12 research outputs found
Seguimiento y recuperación de las poblaciones de conejo europeo (Oryctolagus cuniculus cuniculus) en Mallorca (Illes Balears) (2016-2019)
[spa] El conejo europeo (Oryctolagus cuniculus) es una especie clave y de gran interés económico y ecológico en los ecosistemas Mediterráneos. Durante las últimas décadas los drásticos cambios en los usos del territorio han transformado parte de él, modificando los hábitats naturales, problemática que se ha visto agravada con la incidencia de dos enfermedades víricas, la mixomatosis y la enfermedad hemorrágica (RHD), lo que ha provocado un importante declive de las poblaciones de conejo en Mallorca. La conservación de la especie se ha basado en determinadas ocasiones en la realización de repoblaciones. En este trabajo se muestran los resultados de un estudio iniciado en Mallorca cuya finalidad última es la de minimizar los riesgos asociados con esta medida de gestión, y establecer las bases metodológicas para una correcta recuperación de la especie. Por todo ello, se ha llevado a cabo un muestreo de las poblaciones de conejo susceptibles de ser donadoras, analizando sus características genéticas y sanitarias, a la par que se realiza una prospección de la situación de las poblaciones de conejo silvestre de Mallorca. De esta forma, la administración cinegética de Mallorca ha desarrollado durante los años 2016 y 2019 la cría experimental de conejo de campo partir de seis poblaciones donadoras en condiciones controladas de semi-libertad en el Centre Cinegètic de Mallorca. Los conejos obtenidos han servido para repoblar zonas en las que la densidad de conejo era baja o nula. Las bajas causadas por la nueva variante de la RHD (virus RHDV-2) en los núcleos de cría, y la depredación en las áreas de repoblación, han sido las causas de mortalidad más importantes. Posteriormente, se han observado tasas de mortalidad menores, lo que sugiere una mayor capacidad de respuesta inmunológica natural a la RHD, y las siguientes repoblaciones realizadas en la isla hasta la actualidad han mostrado altas tasas de supervivencia y adaptación de los ejemplares.[cat] El conill europeu (Oryctolagus cuniculus) és una espècie clau i de gran interès econòmic i ecològic als ecosistemes Mediterranis. Durant les últimes dècades els dràstics canvis en els usos del territori han transformat part d'ell, modificant els hàbitats naturals, problemàtica que s'ha vist agreujada amb la incidència de dues malalties víriques, la mixomatosi i la malaltia hemorràgica (RHD), el que ha provocat un important declivi de les poblacions de conill a Mallorca. La conservació de l'espècie s'ha basat en determinades ocasions en la realització de repoblacions. En aquest treball es mostren els resultats d'un estudi iniciat a Mallorca la finalitat última és la de minimitzar els riscos associats amb aquesta mesura de gestió, i establir les bases metodològiques per a una correcta recuperació de l'espècie. Per tot això, s'ha dut a terme un mostreig de les poblacions de conill susceptibles de ser donadores, analitzant les seves característiques genètiques i sanitàries, al mateix temps que es realitza una prospecció de la situació de les poblacions de conill silvestre de Mallorca. D'aquesta manera, l'administració cinegètica de Mallorca ha desenvolupat durant els anys 2016 i 2019 la cria experimental de conill de camp partir de sis poblacions donadores en condicions controlades de semi-llibertat al Centre cinegètic de Mallorca. Els conills obtinguts han servit per a repoblar zones en què la densitat de conill era baixa o nul·la. Les baixes causades per la nova variant de la RHD (virus RHDV-2) en els nuclis de cria, i la depredació en les àrees de repoblació, han estat les causes de mortalitat més importants. Posteriorment, s'han observat taxes de mortalitat menors, el que suggereix una major capacitat de resposta immunològica natural a l'RHD, i les següents repoblacions realitzades a l'illa fins a l'actualitat han mostrat altes taxes de supervivència i adaptació dels exemplars.[eng] The European rabbit (Oryctolagus cuniculus) is a key species of great ecological and economical interest in the Mediterranean ecosystem. During the last decades important changes in the land use have transformed part of its natural habitat, a problem that has been aggravated by the incidence of two viral diseases, myxomatosis and hemorrhagic disease (RHD) causing a major decline in the populations of Mallorca. The conservation of the species has been based on certain occasions in the realization of repopulations. This paper shows the results of a study initiated in Mallorca whose ultimate purpose is to minimize the risks associated with this management measure, and establish the methodological basis for a correct recovery of the species. Therefore, a sampling of the rabbit populations susceptible of being donors has been carried out, analyzing their genetic and sanitary characteristics, at the same time that a survey of the situation of the wild rabbit populations of Mallorca has been carried out. In this way, the hunting administration of Mallorca has developed during the years 2016 and 2019 the field rabbit experimental breeding from six donor populations in controlled conditions of semi-freedom in the Center Cinegètic de Mallorca. The rabbits obtained have served to repopulate areas in which rabbit density was low or zero. The losses caused by the new variant of the RHD (virus RHDV-2) in the breeding nuclei, and the predation in the areas of repopulation, have been the most important causes of mortality. Subsequently, lower mortality rates have been observed, suggesting a greater natural immune response capacity to the RHD, and the following repopulations carried out on the island until now have shown high rates of survival and adaptation of the specimens
Doxorubicin changes the spatial organization of the genome around active promoters
In this study, we delve into the impact of genotoxic anticancer drug treatment on the chromatin structure of human cells, with a particular focus on the effects of doxorubicin. Using Hi-C, ChIP-seq, and RNA-seq, we explore the changes in chromatin architecture brought about by doxorubicin and ICRF193. Our results indicate that physiologically relevant doses of doxorubicin lead to a local reduction in Hi-C interactions in certain genomic regions that contain active promoters, with changes in chromatin architecture occurring independently of Top2 inhibition, cell cycle arrest, and differential gene expression. Inside the regions with decreased interactions, we detected redistribution of RAD21 around the peaks of H3K27 acetylation. Our study also revealed a common structural pattern in the regions with altered architecture, characterized by two large domains separated from each other. Additionally, doxorubicin was found to increase CTCF binding in H3K27 acetylated regions. Furthermore, we discovered that Top2-dependent chemotherapy causes changes in the distance decay of Hi-C contacts, which are driven by direct and indirect inhibitors. Our proposed model suggests that doxorubicin-induced DSBs cause cohesin redistribution, which leads to increased insulation on actively transcribed TAD boundaries. Our findings underscore the significant impact of genotoxic anticancer treatment on the chromatin structure of the human genome
Shear stress switches the association of endothelial enhancers from ETV/ETS to KLF transcription factor binding sites.
Endothelial cells (ECs) lining blood vessels are exposed to mechanical forces, such as shear stress. These forces control many aspects of EC biology, including vascular tone, cell migration and proliferation. Despite a good understanding of the genes responding to shear stress, our insight into the transcriptional regulation of these genes is much more limited. Here, we set out to study alterations in the chromatin landscape of human umbilical vein endothelial cells (HUVEC) exposed to laminar shear stress. To do so, we performed ChIP-Seq for H3K27 acetylation, indicative of active enhancer elements and ATAC-Seq to mark regions of open chromatin in addition to RNA-Seq on HUVEC exposed to 6 h of laminar shear stress. Our results show a correlation of gained and lost enhancers with up and downregulated genes, respectively. DNA motif analysis revealed an over-representation of KLF transcription factor (TF) binding sites in gained enhancers, while lost enhancers contained more ETV/ETS motifs. We validated a subset of flow responsive enhancers using luciferase-based reporter constructs and CRISPR-Cas9 mediated genome editing. Lastly, we characterized the shear stress response in ECs of zebrafish embryos using RNA-Seq. Our results lay the groundwork for the exploration of shear stress responsive elements in controlling EC biology