Detection and identification of pathogenic viruses Gulupa crops (Passiflora edulis Sims) in the region of Sumapaz (Cundinamarca)

ilustraciones, fotografías, gráficas, tablasEl cultivo de gulupa en Colombia representa un nuevo e importante reglón de exportación del sector frutícola. La información y prácticas agronómicas para el sistema de gulupa son extrapoladas de otros cultivos de pasifloras, por lo cual es prioritario investigar sobre los problemas fitosanitarios en esta especie. El objetivo del presente trabajo fue detectar virus que infectan gulupa mediante procedimientos serológicos y moleculares, y definir su identidad mediante secuenciación. El muestreo se realizó en cultivos ubicados en la región del Sumapáz (Cundinamarca). Las plantas evaluadas exhibían síntomas asociados a infección viral, tales como manchas verdes en frutos inmaduros, manchas anulares en frutos maduros, deformación en puntas terminales de ramas, deformación y mosaicos foliares. Se evaluaron tres métodos de extracción de RNA a partir de tejido foliar: Cromatografía en columna de celulosa CF-11 (Whatman), TRIzol y protocolo de extracción para pino. La detección mediante RT-PCR se realizó empleando primers específicos para Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Passion fruit yellow mosaic virus (PFYMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato ringspot virus (ToRSV) y Soybean mosaic virus (SMV); adicionalmente, se evaluaron primers degenerados para los géneros Potyvirus y Carlavirus. La presencia de CMV y Potyvirus fue detectada mediante RT-PCR, la evaluación con los otros primers no permitió la detección de los otros virus. La identidad nucleotídica de los productos de PCR obtenidos con primers Potyvirus correspondió a SMV. El análisis serológico mediante ELISA permitió la detección de CMV, SMV, CABMV y Potyvirus. Este trabajo es el primer reporte de infección por SMV y CMV en gulupa. (Texto tomado de la fuente).The crop of gulupa in Colombia represents a significant new export screed in the fruit sector. Information and agronomic practices for gulupa system are extrapolated from other pasiflora crops; hence research on plant protection of this specie has been constituted in a priority. The aim of this study was to detect viruses infecting gulupa by serological and molecular procedures, and to define their identity by sequencing. Sampling was performed in crops located in the region of Sumapaz (Cundinamarca). The tested plants exhibited symptoms associated with viral infection, such as green spots on immature fruits, ring spots on mature fruits, deformation on endpoints of branches, leaf deformation and mosaic. We evaluated three methods for RNA extraction from leaf tissue: CF-11 cellulose (Whatman) column chromatography, TRIzol and extraction protocol from pine. The RT-PCR detection was performed using specific primers for Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Passion fruit yellow mosaic virus (PFYMV), Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato ringspot virus (ToRSV) and Soybean mosaic virus (SMV). Additionally, degenerate primers were evaluated for the genera Potyvirus and Carlavirus. CMV and Potyvirus infections were detected by RT-PCR, the evaluation with the other primers did not allow the detection of other viruses. The nucleotide identity of PCR Potyvirus products revealed to SMV. The serological analysis by ELISA allowed the detection of CMV, SMV, CABMV and Potyvirus. This work is the first report of SMV and CMV infection in gulupa.Incluye anexosMaestríaMagíster en Ciencias AgrariasFitopatologíaCiencias Agronómica

Effect of rhizomania on red table-beet biomass production and molecular characterization of an isolate of Beet necrotic yellow vein virus from Brazil

In Brazil, Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV), which causes rhizomania in red table-beet (Beta vulgaris subsp. vulgaris), was first reported in 2015. This study evaluated the pathogenic effects of the disease on biomass production of red table-beet plants under field conditions. The effect of rhizomania infection depended on the season when the experiment was conducted. BNYVV infection had no effect on dry weight of aerial parts of plants growing in autumn, and a marginal effect on storage roots, reducing the weight by 27.5%. In spring, rhizomania significantly reduced the dry weight of aerial parts by 48% and the storage-root weight by 64.6%. The presence of the possible vector Polymyxa betae was confirmed by PCR and subsequent nucleotide sequencing. The near-complete genome of a BNYVV isolate from Brazil was determined using high-throughput sequencing; the homologous sequence of the RNA-5 genome segment was not identified. The BNYVV genome of the Brazilian isolate was very similar to the type BNYVV-S isolate.Instituto de Patología VegetalFil: Camelo García, Viviana Marcela. Universidade de São Paulo. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Departamento de Fitopatologia e Nematologia; BrasilFil: Edwards Molina, Juan Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Nagata, Tatsuya. Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular; BrasilFil: Rezende, Jorge A. M. Universidade de São Paulo. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz. Departamento de Fitopatologia e Nematologia; BrasilFil: Silva, João M. F. Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular; Brasi

Biodiversidad 2018. Reporte de estado y tendencias de la biodiversidad continental de Colombia

Las cifras y temáticas contenidos en el presente Reporte, aunque no son el panorama completo del estado del conocimiento de la biodiversidad en Colombia, son un compendio seleccionado de los temas que, desde el Instituto Humboldt, consideramos son relevantes y merecen ser discutidos por el público general. En muchos de los casos, las cifras no son esperanzadoras u son un llamado urgente a la acción. En otro casos son la evidencia de que se requieren acciones a nivel nacional, y más allá de esto, son muchas las iniciativas que están germinando desde los territorios, cada vez desde una mayor variedad de actores.Bogotá, D. C., Colombi