Dynamical demixing of a binary mixture under sedimentation

We investigate the sedimentation dynamics of a binary mixture, the species of which differ by their Stokes coefficients but are identical otherwise. We analyze the sedimentation dynamics and the morphology of the final deposits using Brownian dynamics simulations for mixtures with a range of sedimentation velocities of both species. We found a threshold in the sedimentation velocities difference above which the species in the final deposit are segregated. The degree of segregation increases with the difference in the Stokes coefficients or the sedimentation velocities above the threshold. We propose a simple mean-field model that captures the main features of the simulated deposits

Manejo e exploração sustentável de florestas naturais tropicais: opções, restrições e alternativas.

Introdução; Conceito e manejo florestal e sustentabilidade; Características das florestas naturais tropicais; Formas de manejo florestal; Manejo de produtos não-madeireiros; Manejo de uso múltiplo; Manejo florestal em área com população; Modelo geral para pequena propriedade; condições gerais para o manejo florestal; Condições imediatas para implantação do manejo florestal.bitstream/CNPF-2009-09/40472/1/doc110.pd

Fur controls iron homeostasis and oxidative stress defense in the oligotrophic alpha-proteobacterium Caulobacter crescentus

In most bacteria, the ferric uptake regulator (Fur) is a global regulator that controls iron homeostasis and other cellular processes, such as oxidative stress defense. In this work, we apply a combination of bioinformatics, in vitro and in vivo assays to identify the Caulobacter crescentus Fur regulon. A C. crescentus fur deletion mutant showed a slow growth phenotype, and was hypersensitive to H2O2 and organic peroxide. Using a position weight matrix approach, several predicted Fur-binding sites were detected in the genome of C. crescentus, located in regulatory regions of genes not only involved in iron uptake and usage but also in other functions. Selected Fur-binding sites were validated using electrophoretic mobility shift assay and DNAse I footprinting analysis. Gene expression assays revealed that genes involved in iron uptake were repressed by iron-Fur and induced under conditions of iron limitation, whereas genes encoding iron-using proteins were activated by Fur under conditions of iron sufficiency. Furthermore, several genes that are regulated via small RNAs in other bacteria were found to be directly regulated by Fur in C. crescentus. In conclusion, Fur functions as an activator and as a repressor, integrating iron metabolism and oxidative stress response in C. crescentus

Fur controls iron homeostasis and oxidative stress defense in the oligotrophic alpha-proteobacterium Caulobacter crescentus

In most bacteria, the ferric uptake regulator (Fur) is a global regulator that controls iron homeostasis and other cellular processes, such as oxidative stress defense. In this work, we apply a combination of bioinformatics, in vitro and in vivo assays to identify the Caulobacter crescentus Fur regulon. A C. crescentus fur deletion mutant showed a slow growth phenotype, and was hypersensitive to H2O2 and organic peroxide. Using a position weight matrix approach, several predicted Fur-binding sites were detected in the genome of C. crescentus, located in regulatory regions of genes not only involved in iron uptake and usage but also in other functions. Selected Fur-binding sites were validated using electrophoretic mobility shift assay and DNAse I footprinting analysis. Gene expression assays revealed that genes involved in iron uptake were repressed by iron-Fur and induced under conditions of iron limitation, whereas genes encoding iron-using proteins were activated by Fur under conditions of iron sufficiency. Furthermore, several genes that are regulated via small RNAs in other bacteria were found to be directly regulated by Fur in C. crescentus. In conclusion, Fur functions as an activator and as a repressor, integrating iron metabolism and oxidative stress response in C. crescentus

Twenty years monitoring growth dynamics of a logged tropical forest in Western Amazon.

Resumo - Foi conduzido um estudo sobre a dinâmica de crescimento em floresta localizada no Estado do Acre na Amazônia sul ocidental, onde uma área de 20 ha foi explorada para extração de madeira em 1992. O estudo foi baseado em parcelas permanentes (1 ha) estabelecidas dentro da área explorada e na floresta não manejada, imediatamente após o fim das operações florestais. Os parâmetros da dinâmica florestal foram analisados em termos da biomassa seca acima do solo (BAS). Durante o período do estudo três eventos climáticos extremos causaram um elevado impacto tanto nas áreas exploradas como nas não perturbadas por exploração, produzindo perdas de biomassa superiores às estimadas para a exploração. Vinte anos após a exploração, as taxas de ingresso e mortalidade foram semelhantes às esperadas em uma área de floresta não perturbada por exploração e a recuperação da BAS foi significativamente mais alta nas áreas cortadas. Quando praticado de forma adequada, o manejo de floresta pode promover uma recuperação da BAS mais rápida. Nós sugerimos que o manejo florestal pode ser considerado como uma alternativa para adaptação a eventos extremos de clima por meio da promoção de perturbações controladas que minimizem a mortalidade de árvores e a perda de biomassa

Níveis e frequências de irrigação na limeira 'Tahiti' no Estado do Piauí.

Trabalhos de manejo de irrigação no Brasil com a limeira ácida ?Tahiti? são escassos, especialmente no Estado do Piauí. O objetivo deste estudo foi avaliar a produção e os componentes de produção da limeira ácida ?Tahiti? em resposta à aplicação de cinco lâminas (68, 80, 100, 124 e 136% da evapotranspiração da cultura ? ETc) e duas frequências de irrigação (um e dois dias). O experimento foi realizado em um pomar comercial, com espaçamento de 6 x 5 m e irrigado por microaspersão, localizado em José de Freitas, PI. Utilizou-se o delineamento experimental em blocos casualizados, com quatro repetições, e esquema de parcelas subdivididas (frequências ? parcelas e lâminas ? subparcelas). O manejo diário da irrigação foi realizado pelo balanço de água no solo, com o auxílio do programa computacional Irriplus. O manejo de irrigação com turno de rega diário e reposição de 100% da ETc foi o mais indicado, por proporcionar maiores níveis de produtividade (2.709 kg ha-1), peso médio dos frutos (105,2 g) e máxima EUA (299 g m-3)

Implications of mitotic and meiotic irregularities in common beans (Phaseolus vulgaris L.).

The common bean has great social and economic importance in Brazil and is the subject of a high number of publications, especially in the fields of genetics and breeding. Breeding programs aim to increase grain yield; however, mitosis and meiosis represent under explored research areas that have a direct impact on grain yield. Therefore, the study of cell division could be another tool available to bean geneticists and breeders. The aim of this study was to investigate irregularities occurring during the cell cycle and meiosis in common bean. The common bean cultivar used was BRSMG Talismã, which owing to its high yield and grain quality is recommended for cultivation in Brazil. We classified the interphase nuclei, estimated the mitotic and meiotic index, grain pollen viability, and percentage of abnormalities in both processes. The mitotic index was 4.1%, the interphase nucleus was non-reticulated, and 19% of dividing somatic cells showed abnormal behavior. Meiosis also presented irregularities resulting in a meiotic index of 44.6%. Viability of pollen grains was 94.3%. These results indicate that the common bean cultivar BRSMG Talismã possesses repair mechanisms that compensate for changes by producing a large number of pollen grains. Another important strategy adopted by bean plants to ensure stability is the elimination of abnormal cells by apoptosis. As the common bean cultivar BRSMG Talismã is recommended for cultivation because of its good agronomic performance, it can be concluded that mitotic and meiotic irregularities have no negative influence on its grain quality and yield

Charge-transfer processes in radical ion molecular conductors κ-(BEDT-TTF)2Cu[N(CN)2]Br x Cl1 − x : The superconductor (x = 0.9) and the conductor with the metal-insulator transition (x = 0)

Optical spectral investigations of low-dimensional organic molecular conductors κ-(BEDT-TTF)2Cu[N(CN)2]Br x Cl1 − x with x = 0.9 (the superconductor with T c = 11.3 K) and x = 0 (the metal with the metal-insulator transition at T < 50 K) are performed in the range 50–6000 cm−1 (6 meV–0.74 eV) at temperatures from 300 to 20 K. The optical conductivity spectra are quantitatively analyzed in terms of the proposed model, according to which the charge transfer involves two types of charge carriers, i.e., electrons (holes) localized on clusters (dimers and tetramers formed by BEDT-TTF molecules) and quasi-free charge carriers, with the use of the tetramer “cluster“ model based on the Hubbard Hamiltonian for correlated electrons and the Drude model for quasi-free charge carriers. Physical parameters of the model, such as the energy of Coulomb repulsion between two electrons (holes) in one molecule, the transfer integrals between molecules inside the dimer and between dimers, and the electron-molecular vibration coupling constants, are determined. The anisotropy of the spectra in the conducting plane is explained. The inference is made that only electrons localized on clusters couple with intramolecular vibrations

Effects of the rainy season on growth of Mimosa tenuiflora in dry tropical forest, Brazil.

Resumo

Criteria to be considered to achieve a sustainable second cycle in Amazon Forest.

Estrutura da floresta remanescente e o incremento por classe de diâmetro desempenha papel decisivo na recuperação do volume para o próximo ciclo de corte. Espécies de árvores na Floresta Amazônica, não apresentam um padrão definido de estrutura de diâmetro, discutido aqui utilizando Cedrela odorata L. como estudo de caso. Os objetivos deste trabalho foram identificar, por meio de simulação, a recuperação florestal após o manejo em uma situação real em três locais de produção de madeira, e as alternativas disponíveis para assegurar a recuperação do volume comercial de madeira em um segundo ciclo de corte na Amazônia brasileira. O trabalho se refere às classes de diâmetro de árvores produtivas para o próximo ciclo. A comparação indica que uma das estratégias usadas permite recuperar o estoque de volume mais rápido do que o tempo definido no ciclo de corte estabelecido em lei. O número de árvores remanescentes nos locais não corrobora a suposição comum de que o manejo florestal esgota árvores de grandes diâmetros. Este artigo apresenta estratégias de levantamento para avaliar e estabelecer a estrutura diamétrica mais indicada para recuperar no segundo ciclo o volume registrado durante o primeiro ciclo de corte