Diversity in Secondary Metabolites Including Mycotoxins from Strains of <i>Aspergillus </i>Section <i>Nigri </i>Isolated from Raw Cashew Nuts from Benin, West Africa

<p>In a previous study, raw cashew kernels were assayed for the fungal contamination focusin on strains belonging to the genus Aspergillus and on aflatoxins producers. These sample showed high contamination with Aspergillus section Nigri species and absence o aflatoxins. To investigate the diversity of secondary metabolites, including mycotoxins, th species of A. section Nigri may produce and thus threaten to contaminate the raw cashe kernels, 150 strains were isolated from cashew samples and assayed for their productio of secondary metabolites using liquid chromatography high resolution mass spectrometr (LC-HRMS). Seven species of black Aspergilli were isolated based on morphological an chemical identification: A.Tubingensis (44%), A. niger (32%), A. brasiliensis (10%), A. carbonariu (8.7%), A. luchuensis (2.7%), A. aculeatus (2%) and A. aculeatinus (0.7%). Fro these, 45 metabolites and their isomers were identified. Aurasperone and pyranonigrin A produced by all species excluding A. aculeatus and A. aculeatinus, were most prevalen and were encountered in 146 (97.3%) and 145 (95.7%) isolates, respectively. Three mycotoxin groups were detected: fumonisins (B2 and B4) (2.7%) ochratoxin A (13.3%), an secalonic acids (2%), indicating that these mycotoxins could occur in raw cashew nuts Thirty strains of black Aspergilli were randomly sampled for verification of species identit based on sequences of β-Tubulin and calmodulin genes. Among them, 27 isolates wer positive to the primers used and 11 were identified as A. niger, 7 as A.Tubingensis, 6 as A carbonarius, 2 as A. luchuensis and 1 as A. welwitschiae confirming the species names a based on morphology and chemical features. These strains clustered in 5 clades in A. sectio Nigri. Chemical profile clustering also showed also 5 groups confirming the speciespecific metabolites production.</p

COVID-19 in pediatric nephrology centers in Turkey

Background/aim: There is limited data on COVID-19 disease in children with kidney disease. We aimed to investigate the characteristics and prognosis of COVID-19 in pediatric nephrology patients in Turkey. Materials and methods: This was a national, multicenter, retrospective cohort study based on an online survey evaluating the data between 11th March 2020 and 11th March 2021 as an initial step of a detailed pediatric nephrology COVID-19 registry. Results: Two hundred and three patients (89 girls and 114 boys) were diagnosed with COVID-19. One-third of these patients (36.9%) were between 10–15 years old. Half of the patients were on kidney replacement therapy: kidney transplant (KTx) recipients (n = 56, 27.5%), patients receiving chronic hemodialysis (n = 33, 16.3%) and those on peritoneal dialysis (PD) (n = 18, 8.9%). Fifty-four (26.6%) children were asymptomatic. Eighty-two (40.3%) patients were hospitalized and 23 (28%) needed intensive care unit admission. Fifty-five percent of the patients were not treated, while the remaining was given favipiravir (20.7%), steroid (16.3%), and hydroxychloroquine (11.3%). Acute kidney injury developed in 19.5% of hospitalized patients. Five (2.4%) had MIS-C. Eighty-three percent of the patients were discharged without any apparent sequelae, while 7 (3.4%) died. One hundred and eight health care staff were infected during the study period. Conclusion: COVID-19 was most commonly seen in patients who underwent KTx and received HD. The combined immunosuppressive therapy and frequent exposure to the hospital setting may increase these patients’ susceptibility. Staff infections before vaccination era were alarming, various precautions should be taken for infection control, particularly optimal vaccination coverage

Thermus Oshimai DSMZ 12092'ye ait β-galaktosidazın kısmi karakterizasyonu ile transferaz aktivitesinin belirlenmesi ve β-galaktosidaz geninin E. Coli'de klonlanması

β-Galaktosidazlar hidrolitik enzim sınıfına ait olup laktoz hidrolizi amacıyla süt endüstrisinde uzun bir süredir kullanılmaktadır. Laktoz intoleransı, sütün baskın şekeri laktozun yeterli sindirilememesinden kaynaklanmaktadır ve bu sebeple β-galaktosidazlar laktozsuz süt ürünlerinin üretimi amacıyla son derece önemlidir. Termofiliklerden elde edilen termostabil β-galaktosidazlar mezofilik enzimlerle karşılaştırıldığında düşük-laktozlu süt ürünlerinin üretiminde çok önemli avantajlara sahiptir. Enzimin laktoz hidrolizinde kullanılmalarının yanı sıra son zamanlarda transferaz aktivitesi sonucu laktozdan galaktooligasakkaritlerin üretimi açısından oldukça ilgi çekici olmaya başlamıştır. Çalışmamızda Thermus oshimai DSMZ 12092'ye ait β-galaktosidaz enziminin kısmi karakterizasyonuyla beraber transferaz aktivitesi olup olmadığı incelenmiş ve β-galaktosidaz geninin E. coli'de klonlanması gerçekleştirilmiştir. Thermus oshimai DSMZ 12092'nin β-galaktosidaz enziminin hücre içi bir enzim olması sebebiyle öncelikle çalkalamalı erlenlerde ve biyoreaktörlerde pellet üretimi gerçekleştirilmiştir. Çalkalamalı erlenlerde ve biyoreaktörler bakteriye ait büyüme hızı ve ikilenme süresi belirlenmiş olup sırasıyla 0,29 h-1, 2,41 h ve 0,42 h-1, 1,65 h olarak saptanmıştır. Enzimin kısmi karakterizasyonu amacıyla yapılan çalışmada enzimin çalıştığı optimal sıcaklık ve pH sırasıyla 75 °C ve nötral olarak belirlenmiştir. Enzim aktivitesi üzerine en etkili iki değerlikli katyonun 1,0 mM konsantrasyon kullanıldığında Zn2+ olduğu saptanmış (Zn2+> Fe+2> Ca+2>Cu+2> Mg+2> Mn+2) ve konsantrasyonun artmasına bağlı olarak bu etkinin azaldığı görülmüştür. Ayrıca enzimin bazik pH'lara ve yüksek sıcaklıklara karşı stabilitesinin yüksek olması sebebiyle Thermus oshimai DSMZ 12092'ye ait β- galaktosidaz gen bölgesinin dizisi belirlenmiş olup GenBanka'sına kayıtlanmıştır. Ayrıca β-galaktosidaz geni pBR322 plazmidine klonlanmıştır. β-Galaktosidaz enziminin transferaz aktivitesi ile galaktooligosakkarit (GOS) sentezi HPLC ile kromatografik olarak belirlenmiş ve maksimum GOS üretiminin sağlanması amacıyla farklı reaksiyon (pH, sıcaklık, başlangıç laktoz konsantrasyonu, reaksiyon süresi, enzim konsantrasyonu ve enzim saflığı) koşulları incelenmiştir. En yüksek GOS üretimi 85 °C'de pH 6,0'da, 0,1 U/ml saf enzim ile başlangıç laktoz konsantrasyonu %50 kullanıldığında gerçekleşmiştir

Çeşitli salep (orkide) türlerinde mikoriza oluşturan fungusların izolasyonu ve tanımlanması ile inokulant olarak kullanım olanaklarının incelenmesi

Bu çalışmada Ege Bölgesi ve Akdeniz Bölgesi yörelerinden toplanan salep bitkilerinden mikorizal fungusların izolasyon ve tanımlamaları yapılmış ayrıca bu mikorizal fungusların inokulant olarak kullanım olanakları araştırılmıştır. Çalışmanın sonucunda salep bitkilerinin kök ve yumrularından elde edilen toplam 47 fungus izolatının 44ʼünün Fusarium genusuna., 2ʼsinin Rhizoctonia genusuna. ve 1ʼnin Papulaspora genusuna ait olduğu saptanmıştır. Orkid mikorizal funguslarından 2 tane Rhizoctonia sp. suşu ve Papulaspora sp. suşunun biyoformülasyonu için en uygun propagül boyutu belirlenmiştir. Ayrıca Rhizoctonia sp. izolat 2ʼnin toprakta biyoformülasyonu gerçekleştirilmiştir. Böylece doğada gittikçe azalan salep bitkisinin simbiyotik kültür yöntemiyle in-vitro koşullarda çoğaltılmasına öncülük edecek veriler elde edilmiştir

Mycotoxins and other secondary metabolites of <i>Aspergillus</i> section <i>Nigri</i> isolated from cashew nuts.

<p>Mycotoxins and other secondary metabolites of <i>Aspergillus</i> section <i>Nigri</i> isolated from cashew nuts.</p

Base Peak Chromatogram (BPC) of <i>Aspergillus niger</i> extract.

<p>The Analysis was done by reversed phase ultra-high-performance liquid chromatography quadrupole time of flight mass spectrometry. Positive electrospray ionization (<i>ESI</i>⁺, <i>m/z</i> 100–1000). <i>A</i>. <i>niger</i> was cultured on yeast extract sucrose agar for 5 days in dark. The BPC showed the production of fumonisin B₂ and fumonisin B₄ and other secondary metabolites.</p

<i>Aspergillus</i> section <i>Nigri</i> strains isolated from cashew nuts characterized by sequence analysis.

<p><i>Aspergillus</i> section <i>Nigri</i> strains isolated from cashew nuts characterized by sequence analysis.</p

Mycotoxins and other secondary metabolites of <i>Aspergillus</i> section <i>Nigri</i> isolated from cashew nuts.

<p>Mycotoxins and other secondary metabolites of <i>Aspergillus</i> section <i>Nigri</i> isolated from cashew nuts.</p