Reconstruction and characterization of full-length begomovirus and alphasatellite genomes infecting pepper through metagenomics

In northwestern Argentina (NWA), pepper crops are threatened by the emergence of begomoviruses due to the spread of its vector, Bemisia tabaci (Gennadius). The genus Begomovirus includes pathogens that can have a monopartite or bipartite genome and are occasionally associated with sub-viral particles called satellites. This study characterized the diversity of begomovirus and alphasatellite species infecting pepper in NWA using a metagenomic approach. Using RCA-NGS (rolling circle amplification-next generation sequencing), 19 full-length begomovirus genomes (DNA-A and DNA-B) and one alphasatellite were assembled. This ecogenomic approach revealed six begomoviruses in single infections: soybean blistering mosaic virus (SbBMV), tomato yellow spot virus (ToYSV), tomato yellow vein streak virus (ToYVSV), tomato dwarf leaf virus (ToDfLV), sida golden mosaic Brazil virus (SiGMBRV), and a new proposed species, named pepper blistering leaf virus (PepBLV). SbBMV was the most frequently detected species, followed by ToYSV. Moreover, a new alphasatellite associated with ToYSV, named tomato yellow spot alphasatellite 2 (ToYSA-2), was reported for the first time in Argentina. For the Americas, this was the first report of an alphasatellite found in a crop (pepper) and in a weed (Leonurus japonicus). We also detected intra-species and inter-species recombinationInstituto de VirologíaFil: Bornancini, Veronica Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); ArgentinaFil: Irazoqui, Jose Matias. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Flores, Ceferino Rene. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Yuto; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Amadio, Ariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Lopez Lambertini, Paola Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentin

Primera detección de alfalfa mosaic virus en plantas de Lavandin Super en Argentina

PosterEn la Argentina, el cultivo de lavandas (incluidos los lavandines) se encuentra principalmente en las provincias de Río Negro, Córdoba, Mendoza, San Luis y Buenos Aires. Su producción tiene amplios destinos, desde la obtención de flores secas y aceite esencial hasta su industrialización en productos de perfumería, cosmética y desodorización ambiental; además, presenta valor ornamental y repelente de insectos. En un cultivo ubicado en la provincia de Córdoba, se detectaron plantas de Lavandín Super (Lavandula angustifolia x latifolia) con síntomas virales de moteado y mosaicos cloróticos, similares a los causados por el alfalfa mosaic virus (AMV; familia: Bromoviridae, género: Alfamovirus). El objetivo del presente fue investigar la presencia de AMV en muestras de Lavandin Super que presentaban los síntomas mencionados. El test serológico (DAS-ELISA) con antisueros comerciales específicos al AMV resultó positivo. Se realizaron RT-PCRs con oligonucleótidos para el gen de la cápside proteica (CP) del AMV y los amplicones obtenidos se enviaron a secuenciar (Macrogen).Instituto de Patología VegetalFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Castellanos Collazo, Onias. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola(UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentin

Detección del potyvirus johnsongrass mosaic virus en Argentina

PosterLos potyvirus son responsables de importantes pérdidas económicas en el cultivo de maíz, uno de los cereales más importante en Argentina. En el norte de la provincia de Córdoba se detectaron plantas con síntomas similares a los ocasionados por potyvirus (Figura 1 El objetivo del presente fue identificar al agente causal de los síntomas observados en maíz.Instituto de Patología VegetalFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Castellanos Collazo, Onias. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentin

Estudios epidemiológicos del alfalfa enamovirus-1 en el cultivo de alfalfa de Argentina

PosterEl Alfalfa enamovirus 1 (AEV 1 Género Enamovirus Familia Luteoviridae identificado en 2016 como miembro de una nueva especie viral, es uno de los virus detectados en alfalfas con síntomas de achaparramiento, la que impacta negativamente en la cadena de producción de carne y leche bovina de Argentina Los objetivos del presente fueron generar información respecto a la ocurrencia del AEV 1 en el cultivo de alfalfa de las principales regiones productoras del país y dilucidar aspectos de su transmisión por vector.Instituto de Patología VegetalFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Castellanos Collazo, Onias. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola(UFyMA); ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria. Cátedra de Fitopatología; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentin

Prospección fitosanitaria en sistemas productivos hortícolas del cinturón verde de Córdoba (CVC).

La producción hortícola de la zona periurbana de la Ciudad de Córdoba (Cinturón Verde de Córdoba-CVC) se encuentra en franco retroceso. Unas de sus principales limitantes son las enfermedades y plagas, cuyo manejo adecuado y eficiente depende de la correcta identificación del organismo causal. En un trabajo interdisciplinario e interinstitucional, se realizó un relevamiento fitopatológico en fincas de productores fruti-hortícolas del CVC con diferentes planteos productivos. Como resultado, se identificaron los agentes causales de las enfermedades fúngicas y virales más frecuentes, como así también la entomofauna vinculada a la producción hortícola en el CVC. La información sistematizada será puesta a disposición de los productores a través de cartillas con fotos e información biológica y técnica, que constituya una herramienta útil para la identificación y manejo adecuado de los diferentes agentes biológicos.Instituto de Patología VegetalFil: Pastor, Silvina Estela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Arguello Caro, Evangelina Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Di Feo, Liliana Del Valle. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perez Grosso, Tomas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Pérez, A. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Prado, A. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca. Subsecretaria de Agricultura Familiar. Delegación Córdoba; ArgentinaFil: Narmona, L. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca. Subsecretaria de Agricultura Familiar. Delegación Córdoba; ArgentinaFil: Scifo, A. Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca. Subsecretaria de Agricultura Familiar. Delegación Córdoba; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Serra, G. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Fichetti, P. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Barbero, G. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Alemandri, Vanina Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Rodriguez Pardina, Patricia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Zanini, Andrea Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Zanini, Andrea Alejandra. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Dal Zotto, Angelica. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Benitez, Roger Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi. Agencia De Extensión Rural Córdoba; Argentin

Tomato mottle wrinkle virus, a recombinant begomovirus infecting tomato in Argentina

Begomoviruses seriously threaten tomato production in South America. Here, we present the molecular characterization of a novel tomato-infecting begomovirus isolated in Argentina and demonstrate its infectivity. After cloning and sequencing the complete genome of this new virus, pairwise genetic distance and phylogenetic analyses revealed that it is a novel virus that is closely related to other begomoviruses found in Argentina, Brazil and Bolivia. We have proposed naming the virus tomato mottle wrinkle virus (ToMoWrV), based on symptoms produced upon its biolistic inoculation into tomato plants. Recombination analysis revealed that ToMoWrV is a recombinant, with parental sequences likely belonging to the South American begomoviruses soybean blistering mosaic virus (SoBlMV) and tomato yellow vein streak virus (ToYVSV).Instituto de Patología VegetalFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Martin, Darren P. University of Cape Town. Institute of Infectious Diseases and Molecular Medicine, Computational Biology Group; SudáfricaFil: Lopez Lambertini, Paola Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentin

Genome characterization of three potyviruses affecting maize in Argentina

Argentina is globally recognized as both producer and exporter of maize, the most important cereal crop in the country. Several potyviruses affect the production of various crops, including maize. In this work, the complete nucleotide sequences of the RNA genome of three potyviruses, johnsongrass mosaic virus (JGMV), maize dwarf mosaic virus (MDMV) and sugarcane mosaic virus (SCMV), isolated from maize were obtained by next-generation sequencing (Illumina technology). The JGMV, MDMV and SCMV viral genomes were 9780, 9807 and 9729 nucleotides long, respectively. The polyprotein organization of each of potyvirus genome was determined; their sequences showed high values compared with polyprotein sequences of the other isolates reported worldwide (> 76.1% at the nucleotide sequence and > 85% at the amino acid sequence). The results of this work are the first data in Argentina of complete genome sequences of potyviruses obtained from maize and the first obtained for JGMV and MDMV.Instituto de Patología VegetalFil: Trucco, Veronica Milagros. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Trucco, Veronica Milagros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Castellanos Collazo, Onias. Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica (FONCYT); ArgentinaFil: Castellanos Collazo, Onias. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Vaghi Medina, Carlos Gaston. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Lenardon, Sergio Luis. Universidad Nacional de Río Cuarto (UNRC). Facultad de Agronomía y Veterinaria (FAV); ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Giolitti, Fabian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentin