Primer informe de Fusarium incarnatum (Desm.) Sacc. afectando al cultivo del garbanzo en Cuba

The objective of the work was to characterize isolates of Fusarium sp. from chickpea (Cicer arietinum L.) morphologically and molecularly. For this, the morphological characterization of the isolates of Fusarium sp. was conducted by using a taxonomic key and, for their molecular identification, DNA extraction, amplification of the translation and elongation factor 1α (tef-1α) gene, purification and sequencing of the amplified fragments were performed. The results allowed reporting the first identification of a new Fusarium species on chickpea in Cuba [Fusarium incarnatum (Desm.) Sacc.], a species belonging to the Fusarium incarnatum-equiseti species complex (FIESC). The Cuban strains were phylogenetically clustered with the FIESC 15 group. This is the first report of F. incarnatum associated with chickpea in Cuba.El trabajo tuvo como objetivo caracterizar morfológica y molecularmente aislamientos de Fusarium sp. procedentes de plantas de garbanzo (Cicer arietinum L.). Para ello, se realizó la caracterización morfológica de los aislados de Fusarium sp. mediante el uso de una clave taxonómica. Para la identificación molecular se realizó la extracción de ADN, amplificación del gen que codifica para el factor de elongación y traducción 1α (tef- 1α), purificación de los fragmentos amplificados y su secuenciación. Los resultados permitieron informar, por primera vez en Cuba, una nueva especie de Fusarium en el garbanzo [Fusarium incarnatum (Desm.) Sacc.], incluida en el clado Incarnatum, que pertenece al complejo de especies Fusarium incarnatum-equiseti (FIESC). Las cepas cubanas se agruparon filogenéticamente con el grupo FIESC 15. Este es el primer informe de F. incarnatum asociado al garbanzo en Cuba

ASSISTÊNCIA DOS PROFISSIONAIS DE ENFERMAGEM AO PACIENTE COM SEPTICEMIA: UM ESTUDO DE REVISÃO INTEGRATIVA

This study aims to describe the assistance provided by nursing professionals to patients with sepsis, according to the literature of the last five years. This is an integrative literature review study. The bibliographic survey was carried out between July and August 2023, in the LILACS, SCIELO and Periódico CAPES databases. To increase the scope of the review, the Boolean AND operator was used. The descriptors were used: sepsis “AND” nursing, which are registered in the Health Sciences Descriptors (DeCS) and which were defined according to the proposed theme. The inclusion criteria for this study were original articles published in full, available in indexed databases, written in Portuguese and published between the period 2018 to 2023. After crossing the descriptors with Boolean in the databases, we found 55 studies in LILACS, 23 in SCIELO and 153 in CAPES. After analyzing, reading the articles and applying the inclusion and exclusion criteria, a total of 8 studies were selected to compose the integrative review, as these covered the proposed theme and achieved the proposed objectives. Regarding the approach of the selected studies, 1 was cross-sectional descriptive, 1 observational retrospective study, 1 cross-sectional study, descriptive of a documental nature, 2 qualitative descriptive studies, 1 cross-sectional with a retrospective approach, 1 exploratory descriptive with a qualitative approach and 1 descriptive in nature quantitative. It was evident that many nursing professionals had scientific knowledge for the recognition and management of patients with septicemia. However, some still lack training, as they confuse the signs and symptoms of sepsis with other pathologies and even fail to provide efficient assistance, as they do not carry out a rigorous evaluation of the patient to identify the signs of septicemia.Esse estudo tem como objetivo descrever a assistência realizada pelos profissionais de enfermagem ao paciente com sepse, conforme a literatura dos últimos cinco anos. Trata-se de um estudo de revisão de literatura do tipo integrativa. O levantamento bibliográfico foi realizado entre os meses de julho e agosto de 2023, nas bases de dados LILACS, SCIELO e Periódico CAPES. Para aumentar o escopo da revisão foi utilizado o operador booleano AND. Foram utilizados os descritores: sepse “AND” enfermagem, que estão registrados nos Descritores em Ciências da Saúde (DeCS) e que foram definidos conforme a temática proposta. Os critérios de inclusão desse estudo foram os artigos originais publicados na íntegra, disponíveis nas bases de dados indexadas, escritos em língua portuguesa e publicados entre o período de 2018 a 2023. Após o cruzamento dos descritores com o booleano nas bases de dados, foram encontrados 55 estudos no LILACS, 23 no SCIELO e 153 no CAPES. Após a análise, leitura dos artigos e aplicação dos critérios de inclusão e exclusão, foram selecionados um total de 8 estudos para compor a revisão integrativa, pois esses abrangeram a temática proposta e atingiram os objetivos propostos. Em relação à abordagem dos estudos selecionados, 1 foi transversal descritivo,  1 estudo observacional retrospectivo, 1 estudo transversal, descritivo de caráter documental, 2 estudos qualitativos descritivos, 1 corte transversal com abordagem retrospectiva, 1 exploratório descritivo com abordagem qualitativa e 1 descritivo de natureza quantitativa. Ficou evidente que muitos profissionais de enfermagem apresentaram conhecimentos científicos para o reconhecimento e manejo do paciente com septicemia. Entretanto, alguns ainda carecem de capacitações, visto que confundem os sinais e sintomas da sepse com outras patologias e até mesmo deixam de realizar uma assistência eficiente, pois não fazem uma avaliação rigorosa do paciente para identificar os sinais de septicemia. Palavras-chave: Enfermagem, Pacientes, Sepse

Alguns fungos presentes em plantas nativas e exóticas do Cerrado

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2011De um total de 22 fungos estudados, 19 foram encontrados em plantas nativas do Cerrado e três em plantas exóticas. Espécies possivelmente novas de fungos foram estudadas em folhas de Ocotea sp. (Janetia relatada pela primeira vez em Lauraceae e espécies de Vonarxella, Johansonia, Phillipsiella e Staibia connari); em folhas de uma Asteraceae não identificada (um novo celomiceto); em Roessleria brasiliana (Acrostroma sp.); e em Mauritia sp. (Pestalotiopsis sp.) e Micropholis venulosa (Stigmopeltis sp.), além disso, em Lauraceae não identificada foram estudados dois gêneros novos de ascomicetos ambos associados a tricomas foliares. Outras prováveis espécies novas foram descritas em Ilex affinis (Phyllachora sp. e Stomiopeltis sp.); em Eugenia sp. (Asterinella sp.); em Davilla rugosa (Phyllachora davilae); em Butia sp. (Coccodiella sp.); em Lantana camara (Limacinia sp.), em Triunfetta rhomboidea (Puccinia malvacearum). Em plantas exóticas no cerrado resgistraram-se duas novas espécies de Cercospora em pimenta-do-reino (Piper nigrum) e pinhão-manso (Jatropha curcas) e uma Pseudocercospora em Licuala jeanencyi (Arecaceae). _______________________________________________________________________________________ ABSTRACTA total of 22 fungal species were studied; nineteen of them on native Cerrado plants and three on exotic species grown in the Cerrado. Fungal species considered as probably new taxa were studied on leaves of Ocotea sp. (Janetia sp., a first record on Lauraceae, and Vonarxella sp., Johansonia sp., Phillipsiella sp., and Staibia connari); on leaves of a non-identified Asteraceae (a new coelomycete); on Roessleria brasiliana (Acrostroma sp.); on Mauritia sp. (Pestalotiopsis sp.); and on Micropholis venulosa (Stigmopeltis sp.). On a non-identified species belonging in the Lauraceae, two new trichome-associated ascomycete genera were studied. Other probably new species were described and illustrated on Ilex affinis (Phyllachora sp. and Stomiopeltis sp.); on Eugenia sp. (Asterinella sp); on Davilla rugosa (Phyllachora davilae); on Butia sp. (Coccodiella sp.); on Lantana camara (Limacinia sp.), on Triunfetta rhomboidea (Puccinia malvacearum).Two new Cercospora species were detected on exotic host species found in Brasilia (Piper nigrum and Jatropha curcas), and a Pseudocercospora species on Licuala jeanencyi (Arecaceae) collected in Recife, Pernambuco

Morfotaxonomia e filogenia molecular de Pucciniales do Cerrado brasileiro

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2016.A ordem Pucciniales é um componente importante da micobiota do cerrado brasileiro, entretanto pouco se sabe sobre a sua diversidade e as informações até agora obtidas são quase que exclusivamente baseadas em aspectos morfológicos. Os estudos envolvendo a análise molecular e filogenética para fungos causadores de ferrugens no cerrado é escasso. Com o objetivo da ampliação do estudo em termos morfológicos bem como promover algum avanço em termos de suas relações filogenéticas, foram caracterizadas morfologicamente um total de 41 espécies de Pucciniales das quais destas 36 foram caracterizadas molecularmente, entre formas sexuadas e assexuadas, coletadas nos estados de Goiás, Mato Grosso, Maranhão, Minas Gerais e no Distrito Federal. No Cerrado, os fungos causadores de ferrugem foram encontrados em plantas hospedeiras das famílias Anacardiaceae, Annonaceae, Arecaceae, Asteraceae, Bignoniaceae, Clusiaceae, Combretaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Lauraceae, Loranthaceae, Malpighiaceae Myrtaceae, Rosaceae, Sapindaceae, Sapotaceae, Solanaceae, Vochysiaceae e Thelypteridaceae. O trabalho consistiu na caracterização, ilustração e complementação de dados de vários espécimes já conhecidos ou não. Neste estudo foram incluídos membros representantes da família Pucciniaceae (Puccinia e Uromyces), Phakopsoraceae (Phakopsora, Batistopsora, Catenulopsora e Crossopssora), Raveneliaceae (Diorchidium, Esalque, Ravenelia e Sphaerophragmium), Uropyxidaceae (Dasyspora, Kimuromyces sp., Mimema, Porotenus e Prospodium) Chaconiaceae (Chaconia e Aplopsora), Pileolariaceae (Skierka) e Phragmidiaceae (Kuehneola). Além disso, foram incluídas no estudo espécies de classificação taxonômica incerta pertencentes aos gêneros Cerradoa e Desmella e alguns espécimes assexuais considerados simplesmente como Aecidium e Uredo. A análise filogenética foi realizada com base na região LSU do rDNA por meio de Inferência Bayesiana envolvendo os espécimes aqui estudados e demais retirados do GenBank relacionados filogeneticamente com as famílias e enraizada por Platygloea disciformis. Esta é a primeira vez que foi realizado um estudo baseado em análises moleculares filogenéticas de Pucciniales do cerrado numa dimensão ampla, envolvendo membros representantes de várias famílias. Aqui foi apresentada de forma inédita a caracterização molecular de vários espécimes fúngicos pertencentes a ordem Pucciniales encontradas em plantas endêmicas e introduzidas no cerrado que enriquecerá o banco de dados do NCBI e muito contribuirá para o estudo e compreensão da filogenia da ordem em estudos posteriores. De forma geral, os dados obtidos possibilitaram o entendimento do posicionamento filogenético de apenas alguns grupos em níveis de gênero e espécies como o caso de membros componentes da família Phakopsoraceae. No presente estudo a maioria das famílias de Pucciniales como Pucciniaceae, Raveneliaceae, Uropyxidaceae e Phakopsoraceae se mostraram polifiléticas, entretanto, os dados obtidos não foram suficientes para o esclarecimento das relações filogenéticas dos membros causadores de ferrugem do cerrado neste nível hierárquico dentro da ordem, havendo a necessidade de aprofundamento das análises filogenéticas principalmente com os grupos mais esclarecidos e atualização nomenclatural de alguns espécimes com classificação taxonômica indefinida. Além disso foi realizada caracterização morfo-molecular e nova nomeação de uma espécie de Uromyces encontrada em Phthirusa stelis (Loranthaceae) e um estudo sobre a interação entre U. euphorbiae com Colletotrichum truncatum, baseado em caracterização morfo-molecular de ambos os fungos envolvidos encontrados em folhas de Euphorbia hirta (Euphorbiaceae). Além de aumentar as informações sobre as espécies já conhecidas, o trabalho resultou em novos relatos de ocorrência de membros das Pucciniales em nova hospedeiras e novos locais, prováveis espécies novas, relatos de fase ou fases do ciclo de vida até então inéditas e, finalmente, algumas atualizações nomenclaturais e taxonômicas.The order Pucciniales is an important component of Brazilian Cerrado micobiota, although few is known about its biodiversity and the existent information is almost exclusively based on morphological aspects. Studies of rust fungi involving molecular and phylogenetic analysis in the Cerrado are scarce. In order to increase the morphological knowledge and promote some advance in the understandment of their phylogenetic relationships, a total of 41 Pucciniales species were morphologically characterized, among which 36 were also mollecularly characterized, including sexual and assexual forms. The specimens were collected in the states of Goiás, Mato Grosso, Maranhão, Minas Gerais and Distrito Federal. In the Cerrado, the rust fungi were found inhabiting plants of the families Anacardiaceae, Annonaceae, Arecaceae, Asteraceae, Bignoniaceae, Clusiaceae, Combretaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Lauraceae, Loranthaceae, Malpighiaceae Myrtaceae, Rosaceae, Sapindaceae, Sapotaceae, Solanaceae, Vochysiaceae and Thelypteridaceae. This study consisted in the characterization, illustration and complementation of data about many specimens previously known or unknown. In this study were included members of Pucciniaceae (Puccnia and Uromyces), Phakopsoraceae (Phakopsora, Batistopsora, Catenulopsora and Crossopsora), Raveneliaceae (Diorchidium, Esalque, Ravenelia and Sphaerophragmium), Uropyxidaceae (Dasyspora, Kimuromyces, Mimema, Porotenus and Prospodium) Chaconiaceae (Chaconia and Aplopsora), Pileolariaceae (Skierka) and Phragmidiaceae (Kuehneola). Besides, in this study they were included some species of uncertain taxonomic classification belonging to the genera Cerradoa and Desmella and some assexual specimens simply considered as Aecidium and Uredo. The phylogenetic analysis based on LSU region of rDNA was realized using Bayesian Inference and included the specimens studied here and more related species obtained from GenBank and the tree was rooted with Platygloea disciformis. This is the first time that a broad study based on molecular and phylogenetic analysis of Pucciniales from Cerrado is realized, including representative members of many families. Here it was presented the molecular characterization of many fungal specimens belonging to Pucciniales inhabiting endemic and exotic plants in the Cerrado, which will enrich NCBI database and contribute to study and comprehension of phyiogeny of this order in posterior studies. In general, the data obtained enabled the understandment about phylogenetic placement of some groups at genera and species level, as observed in Phakopsoraceae. The majority of families as Pucciniaceae, Raveneliaceae, Uropyxidaceae and Phakopsoraceae were poliphyletic, although data were insufficient to clarify the phylogenetic relationship among rust fungi at this taxonomic level. So, it is necessary to intensify the phylogenetic analysis specially with groups more clarified and to update the nomenclature of some specimens with uncertain taxonomic classification. Furthermore, it was realized the morpho-molecular characterization and naming of a new species of Uromyces founded in Phthirusa stelis (Loranthaceae) and the study of interaction between U. euphorbiae and Colletotrichum truncation based on morphomolecular characterization of both fungi inhabiting leaves of Euphorbia hirta (Euphorbiaceae). In addition to increase the disponible information about species already known, this study resulted in new records of occurence of Pucciniales in new hosts and locals, problable new species, record of stadium or life cycle stadium unknown until now and, finally, some nomenclatural and taxonomic actualizations

New genus of trichomatous coelomycete on Myrcia fenzliana from the Brazilian Cerrado

Megacoelomyces (type species: Megacoelomyces sanchezii), an ascomycete asexual morph infecting Myrcia fenzliana (Myrtaceae) from the Brazilian Cerrado, is described as a new genus in the Phaeosphaeriaceae (Pleosporales, Dothideomycetes, Ascomycota), based on multilocus phylogeny (three nuclear ribosomal DNA and two protein-coding genes) in addition to morphological (light and scanning electron microscopy) and ecological data

Reinstatement and phylogenetic allocation of the palm rust genus Cerradoa in the Pucciniaceae, and establishment of Pseudocerradoa, gen. nov.

The genus Cerradoa (type species Cerradoa palmaea) was established in 1978 by Hennen and Ono and named after the Brazilian Cerrado biome. The holotype collected in Planaltina, Federal District, Brazil, belonged to the first rust fungus reported on palms (Arecaceae). For decades, the status of Cerradoa as a distinct genus has been regarded as doubtful, representing a synonym of Edythea (Uropyxidaceae) starting with the second edition of the Illustrated Genera of Rust Fungi in 1983. Our molecular phylogenetic analyses, as well as our morphological investigations, allowed us to reject this synonymy, leading to the reinstatement of Cerradoa within the Pucciniaceae. Cerradoa, together with morphologically similar genera such as the newly established Pseudocerradoa with two species (Ps. paullula and Ps. rhaphidophorae) infecting araceous hosts, the fern rust Desmella, and also P. engleriana, could not be assigned to any of the seven identified major lineages within the Pucciniaceae. Edythea, instead of being maintained as a member of the Uropyxidaceae, was herein placed in Pucciniaceae, shown hylogenetically in close relationship to Cumminsiella mirabilissima, both infecting the Berberidaceae. Additionally, our extensive phylogenetic analyses add guidance for future taxonomic revisions in the highly polyphyletic genus Puccinia and other established taxa within the family Pucciniaceae

Retrospective Investigation in Horses with Encephalitis Reveals Unnoticed Circulation of West Nile Virus in Brazil

During these past years, several studies have provided serological evidence regarding the circulation of West Nile virus (WNV) in Brazil. Despite some reports, much is still unknown regarding the genomic diversity and transmission dynamics of this virus in the country. Recently, genomic monitoring activities in horses revealed the circulation of WNV in several Brazilian regions. These findings on the paucity of genomic data reinforce the need for prompt investigation of WNV infection in horses, which may precede human cases of encephalitis in Brazil. Thus, in this study, we retrospectively screened 54 suspicious WNV samples collected between 2017 and 2020 from the spinal cord and brain of horses with encephalitis and generated three new WNV genomes from the Ceará and Bahia states, located in the northeastern region of Brazil. The Bayesian reconstruction revealed that at least two independent introduction events occurred in Brazil. The first introduction event appears to be likely related to the North American outbreak, and was estimated to have occurred in March 2013.The second introduction event appears to have occurred in September 2017 and appears to be likely related to the South American outbreak. Together, our results reinforce the importance of increasing the priority of WNV genomic monitoring in equines with encephalitis in order to track the dispersion of this emerging pathogen through the country