Epidemiología y relaciones evolutivas entre cepas de HIV subtipo F rumano y brasileño

La clasificación inicial del virus del HIV-1 como las cepas Africanas u Occidentales han sido reemplazadas por la subtipificación filogenética que usa datos de secuencia de nucleótidos. En HIV-1 han sido definidos ocho linajes o subtipos distintos de A a H. Considerando que el valor de la evolución del genoma del HIV-1 se estima en 0,5% a 1% al año y que la distancia genética promedio entre los subtipos de HIV-1 es aproximadamente 20%, es probable que estos subtipos se originaran antes de la pandemia del HIV-1. El mosaico global de los subtipos del HIV-1 es consistente con la hipótesis que la mayoría de las epidemias regionales comenzaron con la introducción de uno o de unas pocas variantes que se diversificaron localmente más que mediante olas radiantes de subtipos de HIV-1 ya diversificados que se diseminaron desde el lugar de origen. En este informe, nos abocamos a las relaciones evolutivas epidemiológicas entre el subtipo F del virus del HIV-1 recientemente identificados en dos regiones geográficamente distintas, Rumania y Brasil.Facultad de Ciencias Veterinaria

Epidemiología y relaciones evolutivas entre cepas de HIV subtipo F rumano y brasileño

La clasificación inicial del virus del HIV-1 como las cepas Africanas u Occidentales han sido reemplazadas por la subtipificación filogenética que usa datos de secuencia de nucleótidos. En HIV-1 han sido definidos ocho linajes o subtipos distintos de A a H. Considerando que el valor de la evolución del genoma del HIV-1 se estima en 0,5% a 1% al año y que la distancia genética promedio entre los subtipos de HIV-1 es aproximadamente 20%, es probable que estos subtipos se originaran antes de la pandemia del HIV-1. El mosaico global de los subtipos del HIV-1 es consistente con la hipótesis que la mayoría de las epidemias regionales comenzaron con la introducción de uno o de unas pocas variantes que se diversificaron localmente más que mediante olas radiantes de subtipos de HIV-1 ya diversificados que se diseminaron desde el lugar de origen. En este informe, nos abocamos a las relaciones evolutivas epidemiológicas entre el subtipo F del virus del HIV-1 recientemente identificados en dos regiones geográficamente distintas, Rumania y Brasil.Facultad de Ciencias Veterinaria

Epidemiología y relaciones evolutivas entre cepas de HIV subtipo F rumano y brasileño

La clasificación inicial del virus del HIV-1 como las cepas Africanas u Occidentales han sido reemplazadas por la subtipificación filogenética que usa datos de secuencia de nucleótidos. En HIV-1 han sido definidos ocho linajes o subtipos distintos de A a H. Considerando que el valor de la evolución del genoma del HIV-1 se estima en 0,5% a 1% al año y que la distancia genética promedio entre los subtipos de HIV-1 es aproximadamente 20%, es probable que estos subtipos se originaran antes de la pandemia del HIV-1. El mosaico global de los subtipos del HIV-1 es consistente con la hipótesis que la mayoría de las epidemias regionales comenzaron con la introducción de uno o de unas pocas variantes que se diversificaron localmente más que mediante olas radiantes de subtipos de HIV-1 ya diversificados que se diseminaron desde el lugar de origen. En este informe, nos abocamos a las relaciones evolutivas epidemiológicas entre el subtipo F del virus del HIV-1 recientemente identificados en dos regiones geográficamente distintas, Rumania y Brasil.Facultad de Ciencias Veterinaria

Divergent HIV and Simian Immunodeficiency Virus Surveillance, Zaire

Recent HIV infection or divergent HIV or simian immunodeficiency virus (SIV) strains may be responsible for Western blot–indeterminate results on 70 serum samples from Zairian hospital employees that were reactive in an enzyme immunoassay. Using universal polymerase chain reaction HIV-1, HIV-2, and SIV primers, we detected 1 (1.4%) HIV-1 sequence. Except for 1 sample, no molecular evidence for unusual HIV- or SIV-like strains in this sampling was found

EL virus del HIV-1 de pacientes de May Harbor de diferentes subtipos filogenéticos: las implicancias para la evolución de la pandemia HIV/SIDA

Las variantes virales aisladas de pacientes infectados con HIV a través del mundo comparten una diversidad notable, especialmente en la glicoproteína de envoltura gp120. Los estudios filogenéticos han agrupado a los aislamientos de HIV-1 en ocho subtipos (A-H). No obstante, aún dentro de una sola persona infectada, el HIV está presente como unas «cuasi-especies,» o un enjambre de variantes estrechamente conexas. Esta diversidad genética, que en el caso del HIV-1 se acumula a una tasa de aproximadamente una sustitución de nucleótido por genoma por ciclo de replicación, da al virus una flexibilidad enorme para responder a un amplio conjunto de presiones de selección in vivo. Como una consecuencia, la droga-resistencia y las mutantes inmunológica se generan rápidamente en personas infectadas mediante todas las etapas de infección. Sobre una escala global, la pandemia del HIV se reconoce como consistiendo de muchas epidemias separadas, cada una con una geografía característica, poblaciones afectadas, y tipo predominante de cepa viral. Con unos estimados 15 millones de personas infectadas, la distribución geográfica de los subtipos virales está llegando a ser más dispersa, y estas demarcaciones son además confundidas por la evidencia creciente de infecciones mixtas.Facultad de Ciencias Veterinaria

EL virus del HIV-1 de pacientes de May Harbor de diferentes subtipos filogenéticos: las implicancias para la evolución de la pandemia HIV/SIDA

Las variantes virales aisladas de pacientes infectados con HIV a través del mundo comparten una diversidad notable, especialmente en la glicoproteína de envoltura gp120. Los estudios filogenéticos han agrupado a los aislamientos de HIV-1 en ocho subtipos (A-H). No obstante, aún dentro de una sola persona infectada, el HIV está presente como unas «cuasi-especies,» o un enjambre de variantes estrechamente conexas. Esta diversidad genética, que en el caso del HIV-1 se acumula a una tasa de aproximadamente una sustitución de nucleótido por genoma por ciclo de replicación, da al virus una flexibilidad enorme para responder a un amplio conjunto de presiones de selección in vivo. Como una consecuencia, la droga-resistencia y las mutantes inmunológica se generan rápidamente en personas infectadas mediante todas las etapas de infección. Sobre una escala global, la pandemia del HIV se reconoce como consistiendo de muchas epidemias separadas, cada una con una geografía característica, poblaciones afectadas, y tipo predominante de cepa viral. Con unos estimados 15 millones de personas infectadas, la distribución geográfica de los subtipos virales está llegando a ser más dispersa, y estas demarcaciones son además confundidas por la evidencia creciente de infecciones mixtas.Facultad de Ciencias Veterinaria

EL virus del HIV-1 de pacientes de May Harbor de diferentes subtipos filogenéticos: las implicancias para la evolución de la pandemia HIV/SIDA

Las variantes virales aisladas de pacientes infectados con HIV a través del mundo comparten una diversidad notable, especialmente en la glicoproteína de envoltura gp120. Los estudios filogenéticos han agrupado a los aislamientos de HIV-1 en ocho subtipos (A-H). No obstante, aún dentro de una sola persona infectada, el HIV está presente como unas «cuasi-especies,» o un enjambre de variantes estrechamente conexas. Esta diversidad genética, que en el caso del HIV-1 se acumula a una tasa de aproximadamente una sustitución de nucleótido por genoma por ciclo de replicación, da al virus una flexibilidad enorme para responder a un amplio conjunto de presiones de selección in vivo. Como una consecuencia, la droga-resistencia y las mutantes inmunológica se generan rápidamente en personas infectadas mediante todas las etapas de infección. Sobre una escala global, la pandemia del HIV se reconoce como consistiendo de muchas epidemias separadas, cada una con una geografía característica, poblaciones afectadas, y tipo predominante de cepa viral. Con unos estimados 15 millones de personas infectadas, la distribución geográfica de los subtipos virales está llegando a ser más dispersa, y estas demarcaciones son además confundidas por la evidencia creciente de infecciones mixtas.Facultad de Ciencias Veterinaria

HIV Genetic Diversity in Cameroon: Possible Public Health Importance

To monitor the evolving molecular epidemiology and genetic diversity of HIV in a country where many distinct strains cocirculate, we performed genetic analyses on sequences from 75 HIV-1-infected Cameroonians: 74 were group M and 1 was group O. Of the group M sequences, 74 were classified into the following env gp41 subtypes or recombinant forms: CRF02 (n = 54), CRF09 (n = 2), CRF13 (n = 2), A (n = 5), CRF11 (n = 4), CRF06 (n = 1), G (n = 2), F2 (n = 2), and E (n = 1, CRF01), and 1 was a JG recombinant. Comparison of phylogenies for 70 matched gp41 and protease sequences showed inconsistent classifications for 18 (26%) strains. Our data show that recombination is rampant in Cameroon with recombinant viruses continuing to recombine, adding to the complexity of circulating HIV strains. This expanding genetic diversity raises public health concerns for the ability of diagnostic assays to detect these unique HIV mosaic variants and for the development of broadly effective HIV vaccines.Peer Reviewedhttp://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/63150/1/aid.2006.22.812.pd

Dual and recombinant infections: an integral part of the HIV-1 epidemic in Brazil.

We systematically evaluated multiple and recombinant infections in an HIV-infected population selected for vaccine trials. Seventy-nine HIV-1 infected persons in a clinical cohort study in Rio de Janeiro, Brazil, were evaluated for 1 year. A combination of molecular screening assays and DNA sequencing showed 3 dual infections (3.8%), 6 recombinant infections (7.6%), and 70 (88.6%) infections involving single viral subtypes. In the three dual infections, we identified HIV-1 subtypes F and B, F and D, and B and D; in contrast, the single and recombinant infections involved only HIV-1 subtypes B and F. The recombinants had five distinct B/F mosaic patterns: Bgag-p17/Bgag-p24/Fpol/Benv, Fgag-p17/Bgag-p24/Fpol/Fenv, Bgag-p17/B-Fgag-p24/Fpol/Fenv, Bgag-p17/B-Fgag-p24/Fpol/Benv, and Fgag-p17/B-Fgag-p24/Fpol/Fenv. No association was found between dual or recombinant infections and demographic or clinical variables. These findings indicate that dual and recombinant infections are emerging as an integral part of the HIV/AIDS epidemic in Brazil and emphasize the heterogenous character of epidemics emerging in countries where multiple viral subtypes coexist