Variabilidade genética entre e dentro de grupos de Euterpe spp. com base em microssatélites

The objective of this article is to study the diversity between and within groups of accesses of the Euterpe spp. germoplasm collection of the Agricultural Research and Rural Extension Company of Santa Catarina - Itajaí Experimental Station and to identify dissimilar groups that could guide targeted crossesin order to obtain desirable genotypic combinations. Therefore, 18 microsatellite markers, previously developed for Euterpe edulis Mart., were tested. Six of them - EE03, EE45, EE47, EE52, EE54 and EE59 - were efficient and  used to obtain the desired estimates. The average polymorphic information content varied from 0.305 to 0.835. Trought the variation analysis, variation values of 13% were obtained between the groups, 40 and 47% within and between the accessions. The Bayesian Method indicated the formation of four groups and from the dendogram with the Ward method, 50% of the dissimilarity value was possible to illustrate them, besides indicating the accesses with low dissimilarity (≤ 10%). The diversity found allows the orientation of directed crosses, both for intra and interspecific hybrids formation and for backcrossing.Objetivou-se neste trabalho estudar a diversidade entre e dentro de acessos da coleção de Euterpe spp. daEmpresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina - Estação Experimental de Itajaí(EPAGRI-EEI) e identificar grupos dissimilares que possam orientar cruzamentos dirigidos para obtenção decombinações genotípicas desejáveis. Para tal, foram testados 18 marcadores microssatélites, previamentedesenvolvidos para Euterpe edulis Mart. Seis deles – EE54, EE59, EE03, EE45, EE52 e EE47 - foram eficientese empregados na obtenção das estimativas desejadas. Foram revelados em média15 a 4 alelos por grupo,sendo que o conteúdo de informação polimórfica variou de 0,305 a 0,835. A partir da análise de variância foram obtidos valores de variação de 13% entre grupos, 47 e 40% entre e dentro dos acessos, respectivamente. O Método bayesiano indicou a formação de quatro grupos e a partir do dendograma com o método Ward, com 50% do valor de dissimilaridade foi possível identificar os acessos que compõe esses grupos, além de indicar os acessos com dissimilaridade baixa (≤ 10%). A diversidade encontrada possibilita a orientação de cruzamentos dirigidos, tanto para formação de híbridos intra e interespecíficos, como para retrocruzamentos

Genetic parameters and paternity test in progenies of Euterpeoleracea originated from spontaneous hybridization with Euterpeedulis in subtropical climate

O objetivo deste estudo foi avaliar o sistema de fecundação e a distribuição da variabilidade molecular entre e dentro de três grupos de progênies de polinização aberta de Euterpe oleracea, além de realizar um teste de paternidade para identificação dos genitores masculinos e promover a certificação genética das plântulas bífolioladas. Para tal, foram utilizados seis loci microssatélites em 306 amostras. Os grupos de progênies são resultado de um sistema misto de fecundação, com ausência de cruzamentos entre aparentados, sendo alógamos (tm e ts = 1,0), com correlação de autofecundação (rt) igual a 0,110. Foram constatados diferentes graus de parentescos (rp), entre 15,5 a 26,1% de irmãos completos. A paternidade foi atribuída para 51% e 24% das amostras, com 80 e 95% de confiança respectivamente. Foram identificados 22 doadores de pólen e uma autofecundação, verificou-se que o morfotipo bífoliolado não é garantia de cruzamento intraespecifico, já que quatro progênies foram identificadas como híbridos interespecíficos. Foram detectados em média 7 a 12,3 alelos por locus e uma heterozigosidade média observada entre 0,382 a 0,898 e a esperada entre 0,354 a 0,693. O índice de fixação foi entre -0,053 a -0,319. A variação entre os grupos foi de 5%, sendo 95% dentro deles. Os resultados indicam boas perspectivas para realização de trabalhos futuros relacionados à predição de ganhos genéticos a partir da seleção entre e dentro dos grupos de progênies.The objectives of this study were to analyze the mating system and the distribution of molecular variability among and within three groups of open pollinated progenies of Euterpe oleracea, in addition to performing a paternity test to identify the male parents and to further the genetic certification of the bifoliolate seedlings. With this purpose, we applied six microsatellite loci markers to 306 samples. The progeny groups are the result of a mixed breeding system, with no crosses between relatives, with allogamy (tm and ts = 1), and self-fertilization correlation (rt) of 0.110. Different degrees of kinship were found (rp), with complete siblings between 15.5 a 26,1%. Paternity was assigned to 51% and 24% of the samples with 80 % and 95% confidence, respectively. Twenty-two pollen donors and one self-fertilization were identified. We also found that the bifoliolate morphotype does not assure the occurrence of intraspecific crosses, since four progenies were identified as interspecific hybrids. A mean from 7 a 12.3 to alleles per locus was detected. The average heterozygosity was observed between 0.382 and 0.898 and the expected heterozygosity between 0.354 and 0.693. The fixation index was estimated between -0.053 and - 0.319. The variation between groups was 5% and within groups was 95%. The results indicate good prospects for future work related to the prediction of genetic gains from the selection among and within the progeny groups.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Genetic variability between and within groups of Euterpe spp. based on microsatellites

Objetivou-se neste trabalho estudar a diversidade entre e dentro de acessos da coleção de Euterpe spp. da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina - Estação Experimental de Itajaí (EPAGRI-EEI) e identificar grupos dissimilares que possam orientar cruzamentos dirigidos para obtenção de combinações genotípicas desejáveis. Para tal, foram testados 18 marcadores microssatélites, previamente desenvolvidos para Euterpe edulis Mart. Seis deles – EE54, EE59, EE03, EE45, EE52 e EE47 - foram eficientes e empregados na obtenção das estimativas desejadas. Foram revelados em média15 a 4 alelos por grupo, sendo que o conteúdo de informação polimórfica variou de 0,305 a 0,835. A partir da análise de variância foram obtidos valores de variação de 13% entre grupos, 47 e 40% entre e dentro dos acessos, respectivamente. O Método bayesiano indicou a formação de quatro grupos e a partir do dendograma com o método Ward, com 50% do valor de dissimilaridade foi possível identificar os acessos que compõe esses grupos, além de indicar os acessos com dissimilaridade baixa (≤ 10%). A diversidade encontrada possibilita a orientação de cruzamentos dirigidos, tanto para formação de híbridos intra e interespecíficos, como para retrocruzamentos.The objective of this article is to study the diversity between and within groups of accesses of the Euterpe spp. germoplasm collection of the Agricultural Research and Rural Extension Company of Santa Catarina - Itajaí Experimental Station and to identify dissimilar groups that could guide targeted crossesin order to obtain desirable genotypic combinations. Therefore, 18 microsatellite markers, previously developed for Euterpe edulis Mart., were tested. Six of them - EE03, EE45, EE47, EE52, EE54 and EE59 - were efficient and used to obtain the desired estimates. The average polymorphic information content varied from 0.305 to 0.835. Trought the variation analysis, variation values of 13% were obtained between the groups, 40 and 47% within and between the accessions. The Bayesian Method indicated the formation of four groups and from the dendogram with the Ward method, 50% of the dissimilarity value was possible to illustrate them, besides indicating the accesses with low dissimilarity (≤ 10%). The diversity found allows the orientation of directed crosses, both for intra and interspecific hybrids formation and for backcrossing.Facultad de Ciencias Agrarias y Forestale

Parâmetros genéticos e teste de paternidade em progênies de Euterpe oleracea produto da hibridação espontânea com Euterpe edulis em clima subtropical

The objectives of this study were to analyze the mating system and the distribution of molecular variability among and within three groups of open pollinated progenies of Euterpe oleracea, in addition to performing a paternity test to identify the male parents and to further the genetic certification of the bifoliolate seedlings. With this purpose, we applied six microsatellite loci markers to 306 samples. The progeny groups are the result of a mixed breeding system, with no crosses between relatives, with allogamy (tm and ts = 1), and self-fertilization correlation (rt) of 0.110. Different degrees of kinship were found (rp), with complete siblings between 15.5 a 26,1%. Paternity was assigned to 51% and 24% of the samples with 80 % and 95% confidence, respectively. Twenty-two pollen donors and one self-fertilization were identified. We also found that the bifoliolate morphotype does not assure the occurrence of intraspecific crosses, since four progenies were identified as interspecific hybrids. A mean from 7 a 12.3 to alleles per locus was detected. The average heterozygosity was observed between 0.382 and 0.898 and the expected heterozygosity between 0.354 and 0.693. The fixation index was estimated between -0.053 and -0.319. The variation between groups was 5% and within groups was 95%. The results indicate good prospects for future work related to the prediction of genetic gains from the selection among and within the progeny groups.O objetivo deste estudo foi avaliar o sistema de fecundação e a distribuição da variabilidade molecular entre e dentro de três grupos de progênies de polinização aberta de Euterpe oleracea, além de realizar um teste depaternidade para identificação dos genitores masculinos e promover a certificação genética das plântulasbífolioladas. Para tal, foram utilizados seis loci microssatélites em 306 amostras. Os grupos de progênies sãoresultado de um sistema misto de fecundação, com ausência de cruzamentos entre aparentados, sendoalógamos (tm e ts = 1,0), com correlação de autofecundação (rt) igual a 0,110. Foram constatados diferentesgraus de parentescos (rp), entre 15,5 a 26,1% de irmãos completos. A paternidade foi atribuída para 51% e 24% das amostras, com 80 e 95% de confiança respectivamente. Foram identificados 22 doadores de pólen e uma autofecundação, verificou-se que o morfotipo bífoliolado não é garantia de cruzamento intraespecifico, já que quatro progênies foram identificadas como híbridos interespecíficos. Foram detectados em média 7 a 12,3 alelos por locus e uma heterozigosidade média observada entre 0,382 a 0,898 e a esperada entre 0,354 a 0,693. O índice de fixação foi entre -0,053 a -0,319. A variação entre os grupos foi de 5%, sendo 95% dentro deles. Os resultados indicam boas perspectivas para realização de trabalhos futuros relacionados à predição de ganhos genéticos a partir da seleção entre e dentro dos grupos de progênies

Variabilidade genética entre e dentro de grupos de Euterpe spp. com base em microssatélites

The objective of this article is to study the diversity between and within groups of accesses of the Euterpe spp. germoplasm collection of the Agricultural Research and Rural Extension Company of Santa Catarina - Itajaí Experimental Station and to identify dissimilar groups that could guide targeted crossesin order to obtain desirable genotypic combinations. Therefore, 18 microsatellite markers, previously developed for Euterpe edulis Mart., were tested. Six of them - EE03, EE45, EE47, EE52, EE54 and EE59 - were efficient and used to obtain the desired estimates. The average polymorphic information content varied from 0.305 to 0.835. Trought the variation analysis, variation values of 13% were obtained between the groups, 40 and 47% within and between the accessions. The Bayesian Method indicated the formation of four groups and from the dendogram with the Ward method, 50% of the dissimilarity value was possible to illustrate them, besides indicating the accesses with low dissimilarity (≤ 10%). The diversity found allows the orientation of directed crosses, both for intra and interspecific hybrids formation and for backcrossing.Objetivou-se neste trabalho estudar a diversidade entre e dentro de acessos da coleção de Euterpe spp. da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina - Estação Experimental de Itajaí (EPAGRI-EEI) e identificar grupos dissimilares que possam orientar cruzamentos dirigidos para obtenção de combinações genotípicas desejáveis. Para tal, foram testados 18 marcadores microssatélites, previamente desenvolvidos para Euterpe edulis Mart. Seis deles – EE54, EE59, EE03, EE45, EE52 e EE47 - foram eficientes e empregados na obtenção das estimativas desejadas. Foram revelados em média15 a 4 alelos por grupo, sendo que o conteúdo de informação polimórfica variou de 0,305 a 0,835. A partir da análise de variância foram obtidos valores de variação de 13% entre grupos, 47 e 40% entre e dentro dos acessos, respectivamente. O Método bayesiano indicou a formação de quatro grupos e a partir do dendograma com o método Ward, com 50% do valor de dissimilaridade foi possível identificar os acessos que compõe esses grupos, além de indicar os acessos com dissimilaridade baixa (≤ 10%). A diversidade encontrada possibilita a orientação de cruzamentos dirigidos, tanto para formação de híbridos intra e interespecíficos, como para retrocruzamentos

Variabilidade genética entre e dentro de grupos de Euterpe spp. com base em microssatélites

Objetivou-se neste trabalho estudar a diversidade entre e dentro de acessos da coleção de Euterpe spp. da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina - Estação Experimental de Itajaí (EPAGRI-EEI) e identificar grupos dissimilares que possam orientar cruzamentos dirigidos para obtenção de combinações genotípicas desejáveis. Para tal, foram testados 18 marcadores microssatélites, previamente desenvolvidos para Euterpe edulis Mart. Seis deles – EE54, EE59, EE03, EE45, EE52 e EE47 - foram eficientes e empregados na obtenção das estimativas desejadas. Foram revelados em média15 a 4 alelos por grupo, sendo que o conteúdo de informação polimórfica variou de 0,305 a 0,835. A partir da análise de variância foram obtidos valores de variação de 13% entre grupos, 47 e 40% entre e dentro dos acessos, respectivamente. O Método bayesiano indicou a formação de quatro grupos e a partir do dendograma com o método Ward, com 50% do valor de dissimilaridade foi possível identificar os acessos que compõe esses grupos, além de indicar os acessos com dissimilaridade baixa (≤ 10%). A diversidade encontrada possibilita a orientação de cruzamentos dirigidos, tanto para formação de híbridos intra e interespecíficos, como para retrocruzamentos

Parâmetros genéticos e teste de paternidade em progênies de Euterpe oleracea produto da hibridação espontânea com Euterpe edulis em clima subtropical

The objectives of this study were to analyze the mating system and the distribution of molecular variability among and within three groups of open pollinated progenies of Euterpe oleracea, in addition to performing a paternity test to identify the male parents and to further the genetic certification of the bifoliolate seedlings. With this purpose, we applied six microsatellite loci markers to 306 samples. The progeny groups are the result of a mixed breeding system, with no crosses between relatives, with allogamy (tm and ts = 1), and self-fertilization correlation (rt) of 0.110. Different degrees of kinship were found (rp), with complete siblings between 15.5 a 26,1%. Paternity was assigned to 51% and 24% of the samples with 80 % and 95% confidence, respectively. Twenty-two pollen donors and one self-fertilization were identified. We also found that the bifoliolate morphotype does not assure the occurrence of intraspecific crosses, since four progenies were identified as interspecific hybrids. A mean from 7 a 12.3 to alleles per locus was detected. The average heterozygosity was observed between 0.382 and 0.898 and the expected heterozygosity between 0.354 and 0.693. The fixation index was estimated between -0.053 and -0.319. The variation between groups was 5% and within groups was 95%. The results indicate good prospects for future work related to the prediction of genetic gains from the selection among and within the progeny groups.O objetivo deste estudo foi avaliar o sistema de fecundação e a distribuição da variabilidade molecular entre e dentro de três grupos de progênies de polinização aberta de Euterpe oleracea, além de realizar um teste de paternidade para identificação dos genitores masculinos e promover a certificação genética das plântulas bífolioladas. Para tal, foram utilizados seis loci microssatélites em 306 amostras. Os grupos de progênies são resultado de um sistema misto de fecundação, com ausência de cruzamentos entre aparentados, sendo alógamos (tm e ts = 1,0), com correlação de autofecundação (rt) igual a 0,110. Foram constatados diferentes graus de parentescos (rp), entre 15,5 a 26,1% de irmãos completos. A paternidade foi atribuída para 51% e 24% das amostras, com 80 e 95% de confiança respectivamente. Foram identificados 22 doadores de pólen e uma autofecundação, verificou-se que o morfotipo bífoliolado não é garantia de cruzamento intraespecifico, já que quatro progênies foram identificadas como híbridos interespecíficos. Foram detectados em média 7 a 12,3 alelos por locus e uma heterozigosidade média observada entre 0,382 a 0,898 e a esperada entre 0,354 a 0,693. O índice de fixação foi entre -0,053 a -0,319. A variação entre os grupos foi de 5%, sendo 95% dentro deles. Os resultados indicam boas perspectivas para realização de trabalhos futuros relacionados à predição de ganhos genéticos a partir da seleção entre e dentro dos grupos de progênies

Parâmetros genéticos e teste de paternidade em progênies de Euterpe oleracea produto da hibridação espontânea com Euterpe edulis em clima subtropical

O objetivo deste estudo foi avaliar o sistema de fecundação e a distribuição da variabilidade molecular entre e dentro de três grupos de progênies de polinização aberta de Euterpe oleracea, além de realizar um teste de paternidade para identificação dos genitores masculinos e promover a certificação genética das plântulas bífolioladas. Para tal, foram utilizados seis loci microssatélites em 306 amostras. Os grupos de progênies são resultado de um sistema misto de fecundação, com ausência de cruzamentos entre aparentados, sendo alógamos (tm e ts = 1,0), com correlação de autofecundação (rt) igual a 0,110. Foram constatados diferentes graus de parentescos (rp), entre 15,5 a 26,1% de irmãos completos. A paternidade foi atribuída para 51% e 24% das amostras, com 80 e 95% de confiança respectivamente. Foram identificados 22 doadores de pólen e uma autofecundação, verificou-se que o morfotipo bífoliolado não é garantia de cruzamento intraespecifico, já que quatro progênies foram identificadas como híbridos interespecíficos. Foram detectados em média 7 a 12,3 alelos por locus e uma heterozigosidade média observada entre 0,382 a 0,898 e a esperada entre 0,354 a 0,693. O índice de fixação foi entre -0,053 a -0,319. A variação entre os grupos foi de 5%, sendo 95% dentro deles. Os resultados indicam boas perspectivas para realização de trabalhos futuros relacionados à predição de ganhos genéticos a partir da seleção entre e dentro dos grupos de progênies