an optimal range of propagation distances was found. Optimal mu CT reconstructions were then compared with their respective histopatological images, showing an excellent visibility of relevant structures. The optimization performed in this study will allow to select the most appropriate geometrical configurations for future acquisitions of virtual histology images of different specimens via phase-contrast microtomography

Sementes sintéticas: Tecnologia para viabilizar a conservação in vitro da Batata.

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Micromamíferos de Península Valdés: ¿Recuperación luego de una década sin ganadería?

La Reserva Natural de la Defensa Punta Buenos Aires está ubicada en el noroeste de Península Valdés (provincia del Chubut; -42.22º, -64.22º) y pertenece a la unidad ambiental conocida como Ecotono de la Península Valdés Monte-Patagonia. La misma estuvo sometida a una intensa actividad ganadera y de extracción de leña que se extendió desde principios del siglo XX hasta el año 2008. En este año se retiró el ganado ovino, vacuno y caballar y el área pasó a ser co-administrada por la Administración de Parques Nacionales y la Armada Argentina en el año 2010. Con la finalidad de estudiar la respuesta de los ensambles de micromamíferos a lo largo de esta transición ambiental y temporal en el uso de la tierra de la reserva analizamos 3 muestras de egagrópilas de Tyto furcata colectadas en los años 2010, 2015 y 2019. Las egagrópilas fueron disgregadas siguiendo metodología estándar y se obtuvo el número mínimo de individuos (MNI=833). Como resultado encontramos que la riqueza específica fue aumentando para los distintos años, siendo 5 en 2010, 7 en 2015 y 9 en 2019, con la aparición de Akodon dolores, Reithrodon auritus, Histiotus montanus, Ctenomys sp. y Galea leucoblephara, especies que no habían sido registradas en el ensamble de 2010. Además, se observó un aumento muy llamativo en la frecuencia de Ctenomys sp. Estos cambios en el ensamble de micromamíferos podrían estar vinculados al diferente uso de la tierra, desde un campo ganadero a una unidad de conservación estricta. Estos últimos 10 años pueden haber propiciado en la recuperación del suelo y por ende de la cobertura vegetal, sobre todo de herbáceas, y el aumento de las frecuencias de estas especies.Fil: Formoso, Anahí Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; ArgentinaFil: D'agostino, Romina Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico para el Estudio de los Ecosistemas Continentales; ArgentinaFil: Lorenzo, R. S.. Administración de Parques Nacionales; ArgentinaFil: Udrizar Sauthier, Daniel Edgardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico para el Estudio de los Ecosistemas Continentales; ArgentinaXXXII Jornadas Argentinas de MastozoologíaPuerto MadrynArgentinaSociedad Argentina para el Estudio de los MamíferosConsejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas- Centro Nacional Patagónico; Universidad Nacional de La Plata-Centro de Química InorgánicaUniversidad Nacional de la Patagonia San Juan Bosc