Insights Into Limnothrix sp. Metabolism Based on Comparative Genomics

Currently only four genome sequences for Limnothrix spp. are publicly available, and information on the genetic properties of cyanobacteria belonging to this genus is limited. In this study, we report the draft genome of Limnothrix sp. CACIAM 69d, isolated from the reservoir of a hydroelectric dam located in the Amazon ecosystem, from where cyanobacterial genomic data are still scarce. Comparative genomic analysis of Limnothrix revealed the presence of key enzymes in the cyanobacterial central carbon metabolism and how it is well equipped for environmental sulfur and nitrogen acquisition. Additionally, this work covered the analysis of Limnothrix CRISPR-Cas systems, pathways related to biosynthesis of secondary metabolites and assembly of extracellular polymeric substances and their exportation. A trans-AT PKS gene cluster was identified in two strains, possibly related to the novel toxin Limnothrixin biosynthesis. Overall, the draft genome of Limnothrix sp. CACIAM 69d adds new data to the small Limnothrix genome library and contributes to a growing representativeness of cyanobacterial genomes from the Amazon region. The comparative genomic analysis of Limnothrix made it possible to highlight unique genes for each strain and understand the overall features of their metabolism

Metagenomic analysis of samples from three bat species collected in the Amazon rain forest

This work was partially supported by Evandro Chagas Institute (IEC-PA Brazil) grants, National Council for Scientific and Technological Development (MRTN CNPq) grant number 302584/2015-3, Fundação para o Desenvolvimento Científico e Tecnológico em Saúde (FIOTEC) grant number PRES-012-FIO-16, and Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) grant number 3274/2013.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.We report here the sequencing of five microbiome samples collected from different bat species in the Amazon rain forest. All contigs matching virus sequences were assigned to members of the Retroviridae family, while the bacterial contigs matched several bacterial species mostly belonging to the Proteobacteria phylum

Complete endogenous retrovirus genome sequence from a brazilian vampire bat (desmodus rotundus)

This work was supported by Evandro Chagas Institute (IEC-PA Brazil) grants, MRTN CNPq (National Council for Scientific and Technological Development grant number 302584/2015-3), Fundação para o Desenvolvimento Científico e Tecnológico em Saúde (FIOTEC; grant number PRES-012-FIO-16), and Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES; grant number 3274/2013).Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.The strain Desmodus rotundus endogenous retrovirus (DrERV) QR09 was obtained from a bat tissue sample collected from Desmodus rotundus in the Brazilian rain forest. The complete genome was sequenced using the next-generation sequencing strategy. The full-length genome of DrERV QR09 is 8,256 nucleotides in length and showed high similarity with other DrERVs

Emergence of new insect-restrictive viruses in the Amazon Region

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.University of Texas Medical Branch. Center for Biodefense and Emerging Infectious Diseases. Department of Pathology. Galveston, TX, USA.University of Texas Medical Branch. Center for Biodefense and Emerging Infectious Diseases. Department of Pathology. Galveston, TX, USA.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Centro de Inovações Tecnológicas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.The complete genome was determined for 12 viruses isolated from 8 different pools of mosquitoes (Culex sp. and Psorophora ferox) collected at Brejeira farm, Canaan dos Carajas, Para state in northern Brazil. Eight of the viruses were distantly related to Piura virus, hereafter designated as Brejeira virus; the other 4 were similar to Wallerfield virus

First new world primate papillomavirus identification in the Atlantic Forest, Brazil: Alouatta guariba papillomavirus 1

Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil / São Paulo University. Veterinary Medicine and Animal Science Faculty. Department of Pathology. São Paulo, SP, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Environment and Green Areas Secretary. Technical Division of Veterinary Medicine and Wildlife Management. São Paulo, SP, Brazil.Technical Division of Veterinary Medicine and Wildlife Management, Environment and Green Areas Secretary, São Paulo, Brazil.Technical Division of Veterinary Medicine and Wildlife Management, Environment and Green Areas Secretary, São Paulo, Brazil.São Paulo University. Veterinary Medicine and Animal Science Faculty. Department of Pathology. São Paulo, SP, Brazil.We report here the complete genome sequence of the first papillomavirus detected in a New World primate, howler monkey, Alouatta guariba clamitans papillomavirus 1 (AgPV1), from the Atlantic Forest in São Paulo State, Brazil

Vírus Zika genoma completo de Salvador, Bahia, Brasil

Fundação Oswaldo Cruz. Salvador, BA, Brazil / University of Rome “Tor Vergata”. Roma, Italy.University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.University of Cape Town. Faculty of Health Sciences. Division of Computational Biology. Cape Town, South Africa.Fundação Oswaldo Cruz. Salvador, BA, Brazil / Hospital Santa Isabel. Salvador, BA, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Salvador, BA, Brazil.National Institute of Healthy. Rome, Italy.University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.Hospital Santa Isabel. Salvador, BA, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Salvador, BA, Brazil.In May 2015 the first autochthonous Zika virus infection was reported in Brazil. Rapid and urgent measures are needed to contain the ongoing outbreak. Here we report the full-length ZIKV coding sequence from Bahia. Genetic analysis of outbreak sequences will be essential for characterizing the diversity of circulating strains, identifying hotspots of virus transmission and guiding public health control. Rapid and urgent measures are needed to contain the ongoing outbreak

First New World Primate Papillomavirus Identification in the Atlantic Forest, Brazil: Alouatta guariba papillomavirus 1

We report here the complete genome sequence of the first papillomavirus detected in a New World primate, howler monkey, Alouatta guariba clamitans papillomavirus 1 (AgPV1), from the Atlantic Forest in São Paulo State, Brazil

Zika virus complete genome from Salvador, Bahia, Brazil

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2016-04-25T19:04:12Z No. of bitstreams: 1 Giovanetti M Zika virus complete genome from Salvador, Bahia, Brazil.pdf: 237413 bytes, checksum: a1bd028fb686588dc0a7fa03fefdcb3d (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2016-04-25T19:16:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Giovanetti M Zika virus complete genome from Salvador, Bahia, Brazil.pdf: 237413 bytes, checksum: a1bd028fb686588dc0a7fa03fefdcb3d (MD5)Made available in DSpace on 2016-04-25T19:16:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Giovanetti M Zika virus complete genome from Salvador, Bahia, Brazil.pdf: 237413 bytes, checksum: a1bd028fb686588dc0a7fa03fefdcb3d (MD5) Previous issue date: 2016Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / University of Rome “Tor Vergata”. ItalyUniversity of Oxford. Department of Zoology. UKInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilUniversity of Oxford. Department of Zoology. UKInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilInstituto Evandro Chagas. Belém, PA, BrasilUniversity of Cape Town. Faculty of Health Sciences. Division of Computational Biology. Cape Town, South AfricaFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Hospital Santa Isabel. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilNational Institute of Healthy. Rome, ItalyUniversity of Oxford. Department of Zoology. UKUniversity of KwaZulu-Natal. Africa Center, Durban, South AfricaFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilIn May 2015 the first autochthonous Zika virus infection was reported in Brazil. Rapid and urgent measures are needed to contain the ongoing outbreak. Herewe report the full-length ZIKV coding sequence fromBahia. Genetic analysis of outbreak sequences will be essential for characterizing the diversity of circulating strains, identifying hotspots of virus transmission and guiding public health control. Rapid and urgent measures are needed to contain the ongoing outbreak

Zika virus disrupts molecular fingerprinting of human neurospheres

Zika virus (ZIKV) has been associated with microcephaly and other brain abnormalities; however, the molecular consequences of ZIKV to human brain development are still not fully understood. Here we describe alterations in human neurospheres derived from induced pluripotent stem (iPS) cells infected with the strain of Zika virus that is circulating in Brazil. Combining proteomics and mRNA transcriptional profiling, over 500 proteins and genes associated with the Brazilian ZIKV infection were found to be differentially expressed. These genes and proteins provide an interactome map, which indicates that ZIKV controls the expression of RNA processing bodies, miRNA biogenesis and splicing factors required for self-replication. It also suggests that impairments in the molecular pathways underpinning cell cycle and neuronal differentiation are caused by ZIKV. These results point to biological mechanisms implicated in brain malformations, which are important to further the understanding of ZIKV infection and can be exploited as therapeutic potential targets to mitigate it7CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQCOORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPESFINANCIADORA DE ESTUDOS E PROJETOS - FINEPFUNDAÇÃO CARLOS CHAGAS FILHO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DO RIO DE JANEIRO - FAPERJFUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESPsem informaçãosem informaçãosem informaçãosem informação14/21035-0; 14/14881-1; 13/08711-3; 14/10068-