인간 대장암 세포주에 대한 선택적 CDK4/6 억제제의 항종양효과와 작용기전에 대한 연구

학위논문 (박사) -- 서울대학교 대학원 : 의과대학 의학과, 2021. 2. 김지현.Purpose: Colorectal cancer (CRC) is the third most common cancer and the second highest cause of cancer related mortality worldwide. Selective cyclin dependent kinase (CDK) 4/6 inhibitors have been evaluated as promising therapeutic strategy in many cancers. However, targeting cell cycle regulation in colorectal cancer has not been fully evaluated. The aim of our study was to investigate the anti-tumor activity of the selective CDK4/6 inhibitors and to explore the mechanism of action of selective CDK4/6 inhibitors in human CRC cell lines. Materials and Methods: We investigated the anti-proliferative efficacy of selective CDK4/6 inhibitors, palbociclib, abemaciclib, and ribociclib. With the most potent selective CDK4/6 inhibitor, we explored the mechanism of anti-proliferative activity and optimal combination agents with a synergistic interaction in colorectal cancer cell lines. To identify the possible predictive biomarkers for selective CDK4/6 inhibitors, multiple in vitro models of colorectal cancer cell lines were used. Tumor xenograft model of human colorectal cancer cell lines were established using athymic nude mice for in vivo validation. Results: Growth inhibition assay with multiple colorectal cancer cell lines revealed that abemaciclib was the most potent among the three selective CDK4/6 inhibitors tested. Abemaciclib monotherapy inhibited cell cycle progression and proliferation especially in Caco-2 and SNU-C4 cells. CDK2-cyclin E complex mediated Rb phosphorylation and AKT phosphorylation appeared to be potential resistance mechanisms to abemaciclib monotherapy. Abemaciclib/BYL719 (selective PI3K p110α inhibitor) combination therapy demonstrated synergistic effects regardless of PIK3CA mutation status but showed greater efficacy in the PIK3CA mutated SNU-C4 cell line. Growth inhibition, cell cycle arrest, and migration inhibition were confirmed as mechanisms of action for this combination. In a mouse xenograft model with SNU-C4 cell line harboring PIK3CA mutation, abemaciclib/BYL719 combination resulted in tumor growth inhibition and apoptosis with tolerable toxicity. Conclusion: Abemaciclib showed anti-tumor activity in human colorectal cancer cell lines and dual blockade of PI3K p110α and CDK4/6 showed synergistic anti-tumor effects in vivo and in vitro. PIK3CA mutation could be an additional predictive marker for the efficacy of abemaciclib in combination with BYL719. These findings provide novel insight into a possible therapeutic strategy for patients with metastatic CRC.목적: 대장암은 전 세계적으로 세 번째로 흔한 악성종양이며, 대장암으로 인한 사망률은 암사망률 중 두 번째로 높은 것으로 알려져 있다. 이미 다양한 악성 종양에서 암세포의 세포주기를 조절하는 선택적 CDK4/6 억제제가 새로운 치료적 대안으로 떠오르고 있음에도 불구하고, 아직까지 대장암의 치료에 있어 세포주기를 조절하는 약제에 대한 연구는 부족한 실정이다. 본 연구는 대장암 세포주에서 선택적 CDK4/6 억제제의 항종양효과를 확인하고, 약물의 작용기전을 탐구하기 위해 설계 되었다. 재료 및 방법: 대장암 세포주에 대하여 세 가지 선택적 CDK4/6 억제제들 (palbociclib, abemaciclib, ribociclib)의 항종양효과를 확인하였다. 그 중 가장 효과적인 선택적 CDK4/6 억제제를 가지고 대장암 세포주에 대한 약물의 작용 기전을 탐구하고 최적의 병합요법제제를 찾아내기 위한 실험을 진행하였다. 최종적으로 무흉선 누드 마우스를 사용한 종양이종이식모델을 통해 체내에서의 병합 요법의 효과를 확인하였다. 결과: 다양한 대장암 세포주에 대한 종양 성장 억제 실험을 통해 선택적 CDK4/6 억제제인 palbociclib, abemaciclib, ribociclib 중 abemaciclib이 다른 선택적 CDK4/6억제제에 비해 가장 강력한 항종양효과를 가지는 것으로 확인되었다. KRAS 의 돌연변이가 없는 대장암 세포주들이 KRAS돌연변이를 가진 세포주에 비해abemaciclib 에 감수성을 보이는 경향도 확인하였다. 실험에 사용된 대장암 세포주 중Abemaciclib에 가장 감수성이 높은 Caco-2 와 SNU-C4 대장암 세포주에서 확인한 결과 abemaciclib은 단독 사용 시 세포 주기의 진행 및 세포의 증식을 억제하였다. 또한, abemaciclib 단독 치료에 대한 치료 저항성 발생과정에 CDK2-cyclin E 복합체에 의한 Rb 인산화와 AKT 인산화가 관여하고 있음을 확인하였다. Abemaciclib과 BYL719 (선택적 PI3K p110α 억제제)의 병합요법은 abemaciclib 단독 치료의 저항 발생 기전을 극복할 수 있는 가능한 병합요법임을 체외 및 체내 실험 모델을 통해 확인하였다. Abemaciclib과 BYL719의 병합효과는 PIK3CA 돌연변이가 있는 대장암 세포주에서 더 두드러지게 나타났다. 이 병합요법은 세포성장 억제, 세포주기정지, 세포이동억제 등의 기전을 통해 항종양효과를 나타내는 것으로 체외 실험을 통해 밝혀졌다. PIK3CA 돌연변이가 있는SNU-C4 대장암 세포주를 가지고 만든 종양이종이식 모델에서는 abemaciclib과 BYL719의 병합요법이 적절한 독성 범위 내에서 종양의 성장 억제뿐만 아니라 암세포의 세포자멸사를 유도하는 것을 관찰할 수 있었다. 결론: Abemaciclib 단독 요법은 인간 대장암 세포주에서 항 종양효과를 가지는 것으로 확인되었다. 또한, 선택적 PI3K p110α 와CDK4/6의 이중 억제는 인간 대장암 세포주에서 항종양 효과를 상승시키는 것으로 나타났다. PIK3CA 돌연변이는 이 병합요법에 대한 반응을 예측할 수 있는 추가적인 생물학적 표지자로서의 가능성을 보여 주었다. 선택적 PI3K p110α 와CDK4/6의 이중 억제는 진행성 대장암을 가진 환자들에게 필요한 새로운 치료적 대안을 제시할 수 있을 것으로 보인다.Abstract …………………………………………………………………………… i Contents …………………………………………………………………………… iv List of figures …………………………………………………………………… vii List of tables ……………………………………………………………………… ix List of abbreviations and symbols ……………………………………………… x Introduction ……………………………………………………………………… 1 Materials and methods Materials ………………………………………………………………………… 4 Cell culture ……………………………………………………………………… 5 Cell proliferation assay ………………………………………………………… 5 Colony-forming assay …………………………………………………………… 6 Cell migration assay …………………………………………………………… 6 Cell cycle analysis ……………………………………………………………… 7 Combination index analysis …………………………………………………… 7 Western blot analysis …………………………………………………………… 8 Mouse xenograft ………………………………………………………………… 9 Immunohistochemistry ………………………………………………………… 10 Apoptosis assay ………………………………………………………………… 11 Statistical analysis …………………………………………………………… 11 Results Abemaciclib is the most potent selective CDK4/6 inhibitor in human colorectal cancer cell lines …………………………………………………………………13 Abemaciclib differentially regulates cell proliferation depending on cyclin D1 and p16 expression in colorectal cancer cell lines …………………………… 17 Abemaciclib and BYL719 combination shows synergistic anti-proliferative activity in PIK3CA mutated cell lines ………………………………………… 25 Abemaciclib and BYL719 combination induces G0/G1 phase arrest and alters regulatory protein expression in Caco-2 and SNU-C4 cell lines …………………………………………………………………………………… 33 Abemaciclib and BYL719 combination inhibits colony-forming activity and cell migration ………………………………………………………………… 37 Abemaciclib and BYL719 combination inhibits tumor growth and induces apoptosis in vivo ……………………………………………………………… 41 Discussion ……………………………………………………………………… 49 References ……………………………………………………………………… 57 국문초록 ………………………………………………………………………… 67Docto

식물성 대체 음료의 소비에 영향을 미치는 요인

학위논문(석사) -- 서울대학교대학원 : 농업생명과학대학 농경제사회학부(지역정보학전공), 2023. 2. 문정훈.As the recent trend of interest in environmental impact and sustainability, personal health, and animal welfare issues has grown, plant-based alternative beverages have become increasingly popular and sophisticated. This study examines the key factors that influence the consumption of plant-based alternative beverages. Essay 1 aims to investigate how the consumption situations, consumer characteristics, and food pairing patterns differ based on milk selection, namely cow milk and plant-based milk. To accomplish the aim of the essay 1, food diary data with 117,728 cases were used for the main study and the follow-up tests. The main study investigated the consumer characteristics and drinking situations of milk and plant-based milk using the probit model. The follow-up tests investigated what kinds of food were mainly taken with milk and plant-based milk through decision tree analysis. The results show consumers who drink plant-based milk are more likely to be older, female, have fewer family members, have adult children than younger children, have lower incomes and live in the capital area, compared to consumers who drink milk. Compared to the drinking situation of milk, the drinking situation of plant-based milk is more likely to take place on the move. When people drink plant-based milk, they are likely to have eggs, bananas, sweet potatoes and nuts, while when people drink milk, they are likely to have cereals, bananas and various types of bread. These findings provide marketers and retailers a stepping stone for developing an account for marketing strategies associated with plant-based milk. This study is the first empirical study to compare food pairing patterns between milk and plant-based milk, which extends the scope of food pairing studies with new method. Essay 2 aims to find the factors affecting consumer intention to purchase lattes using alternative milk from plant-based sources, and to compare the links between the factors and purchase intentions depending on two labels, vegan latte and plant-based latte. Based on a literature review, it proposes antecedent factors influencing the purchase intention of plant-based lattes, such as perceived health/sustainability/reputational benefits, food snobbery, food curiosity, food variety-seeking, and vegetarian stigma. An online and scenario-based experiment was conducted with a between-subjects design, followed by a survey. Two different labels were used in the experiment: a plant-based label and a vegan label. In both groups, the results show that the perceived benefits have a positive significant effect on purchase intention, but the perceived barrier (i.e., vegetarian stigma) does not. Perceived benefits and preference are higher when showing a plant-based latte label focusing on the presence of plant-based ingredients than when showing a vegan latte label focusing on the absence of animal-based ingredients. However, there is no significant difference between purchase intentions depending on the label. For the label vegan latte, even if consumers are non-vegan, the higher their food curiosity, food snobbery, and food variety-seeking tendency, the higher their purchase intention. Therefore, vegan certifications can also work in marketing. We suggest to marketers and menu developers what needs to be highlighted and which consumers to target in order to boost sales of latte using alternative milk. The findings also emphasize the potential for labels to promote the purchase intention of lattes using alternative milk, offering a strategy for changing consumer behavior.최근 환경 및 지속가능성, 개인건강, 동물복지 이슈 등에 대한 관심이 높아지면서 식물성 대체음료의 수요는 증가하고 있다. 본 연구에서는 식물성 대체음료의 소비에 영향을 미치는 주요 요인을 분석한다. 에세이 1은 기존의 소 우유와 식물성 우유에 따라 소비 상황, 소비자 특성, 식품 페어링 패턴이 어떻게 달라지는 것을 탐색하기를 목적으로 한다. 이를 위해 본 연구(Main study)와 후속 테스트(Follow-up tests)을 위해 푸드다이어리 데이터를 활용하였다. 본 연구는 프로빗 모델을 통해 우유/식물 기반 우유의 소비자 특성과 음주 상황을 분석한다. 후속 테스트는 의사결정나무 분석을 통해 기존 우유/식물성 우유와 함께 주로 어떤 종류의 음식을 섭취하는지 조사한다. 그 결과 식물성 우유를 더 많이 마시는 소비자들은 우유를 마시는 소비자들에 비해 나이가 많고, 여성이 많고, 가족 구성원이 적으며, 어린 아이들보다 성인 자녀를 낳고, 소득이 낮고, 수도권에 거주할 가능성이 더 높은 것으로 나타났다. 또한, 우유의 음용 상황에 비해 식물성 우유의 음용 상황은 이동 중에 발생할 가능성이 높다. 식물성 우유를 마실 때 달걀, 바나나, 고구마, 견과류를 함께 먹는 반면, 우유를 마실 때는 시리얼, 바나나, 다양한 종류의 빵을 함께 먹는 경향이 있다. 이러한 발견은 마케팅 담당자와 영양 관련 실무자들이 식물성 우유와 관련된 마케팅 전략 및 식생활 가이드라인을 개발할 수 있는 발판을 제공한다. 본 연구는 우유와 식물성 우유의 식품 페어링 패턴을 비교한 최초의 실증 연구로, 식품 페어링 연구의 범위를 방법으로 확장하였다. 에세이2는 식물성 원료의 대체 우유를 이용한 라떼 구매의도에 영향을 미치는 요인을 찾고, '비건 라떼'와 '식물성 라떼'라는 두 가지 라벨에 따라 요인과 구매의도 간의 연관성을 비교하는 것을 목적을 목적으로 한다. 문헌 검토를 바탕으로 지각된 건강/지속가능성/평판적 이익, 음식 속물 성향, 음식 호기심, 음식 다양성 추구, 채식주의자 낙인 등 식물 기반 라떼의 구매 의도에 영향을 미치는 선행 요인을 제안한다. 온라인과 시나리오 기반의 실험을 피실험자 간 설계로 수행한 후 설문조사를 실시하였고, 실험에는 두 가지 비건(Vegan)과 식물성(Plant-based)이라는 각기 다른 라벨이 사용되었다. 두 그룹 모두에서 인식된 이익은 구매 의도에 긍정적으로 유의한 영향을 미치지만 인식된 장벽(즉, 채식주의자 낙인)은 그렇지 않다는 것을 보여준다. 동물성 재료가 없는 것에 초점을 맞춘 '비건 라떼' 라벨을 보여줄 때보다 식물성 재료의 존재에 초점을 맞춘 '식물성 라떼' 라벨을 보여줄 때 인지된 이점과 선호도가 더 높다. 다만 라벨에 따라 구매의도에 큰 차이는 없다. '비건 라떼'라는 라벨의 경우 소비자가 비건이 아니더라도 음식에 대한 호기심, 음식 속물 근성, 음식 다양성 추구 성향이 높을수록 구매의도가 높았다. 따라서 비건 인증은 구매의도를 증가시키는 마케팅 방안으로서 효과가 있을 수 있다. 본 연구는 대체 우유를 활용한 라떼 판매를 활성화하기 위해 마케팅 담당자와 메뉴 개발자들에게 어떤 점을 부각시켜야 하는지, 어떤 소비자를 공략해야 하는지 제안한다. 또한 특정 라벨이 대체 우유를 사용하는 라떼의 구매 의도를 촉진할 수 있는 가능성을 강조하여 소비자 행동을 변화시킬 수 있는 전략을 제시한다.I. Essay 1: Understanding the consumption of plant-based milk : Drinking situations and food pairings 8 1. Introduction 8 2. Literature Review 11 2.1 Consumer segmentation 11 2.2 Drinking situations 12 2.3 Food pairing patterns 14 3. Main study 15 3.1 Materials and methods 15 3.2 Results 21 4. Follow-up tests 26 4.1 Material and methods 27 4.2 Results 28 5. Discussion 30 5.1 Practical implications 31 5.2 Academic implications 33 5.3 Limitations and future research 34 6. Conclusion 35 II. Essay 2: Purchasing vegan latte or plant-based latte : Label communications toward sustainability 37 1. Introduction 37 2. Literature review and hypothesis development 39 2.1 Perceived benefits and preference for vegan/plant-based lattes 39 2.2 Food snobbery, curiosity, and variety-seeking 42 2.3 Vegetarian stigma 43 2.4 Label communication for plant-based alternative products 44 3. Research methods 46 3.1 Data collection 46 3.2 Experimental design and materials 48 3.3 Statistical analysis 51 4. Results 51 4.1 Confirmatory factor analysis (CFA) 51 4.2 Differences in perceived benefits, preference, and purchase intention by labeling 52 4.3 Assessment of the structural model 53 4.4 Multigroup analysis of the vegan and plant-based labels 56 5. Discussion 57 5.1. Factors associated with purchase intention of latte using alternative milk 58 5.2. Different perceptions depending on labels: Comparison between "vegan" and "plant-based" 60 5.3. Limitations and future research 62 6. Conclusion 63 Appendix 65 Appendix A. Cronbach's alpha, rho A, construct reliability (CR), and average variance extracted (AVE) 65 Appendix B. Correlations of the latent variables and the square root of AVE 66 Appendix C. Items with statements used for each construct 68 Appendix D-1. Cross-loading in the vegan latte group 71 Appendix D-2. Cross-loading in the plant-based latte group 73 Bibliography 75 Abstract in Korean 110 Figures Figure 1. Decision tree classification of food pairing with milk 29 Figure 2. Decision tree classification of food pairing with plant-based milk 30 Figure 3. Research model and hypothesized relationships 39 Figure 4. Information offered to respondents as stimuli 51 Figure 5. Structural model results in the VGL group 55 Figure 6. Structural model results in the PBL group 55 Tables Table 1. Participant properties of Case 1 16 Table 2. Literature review of socio-demographic, situational, and contextual factors affecting beverage consumption behaviour 19 Table 3. Frequency of consumption by situation and context in Case 1 19 Table 4. Frequency of consumption by situation in Case 2 20 Table 5. Probit results: Determinants of milk consumption 23 Table 6. Probit results: Determinants of plant-based milk consumption 25 Table 7. Properties of the sample 47 Table 8. Differences in perceived benefits, preference, and purchase intention between the vegan label group and the plant-based label group 53 Table 9. Multigroup analysis results for structural models of preference and purchase intention using Smith-Satterthwaite t-test 56석

대동맥판만협착증 환자에서 당뇨에 의한 혈장단백체의 변화 및 심근의 재형성과 예후와의 관련성 연구

학위논문(박사) -- 서울대학교대학원 : 의과대학 의학과, 2022. 8. 김용진.Background: It is unclear whether and how diabetes mellitus may aggravate myocardial fibrosis and remodeling in the pressure-overloaded heart. We investigated the impact of diabetes on the prognosis of aortic stenosis (AS) patients and its underlying mechanisms using comprehensive noninvasive imaging studies and plasma proteomics. Methods: Severe AS patients undergoing both echocardiography and cardiovascular magnetic resonance (CMR) (n=253 of which 66 had diabetes) comprised the imaging cohort. The degree of replacement and diffuse interstitial fibrosis by late gadolinium enhancement (LGE) and extracellular volume fraction (ECV) was quantified using CMR. Plasma samples were analyzed with the multiplex proximity extension assay for 92 proteomic biomarkers in a separate biomarker cohort of severe AS patients (n=100 of which 27 had diabetes). Results: In the imaging cohort, diabetic patients were older (70.4±6.8 vs. 66.7±10.1 years) and had a higher prevalence of ischemic heart disease (28.8% vs. 9.1%), with more advanced ventricular diastolic dysfunction. On CMR, diabetic patients had increased replacement and diffuse interstitial fibrosis (LGE% 0.3 [0.0-1.6] vs. 0.0 [0.0-0.5], p=0.009; ECV% 27.9 [25.7-30.1] vs. 26.7 [24.9-28.5], p=0.025). Plasma proteomics analysis of the biomarker cohort revealed that 9 proteins (E-selectin, interleukin-1 receptor type 1, interleukin-1 receptor type 2, galectin-4, intercellular adhesion molecule 2, integrin beta-2, galectin-3, growth differentiation factor 15, and cathepsin D) are significantly elevated in diabetic AS patients. Pathway over-representation analyses of the plasma proteomics with Gene Ontology terms indicated that pathways related to inflammatory response and extracellular matrix components were enriched, suggesting that diabetes is associated with systemic effects that evoke proinflammatory and profibrotic response to the pressure-overloaded myocardium. During follow-up (median 6.3 years [IQR 5.2-7.2]) of the imaging cohort, 232 patients received aortic valve replacement (AVR) with 53 unexpected heart failure admissions or death. Diabetes was a significant predictor of heart failure and death, independent of clinical covariates and AVR (hazard ratio 1.88, 95% confidence interval 1.06-3.31, p=0.030). Conclusion: Plasma proteomic analyses indicate that diabetes potentiates the systemic proinflammatory and profibrotic milieu in AS patients. These systemic biological changes underlie the increase of myocardial fibrosis, diastolic dysfunction, and worse clinical outcomes in severe AS patients with concomitant diabetes.연구 배경: 대동맥판막협착증에 당뇨병이 동반된 경우, 당뇨병이 심근의 재형성 및 섬유화에 미치는 영향 및 그 기전에 대하여 정확히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서는 당뇨병이 대동맥판막협착증 환자들의 예후에 미치는 영향 및 그 기전에 대하여 비침습적인 영상검사 및 혈장 단백체학(proteomics)을 포괄적으로 이용하여 연구하고자 하였다. 연구 방법: 본 연구는 영상검사 코호트와 바이오마커 코호트를 활용하여 진행하였다. 영상검사 코호트에는 심초음파와 심장자기공명영상을 같이 시행한 중증 대동맥판막협착증 환자 253명(그 중 당뇨 66명)이 포함되었으며, 심근의 대치성 섬유화(replacement fibrosis)와 미만성 간질성 섬유화(diffuse interstitial fibrosis)의 정도를 심장자기공명영상 분석을 통하여 각각 가돌리늄 지연 조영증강(late gadolinium enhancement; LGE) 및 extracellular volume fraction(ECV)으로 정량적으로 측정하였다. 바이오마커 코호트에는 혈액샘플을 채취한 100명의 중증 대동맥판막협착증 환자들(그 중 당뇨 27명)이 포함되었으며, 다중 근접 연장 측정법 (multiplex proximity extension assay)를 이용하여 혈장의 단백체 분석을 진행하였다. 연구 결과: 영상검사 코호트에서 당뇨병이 동반된 대동맥판막협착증 환자들은 비당뇨병 환자들에 비하여 나이가 더 많고 (70.4±6.8 vs. 66.7±10.1세) 허혈성심장질환의 빈도가 더 높았으며 (28.8% vs. 9.1%), 심초음파 상 더 진행된 좌심실 이완기능 장애를 보였다. 심장자기공명영상에서 당뇨병 환자들은 심근의 대치성 및 간질성 섬유화 모두 증가된 소견이 확인되었다 (LGE% 0.3 [0.0-1.6] vs. 0.0 [0.0-0.5], p=0.009; ECV% 27.9 [25.7-30.1] vs. 26.7 [24.9-28.5], p=0.025). 바이오마커 코호트의 혈장 단백체 분석을 통하여 당뇨병이 동반된 대동맥판막협착증 환자들의 혈중에서 9개의 단백질(E-selectin, interleukin-1 receptor type 1, interleukin-1 receptor type 2, galectin-4, intercellular adhesion molecule 2, integrin beta-2, galectin-3, growth differentiation factor 15, and cathepsin D)이 유의하게 증가되어 있음을 확인하였다. Gene ontology terms를 이용한 혈장 단백체의 과발현 경로 분석 (pathway over-representation analysis) 시, 염증 반응 및 세포외기질과 관련된 경로들의 발현이 유의하게 증가한 것으로 나타났다. 이러한 결과는 당뇨병이 전신적인 효과를 통하여 압력 과부하 상태인 심근에서 염증 및 섬유화를 증가시키는 역할을 한다는 것을 시사한다. 영상검사 코호트를 6.3년간 (중앙값 6.3년, 사분위수범위 5.2-7.2년) 추적 관찰하였을 때, 232명(91.7%)이 대동맥판막치환술을 받았으며 심부전으로 인한 입원 또는 사망이 53명 있었다. 당뇨병은 다른 임상적 공변량들이나 대동맥판막치환술의 여부와 무관하게 심부전 및 사망의 발생의 유의한 예측인자로 확인되었다. 결론: 혈장 단백체 분석에 따르면 당뇨병은 대동맥판막협착증 환자들에서 전신적인 염증 및 섬유화 반응을 강화시킨다. 이러한 전신적 생물학적인 변화는 당뇨병이 동반된 대동맥판막협착증 환자들에서 나타나는 심근 섬유화의 증가, 이완기능장애의 진행 및 불량한 예후의 기저에 있다.Chapter 1. Introduction 1 1.1. Study background 1 1.2. Purpose of research 2 Chapter 2. Methods 3 2.1. Study population 3 2.2. Echocardiographic evaluation 8 2.3. Cardiac magnetic resonance analysis 8 2.4. Plasma proteomics assay 12 2.5. Clinical outcome assessment 18 2.6. Statistical analysis 18 Chapter 3. Results 20 3.1. Demographic and clinical characteristics according to the presence of diabetes 20 3.2. Increased risk of myocardial fibrosis on noninvasive imaging in diabetic AS patients 20 3.3. Upregulation of the proinflammatory and profibrotic pathways in the plasma proteome of diabetic AS patients 36 3.4. Clinical outcomes according to the presence of diabetes 53 Chapter 4. Discussion 58 4.1. Myocardial remodeling and poor prognosis in AS patients with diabetes 58 4.2. Systemic proinflammatory and profibrotic response as the main pathophysiological process in AS patients with diabetes 60 4.3. Clinical implications and future direction 62 4.4. Study limitations 63 4.5. Conclusions 63 Bibliography 65 Abstract in Korean 72박

소아 유두상 갑상선암의 유전체 및 전사체 데이터 통합 분석

학위논문(박사) -- 서울대학교대학원 : 의과대학 의과학과, 2023. 2. 김종일.Recently, due to the development of next-generation sequencing (NGS) technology, cancer genome research has significantly improved our understanding of the mechanisms of cancer development. Information on the molecular characteristics of pediatric papillary thyroid cancer (PTC) as distinct from adult PTC is important for developing new molecularly targeted therapies to treat progressive radioiodine-refractory PTC. PTC samples from 106 pediatric patients (age: 4.3–19.8 years; 22 boys) who attended Seoul National University Hospital (January 1983–March 2020) were available for genomic profiling. Previous transcriptome data from 125 adult PTCs were used for comparison. Genetic drivers were found in 80 tumors; 31 with fusion oncogenes (RET in 21, ALK in 6, and NTRK1/3 in 4), 47 with point mutations (BRAFV600E in 41, TERTC228T in 2, and DICER1 variants in 5), and 2 with amplifications. Fusion-oncogene PTCs, predominantly detected in younger patients, presented with a more advanced stage and showed more recurrent or persistent disease than BRAFV600E PTCs, which were detected mostly in adolescents. Pediatric fusion PTCs (in those aged < 10 years) showed lower expression of thyroid differentiation genes, including SLC5A5, than adult fusion PTCs. Two girls with progressive 131I-refractory lung metastases harboring a TPR-NTRK1 or CCDC6-RET fusion received fusion-targeted therapy; larotrectinib and selpercatinib decreased the tumor extent and restored radioiodine uptake. The girl with the CCDC6-RET fusion received 131I therapy combined with selpercatinib, leading to a tumor response. In vitro 125I uptake and 131I clonogenic assays showed that larotrectinib inhibited growth and restored radioiodine avidity. In pediatric fusion-oncogene PTC cases with 131I-refractory advanced disease, selective fusion-directed therapy may restore radioiodine avidity and lead to a dramatic tumor response, underscoring the importance of molecular testing in pediatric PTC patients. * The study was published in NTRK and RET fusion-directed therapy in pediatric thyroid cancer yields a tumor response and radioiodine uptake. Journal of Clinical Investigation. 2021 Sep 15;131(18):e144847 (co-first authors: Young Ah Lee and Hyunjung Lee)최근 차세대 시퀀싱(NGS) 기술의 발달로 인해 암 게놈 연구는 암 발생 메커니즘에 대한 이해를 크게 향상시켰다. 성인 PTC와 구별되는 소아 유두 갑상선암(PTC)의 분자 특성화는 방사성요오드 치료저항성을 가진 PTC에 대한 분자 표적 치료법을 개발하는 데 중요하다. SNUH(1983년 1 월~2020년 3월)에 입원한 106명의 소아 환자(연령 범위: 4.3~19.8세, n = 여아 84명, 남아 22명)의 PTC 샘플을 게놈 프로파일링에 사용하였다. 비교를 위해 125개의 성인 PTC 샘플에서 얻은 이전 전사체 데이터를 사용하였다. 우리는 80개의 종양에서 유전자 드라이브를 확인하였으며, 융합 종양유전자가 있는 31개(21명의 환자에서 RET, 6명의 환자에서 ALK, 4명의 환자에서 NTRK1/3), 점 돌연변이가 있는 47명(41명의 환자에서 BRAFV600E, 2명의 환자에서 TERTC228T, 5명의 환자에서DICER1 변이), 2 명의 환자에서 유전자 증폭을 가지고 있었다. 어린 환자에서 BRAFV600E 보다 우세하게 검출되는 융합 종양 유전자 PTC는 더 진행된 단계에 있었고 더 많은 재발성 또는 지속성 질환을 보였다. 10세 미만의 소아 융합PTC는 성인 융합 PTC보다 SLC5A5 를 비롯한 갑상선 분화 유전자의 발현이 더 낮았습니다. 각각 TPR-NTRK1 또는 CCDC6-RET 융합 종양유전자를 가진 진행성 131I-불응성 폐 전이가 있는 2명의 환자가 융합 표적 요법을 받았으며, larotrectinib과 selpercatinib은 종양의 크기를 줄이고 125I 방사성 요오드 흡수를 회복하였다. CCDC6-RET 융합 종양유전자를 가진 환자는 셀퍼카티닙과 결합된 131I 요법을 받았고, 그 결과 종양 반응이 나타났다. 125I 흡수 및 131I clonogenic assays는 larotrectinib이 종양 성장을 억제하고 방사성 요오드 결합력을 회복시키는 것으로 나타났다. 방사성요오드 치료저항성이 있는 융합 종양유전자 PTC를 가진 소아 환자 에서 선택적 융합 유도 요법은 방사성 요오드 결합력을 회복시키고 극적인 종양 반응을 유발할 수 있으므로 소아 PTC 환자에서 분자 검사의 중요성을 강조하고 있다.Introduction 1 Material and Methods 5 Results 10 Discussion 93 Acknowledgments 97 References 98 Abstract in Korean 106박

중국 농촌의 자살 현상에 관한 의료인류학적 분석: 구조적 폭력과 체현 개념을 중심으로

중국의 자살은 거대한 인구 규모 뿐 아니라 독특한 성별·지역별 자살률 패턴으로 인해 많은 학자들의 관심을 받아왔다. 본 연구는 그동안 정신의학적 혹은 사회학적 접근 방식으로 충분히 설명되지못한 중국 자살률의 독특한 패턴의 원인을 추가적으로 파악하고자 중국 하북성 마을에서 2004년부터 2013년까지 다양한 민족지적 연구방법?참여관찰, 비공식적 면담, 심층면담, 생애이야기 수집, 초점집단 연구, 문헌 분석?을 사용하여 인류학적 현장연구를 실시하였다. 그리고 연구를 통해 획득한 자료를 구조적 폭력 및 체현 개념을 활용하여 분석하였다. 결론적으로, 중국 농촌 여성들의 높은 자살률은 빈곤 및 가부장적 억압이 구조적 폭력으로 작용하는 사회문화적 환경 속에서, 삶 속에서 여성의자살 행위를 자주 접해 온 농촌의 여성들이 문화적 체현과정을 통해 자연스럽게 자살을 특정 상황에서 선택 가능한 대응 방식으로 인식하게 되었기 때문이라고 주장한다.OAIID:oai:osos.snu.ac.kr:snu2013-01/102/2011003842/2SEQ:2PERF_CD:SNU2013-01EVAL_ITEM_CD:102USER_ID:2011003842ADJUST_YN:YEMP_ID:A079114DEPT_CD:206FILENAME:중국 농촌의 자살 현상에 관한 의료인류학적 분석.pdfDEPT_NM:인류학과EMAIL:[email protected]_YN:NCONFIRM:

The relationship between diverticulosis and colorectal neoplasia: A meta-analysis

BACKGROUND/AIMS: Diverticulosis and colorectal neoplasia share epidemiological trends and risk factors which are common in Western countries and incidences increase with age. However, the data on an association between diverticulosis and colorectal neoplasia are conflicting. Thus, we performed a meta-analysis to evaluate whether diverticulosis is associated with colorectal neoplasia. METHODS: A systematic literature search of PubMed, EMBASE, Cochrane Library, Web of Science, and SCOPUS was conducted to identify studies that investigated the association between diverticulosis and advanced colorectal neoplasia (advanced adenoma, colorectal cancer), adenomas, or polyps. The demographic characteristics of patients, including age, gender, indication for colonoscopy, confounding factors, and outcomes of colorectal neoplasia were assessed. RESULTS: We identified 29 cross-sectional studies (N = 450,953) that investigated the association between diverticulosis and colorectal neoplasia. The meta-analysis found that diverticulosis was not associated with advanced colorectal neoplasia (odds ratio [OR] 0.98, 95% confidence interval [CI] 0.63-1.50). Although there was a positive correlation between diverticulosis and adenomas (OR 1.47, 95% CI 1.18-1.84) and diverticulosis and polyps (OR 1.95, 95% CI 1.15-3.31), diverticulosis did not increase the risk of adenomas (OR 1.34, 95% CI 0.87-2.06) in patients who underwent screening colonoscopy. Moreover, all the increased risk of colorectal neoplasia in patients with diverticulosis was observed in published studies only, and not in unpublished ones. CONCLUSIONS: This meta-analysis demonstrated that diverticulosis is not associated with an increased risk of advanced colorectal neoplasia. Although diverticulosis was associated with a higher risk of polyps and adenomas, the risk was not increased in screening populations. Moreover, the increased risk of colorectal neoplasia in patients with diverticulosis was observed only in published studies and not in unpublished ones.ope

G단백질 알파 12에 의한 암세포와 혈관내피세포의 epigenetic 조절

의과대학/박사Heterotrimeric guanine nucleotide binding proteins (G proteins) transmit a variety of extracellular signals from cell surface G protein-coupled receptors (GPCRs) to intracellular effector molecules. Gα12/13-mediated signals formed networks with other signaling proteins at various levels, from cell surface receptors to transcription factors, to regulate cellular responses. The G12 subfamily is composed of Gα12 and Gα13. Accumulating evidence indicates that Gα12/13-mediated signaling pathways are involved in a variety of physiological processes, including embryonic development, cell growth, cell polarity and migration, angiogenesis, platelet activation, immune response, apoptosis, and neuronal responses. Epigenetic mechanisms denote gene expression variability without coding sequence alteration. Epigenetic machinery includes DNA methylation, histone modifications and regulation of gene expression posttranscriptionally by small, non-coding RNA molecules. Epigenetic modifications play essential roles in the regulation of gene expression and are important in mammalian development and disease processes. In this study aim to examine whether Gα12 signaling pathway regulates epigenetic modification and to evaluate this change has any physiological meaning. In Part Ⅰ, we investigated Gα12 action on apoptosis which is mediated by epigenetic modification of XAF1 promoter in NSCLCs. Basal XAF1 mRNA level was very weakly detected in NSCLCs. However, XAF1 expression was restored in A549 cells when blocked Gα12 signal. According to data from MSP and MeDIP, XAF1 promoter methylation was reduced by siGα12. In our data shown that siGα12 was enhanced demethylation of XAF1 promoter and was induced apoptosis. In Part Ⅱ, we aimed to investigate the effect of Gα12 on cellular proliferation and its underlying mechanism in HepG2 human hepatoma cells. p16 expression was significantly enhanced in HepG2 cells after siGα12 transfection. From MSP, MeDIP and DNMT1 expression data, we can show that Gα12 regulates p16 expression by epigenetic modification mechanism, by inducing DNMT1 expression and activation. Therefore, Gα12 siRNA inhibits the proliferation of HepG2 cells by upregulating p16 expression, suggesting that the abnormal proliferation of HepG2 cells might be resulted from Gα12 signaling to suppress p16 expression of HepG2 hepatoma cells. In part Ⅲ, we aimed to investigate the role of Gα12 in serum withdrawal -induced apoptosis of HUVECs, and its underlying mechanisms. Gα12 siRNA markedly increased the serum deprivation-induced apoptosis of HUVECs. Because miR-155 has been reported to regulate apoptosis of HUVECs, we examined apoptotic effect of Gα12 on the miR-155 expression. Results indicated that Gα12 regulates the apoptosis of vascular endothelial cells by regulating miR-155 expression. These results suggest that Gα12 protects vascular endothelial cells against vascular injuries causing endothelial dysfunction by regulating miR-155 expression. From these results, we conclude that Gα12 regulates epigenetic modification in cancer cell and vascular endothelial cells.ope

Machine learning reveals sex-specific associations between cardiovascular risk factors and incident atherosclerotic cardiovascular disease

We aimed to investigate sex-specific associations between cardiovascular risk factors and atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) risk using machine learning. We studied 258,279 individuals (132,505 [51.3%] men and 125,774 [48.7%] women) without documented ASCVD who underwent national health screening. A random forest model was developed using 16 variables to predict the 10-year ASCVD in each sex. The association between cardiovascular risk factors and 10-year ASCVD probabilities was examined using partial dependency plots. During the 10-year follow-up, 12,319 (4.8%) individuals developed ASCVD, with a higher incidence in men than in women (5.3% vs. 4.2%, P < 0.001). The performance of the random forest model was similar to that of the pooled cohort equations (area under the receiver operating characteristic curve, men: 0.733 vs. 0.727; women: 0.769 vs. 0.762). Age and body mass index were the two most important predictors in the random forest model for both sexes. In partial dependency plots, advanced age and increased waist circumference were more strongly associated with higher probabilities of ASCVD in women. In contrast, ASCVD probabilities increased more steeply with higher total cholesterol and low-density lipoprotein (LDL) cholesterol levels in men. These sex-specific associations were verified in the conventional Cox analyses. In conclusion, there were significant sex differences in the association between cardiovascular risk factors and ASCVD events. While higher total cholesterol or LDL cholesterol levels were more strongly associated with the risk of ASCVD in men, older age and increased waist circumference were more strongly associated with the risk of ASCVD in women. © 2023. The Author(s).ope

Higher body mass index is associated with an increased risk of multiplicity in surveillance colonoscopy within 5 years

We aimed to evaluate whether obesity was associated with a certain clinicopathologic characteristics of metachronous CRA. This retrospective longitudinal cohort study included 2,904 subjects who had at least one resected CRA at index colonoscopy and who subsequently underwent one or more surveillance colonoscopies within 5 years. Of the 2,904 subjects, 60.9% (n = 1,769) were normal, 35.8% (n = 1,040) were overweight, and 3.3% (n = 95) were obese. Patients with any metachronous CRA were 53.7% (n = 1,559). In multivariate analyses, higher BMI at index colonoscopy was significantly associated with any metachronous CRA (overweight, OR = 1.07; obese, OR = 1.82; p for trend = 0.049). Regarding the multiplicity, the ORs of ≥ 3, ≥ 4 and ≥ 5 metachronous CRAs significantly increased as index BMI increased (p for trend < 0.001, = 0.007 and = 0.004, respectively). In negative binomial regression regarding the incidence for total number of metachronous CRA, the higher BMI the subject has at the time of index colonoscopy, the more metachronous CRAs the subject will have at the surveillance colonoscopy (p for trend = 0.016). Higher index BMI was significantly associated with the risk of multiple metachronous CRAs on surveillance colonoscopy within 5 years.ope

The study on detecting inner knots in large cross section timber using X-ray tomosynthesis

학위논문 (석사)-- 서울대학교 대학원 : 농업생명과학대학 산림과학부, 2018. 2. 여환명.본 연구에서는 구조용 대단면 목재의 품질검사 과정에서 적용 가능한 촬영 조건을 정립하고, 단층영상합성법의 단점인 블러를 최소화할 수 있는 필터를 선정하고자 하였다. 디텍터와 선원을 고정시키고 목재를 이동시켜 영상을 획득하는 촬영 조건을 구현하였다. 블러를 제거하기 위해 해닝 필터, 삼각 필터, 바틀렛 필터를 적용한 뒤 촬영 조건을 구현하기 위해 작성한 알고리즘을 이용하여 단면 영상을 재구성하였다. 실제 단면과 재구성된 영상을 비교한 결과 해닝 필터를 사용했을 때 블러와 건전부 간 명도차가 가장 적어 블러가 필터에 의해 다소 제거되었음을 확인하였다. 또한 옹이의 변동계수가 블러에 비해 상대적으로 크게 나타나 옹이가 더 명확하게 구분될 수 있는 것으로 확인되었다. 따라서 대단면 목재의 단면영상촬영법에서는 해닝 필터가 가장 적합한 것으로 사료되었다.1. 서론 1 1-1 연구배경 1 1-2 연구목적 5 2. 연구사 6 2-1 단층영상합성법 6 2-2 디블러링 필터 8 2-3 단층영상합성법 촬영 조건 9 3. 재료 및 방법 13 3-1 공시 재료 13 3-2 X선 실험 장비 16 3-3 실험 방법 18 3-4 영상 처리 22 3-5 필터별 옹이 검출 정확도 분석 31 4. 결과 및 고찰 33 4-1 재구성 영상 획득 33 4-2 필터별 재구성 영상의 정량적 평가 34 5. 결론 49 6. 참고문헌 50 Abstract 53Maste