Genetic diversity in Mexican Creole pigs with candidate genes associated with productive characters

The aim of this study was to compare the genetic variability and diversity, and genetic distances between Mexican Creole pigs – Pelón Mexicano (CPM) and Cuinos (CC) – with the commercial breed Yorkshire for the candidate genes CAST,DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN andCHX, using the PCR-RFLP technique. One hundred eighty pigs (59 CPM, 65 CC and 56 Yorkshire) were evaluated. Gene and genotypic frequencies, heterozygosity, genetic distances and filogenetic trees between breed groups were analyzed. In the comparison among the three breeds, the allelic and genotypic frequencies were different for CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 and CHX. ForLIPE, CC pigs were similar to Yorkshire; while for MYOG, the CPM were similar to Yorkshire breeds. There were no differences in the genic and genotypic frequencies for HALand RN genes between Creole and Yorkshire populations. The Yorkshire breed had higher favorable allele frequency for CAST, LIPE, MCR4 and MYOG, smaller for DECR1,HFABP4, and for CHX, and moderate for LEP genes. The heterozygosity average for all genes was higher in CPM (0.42±0.05) and similar in both the CC (0.33±0.06) and Yorkshire (0.35±0.05) breeds. In the estimation of genetic distances considering all genes, the CC breed are more distant from the Yorshire pigs.El objetivo de este trabajo fue comparar la variabilidad, diversidad y distancias genéticas entre cerdos criollos, Pelón Mexicano (CPM) y Cuinos (CC), con Yorkshire, cuanto a los genes candidatos CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN y CHX, a través de analysis por PCR-RFLP. Se evaluaron 180 cerdos: 59 CPM, 65 CC y 56 Yorkshire. Se analizaron las frecuencias génicas y genotípicas, heterocigosidad, distancias genéticas y árboles filogenéticos entre grupos raciales. Para CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 y CHX las frecuencias génicas y genotípicas fueron diferentes al comparar las tres razas. En LIPE, los CC fueron iguales a los Yorkshire; en cuanto a MYOG, los CPM fueron iguales a los Yorkshire. No hubo diferencias entre poblaciones criollas y Yorkshire en las frecuencias génicas y genotípicas para HAL y RN. Los cerdos Yorkshire presentaron mayor frecuencia en alelos favorables para CAST, LIPE, MCR4 y MYOG, menor frecuencia de DECR1, HFABP4, CHX, y moderada en LEP. La heterocigosidad promedio para todos los genes fue mayor en CPM (0,42±0,05) y similar en CC (0,33±0,06) y Yorkshire (0,35±0,05). Al calcular distancias genéticas con todos los genes, los CC se encuentran más distantes de los Yorkshire.The aim of this study was to compare the genetic variability and diversity, and genetic distances between Mexican Creole pigs – Pelón Mexicano (CPM) and Cuinos (CC) – with the commercial breed Yorkshire for the candidate genes CAST, DECR1, HAL, HFABP4, LEP, LIPE, MCR4, MYOG, RN and CHX, using the PCR-RFLP technique. One hundred eighty pigs (59 CPM, 65 CC and 56 Yorkshire) were evaluated. Gene and genotypic frequencies, heterozygosity, genetic distances and filogenetic trees between breed groups were analyzed. In the comparison among the three breeds, the allelic and genotypic frequencies were different for CAST, DECR1, HFABP4, LEP, MCR4 and CHX. For LIPE, CC pigs were similar to Yorkshire; while for MYOG, the CPM were similar to Yorkshire breeds. There were no differences in the genic and genotypic frequencies for HAL and RN genes between Creole and Yorkshire populations. The Yorkshire breed had higher favorable allele frequency for CAST, LIPE, MCR4 and MYOG, smaller for DECR1, HFABP4, and for CHX, and moderate for LEP genes. The heterozygosity average for all genes was higher in CPM (0.42±0.05) and similar in both the CC (0.33±0.06) and Yorkshire (0.35±0.05) breeds. In the estimation of genetic distances considering all genes, the CC breed are more distant from the Yorshire pigs

Aplicación del protocolo de auditoría Welfare Quality® en bovinos Holstein para engorda bajo condiciones desérticas

The application of the European Welfare Quality® protocol was evaluated in finishing Holstein males in a fattening cattle production company located in the Mexicali Valley, Baja California, Mexico. Twelve pens were randomly selected with 75 steers per pen. In addition, 38 animals per pen were individually evaluated. The evaluation was performed using a format for each of the four principles: feeding, housing, health and behaviour, corresponding to 9 criteria and evaluating 20 measurements, to obtain a global rating. The results for the principles "good health" were 92 points, for housing " 88 points, for "health" 52 points and for " behaviour" 68 points. The overall rating was "good animal welfare". It is concluded that the European protocol WQ® is feasible to be applied in finishing feedlots; however, modifications and adaptations of some measurements are suggested in accordance with the climatic conditions of the area and the temperament of the Holstein cattle.Con el objetivo de evaluar la aplicación del protocolo europeo Welfare Quality® en machos Holstein en finalización, se realizó un estudio en una empresa productora de ganado de engorda ubicada en el valle de Mexicali, Baja California, México. Se seleccionaron aleatoriamente 12 corrales con 75 machos por corral, además de evaluaciones individuales a 38 animales por corral. Se aplicaron formatos considerando los cuatro principios: alimentación, alojamiento, salud y comportamiento, correspondientes a 9 criterios y evaluando 20 mediciones, para obtener una calificación global. La calificación para los principios “buena salud” obtuvo 92 puntos, el de “buen alojamiento” 88 puntos, el de “buena salud” 52 puntos y el de “comportamiento adecuado” 68 puntos. La calificación global fue de “buen bienestar animal”. Se concluye que el protocolo europeo WQ® es factible de ser aplicable en los corrales de engorda en finalización; sin embargo, se sugieren modificaciones y adecuaciones de algunas mediciones acordes con las condiciones climáticas de la zona y el temperamento del ganado Holstein

Effect of immunocastration on behaviour and blood parameters (cortisol and testosterone) of Holstein bulls

To evaluate the effect that immunocastration has on behaviour, testosterone and cortisol levels of feedlot Holstein bulls, 720 intact animals aged between 7 and 8 months, weighing 232±1.19 kg were randomly assigned to two treatments: immunocastration using the Bopriva vaccine and a placebo (360 animals per treatment). The bulls were slaughtered at day 239 of treatment. Animals were vaccinated on days 1, 21, 101, and 181, and on those same days testosterone levels were measured; while cortisol, glucose and creatin kinase measurements were done on day 181 and during exanguination at slaughter. Sexual, aggressive and social behaviours were evaluated and it was found that intact bulls showed a higher average of head butts, mounting, threats, flehmen sign and sniffing (P<0.05), no differences were found for vocalisations, lowering of the head and grooming (P>0.05). Testosterone levels in intact bulls remained at 0.47ng/mL throughout the study, however, by day 181 differences (P<0.05) were observed in immunised bulls, with values of 0.22ng/mL. At slaughter, testosterone levels were 0.21 ± 0.06 ng/mL in immunocastrated bulls and 0.54 ± 0.06 ng/mL in the placebo group. The use of immunocastration with Bopriva has shown to be effective to reduce testosterone, sexual and aggressive behaviours on Holstein bulls

Comparación de la castración quirúrgica al nacimiento versus inmunocastración sobre el comportamiento conductual y parámetros sanguíneos (testosterona y cortisol) en machos Holstein en engorda

The behavioural response and blood parameters were compared in immunocastrated and surgically castrated bovine males. In total, 720 Holstein males, 7-8 months old and approximately 240 kg body weight were used. One group was immunocastrated by vaccination with Bopriva (commercial anti-GnRH vaccine) on days 1, 21, 101 and 181 days of the fattening and the other group was surgically castrated at birth. Blood samples were taken on vaccination days for testosterone determination and on days 181 and during slaughtering to analyse blood cortisol. Sexual behaviour (mounts and flehmen signs) and aggressive (threats and head butting) and social behaviour (sniffing, grooming, lowered head, and vocalization) were evaluated, finding no significant differences between treatments. Testosterone concentration in both treatments was below 1 ng/ml in all samples. Cortisol levels on day 181 of fattening were lower (p<0.05) with respect to the day of slaughtering in both treatments. Slaughter weight (242 days fattening) was 595.0 kg in immunocastrated males and 620.74 kg in surgically castrated males.Se comparó el comportamiento conductual y parámetros sanguíneos en toros inmunocastrados y quirúrgicamente castrados. Se utilizaron 720 machos Holstein de 7-8 meses de edad y peso aproximado de 240 kg. Un grupo fue inmunocastrado mediante vacunación con Bopriva (vacuna comercial anti-GnRH) los días 1, 21, 101 y 181 días de engorda y el otro grupo fue castrado quirúrgicamente al nacimiento. Se tomaron muestras de sangre los días de las vacunaciones para la determinación de testosterona y los días 181 y durante el desangrado en el sacrificio para analizar cortisol sanguíneo. Se evaluó el comportamiento sexual (montas y signos de flehmen), agresivo (amenazas y topetazos) y social (olfateos, acicalamiento, cabeza baja y vocalizaciones) no encontrándose diferencias significativas entre tratamientos. La concentración de testosterona en ambos tratamientos fue por debajo de 1 ng/ml en todos los muestreos. Los niveles de cortisol en el día 181 de engorda fueron más bajos (p<0.05) con respecto al día de sacrificio en ambos tratamientos. El peso al sacrificio (242 días de engorda) fue de 595.0 kg en machos inmunocastrados y 620.74 kg en castrados quirúrgicamente

Comparación de la castración quirúrgica al nacimiento versus inmunocastration sobre las características de la canal y carne en machos Holstein

El objetivo fue comparar el efecto de la castración quirúrgica al nacimiento vs immunocastración, sobre las características de la canal y carne en machos Holstein en engorda; se utilizaron 720 machos Holstein aproximadamente de 7 a 8 meses de edad con peso inicial de 240.82 kg. Se formaron 2 tratamientos con 4 corrales de 90 animales en cada uno: toros castrados quirúrgicamente que fueron castrados 24 h después del nacimiento y toros inmunocastrados vacunados con Bopriva aplicando cuatro dosis, al día 1, 21, 101 y 181 de engorda. Se tomaron pesos individuales en cada vacunación. Los animales se sacrificaron a los 242 días de engorda. A partir de la segunda vacunación se observaron diferencias (P0.05) entre tratamientos mientras que los valores de b*, C* y H* fueron más altos (P<0.05) en los animales inmunocastrados. Para fines de producción, el sacrificar los machos Holstein al nacimiento, se obtienen animales más pesados y con mejores características en la canal; sin embargo es importante evaluar el impacto del bienestar animal por la castración al nacimiento

Polimorfismo de los genes receptores de estrogenos (ESR) y prolactina (PRLR) y su asociación con prolificidad y productividad de la cerda

Los genes receptor de estrógeno (ESR) y receptor de prolactina (PRLR) fueron investigados como genes candidatos para características reproductivas. Dos localidades fueron incluidas en este estudio: Mexicali, Baja California y Navojoa, Sonora. Los genotipos para los genes ESR y PRLR fueron obtenidos de muestras sanguíneas de 136 hembras del sitio 1 (Baja California) y 300 provenientes del sitio 2 (Sonora). Los grupos genéticos utilizados fueron Yorkshire (Y), Landrace (L), Duroc (D), y cruzas YL. Se estimaron las frecuencias genotípicas y alélicas por gen y las asociaciones de los genotipos con caracteres de prolificidad y productividad. Los polimorfismos fueron identificados por medio del método PCR- RFLP. Se probó independencia del alelo A entre grupos genéticos y equilibrio Hardy-Weinberg por gen utilizando la prueba de chi-cuadrada. Se analizaron 590 registros para las variables total nacidos vivos (TNV), tamaño de camada al nacer (TCN) y al destete (TCD), peso de la camada al nacer (PCN) y al destete (PCD) para asociación empleando un modelo lineal mixto para cada gen. Los efectos de aditividad y dominancia fueron estimados en cada gen por cada carácter reproductivo. Las frecuencias del alelo B del gen ESR fueron de 0.32, 0.29, 0.09 y 0.46, en general, y para los grupos D, L y Y, respectivamente. No se observaron genotipos BB para ESR gen en este estudio. Para el gen PRLR, la frecuencia del alelo A fue en general 0.46 con variación entre grupos genéticos. Las frecuencias genotípicas y alélicas para ambos genes entre razas fueron diferentes (P< 0.05). No diferencias fueron observadas entre genotipos para el gen ESR. TCN y PCN fueron mejores en AB vs. AA. L mostró ser mayor a Y y D para TCD y PCD. Para el gen PRLR, YL presentaron mejor comportamiento para TNV. Los individuos de genotipo AA en D fueron mejores para TCD sin diferencias entre genotipos. Diferencias entre genotipos para TCN en hembras de primer parto fueron evidentes, con los mayores valores en BB (10.40 lechones) para el gen PRLR. La substitución de B por A en el gen ESR para TCN, TCD y PCD fue de 0.29 y 0.12 lechones y 0.25 kg respectivamente, pero no diferente de cero (P> 0.05). Para el gen PRLR, efectos aditivos para el alelo A resultó en un incremento negativo de 2.26 lechones (TCN), y positivo de 0.42 kg por camada para PCN. Efectos de dominancia para TCN y PCN fue de -2.67 lechones y -0.56 kg, respectivamente._______The estrogen receptor (ESR) and prolactin receptor (PRLR) genes were investigated as candidate gene for swine reproductive traits. Two sites were included: Mexicali, Baja California and Navojoa, Sonora. The genotypes of ESR and PRLR genes were obtained from 136 sows from site 1 and 300 sows from site 2. Four genetic groups: Yorkshire (Y), Landrace (L) Duroc (D), and YL crossbreed were used to calculate genotypic and allelic frequencies for the ESR and PRLR genes and estimate associations with prolificacy and productivity traits. The polymorphisms were identified by means of the PCR-RFLP method. Allelic frequencies between each breed and Hardy-Weinberg equilibrium by gene were tested by chi-square test. 590 records of the following traits: total number of born piglets (TNB), number of weaned piglets (NW), litter weight at birth (LWB) and weaning weight of piglets (WW) were analyzed for association utilizing a mixed linear model by gene. Additive and dominance effects were estimated in each gene on reproductive traits. The frequencies of B allele in general, D, L and Y were 0.32, 0.29, 0.09 and 0.46, respectively for ESR gene. The BB genotype was not found in the population under study. For PRLR gene, the frequency of A allele was in general 0.46, with variation between genetic groups. The allelic and genotypic frequencies for both genes between breeds were different (P< 0.05). No differences were observed among genotypes for ESR gene, TNB and LWB were better on AB vs. AA. L was showed to be better to Y and D in NW and WW. In PRLR gene, YL showed the best performance for NBA. AA genotype in D showed the best performance for NWP but no differences were found among genotypes. Differences in first parity were observed between genotypes for TNB, with highest value in BB (10.40 piglets) for PRLR gene. The replacement of B for A allele in ESR gene at TNB, NW and LWB was 0.29 and 0.12 piglets and 0.25 kg respectively, but not different from zero (P> 0.05). In general for PRLR gene, additive effect per allele A resulted in a negative increase of 2.26 pigs (TNB), and positive of 0.42 kg (LWB) per litter. For TNB and LWB, dominance effect was -2.67 pigs and -0.56 kg, respectively.Tesis ( Doctorado en Ciencias, especialista en Ganadería).- Colegio de Postgraduados, 2008.PROMEP-CONACY

Evaluación de los componentes del manejo antes, durante y después de la matanza y su asociación con la presencia de carne DFD en bovinos del noreste de México

A total of 27 management variables (before, during and after slaughter) in 394 bovines were analyzed and used to determine their association and explanatory value with the presence of DFD (Dark, Firm, Dry) beef, using probability ratios in a multiple logistic regression model. The study was conducted from November 2016 to August 2017 on a Federal Inspection Type slaughterhouse located in northeastern Mexico. The presence of DFD beef was 13.45%. A contrast was made between classes for the factors evaluated by means of Student’s t and Chi-square according to the nature of the variable as a criterion for inclusion in logistic modeling. Ten of the variables showed statistical significance (P<0.05) in these tests, but only four of them presented explanatory value in the final multiple logistic model (P<0.01), which were: the waiting time prior to death, poor desensitization, the thickness of the subcutaneous fat and pH differential of the carcass established with 24 h of difference. The first two increased the possibility in the presence of DFD beef, on the contrary, the fat thickness and pH differential were inversely proportional. The four variables included in the final model were present at different stages and are of a different nature. For this reason, to effectively prevent this problem, a multicausal evaluation is needed throughout the slaughter process.Un total de 27 variables de manejo (antes, durante y después del sacrificio) en 394 bovinos fueron analizadas y utilizadas para determinar su asociación y valor explicativo con la presencia de carne DFD (Dark, Firm, Dry, por sus siglas en inglés), mediante las razones de probabilidad en un modelo de regresión logística múltiple. El estudio se realizó de noviembre de 2016 a agosto de 2017 en un rastro Tipo Inspección Federal localizado en el noreste de México. La presencia de carne DFD fue del 13.45 %. Se realizó un contraste entre clases para los factores evaluados mediante t Student y Ji cuadrada en función de la naturaleza de la variable como criterio de inclusión en la modelación logística. Diez de las variables mostraron significación estadística (P<0.05) en estas pruebas, pero solo cuatro de ellas presentaron valor explicativo en el modelo logístico múltiple final (P<0.01), las cuales fueron: el tiempo de espera previo a la muerte, un mal insensibilizado, el espesor de la grasa subcutánea y diferencial de pH de la canal establecido con 24 h de diferencia. Las dos primeras aumentaron la posibilidad en la presencia de carne DFD, por el contrario, el espesor de grasa y el diferencial de pH fueron inversamente proporcionales. Las cuatro variables incluidas en el modelo final estuvieron presentes en diferentes etapas y son de naturaleza distinta. Por esta razón, para prevenir de manera efectiva este problema se necesita una evaluación multicausal en todo el proceso de matanza