Collaborative denoising autoencoder for high glycated haemoglobin prediction.

A pioneering study is presented demonstrating that the presence of high glycated haemoglobin (HbA1c) levels in a patient’s blood can be reliably predicted from routinely collected clinical data. This paves the way for performing early detection of Type-2 Diabetes Mellitus (T2DM). This will save healthcare providers a major cost associated with the administration and assessment of clinical tests for HbA1c. A novel collaborative denoising autoencoder framework is used to address this challenge. The framework builds an independent denoising autoencoder model for the high and low HbA1c level, which extracts feature representations in the latent space. A baseline model using just three features: patient age together with triglycerides and glucose level achieves 76% F1-score with an SVM classifier. The collaborative denoising autoencoder uses 78 features and can predict HbA1c level with 81% F1-score

Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data

Improving the multiobjective evolutionary algorithm based on decomposition with new penalty schemes

It has been increasingly reported that the multiobjective optimization evolutionary algorithm based on decomposition (MOEA/D) is promising for handling multiobjective optimization problems (MOPs). MOEA/D employs scalarizing functions to convert an MOP into a number of single-objective subproblems. Among them, penalty boundary intersection (PBI) is one of the most popular decomposition approaches and has been widely adopted for dealing with MOPs. However, the original PBI uses a constant penalty value for all subproblems and has difficulties in achieving a good distribution and coverage of the Pareto front for some problems. In this paper, we investigate the influence of the penalty factor on PBI, and suggest two new penalty schemes, i.e., adaptive penalty scheme and subproblem-based penalty scheme (SPS), to enhance the spread of Pareto-optimal solutions. The new penalty schemes are examined on several complex MOPs, showing that PBI with the use of them is able to provide a better approximation of the Pareto front than the original one. The SPS is further integrated into two recently developed MOEA/D variants to help balance the population diversity and convergence. Experimental results show that it can significantly enhance the algorithm�s performance. © 2016, Springer-Verlag Berlin Heidelberg

Sur le développement larvaire de Grouvellinus coyei Allard, 1868 (Coleoptera-Elmidae) récolté dans la Bekaa-Liban

L'étude biométrique des populations larvaires de Grouvellinus coyei récoltées à Chlifa dans la Bekaa-Liban, a permis d'identifier 8 stades larvaires chez cette espèce. Son cycle de développement paraît s'étaler sur plus d'une année, mais devra être précisé ultérieurement

Les stades ailés de Baetis samochai Koch 1981 du Proche-Orient (Insecta : Ephemeroptera)

Les imagos et subimagos mâles et femelles de Baetis samochai Koch, 1981 sont décrites sur du matériel en provenance de la plaine de la Békaa (Liban)

Les Hétéroptères aquatiques du Liban. I. Inventaire faunistique

Un inventaire des Hétéroptères aquatiques du Liban, basé sur des collections récentes et sur la littérature, est donné. Cet inventaire est accompagné de notes faunistiques et biogéographiques sur la base d'une comparaison avec la faune des pays avoisinants

Les Chironomidés (Diptera) du Liban. I. Premier inventaire faunistique

Dans ce travail, les auteurs dressent un premier inventaire faunistique des Chironomidés du Liban où 142 taxa ont été identifiés dans les deux rivière Oronte et Litani de la plaine de la Bekaa et dans la rivière côtière Beyrouth. 81 espèces se révèlent nouvelles pour la région de la Méditerranée orientale : 131 sont nouvelles pour le Moyen-Orient dont les seules données antérieures concernaient la faune lacustre d'Israël. La distribution géographique des Chironomidés du Liban permet de situer cette région au carrefour des influences paléarctique, éthiopienne et orientale

Cinq espèces nouvelles de Diptères Psychodidae Psychodinae du Liban

Des représentants de 10 espèces de Psychodinae ont été recueillis au Liban ; 4 d'entre elles ont une vaste répartition en Europe et même en dehors de ce continent ; 5 autres espèces sont nouvelles et chacune d'entre elles est proche d'une espèce de la partie occidentale de l'Europe

Les Chironomidés (Diptera) du Liban. II. Description de l'imago mâle et de la nymphe de Thienemannia libanica n.sp

Les auteurs décrivent l'imago [math] et la nymphe d'une nouvelle espèce récoltée dans la rivière Yammouné (Bekaa-Liban) et la comparent avec la seule espèce européenne connue du genre Thienemannia gracilis K