Terrains et espaces en devenir à La Rochelle (xiie-xviiie siècles)

Création ducale des années 1130, La Rochelle se développe rapidement au cours des xiie-xiiie siècles et se retrouve très vite à l’étroit dans ses murs qu’elle n’a alors de cesse d’étendre. La ville atteint ses limites au xive siècle et ce n’est qu’à la fin du xvie siècle qu’une nouvelle extension est possible. Après le siège de 1628, les fortifications sont rasées, à l’exception du front de mer. Libérée de son carcan militaire, la ville s’étale alors sur ces nouveaux terrains de manière parfois anarchique jusque vers la fin du xviie siècle quand une nouvelle enceinte, plus large que la précédente, va enclore la ville jusqu’au début du xxe siècle.Bien qu’ils soient à prendre avec prudence, les nombreux plans de la ville montrent, à partir de la fin du xvie siècle, de nombreux terrains libres de construction au sein de l’espace urbain. Il s’agit souvent de jardins, vergers ou espaces agraires divers, en général privatifs et enclos de murs. D’autres peuvent être interprétés, grâce aux sources archivistiques, comme résultant de destructions. Toutefois, ces espaces ne sont jamais qualifiés de « place vide ». Les opérations d’archéologie préventive menées depuis une vingtaine d’années à La Rochelle complètent parfois ces informations et permettent une nouvelle approche de leur interprétation. Quelques-unes ont également mis l’accent sur des phénomènes peu documentés comme la conquête de nouveaux espaces soumis à un processus de transformation naturel accentué par l’homme.Ducal creation of the years 1130, La Rochelle developed quickly during the 12th-13th centuries and was rapidly found cramped within its walls that it had not ceased to extend. The city reached its limits in the 14th century and it was not until the end of the 16th century that a new extension was possible. After the siege of 1628, the fortifications were razed, with the exception of the waterfront. Freed from its military straitjacket, the city then spread out on these new grounds in a periodically anarchic manner until the end of the 17th century when a new enclosure, wider than the previous one, enclosed the city until the beginning of the 20th century. Although they should be taken with caution, the town's numerous plans show, from the end of the 16th century, many vacant lots within the urban space. They are often gardens, orchards or various agrarian spaces, usually private and behind enclosed walls. Others can be interpreted, through archival sources, as resulting from destructions. However, these spaces are never referred to as "empty spaces". The preventive archaeology operations carried out for some twenty years in La Rochelle sometimes supplement this information and allow a new approach to their interpretation. Some have also focused on poorly documented phenomena such as the conquest of new spaces subjected to a process of natural transformation accentuated by man.La Rochelle, una creación ducal de los años 1130, se desarrolló rápidamente durante los siglos XII y XIII. Sus muros resultaron prontamente estrechos, con lo cual la ciudad hubo de extenderlos permanentemente, llegando a alcanzar sus límites en el siglo XIV; no fue sino a fines del siglo XVI que pudo llevarse a cabo una nueva extensión. Las fortificaciones fueron destruidas tras el asedio de 1628, exceptuando aquellas que se encontraban en el frente de playa. Una vez liberada del yugo militar, la ciudad se extendió hacia esos nuevos terrenos –algunas veces de manera anárquica– hasta fines del siglo XVII, momento en que se edificó una muralla más amplia que la anterior y que cercaría la ciudad hasta principios del siglo XX. Los abundantes planos de la ciudad –pese a que deben ser analizados con prudencia– muestran numerosos terrenos libres de construcciones al interior del espacio urbano desde fines del siglo XVI: se trata a menudo de jardines, huertos o espacios agrarios diversos, en general de uso privado y cercados con muros. Otros espacios pueden interpretarse, gracias a las fuentes de archivos, como resultado de destrucciones. No obstante, nunca son calificados como «lugares vacíos». Las operaciones de arqueología preventiva llevadas a cabo desde hace unos veinte años en La Rochelle han completado en ciertas ocasiones dichas informaciones, lo cual ha permitido interpretarlas desde un nuevo enfoque. Otras han hecho hincapié en fenómenos poco documentados, tales como la conquista de nuevos espacios sometidos a un proceso de transformación natural acentuado por el hombre

Alteration of mitochondrial oxidative phosphorylation in aged skeletal muscle involves modification of adenine nucleotide translocator

AbstractThe process of skeletal muscle aging is characterized by a progressive loss of muscle mass and functionality. The underlying mechanisms are highly complex and remain unclear. This study was designed to further investigate the consequences of aging on mitochondrial oxidative phosphorylation in rat gastrocnemius muscle, by comparing young (6 months) and aged (21 months) rats. Maximal oxidative phosphorylation capacity was clearly reduced in older rats, while mitochondrial efficiency was unaffected. Inner membrane properties were unaffected in aged rats since proton leak kinetics were identical to young rats. Application of top-down control analysis revealed a dysfunction of the phosphorylation module in older rats, responsible for a dysregulation of oxidative phosphorylation under low activities close to in vivo ATP turnover. This dysregulation is responsible for an impaired mitochondrial response toward changes in cellular ATP demand, leading to a decreased membrane potential which may in turn affect ROS production and ion homeostasis. Based on our data, we propose that modification of ANT properties with aging could partly explain these mitochondrial dysfunctions

Improved Energy Supply Regulation in Chronic Hypoxic Mouse Counteracts Hypoxia-Induced Altered Cardiac Energetics

Hypoxic states of the cardiovacular system are undoubtedly associated with the most frequent diseases of modern time. Therefore, understanding hypoxic resistance encountered after physiological adaptation such as chronic hypoxia, is crucial to better deal with hypoxic insult. In this study, we examine the role of energetic modifications induced by chronic hypoxia (CH) in the higher tolerance to oxygen deprivation.P-NMR), and to describe the integrated changes in cardiac energetics regulation by using Modular Control Analysis (MoCA). Oxygen reduction induced a concomitant decrease in RPP (−46%) and in [PCr] (−23%) in Control hearts while CH hearts energetics was unchanged. MoCA demonstrated that this adaptation to hypoxia is the direct consequence of the higher responsiveness (elasticity) of ATP production of CH hearts compared with Controls (−1.88±0.38 vs −0.89±0.41, p<0.01) measured under low oxygen perfusion. This higher elasticity induces an improved response of energy supply to cellular energy demand. The result is the conservation of a healthy control pattern of contraction in CH hearts, whereas Control hearts are severely controlled by energy supply.As suggested by the present study, the mechanisms responsible for this increase in elasticity and the consequent improved ability of CH heart metabolism to respond to oxygen deprivation could participate to limit the damages induced by hypoxia

System's biology analysis of chronic hypoxia-induced heart energetics adaptation

La compréhension des mécanismes physiologiques mis en jeu en réponse à l’hypoxie aigüe et chronique ainsi que leur retentissement global sur l’énergétique cardiaque nécessite l’application d’approches globales. L’approche intégrative développée par notre équipe, l’Analyse Modulaire du Contrôle (MoCA) permet une description quantitative de l’ensemble des interactions au sein d’un système biologique complexe décomposé en différents modules liés par des intermédiaires communs, ce qui en fait un outil puissant pour l’étude des interactions au sein de l’énergétique cardiaque, normale ou pathologique. Dans cette thèse, MoCA a été appliquée sur des coeurs isolés de souris contrôles et de souris soumises à une hypoxie chronique de 21 jours, perfusés en conditions d’oxygénation normale ou avec un milieu dont la concentration en oxygène dans le milieu a été réduite. Après exposition à l’hypoxie chronique, les coeurs sont caractérisés par une réponse (élasticité) plus importante des processus d’apport en énergie face à une variation des intermédiaires énergétiques (PCr, ATP, Pi), et ceci malgré une diminution de la masse mitochondriale. De plus, contrairement aux coeurs sains, aucune modi?cation de l’activité contractile et de la concentration d’intermédiaires énergétiques n’a été mesurée sur les coeurs hypoxiques après diminution de la concentration en oxygène dans le milieu de perfusion. Ces résultats suggèrent une adaptation fonctionnelle de l’ensemble de la bioénergétique cardiaque après exposition à l’hypoxie chronique, l’augmentation de l’élasticité des processus d’apport en énergie permettant de compenser en partie les altérations énergétiques induites par un dé?cit en oxygène.An important issue in the comprehension of the link between molecular events developed in pathologies such as chronic hypoxia adaptation, is the development of new experimental strategies aimed at the study of the integrated organ physiology. Our Modular Control Analysis (MoCA), gives quantitative information on the internal control and regulation of integrated heart energetics on the basis of a supply-demand system and is therefore of particular interest to better understand the overall effect as well as the relative importance of the various modi?cations developed during pathologies. In this thesis, MoCA was applied on isolated hearts of control and chronic hypoxic mice perfused with high or low oxygen in the medium. Despite a severe mitochondrial alteration after chronic hypoxia exposure, a surprizing higher response of energy supply (elasticity) to energetic intermediates changes (PCr, ATP, Pi) was detected in chronic hypoxic hearts. Moreover, chronic hypoxic hearts energetics was unchanged by oxygen reduction while a strong concomitant decrease in heart contractile activity and in PCr concentration, was measured in control hearts. As suggested by these results, this increase in energy-supply elasticity could be considered as an adaptive mechanism developed after chronic hypoxia counteracting hypoxia-induced altered cardiac energetics

System's biology analysis of chronic hypoxia-induced heart energetics adaptation

La compréhension des mécanismes physiologiques mis en jeu en réponse à l’hypoxie aigüe et chronique ainsi que leur retentissement global sur l’énergétique cardiaque nécessite l’application d’approches globales. L’approche intégrative développée par notre équipe, l’Analyse Modulaire du Contrôle (MoCA) permet une description quantitative de l’ensemble des interactions au sein d’un système biologique complexe décomposé en différents modules liés par des intermédiaires communs, ce qui en fait un outil puissant pour l’étude des interactions au sein de l’énergétique cardiaque, normale ou pathologique. Dans cette thèse, MoCA a été appliquée sur des coeurs isolés de souris contrôles et de souris soumises à une hypoxie chronique de 21 jours, perfusés en conditions d’oxygénation normale ou avec un milieu dont la concentration en oxygène dans le milieu a été réduite. Après exposition à l’hypoxie chronique, les coeurs sont caractérisés par une réponse (élasticité) plus importante des processus d’apport en énergie face à une variation des intermédiaires énergétiques (PCr, ATP, Pi), et ceci malgré une diminution de la masse mitochondriale. De plus, contrairement aux coeurs sains, aucune modi?cation de l’activité contractile et de la concentration d’intermédiaires énergétiques n’a été mesurée sur les coeurs hypoxiques après diminution de la concentration en oxygène dans le milieu de perfusion. Ces résultats suggèrent une adaptation fonctionnelle de l’ensemble de la bioénergétique cardiaque après exposition à l’hypoxie chronique, l’augmentation de l’élasticité des processus d’apport en énergie permettant de compenser en partie les altérations énergétiques induites par un dé?cit en oxygène.An important issue in the comprehension of the link between molecular events developed in pathologies such as chronic hypoxia adaptation, is the development of new experimental strategies aimed at the study of the integrated organ physiology. Our Modular Control Analysis (MoCA), gives quantitative information on the internal control and regulation of integrated heart energetics on the basis of a supply-demand system and is therefore of particular interest to better understand the overall effect as well as the relative importance of the various modi?cations developed during pathologies. In this thesis, MoCA was applied on isolated hearts of control and chronic hypoxic mice perfused with high or low oxygen in the medium. Despite a severe mitochondrial alteration after chronic hypoxia exposure, a surprizing higher response of energy supply (elasticity) to energetic intermediates changes (PCr, ATP, Pi) was detected in chronic hypoxic hearts. Moreover, chronic hypoxic hearts energetics was unchanged by oxygen reduction while a strong concomitant decrease in heart contractile activity and in PCr concentration, was measured in control hearts. As suggested by these results, this increase in energy-supply elasticity could be considered as an adaptive mechanism developed after chronic hypoxia counteracting hypoxia-induced altered cardiac energetics

Analyse intégrative de l'adaptation de l'énergétique cardiaque à l'hypoxie chronique

La compréhension des mécanismes physiologiques mis en jeu en réponse à l hypoxie aigüe et chronique ainsi que leur retentissement global sur l énergétique cardiaque nécessite l application d approches globales. L approche intégrative développée par notre équipe, l Analyse Modulaire du Contrôle (MoCA) permet une description quantitative de l ensemble des interactions au sein d un système biologique complexe décomposé en différents modules liés par des intermédiaires communs, ce qui en fait un outil puissant pour l étude des interactions au sein de l énergétique cardiaque, normale ou pathologique. Dans cette thèse, MoCA a été appliquée sur des coeurs isolés de souris contrôles et de souris soumises à une hypoxie chronique de 21 jours, perfusés en conditions d oxygénation normale ou avec un milieu dont la concentration en oxygène dans le milieu a été réduite. Après exposition à l hypoxie chronique, les coeurs sont caractérisés par une réponse (élasticité) plus importante des processus d apport en énergie face à une variation des intermédiaires énergétiques (PCr, ATP, Pi), et ceci malgré une diminution de la masse mitochondriale. De plus, contrairement aux coeurs sains, aucune modi?cation de l activité contractile et de la concentration d intermédiaires énergétiques n a été mesurée sur les coeurs hypoxiques après diminution de la concentration en oxygène dans le milieu de perfusion. Ces résultats suggèrent une adaptation fonctionnelle de l ensemble de la bioénergétique cardiaque après exposition à l hypoxie chronique, l augmentation de l élasticité des processus d apport en énergie permettant de compenser en partie les altérations énergétiques induites par un dé?cit en oxygène.An important issue in the comprehension of the link between molecular events developed in pathologies such as chronic hypoxia adaptation, is the development of new experimental strategies aimed at the study of the integrated organ physiology. Our Modular Control Analysis (MoCA), gives quantitative information on the internal control and regulation of integrated heart energetics on the basis of a supply-demand system and is therefore of particular interest to better understand the overall effect as well as the relative importance of the various modi?cations developed during pathologies. In this thesis, MoCA was applied on isolated hearts of control and chronic hypoxic mice perfused with high or low oxygen in the medium. Despite a severe mitochondrial alteration after chronic hypoxia exposure, a surprizing higher response of energy supply (elasticity) to energetic intermediates changes (PCr, ATP, Pi) was detected in chronic hypoxic hearts. Moreover, chronic hypoxic hearts energetics was unchanged by oxygen reduction while a strong concomitant decrease in heart contractile activity and in PCr concentration, was measured in control hearts. As suggested by these results, this increase in energy-supply elasticity could be considered as an adaptive mechanism developed after chronic hypoxia counteracting hypoxia-induced altered cardiac energetics.BORDEAUX2-Bib. électronique (335229905) / SudocSudocFranceF

A quantitative method to track protein translocation between intracellular compartments in real-time in live cells using weighted local variance image analysis.

The genetic expression of cloned fluorescent proteins coupled to time-lapse fluorescence microscopy has opened the door to the direct visualization of a wide range of molecular interactions in living cells. In particular, the dynamic translocation of proteins can now be explored in real time at the single-cell level. Here we propose a reliable, easy-to-implement, quantitative image processing method to assess protein translocation in living cells based on the computation of spatial variance maps of time-lapse images. The method is first illustrated and validated on simulated images of a fluorescently-labeled protein translocating from mitochondria to cytoplasm, and then applied to experimental data obtained with fluorescently-labeled hexokinase 2 in different cell types imaged by regular or confocal microscopy. The method was found to be robust with respect to cell morphology changes and mitochondrial dynamics (fusion, fission, movement) during the time-lapse imaging. Its ease of implementation should facilitate its application to a broad spectrum of time-lapse imaging studies