Radio fiber bursts and fast magnetoacoustic wave trains

We present a model for dm-fiber bursts that is based on assuming fast sausage magnetoacoustic wave trains that propagate along a dense vertical filament or current sheet. Eight groups of dm-fiber bursts that were observed during solar flares were selected and analyzed by the wavelet analysis method. To model these fiber bursts we built a semi-empirical model. We also did magnetohydrodynamic simulations of a propagation of the magnetoacoustic wave train in a vertical and gravitationally stratified current sheet. In the wavelet spectra of the fiber bursts computed at different radio frequencies we found the wavelet tadpoles, whose head maxima have the same frequency drift as the drift of fiber bursts. It indicates that the drift of these fiber bursts can be explained by the propagating fast sausage magnetoacoustic wave train. Using new semi-empirical and magnetohydrodynamic models with a simple radio emission model we generated the artificial radio spectra of the fiber bursts, which are similar to the observed ones.Comment: 7 pages, 10 figure

Fast magnetoacoustic wave trains in magnetic funnels of the solar corona

Context: Fast magneto-acoustic waves are highly dispersive in waveguides, so they can generate quasi-periodic wave trains if a localised, impulsive driver is applied. Such wave trains have been observed in the solar corona and may be of use as a seismological tool since they depend upon the plasma structuring perpendicular to the direction of propagation. Aims. We extend existing models of magnetoacoustic waveguides to consider the effects of an expanding magnetic field. The funnel geometry employed includes a field-aligned density structure. Methods: We performed 2D numerical simulations of impulsively generated fast magneto-acoustic perturbations. The effects of the density contrast ratio, density stratification, and spectral profile of the driver upon the excited wave trains were investigated. Results: The density structure acts as a dispersive waveguide for fast magneto-acoustic waves and generates a quasi-periodic wave train similar to previous models. The funnel geometry leads to generating additional wave trains that propagate outside the density structure. These newly discovered wave trains are formed by the leakage of transverse perturbations, but they propagate upwards owing to the refraction caused by the magnetic funnel. Conclusions: The results of our funnel model may be applicable to wave trains observed propagating in the solar corona. They demonstrate similar properties to those found in our simulations

Variability of chemical composition of apatites from alkaline rocks of the Bohemian Massif

II Abstrakt Náplní této diplomové práce je chemicky a strukturně charakterizovat apatity alkalických hornin Českého masívu. Pro toto studium bylo vybráno 15 vzork vulkanických hornin, které jsou p edevším kenozoického stá í. Vzorek č. 5 je stá í silurského. Vzorek č. 15 pochází ze Slovenska z hornin kenozoického stá í a byl do této práce vybrán pro sv j rozmanitý chemismus. Obsahy hlavních a vedlejších prvk v apatitech byly mě eny na elektronovém mikroanalyzátoru, obsahy některých vedlejších a stopových prvk určeny hmotnostním spektrometrem s indukčně vázaným plazmatem. Vybrané vzorky apatit byly zkoumány katodovou luminiscencí. Strukturně byly apatity charakterizovány Ramanovou spektroskopií a rentgenovou difrakcí. Dominantním aniontem v pozici X je p evážně fluor. U některých vzork jsou významné obsahy OH, jehož množství je ale dopočítáno na základě plně obsazené pozice X. Obsahy Cl jsou obecně nízké, výjimkou je vzorek č. 15, ve kterém dosahují až 0,6 apfu pro Z = 2. Studované apatity obsahují velké množství r zných substitucí, jejichž obsahy jsou ale obecně nízké. V pozici M jsou nejčastějšími a nejvýznamnějšími substituenty za vápník Sr, Fe, REE a u vzork č. 10 a č. 14 Mg. V tetraedricky koordinované pozici je nejvýznamnějším substituentem za fosfor Si. Katodoluminiscenční vlastnosti jsou pravděpodobně...III Summary This thesis is focused on crystal chemistry and crystal structure of apatites from alkaline rock of the Bohemian Massif. Fifteen samples of volcanic rocks, mostly of the Cenozoic age was selected for the study. Sample No. 5 is of the Silurian age. Sample No. 15 originates from volcanic rock of the Cenozoic age from the Slovak Western Carpathians. This sample was chosen for this study due to its substantially different chemical composition. The contents of major and minor elements in apatites were measured on an electron microprobe, the contents of some minor and trace elements were determined by laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry. Selected samples were investigated by cathodoluminescence (CL) spectrometry. Crystal structure of studied apatites was characterized by X-ray diffraction and Raman spectroscopy. It was found that dominant anion at position X is fluorine. The OH content calculated on the basis of the fully occupied position X is significant in some samples. The amount of Cl is generally low. The exception is the sample No. 15 where Cl reached up to 0.6 apfu (Z = 2). Studied apatites contain many substitutions but they are generally of minor extent. Strontium, iron and REE at position M belong to the most common and most important substituents for calcium in...Institute of Geochemistry, Mineralogy and Mineral ResourcesÚstav geochemie, mineralogie a nerostných zdrojůPřírodovědecká fakultaFaculty of Scienc

Solar Radio Bursts with Spectral Fine Structures in Preflares

A good observation of preflare activities is important for us to understand the origin and triggering mechanism of solar flares, and to predict the occurrence of solar flares. This work presents the characteristics of microwave spectral fine structures as preflare activities of four solar flares observed by Ond\v{r}ejov radio spectrograph in the frequency range of 0.8--2.0 GHz. We found that these microwave bursts which occurred 1--4 minutes before the onset of flares have spectral fine structures with relatively weak intensities and very short timescales. They include microwave quasi-periodic pulsations (QPP) with very short period of 0.1-0.3 s and dot bursts with millisecond timescales and narrow frequency bandwidths. Accompanying these microwave bursts, there are filament motions, plasma ejection or loop brightening on the EUV imaging observations and non-thermal hard X-ray emission enhancements observed by RHESSI. These facts may reveal certain independent non-thermal energy releasing processes and particle acceleration before the onset of solar flares. They may be conducive to understand the nature of solar flares and predict their occurrence

Substitution trends in apatites of Cenozoic igneous rocks of the Czech Republic

Tato bakalářská práce je zaměřena na studium krystalochemie apatitů kenozoických vyvřelých hornin České republiky. Náplní práce je určit substituční trendy 23 vzorků apatitů z vybraných magmatických hornin. Vzorky pocházejí převážně z kenozoických vulkanitů Českého středohoří, Doupovských hor a labské vulkano-tektonické zóny. Byla zjištěna vzájemná závislost koncentrace REE (Ce, La, Nd, Sm a také Y) a Si. Tato skupina prvků navíc vykazuje negativní korelaci s koncentracemi Ca a P. Tyto skutečnosti potvrzují existenci podvojné substituce REE, Y a Si. Další část práce se zabývá zpřesněním struktury studovaných apatitů. U části vzorků byla pomocí Rietveldovy metody zpřesněna krystalová struktura. U všech vzorků byly pozorovány odlišné tvary píků u difrakcí od rovin 00l ve srovnání s ostatními difrakcemi. Lze předpokládat, že změna tvarových parametrů byla způsobena rozdílnou velikostí krystalitů v tomto směru. Během zpřesňování se ukázalo, že vzorky A7 a A10 obsahují dva různé apatity, které mají velmi podobné mřížkové parametry. U Vzorku A7 je tato skutečnost způsobena chemickou zonalitu krystalů, konkrétně rozdílnými koncentracemi Ce a La.This bachelor thesis is focused on studying crystal chemistry of apatites of the Cenozoic igneous rocks of the Czech Republic. The main goal of this thesis is to determine the substitution trends in 23 samples of apatites from selected volcanic rocks of České středohoří Mts., Doupovské hory Mts. and the Labe Tectono-volcanic Zone. It was found that contents of REE (Ce, La, Bd, Sm, as well as Y) and Si correlate mutually. In addition to that this group of elements displays the inverse correlation with Ca and P. These observations confirm the coupled substitution of REE, Y and Si. The second part deals with refinement of crystal structures of studied apatites. The crystal structure of selected samples was refined by Rietveld method. All samples displayed different peak shapes for 00l reflections compared to other reflections. It can be assumed that the change of the shape parameters was caused by different size of crystallites in this direction. During the refinement it was found that the samples A7 and A10 contain two different apatites displaying very similar crystal lattice parameters. In the sample A7 this fact is caused by chemical zoning, in particular, by different concentrations of Ce and La.Institute of Geochemistry, Mineralogy and Mineral ResourcesÚstav geochemie, mineralogie a nerostných zdrojůFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Testování křemíkových detektorů pro modernizaci detektoru ATLAS

Cílem bakalářské práce je popis připravovaného experimentu ATLAS Upgrade a jeho porovnání s původním ATLASem, popis připravovaného rutinního testování detektorů a vlastní testování prototypů stripových křemíkových detektorů pro ATLAS Upgrade. Práce je rozdělená do tří kapitol. První kapitola je věnována obecně výzkumnému zařízení CERN, konkrétně současnému detektoru ATLAS, jeho vnitřnímu detektoru a stripovým křemíkovým polovodičovým detektorům. V další části se charakterizuje plánovaný ATLAS Upgrade a opět jeho vnitřní detektor a stripové detektory. V závěru téhle části se nachází přehledné porovnání ATLASu a ATLASu Upgrade. Poslední kapitola se zabývá testováním detektorů, nejdřív rutinnímu testování detektorů v minulosti, pak plánovanému rutinnímu testování a nakonec jsou popsána samotná naše měření prototypů stripových křemíkových detektorů pro ATLAS Upgrade prováděná na FZÚ AV ČR pod vedením Ing. Marcely Mikeštíkové, Ph.D.The main goal of this bachelor thesis is to describe upcoming experiment ATLAS Upgrade and to compare it with present ATLAS, to describe upcoming tests of detectors and our own tests of prototypes of strip silicon detectors for the ATLAS Upgrade. Thesis is divided into three chapters. The first chapter is dedicated to the research facility CERN, specifically the present detector ATLAS, its inner detector and strip silicon detectors. In the next part there is characterized planned detector ATLAS Upgrade and again its inner detector and strip detectors. In the end of this part there is a tabular comparison of ATLAS and ATLAS Upgrade. The last chapter deals with the testing of detectors, at first routine testing of detectors in the past for ATLAS and planned routine tests for ATLAS Upgrade, and finally there are described our own tests of prototype the strip silicon detectors in FZÚ AV ČR supervised by Ing. Marcela Mikeštíková, Ph.D.Institute of Particle and Nuclear PhysicsÚstav částicové a jaderné fyzikyMatematicko-fyzikální fakultaFaculty of Mathematics and Physic

Vazba kultury na sociální prostor Prahy (na příkladu slovenské a maďarské menšiny)

Vzájemná vazba prostoru a kultury je ústřední otázkou disertační práce. K interpretaci této vazby autorka přistupuje prostřednictvím aktuálních atributů etnické identity vybraných cílových skupin, kterými jsou slovenská a maďarská menšina žijící v Praze. Cílem práce je vymezení relevantnosti a unikátního zastoupení prostorového a kulturního fenoménu v rámci současné vazby, včetně určité míry pozorovatelnosti tohoto vzájemného spojení. Hypotéza dizertační práce představuje kulturu jako prostorově nevázanou a fenomén prostoru jako médium, které ovlivňuje intenzitu zájmu o vlastní etnoidentifikační znaky. Ověření této hyptézy autorka uskutečňuje v sociálním a virtuálním prostoru na základě zaznamenaných diskurzů. Diskurzy, roztříděné na tématické kategorie, reprezentují nejčastěji se vyskytující atributy etnicity a etnické identity zkoumaných skupin. V empirické části práce obsažená analýza a intepretace diskurzů je doplněna teorií artikulace. Obsáhlejší vymezení aplikovaných teoretických přístupů, společně s terminologií, výzkumnou metodikou a etikou, resp. netiketou se nachází v teoreticko-metodologické části. Charakteristika Prahy a zvolených cílových skupin, Slováků a slovenských Maďarů, je znázorněna jednak z perspektivy historických a kulturně-společenských událostí a jednak ve smyslu současné...The interrelation between space and culture represents the central question of this doctoral thesis. To interpret this relationship the author approaches the issue by virtue of actual identity attributes of the selected ethnic groups, namely Slovak and Hungarian minorities living in Prague. The aim of the work is to define the relevance and unique representation of the spatial and cultural phenomenon in the context of existing relations, including determining the extent of observability this mutual connection. The hypothesis of this doctoral is to present culture as a spatially unbounded, and the phenomenon of space as a medium, which can influence the intensity of interest in relation to the own ethno-identifying components. The verification of this assumption author carries out within social and virtual space, on the basis of registered discourses. Discourses, sorted into thematic categories, represent the most common attributes of ethnicity and ethnic identity of the given target groups. The empirical part of this thesis contains the analysis and interpretation of the discourses, which are supported with the theory of articulation. More comprehensive definitions of applied theoretical approaches, together with terminology, research methods and ethics or netiquette, are situated in the...Institute of EthnologyÚstav etnologieFilozofická fakultaFaculty of Art

The Application of Massively Parallel Next Generation Sequencing Technologies for Diagnosis of Hereditary Spastic Paraplegia: A Contribution to the Development of DNA Diagnosis of a Highly Heterogeneous Disease

Dizertační práce RNDr. Anna Uhrová Mészárosová Využití masivně paralelního sekvenování nové generace pro diagnostiku hereditární spastické paraparézy Příspěvek k rozvoji DNA diagnostiky vysoce heterogenního onemocnění Školitel: prof. MUDr. Pavel Seeman, Ph.D. Konzultantka: MUDr. Dana Šafka Brožková, Ph.D. Praha, 2018 Souhrn Předkládaná dizertační práce zpracovává výsledky molekulárně genetických vyšetření českých pacientů onemocněním hereditární spastická paraplegie a mapováním genetického pozadí této nemoci u českých pacientů. Hereditární spastická (HSP) je dědičné neurologické onemocnění se všemi typy mendelovské dědičnosti, které se projevuje bilaterální progresivní spasticitou a slabostí dolních končetin a vede k postupně se zhoršující chůzi, u některých pacientů může dojít až k úplné ztrátě schopnosti samostatné chůze. HSP je onemocnění velice heterogenní jak klinicky, tak geneticky. Bylo popsáno přes 90 typů nemoci a přes 70 genů, jejichž patogenní varianty mohou způsobovat tuto nemoc. Onemocnění se většinou projevuje jako tzv. nekomplikovaný typ nemoci, vyskytují se ale i formy komplikované s přidruženými příznaky (mentální retardace, epilepsie, ataxie, atrofie optického nervu, aj.) U souboru 96 českých pacientů s klinickým podezřením na nekomplikovanou HSP, u nichž byl předem vyloučen nejčastější...Doctoral thesis Anna Uhrová Mészárosová, MSc. The Application of Massively Parallel Next Generation Sequencing Technologies for Diagnosis of Hereditary Spastic Paraplegia: A Contribution to the Development of DNA Diagnosis of a Highly Heterogeneous Disease. Prague, 2018 Abstract The aim of this work is to map the genetical spectrum of hereditary spastic paraplegia in Czech patients. Hereditary spastic paraplegia (HSP) is an inherited neurological disorder, clinically characterized by progressive weakness and spasticity of the lower limbs leading to problems with gait and can cause the complete loss of the ability to walk. HSP is clinically and genetically very heterogenous; more than 90 HSP types and pathogenic variants in more than 70 genes have been described to date. HSP manifests as an uncomplicated (pure) form in the majority of HSP patients. Less often it manifests as a complicated phenotype with the associated clinical signs (mental impairment, epilepsy, ataxia, atrophy of the optic nerve). We performed massively parallel sequencing (MPS) of uncomplicated HSP gene panel in a group of 96 Czech patients with suspected uncomplicated type of HSP. In all patients the most common HSP type SPG4 was previously excluded. HaloPlex Target Enrichment kit and SureSelect Target Enrichment kit (both Agilent...Klinika dětské neurologieDepartment of Paediatric Neurology2. lékařská fakultaSecond Faculty of Medicin

Modeling of gyrosynchrotron radio emission pulsations produced by MHD loop oscillations in solar flares

A quantitative study of the observable radio signatures of the sausage, kink, and torsional MHD oscillation modes in flaring coronal loops is performed. Considering first non-zero order effect of these various MHD oscillation modes on the radio source parameters such as magnetic field, line of sight, plasma density and temperature, electron distribution function, and the source dimensions, we compute time dependent radio emission (spectra and light curves). The radio light curves (of both flux density and degree of polarization) at all considered radio frequencies are than quantified in both time domain (via computation of the full modulation amplitude as a function of frequency) and in Fourier domain (oscillation spectra, phases, and partial modulation amplitude) to form the signatures specific to a particular oscillation mode and/or source parameter regime. We found that the parameter regime and the involved MHD mode can indeed be distinguished using the quantitative measures derived in the modeling. We apply the developed approach to analyze radio burst recorded by Owens Valley Solar Array and report possible detection of the sausage mode oscillation in one (partly occulted) flare and kink or torsional oscillations in another flare.Comment: ApJ, accepte

Relationship between wave processes in sunspots and quasi-periodic pulsations in active region flares

A phenomenological relationship between oscillations in a sunspot and quasi-periodic pulsations (QPP) in flaring energy releases at an active region (AR) above the sunspot is established. The analysis of the microwave emission recorded by the Nobeyama Radioheliograph at 17 GHz shows a gradual increase in the power of the 3-min oscillation train in the sunspot associated with AR 10756 before flares in this AR. The flaring light curves are found to be bursty with a period of 3 min. Our analysis of the spatial distribution of the 3-min oscillation power implies that the oscillations follow from sunspots along coronal loops towards the flaring site. It is proposed that QPP in the flaring energy releases can be triggered by 3-min slow magnetoacoustic waves leaking from sunspots