Rôle de la mutation Vav1R63W dans la sensibilité à l’asthme allergique

Dans mon équipe d’accueil, une dissection génétique à l'aide des lignées de rats congéniques BN.LEW a permis d'identifier un polymorphisme sur le gène Vav1. Ce polymorphisme se caractérise par la substitution d’une arginine (R) chez le rat LEW en tryptophane (W) chez le rat BN, en position 63 de la protéine Vav1 et pourrait être impliqué dans la différence de sensibilité des rats LEW (résistants) et BN (sensibles) aux manifestations allergiques. Pour tester cette hypothèse, une souris Knock-In (KI) Vav1R63W, sur fond génétique C57BL/6, a été générée et, dans cette étude, elle est comparée à une souris sauvage (Wild-Type, WT) portant une R. Ma thèse a eu pour premier objectif d’étudier l’impact de ce polymorphisme sur le développement et sur la fonction des lymphocytes T. J’ai démontré que les souris KI présentent un développement thymique normal mais possèdent plus de lymphocytes T régulateurs (Treg) que les souris WT. De plus, les lymphocytes T CD4+ de ces souris KI présentent un déséquilibre de la balance Th1/Th2, caractérisé par une augmentation de la production d’IL-4 (Th2) et une diminution de la production d’IFNy (Th1). Le deuxième but de ma thèse a été d’analyser la susceptibilité de ces souris KI à un modèle d’asthme allergique. L’étude de cette maladie est importante puisqu’elle représente un enjeu de santé publique. L’asthme résulte d’une réponse immunitaire aberrante de type Th2 à des allergènes inhalés. Chez les souris KI, un protocole d’induction de l’asthme a entraîné une réaction inflammatoire plus importante que chez les souris WT. Cette étude préliminaire tend à montrer que les souris KI sont plus sensibles à une maladie de type Th2 et qu’elles possèdent plus de Treg. Elle confirme le rôle important de Vav1 dans la réponse immunitaire, et particulièrement dans la balance Th1/Th2

Rôle de la mutation Vav1R63W dans la sensibilité à l asthme allergique

Dans mon équipe d accueil, une dissection génétique à l'aide des lignées de rats congéniques BN.LEW a permis d'identifier un polymorphisme sur le gène Vav1. Ce polymorphisme se caractérise par la substitution d une arginine (R) chez le rat LEW en tryptophane (W) chez le rat BN, en position 63 de la protéine Vav1 et pourrait être impliqué dans la différence de sensibilité des rats LEW (résistants) et BN (sensibles) aux manifestations allergiques. Pour tester cette hypothèse, une souris Knock-In (KI) Vav1R63W, sur fond génétique C57BL/6, a été générée et, dans cette étude, elle est comparée à une souris sauvage (Wild-Type, WT) portant une R. Ma thèse a eu pour premier objectif d étudier l impact de ce polymorphisme sur le développement et sur la fonction des lymphocytes T. J ai démontré que les souris KI présentent un développement thymique normal mais possèdent plus de lymphocytes T régulateurs (Treg) que les souris WT. De plus, les lymphocytes T CD4+ de ces souris KI présentent un déséquilibre de la balance Th1/Th2, caractérisé par une augmentation de la production d IL-4 (Th2) et une diminution de la production d IFN (Th1). Le deuxième but de ma thèse a été d analyser la susceptibilité de ces souris KI à un modèle d asthme allergique. L étude de cette maladie est importante puisqu elle représente un enjeu de santé publique. L asthme résulte d une réponse immunitaire aberrante de type Th2 à des allergènes inhalés. Chez les souris KI, un protocole d induction de l asthme a entraîné une réaction inflammatoire plus importante que chez les souris WT. Cette étude préliminaire tend à montrer que les souris KI sont plus sensibles à une maladie de type Th2 et qu elles possèdent plus de Treg. Elle confirme le rôle important de Vav1 dans la réponse immunitaire, et particulièrement dans la balance Th1/Th2.TOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocSudocFranceF

A new methodology based on sensitivity analysis to simplify the recalibration of functional–structural plant models in new conditions

Functional–structural plant models (FSPMs) describe explicitly the interactions between plants and their environment at organ to plant scale. However, the high level of description of the structure or model mechanisms makes this type of model very complex and hard to calibrate. A two-step methodology to facilitate the calibration process is proposed here.MethodsFirst, a global sensitivity analysis method was applied to the calibration loss function. It provided first-order and total-order sensitivity indexes that allow parameters to be ranked by importance in order to select the most influential ones. Second, the Akaike information criterion (AIC) was used to quantify the model’s quality of fit after calibration with different combinations of selected parameters. The model with the lowest AIC gives the best combination of parameters to select. This methodology was validated by calibrating the model on an independent data set (same cultivar, another year) with the parameters selected in the second step. All the parameters were set to their nominal value; only the most influential ones were re-estimated.Key ResultsSensitivity analysis applied to the calibration loss function is a relevant method to underline the most significant parameters in the estimation process. For the studied winter oilseed rape model, 11 out of 26 estimated parameters were selected. Then, the model could be recalibrated for a different data set by re-estimating only three parameters selected with the model selection method.ConclusionsFitting only a small number of parameters dramatically increases the efficiency of recalibration, increases the robustness of the model and helps identify the principal sources of variation in varying environmental conditions. This innovative method still needs to be more widely validated but already gives interesting avenues to improve the calibration of FSPMs