Dynamics of spin correlations in the spin-1/2 isotropic XY chain in a transverse field

Dynamic xx spin pair correlation functions for the isotropic spin-1/2 XY chain are calculated numerically for long open chains in the presence of a transverse magnetic field at finite temperature. As an application we discuss the temperature dependence of the spin-spin relaxation time in PrCl_3.Comment: 2 pages, latex, 2 figures, abstract of the paper presented at Ampere Summer School ``Applications of Magnetic Resonance in Novel Materials'' Nafplion, Greece, 3-9 September, 2000, partially published in J. Phys. A: Math. Gen. 33, 3063 (2000

Associations of BCL-2 (RS17759659), CTLA-4 (RS231775), APO-1/FAS (RS2234767) genes polymorphisms with activity of proliferation and apoptosis in thyroid tissue of patients with nodular forms of goiter combined with autoimmune thyroiditis and thyroid adenoma

The study of apoptosis and proliferative activity in the thyroid gland (TG) tissue of patients with nodular goiter and autoimmune thyroiditis (NGAIT) and thyroid adenoma (TA) is based on the expression/density of Fas/FasL, BCL-2, p53, and Ki-67 markers assessment depending on the genetic polymorphisms of BCL-2 (rs17759659), CTLA-4 (rs231775) and APO-1/Fas (rs2234767) genes.Several mechanisms of thyroid cells' programmed killing are activated in NGAIT and TA with domination of Fas-induced apoptosis, which strongly associates with the BCL-2 gene's (rs17759659) promoter (F=25.33; p<0.001) and almost six fold weaker associates with the CTLA-4 gene's (rs231775) promoter (F=4.23, p=0.017). Factors that decrease the likelihood of NGAIT and TA regardless of the CTLA-4 (rs231775) and APO-1/Fas (rs2234767) genes' genotypes are the high Ki-67 density and reduction of cells containing p53 or BCL-2 proteins (OR=0.07-0.17; 95% CI OR: 0.03-0.36; p<0.001, and OR=0.08-0.11; 95% CI OR: 0.02-0.31; p<0.001, re­spectively). High expression of surface Fas and FasL in lymphoid infiltration and de­struction of thyroid cells (stronger in GG-genotype carriers of the BCL-2 gene by 18.54% (pAA=0.043) and 36.18% (pAG=0.018), respectively) indicates the initiation of the external pathway of apoptosis through the caspase mechanism (effector caspase- 8)

Распространенный аппендикулярный перитонит: лапароскопический или открытый доступ — критический анализ

The perforative acute appendicitis with the development of diffuse peritonitis increases the incidence of postoperative complications to 47%, and mortality to 3%. Mortality in the case of the development of diffuse purulent peritonitis makes 4.5-58%, and it can exceed 70% in severe forms of diffuse peritonitis with the development of infectious-toxic shock and multiple organ failure. National Clinical Guidelines for acute appendicitis with diffuse peritonitis allow for appendectomy from both the median and laparoscopic access in the absence of general contraindications to the creation of pneumoperitoneum. However, despite the proven advantages of laparoscopic appendectomy, there are opponents of its use in diffuse forms of appendicular peritonitis. An increased number of postoperative abscesses with a minimally invasive approach has been reported in literature; however, recent randomized studies refute this fact. There is also evidence that the laparoscopic method for appendicular peritonitis often leads to a lengthening of the operation time and higher operating costs, but at the same time there is a decrease in postoperative pain syndrome, a reduction in the length of inpatient treatment and early social and labor rehabilitation, which leads to an overall decrease in hospital costs. Thus, to date, there is no generally accepted opinion about the advisability of laparoscopic access for appendicular peritonitis. At the moment, the presence of diffuse peritonitis is the most common intraoperative reason for refusing a minimally invasive surgical treatment. However, there is a tendency to trying to standardize indications and contraindications, which was the objective of our literature review.Острый аппендицит является наиболее распространенным острым хирургическим заболеванием и, несмотря на то что имеется значительное сокращение его доли в практике врача-хирурга (40,3% — 2000, 24,8% — 2019), он все равно занимает первое место по встречаемости и оперативной активности.Перфоративная форма острого аппендицита с развитием распространенного перитонита увеличивает частоту послеоперационных осложнений до 47%, а летальность — до 3%. Летальность в случае развития разлитого гнойного перитонита составляет 4,5–58%, а при тяжелых формах распространенного перитонита с развитием инфекционно-токсического шока и полиорганной недостаточности может превышать 70%.Национальные клинические рекомендации при остром аппендиците с распространенным перитонитом допускают выполнение аппендэктомии как из срединного, так и из лапароскопического доступа при отсутствии общих противопоказаний к созданию пневмоперитонеума. Однако несмотря на доказанные преимущества лапароскопической аппендэктомии, имеются противники ее использования при распространенных формах аппендикулярного перитонита.В литературе отмечено увеличение количества послеоперационных абсцессов при минимально инвазивном доступе, однако последние рандромизированные исследования опровергают данный факт. Также имеются данные, что лапароскопический метод при аппендикулярном перитоните часто приводит к удлинению времени операции и более высоким операционным затратам, но при этом происходит уменьшение болевого послеоперационного синдрома, сокращение сроков стационарного лечения и ранняя социально-трудовая реабилитация, что приводит к общему снижению расходов больницы.Таким образом, на сегодняшний день нет общепринятого мнения о целесообразности лапаро­скопического доступа при аппендикулярном перитоните. На данный момент наиболее частая интраоперационная причина отказа от минимально инвазивного метода хирургического лечения — наличие распространенного перитонита. Однако прослеживается тенденция к попытке стандартизировать показания и противопоказания, что и явилось целью нашего литературного обзора

Constant regulation for stable CD8 T-cell functional avidity and its possible implications for cancer immunotherapy.

The functional avidity (FA) of cytotoxic CD8 T cells impacts strongly on their functional capabilities and correlates with protection from infection and cancer. FA depends on TCR affinity, downstream signaling strength, and TCR affinity-independent parameters of the immune synapse, such as costimulatory and inhibitory receptors. The functional impact of coreceptors on FA remains to be fully elucidated. Despite its importance, FA is infrequently assessed and incompletely understood. There is currently no consensus as to whether FA can be enhanced by optimized vaccine dose or boosting schedule. Recent findings suggest that FA is remarkably stable in vivo, possibly due to continued signaling modulation of critical receptors in the immune synapse. In this review, we provide an overview of the current knowledge and hypothesize that in vivo, codominant T cells constantly "equalize" their FA for similar function. We present a new model of constant FA regulation, and discuss practical implications for T-cell-based cancer immunotherapy

Клиническое наблюдение тонкокишечной непроходимости при множественных диоспиробезоарах желудочно-кишечного тракта

Abstract Small bowel obstruction (SBO) is 3-4% of all abdominal acute diseases. Small bowel obstruction due to bezoars is rare (2-4%), and is detected mainly in patients with predisposing risk factors: gastrointestinal motility disorders, psychiatric diseases, enzymatic insufficiency, previous bariatric surgery, diabetes mellitus and hypothyroidism complicated by gastroparesis. The leading role in the verification of small bowel obstruction in patients without surgical interventions on the abdominal organs should be given to computed tomography. According to the literature, the mortality from SBO due to bezoar may reach 30%. We present an unusual clinical case of recurrent small bowel obstruction with severe intestinal disease and septic shock induced by multiple phytobezoars and complicated with severe pseudomembranous colitis. Moreover, in our opinion, laparoscopic access can be used both for diagnostic and therapeutic purposes in patients with acute small bowel obstruction.РЕЗЮМЕ Острая кишечная непроходимость (ОКН) составляет 3-4% от всех неотложных заболеваний брюшной полости. Тонкокишечная непроходимость, обусловленная безоарами, встречается достаточно редко (2-4%) и выявляется, в основном, у пациентов с предрасполагающими факторами риска, такими как: нарушения моторики желудочно-кишечного тракта, психиатрические заболевания, ферментативная недостаточность, перенесенные бариартрические операции, сахарный диабет и гипотиреоз, осложненные гастропарезом. Ведущую роль в верификации тонкокишечной непроходимости у пациентов без оперативных вмешательств на органах брюшной полости в анамнезе следует отдавать компьютерной томографии. Летальность при ОКН, вызванной безоарами, может достигать, по данным литературы, 30%. Мы представляем необычный клинический случай рецидивирующей тонкокишечной непроходимости с тяжелой степенью кишечной недостаточности и исходом в септический шок, вызванной множественными фитобезоарами и отягощенной псевдомембранозным колитом тяжелой степени. При этом, по нашему мнению, лапароскопический доступ может быть использован как с диагностической, так и с лечебной целью у пациентов с острой тонкокишечной непроходимостью

Поліморфізм генів apo-1 / fas, ctla-4 та bcl-2 у пацієнтів, оперованих із приводу вузлової патології щитоподібної залози

The aim of the work: to analyze the frequency of polymorphic variants of genes BCL-2 (rs17759659), CTLA-4 (rs231775), APO-1/ Fas (rs2234767) in patients, operated on nodular thyroid pathology with regard to its form (NGAIT, TA- thyroid adenoma).Materials and Methods. An analysis of the frequency of polymorphic variants of genes BCL-2 (rs17759659), CTLA-4 (rs231775), APO-1/Fas (rs2234767) in 125 patients, operated on nodular thyroid pathology with regard to its form (NGAIT, TA) was conducted. Also, we examined 25 healthy donors. The study of polymorphism of genes was carried out by the method of polymerase chain reac­tion in real time.Results and Discussion. Mutation of BCL-2 gene (rs17759659) and CTLA-4 (rs231775) in the homozygous state among patients, operated on nodular thyroid pathology occurs with a frequency 3.2–4.0 % no reliable difference between patients with thyroid pathology and healthy. Mutation of the gene APO-1/Fas (rs2234767) in the homozygous state among surveyed patients was not met at all.Цель работы: провести анализ частоты полиморфных вариантов генов BCL-2 ( rs17759659), CTLA-4 ( rs231775), APO-1/Fas (rs2234767) у пациентов, оперированных по поводу узловой патологии щитовидной железы (ЩЖ) с учетом ее вида (узловой зоб на фоне аутоиммунного тиреоидита, аденома щитовидной железы.Материалы и методы. Проведен анализ частоты полиморфных вариантов генов BCL-2 ( rs17759659), CTLA-4 (rs231775), APO-1/Fas (rs2234767) у 125 пациентов, оперированных по поводу узловой патологии щитовидной железы с учетом ее вида (узловой зоб на фоне аутоиммунного тиреоидита, аденома щитовидной железы). Также обследовано 25 практически здоровых доноров. Исследование полиморфизма генов проводили методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени.Результаты исследований и их обсуждение. Мутация генов BCL-2 ( rs17759659) и CTLA-4 ( rs231775) в гомозиготном состоянии среди пациентов, оперированных по поводу узловой патологии щитовидной железы, встречается с частотой 3,2– 4,0 % без достоверной разницы между больными на патологию щитовидной железы и здоровыми. Мутация гена APO-1/Fas (rs2234767) в гомозиготном состоянии среди обследованных не встречалась вообще.Мета роботи: провести аналіз частоти поліморфних варіантів генів BCL-2 (rs17759659), CTLA-4 (rs231775), APO-1/Fas (rs2234767) у хворих, оперованих із приводу вузлової патології щитоподібної залози із урахуванням її виду вузловий зоб на фоні автоімунного тиреоїдиту, аденома щитоподібної залози. Матеріали і методи. Проведено аналіз частоти поліморфних варіантів генів BCL-2 (rs17759659), CTLA-4 (rs231775), APO-1/Fas (rs2234767) у 125 хворих, оперованих з приводу вузлової патології щитоподібної залози із урахуванням її виду – вузлового зоба на фоні автоімунного тиреоїдиту, аденома щитоподібної залози. Також обстежено 25 практично здорових донорів. Дослідження поліморфізму генів проводили методом полімеразної ланцюгової реакції в режимі реального часу.Результати досліджень та їх обговорення. Мутація генів BCL-2 (rs17759659) та CTLA-4 (rs231775) у гомозиготному стані у хворих, оперованих з приводу вузлової патології щитоподібної залози, зустрічається із частотою 3,2–4,0 % без вірогідної різниці між хворими на патологію щитоподібної залози та здоровими. Мутація гена APO-1/Fas (rs2234767) у гомозиготному стані серед обстежених не траплялася взагалі

Observation of narrow baryon resonance decaying into pKs0pK^0_s in pA-interactions at 70GeV/c70 GeV/c with SVD-2 setup

SVD-2 experiment data have been analyzed to search for an exotic baryon state, the $\Theta^+$-baryon, in a $pK^0_s$ decay mode at $70 GeV/c$ on IHEP accelerator. The reaction $pA \to pK^0_s+X$ with a limited multiplicity was used in the analysis. The $pK^0_s$ invariant mass spectrum shows a resonant structure with $M=1526\pm3(stat.)\pm 3(syst.) MeV/c^2$ and $\Gamma < 24 MeV/c^2$. The statistical significance of this peak was estimated to be of $5.6 \sigma$. The mass and width of the resonance is compatible with the recently reported $\Theta^+$- baryon with positive strangeness which was predicted as an exotic pentaquark ($uudd\bar{s}$) baryon state. The total cross section for $\Theta^+$ production in pN-interactions for $X_F\ge 0$ was estimated to be $(30\div120) \mu b$ and no essential deviation from A-dependence for inelastic events $(\sim A^{0.7})$ was found.Comment: 8 pages, 7 figures, To be submitted to Yadernaya Fizika. v3-v5 - Some references added, minor typos correcte

Effective transcription factor binding site prediction using a combination of optimization, a genetic algorithm and discriminant analysis to capture distant interactions

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Reliable transcription factor binding site (TFBS) prediction methods are essential for computer annotation of large amount of genome sequence data. However, current methods to predict TFBSs are hampered by the high false-positive rates that occur when only sequence conservation at the core binding-sites is considered.</p> <p>Results</p> <p>To improve this situation, we have quantified the performance of several Position Weight Matrix (PWM) algorithms, using exhaustive approaches to find their optimal length and position. We applied these approaches to bio-medically important TFBSs involved in the regulation of cell growth and proliferation as well as in inflammatory, immune, and antiviral responses (NF-κB, ISGF3, IRF1, STAT1), obesity and lipid metabolism (PPAR, SREBP, HNF4), regulation of the steroidogenic (SF-1) and cell cycle (E2F) genes expression. We have also gained extra specificity using a method, entitled SiteGA, which takes into account structural interactions within TFBS core and flanking regions, using a genetic algorithm (GA) with a discriminant function of locally positioned dinucleotide (LPD) frequencies.</p> <p>To ensure a higher confidence in our approach, we applied resampling-jackknife and bootstrap tests for the comparison, it appears that, optimized PWM and SiteGA have shown similar recognition performances. Then we applied SiteGA and optimized PWMs (both separately and together) to sequences in the Eukaryotic Promoter Database (EPD). The resulting SiteGA recognition models can now be used to search sequences for BSs using the web tool, SiteGA.</p> <p>Analysis of dependencies between close and distant LPDs revealed by SiteGA models has shown that the most significant correlations are between close LPDs, and are generally located in the core (footprint) region. A greater number of less significant correlations are mainly between distant LPDs, which spanned both core and flanking regions. When SiteGA and optimized PWM models were applied together, this substantially reduced false positives at least at higher stringencies.</p> <p>Conclusion</p> <p>Based on this analysis, SiteGA adds substantial specificity even to optimized PWMs and may be considered for large-scale genome analysis. It adds to the range of techniques available for TFBS prediction, and EPD analysis has led to a list of genes which appear to be regulated by the above TFs.</p