Identification of CFTR variants in Latino patients with cystic fibrosis from the Dominican Republic and Puerto Rico

BackgroundIn cystic fibrosis (CF), the spectrum and frequency of CFTR variants differ by geography and race/ethnicity. CFTR variants in White patients are wellâ described compared with Latino patients. No studies of CFTR variants have been done in patients with CF in the Dominican Republic or Puerto Rico.MethodsCFTR was sequenced in 61 Dominican Republican patients and 21 Puerto Rican patients with CF and greater than â â â â 60â mmol/L sweat chloride. The spectrum of CFTR variants was identified and the proportion of patients with 0, 1, or 2 CFTR variants identified was determined. The functional effects of identified CFTR variants were investigated using clinical annotation databases and computational prediction tools.ResultsOur study found 10% of Dominican patients had two CFTR variants identified compared with 81% of Puerto Rican patients. No CFTR variants were identified in 69% of Dominican patients and 10% of Puerto Rican patients. In Dominican patients, there were 19 identified CFTR variants, accounting for 25 out of 122 disease alleles (20%). In Puerto Rican patients, there were 16 identified CFTR variants, accounting for 36 out of 42 disease alleles (86%) in Puerto Rican patients. Thirty CFTR variants were identified overall. The most frequent variants for Dominican patients were p.Phe508del and p.Ala559Thr and for Puerto Rican patients were p.Phe508del, p.Arg1066Cys, p.Arg334Trp, and p.I507del.ConclusionsIn this first description of the CFTR variants in patients with CF from the Dominican Republic and Puerto Rico, there was a low detection rate of two CFTR variants after full sequencing with the majority of patients from the Dominican Republic without identified variants.Peer Reviewedhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/153634/1/ppul24549.pdfhttps://deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/153634/2/ppul24549_am.pd

Native American Ancestry and Air Pollution Interact to Impact Bronchodilator Response in Puerto Rican Children with Asthma.

ObjectiveAsthma is the most common chronic disease in children. Short-acting bronchodilator medications are the most commonly prescribed asthma treatment worldwide, regardless of disease severity. Puerto Rican children display the highest asthma morbidity and mortality of any US population. Alarmingly, Puerto Rican children with asthma display poor bronchodilator drug response (BDR). Reduced BDR may explain, in part, the increased asthma morbidity and mortality observed in Puerto Rican children with asthma. Gene-environment interactions may explain a portion of the heritability of BDR. We aimed to identify gene-environment interactions associated with BDR in Puerto Rican children with asthma.SettingGenetic, environmental, and psycho-social data from the Genes-environments and Admixture in Latino Americans (GALA II) case-control study.ParticipantsOur discovery dataset consisted of 658 Puerto Rican children with asthma; our replication dataset consisted of 514 Mexican American children with asthma.Main outcome measuresWe assessed the association of pairwise interaction models with BDR using ViSEN (Visualization of Statistical Epistasis Networks).ResultsWe identified a non-linear interaction between Native American genetic ancestry and air pollution significantly associated with BDR in Puerto Rican children with asthma. This interaction was robust to adjustment for age and sex but was not significantly associated with BDR in our replication population.ConclusionsDecreased Native American ancestry coupled with increased air pollution exposure was associated with increased BDR in Puerto Rican children with asthma. Our study acknowledges BDR's phenotypic complexity, and emphasizes the importance of integrating social, environmental, and biological data to further our understanding of complex disease

Breastfeeding associated with higher lung function in African American youths with asthma

OBJECTIVE: In the United States, Puerto Ricans and African Americans have lower prevalence of breastfeeding and worse clinical outcomes for asthma compared with other racial/ethnic groups. We hypothesize that the history of breastfeeding is associated with increased forced expiratory volume in 1 second (FEV1) % predicted and reduced asthma exacerbations in Latino and African American youths with asthma. METHODS: As part of the Genes-environments & Admixture in Latino Americans (GALA II) Study and the Study of African Americans, asthma, Genes & Environments (SAGE II), we conducted case-only analyses in children and adolescents aged 8-21 years with asthma from four different racial/ethnic groups: African Americans (n = 426), Mexican Americans (n = 424), mixed/other Latinos (n = 255), and Puerto Ricans (n = 629). We investigated the association between any breastfeeding in infancy and FEV1% predicted using multivariable linear regression; Poisson regression was used to determine the association between breastfeeding and asthma exacerbations. RESULTS: Prevalence of breastfeeding was lower in African Americans (59.4%) and Puerto Ricans (54.9%) compared to Mexican Americans (76.2%) and mixed/other Latinos (66.9%; p \u3c 0.001). After adjusting for covariates, breastfeeding was associated with a 3.58% point increase in FEV1% predicted (p = 0.01) and a 21% reduction in asthma exacerbations (p = 0.03) in African Americans only. CONCLUSION: Breastfeeding was associated with higher FEV1% predicted in asthma and reduced number of asthma exacerbations in African American youths, calling attention to continued support for breastfeedin

Genetic Determinants of Telomere Length in African American Youth.

Telomere length (TL) is associated with numerous disease states and is affected by genetic and environmental factors. However, TL has been mostly studied in adult populations of European or Asian ancestry. These studies have identified 34 TL-associated genetic variants recently used as genetic proxies for TL. The generalizability of these associations to pediatric populations and racially diverse populations, specifically of African ancestry, remains unclear. Furthermore, six novel variants associated with TL in a population of European children have been identified but not validated. We measured TL from whole blood samples of 492 healthy African American youth (children and adolescents between 8 and 20 years old) and performed the first genome-wide association study of TL in this population. We were unable to replicate neither the 34 reported genetic associations found in adults nor the six genetic associations found in European children. However, we discovered a novel genome-wide significant association between TL and rs1483898 on chromosome 14. Our results underscore the importance of examining genetic associations with TL in diverse pediatric populations such as African Americans

Внешнеэкономическое сотрудничество России и Казахстана: от истории к современности

Abstract: Предмет/тема. Россия и Казахстан являются странами, имеющими тесные партнерские политические и экономические отношения в разных форматах: ЕАЭС и Таможенного союза, а также ОДКБ и СНГ. У России и Казахстана имеется общий рынок, отсутствует таможенная граница, могут свободно перемещаться товары, услуги, рабочая сила, но, несмотря на эту внешнюю открытость, не решен ряд проблем, связанных с современной экономической и политической ситуацией. В статье проанализированы тенденции внешней торговли между двумя странами, освещены основные проблемы внешнеэкономического сотрудничества России и Казахстана. Актуальность темы исследования обусловлена тем, что в 2017-2018 гг. наблюдается несоответствие между экономическими и политическими линиями развития Российской Федерации и Республики Казахстан, что негативно влияет на внешне-экономические, политические и культурные связи России. Цели/задачи. Целями данной статьи является исследование исторических аспектов и современных реалий двусторонних отношений между Республикой Казахстан и Российской Федерацией; выявление факторов, оказывающих влияние на усиление экономического и политического неравенства между Россией и Республикой Казахстан, которое отрицательно сказывается на исторически дли-тельные отношения между странами, что, в свою очередь, отрицательно влияет как на внешнюю торговлю, так и на социокультурный обмен. Методология. Методической основой являются литературные источники по теме исследования, а также открытые аналитические материалы. Методами исследования являются общенаучные методы анализа и синтеза. Результаты. В настоящей статье авторы приходят к выводу, что решение ряда проблем, возникших в процессе внешнеэкономического сотрудничества России и Казахстана, кроется в формировании надгосударственного института агентов экономической дипломатии. Такой институт обеспечит согласованность интересов политических дипломатов и деловых кругов, а также может явиться основой для выработки рекомендаций в области координации важнейших направлений стратегического развития Российской Федерации и Республики Казахстан. Выводы/значимость. Проведенное исследование исторических и современных аспектов двусторонних отношений между Российской Федерацией и Республикой Казахстан позволило сделать следующие важные выводы. Во-первых, Россия и Казахстан, несмотря на негативные исторические аспекты совместного развития, смогли сформировать единое и относительно эффективное экономическое пространство, использующее преимущества сотрудничества, созданного в советское время. Во-вторых, Казахстан нуждается в большем развитии двусторонних экономических отношений (в том числе в рамках единого таможенного пространства) в большей степени, чем Россия, поскольку это зависит от внешней торговли с Российской Федерацией. В-третьих, Россия, находящаяся под внешне-политическим и внешнеэкономическим давлением со стороны европейских стран и США, нуждается в поддержке со стороны Республики Казахстан, а также стран, вступающих в Таможенный союз и Евразийский экономический союз. Применение. Полученные выводы и результаты исследования могут быть использованы при решении проблем, связанных с современной экономической и политической ситуацией в мире и в странах ЕАЭС в целом. Статья подготовлена в рамках государственного задания ИПР РАН, тема НИР «Социально-экономическое и научно-технологическое развитие на разных уровнях управления в отраслях, комплексах и сферах деятельности национального хозяйства России»