Caracterización fenotípica y genotípica de aislamientos clínicos colombianos de Sporothrix spp.

Introduction: Over a century, Sporothrix schenckii was considered the only species responsible for sporotrichosis, years later in 2007 it became evident that the disease could be caused by different Sporothrix species that differed in both their virulence factors and antifungals susceptibility among them. Objectives: To characterize phenotypical and genotypically 42 Colombian clinical isolates of Sporothrix spp.Material and methods: 42 clinical isolates were characterized using phenotypic methods that include: several culture media to determine range of growth at different temperatures, type and distribution of their pigment and the texture of the colonies. Additionally, the microscopic morphology was evaluated by microcultures determining the diameter and type of sporulation and the morphology of the conidia. The assimilation of carbohydrates was also used as a physiological trait for species identification. Genotyping of 40 isolates was carried out by partial amplification of the calmodulin gene and sequence analysis.Results: Molecular studies permitted the identification of 32 S. schenckii and 8 S. globosa isolates. The combination of phenotypic and genotypic methods allowed to characterize the species and allowed to construct keys for their recognition based on parameters such as diameter of growth at 25 ºC, 30 ºC, colony texture in PDA (membranous, velvety), and microscopic morphology with predominance of conidia (pigmented triangular, elongated oval globose, subglobose).Conclusions: the confirmation of the phenotypic characteristics and molecular analyzes should be performed in order to identify the Sporothrix species allowing to decide on proper treatment. This is the first phenotypical and genotypical characterization of Colombian Sporothrix spp. clinical isolates.Introducción. Por más de un siglo, Sporothrix schenckii se pensó era la única especie responsable de la esporotricosis, en el 2007 se consideró que puede ser causada por diferentes especies de Sporothrix que difieren en sus factores de virulencia y susceptibilidad a antifúngicos.Objetivos. Caracterizar fenotípica y genotípicamente 42 aislamientos clínicos Colombianos de Sporothrix spp.Materiales y métodos. 42 aislamientos clínicos se caracterizaron usando métodos fenotípicos: varios medios de cultivo para determinar: rango de crecimiento a diferentes temperaturas, tipo y distribución del pigmento y textura de las colonias. Se evaluó la morfología microscópica por microcultivos determinando el diámetro y tipo de esporulación y la morfología de las conidias. La asimilación de carbohidratos se usó como una característica fisiológica para la identificación de especies. La genotipificación de 40 aislamientos se llevó a cabo mediante la amplificación parcial del gen de calmodulina y secuenciación.Resultados. Mediante estudios moleculares se identificaron los aislamientos: 32 S. schenckii y 8 S. globosa. La combinación de métodos fenotípicos y genotípicos permitió caracterizar las especies y construir claves para su reconocimiento basado en parámetros tales como el diámetro de crecimiento a 25 ºC, 30 ºC, textura de las colonias en PDA (membranosa, aterciopelada), y la morfología microscópica con predominio de conidias (triangulares pigmentadas, ovales globosas elongadas, subglobosas). Conclusiones. La caracterización fenotípica y análisis moleculares deben realizarse para poder identificar las especies de Sporothrix y de esta forma decidir el tratamiento indicado. Esta es la primera caracterización fenotípica y genotípica de aislamientos clínicos Colombianos de Sporothrix spp