Роль полиморфизма в промоторной области гена TNF в развитии хронической обструктивной болезни легких

Association of –308G/A-polymorphism of α-tumor necrosis factor (TNF) gene with the development of chronic obstructive pulmonary disease has been investigated in two populations of Tomsk city (Siberian Tatars and Russians). As a result, it has not been marked any genotype distribution deviation of expected in patient groups as well as in control groups at Hardy-Vainberg equilibrium. Statistically significant difference in allele distribution rate at patients with COPD and in control groups has not been found (p > 0,5) including ethnic groups (Russians and Tatars). Differences in genotype distribution at patients and control group have been found for Tatars due to heterosive carrier (AG) prevalence at patients (p < 0,05). The obtained data allow to conclude the presence of association of –308G/A-polymorphism of TNF gene with the COPD development at Siberian Tatars.Исследована ассоциация полиморфизма –308G/A гена фактора некроза опухолей-α (TNF) с развитием хронической обструктивной болезни легких в двух популяциях г. Томска (сибирские татары и русские). В результате, как в группах больных, так и в группах контроля, не отмечено отклонения распределений генотипов от ожидаемых при равновесии Харди—Вайнберга. Статистически значимых различий в распределении частот аллелей среди больных с ХОБЛ и в контрольных группах получено не было (p > 0,5), в том числе и между этническими группами (русские и татары). Для татар были установлены различия в распределении генотипов между больными и контрольной группой за счет преобладания гетерозитных носителей (AG) у больных (p < 0,05). Полученные данные позволяют сделать заключение о наличии ассоциации полиморфизма –308G/A гена TNF с развитием ХОБЛ у сибирских татар

ЦИРКУЛИРУЮЩАЯ РЕКОМБИНАНТНАЯ ФОРМА ВИРУСА ГЕПАТИТА С RF2k/1b: ПРОБЛЕМЫ ДИАГНОСТИКИ И ТЕРАПИИ

Study objective: To find out the causes of nonstandard results of hepatitis C virus genotyping using the test system Abbott RealTime HCV Genotype II. Materials and methods: 19 plasma samples from HCV/HIV patients showing nonstandard genotyping results were studied by sequencing the NS5B and 5’UTR/core regions of viral genomes. Genotyping kits manufactured by Vector-Best and Interlabservice were additionally used. Results: Patients were found to be infected with RF2k/1b HCV. RF2k/1b HCV was found in 6% of the co-infected HCV/HIV patients. Conclusion: The routinely used test systems targeted to only one fragment of HCV genome, i.e. to 5’UTR/core, erroneously identify the RF2k/1b recombinant as genotype 2. Data on antiviral therapy for RF2k/1b HCV suggest that therapeutic regimens recommended for genotype 2 HCV are inadequate for RF2k/1b cases.Цель исследования: установить причину «нестандартных» результатов при генотипировании вируса гепатита С (ВГС) с применением тест-системы «Abbott RealTime HCV Genotype II». Материалы и методы исследования: 19 образцов плазмы крови коинфицированных ВГС/ВИЧ пациентов с «нестандартными» результатами генотипирования ВГС были исследованы путем секвенирования областей генома ВГС NS5B и 5’UTR/core, а также с применением генотипирующих наборов производства «Вектор-Бест» и «Интерлабсервис». Результаты: установлено, что обследованные пациенты инфицированы RF2k/1b ВГС. Среди коинфицированных ВИЧ/ВГС доля инфицированных RF2k/1b составляет 6%. Заключение: широко применяемые в рутинной практике тест-системы, мишенью которых является только один фрагмент генома вируса 5’UTR/core, ошибочно идентифицируют рекомбинант ВГС RF2k/1b как генотип 2. Данные о результатах противовирусной терапии у пациентов, инфицированных RF2k/1b, говорят о недостаточной эффективности схем, рекомендованных для лечения вируса генотипа 2