50 research outputs found
ПОЛІМОРФІЗМ ГЕНІВ НЕЙРАМІНІДАЗИ ТА НУКЛЕОПРОТЕЇНУ ШТАМІВ ВІРУСУ ПТАШИНОГО ГРИПУ А H1N1 І H7N9
Introduction. Nowadays, the influenza virus is the main cause of diseases for people of all ages, annually leading to death and causing significant economic damage. The virulence and pathogenicity of this virus are largely due to the presence of neuraminidase and a nucleoprotein that provide its adhesion to the host cell and replication. Genetic monitoring is an important key element of epidemiological surveillance, which includes the early detection and identification of seasonal (circulating) influenza viruses, as well as influenza viruses of new subtypes that may cause a pandemic. The precise information including molecular genetic analysis of influenza viruses, level of collective immunity, study of susceptibility to antiviral drugs, antigenic characteristics of the virus appears to be strongly required.
The aim of the study – to determine the molecular genetic polymorphism of the neuraminidase and nucleoprotein genes of the avian influenza A H1N1 and H7N9 strains and to determine its effect on the structure of coded protein domains by bioinformatics methods.
Research Methods. The nucleotide sequences of the neuraminidase and nucleoprotein genes of the influenza A H1N1 and H7N9 strains were analyzed, as well as the domains of the studied gene product were analyzed by cluster analysis and the DELTA-BLAST program.
Results and Discussion. As a result of the accomplished study, the polymorphisms and genetic distances between the alleles of the neuraminidase and nucleoprotein genes of the influenza A strains A1N1 and H7N9 alleles were calculated. The type and localization of mutations was shown. The domains of the gene products of the studied nucleotide sequences were determined. The role and effect of codons in the nucleotide sequences of the alleles of genes, which areencoding neuraminidase and nucleoprotein, on neuraminidase and nucleoprotein was shown.
Conclusions. In the result of the accomplished studies there was determined the polymorphism of the neuraminidase and nucleoprotein genes. The absence of the effect of polymorphism of the nucleotide sequences of the neuraminidase and nucleoprotein genes of influenza A H1N1 and H7N9 strains on the domain composition of the studied proteins and, thus, on the properties of the studied strains was shown.Вступление. На сегодня вирус гриппа является основной причиной заболеваемости людей разного возраста. Грипп ежегодно приводит к смерти значительного количества населения и наносит существенный экономический ущерб. Вирулентность и патогенность этого вируса в значительной степени обусловлены наличием у него нейраминидазы и нуклеопротеина, которые обеспечивают вирусную адгезию на клетке-хозяине и репликацию. Генетический мониторинг является важным ключевым элементом эпидемиологического наблюдения, которое включает в себя раннее выявление и идентификацию сезонных (циркулирующих) вирусов гриппа, а также вирусов гриппа новых подтипов, которые могут вызвать пандемию. Для предотвращения пандемий необходима информация о молекулярно-генетическом анализе образцов вируса гриппа, уровне коллективного иммунитета, чувствительности к противовирусным препаратам, антигенных характеристиках вируса.
Цель исследования – определить молекулярно-генетический полиморфизм генов нейраминидазы и нуклеопротеина штаммов вируса птичьего гриппа А H1N1 и H7N9 и его влияние на структуру доменов кодированных протеинов биоинформационными методами.
Методы исследования. Были проанализированы нуклеотидные последовательности генов нейраминидазы и нуклеопротеина штаммов вируса гриппа А Н1N1 и Н7N9, а также определены домены продуктов этих генов с помощью кластерного анализа и программы DELTA-BLAST.
Результаты и обсуждение. По результатам исследования, определены полиморфизм и генетические дистанции между аллелями генов нейраминидазы и нуклеопротеина штаммов вируса гриппа А Н1N1 и Н7N9. Показаны тип и локализация мутаций. Определены домены продуктов исследуемых нуклеотидных последовательностей. Показаны роль и влияние мутаций в нуклеотидных последовательностях алеллей исследуемых генов на полиморфизм нейраминидазы и нуклеопротеина.
Выводы. Определен полиморфизм генов нейраминидазы и нуклеопротеина. Показано отсутствие влияния полиморфизма нуклеотидных последовательностей генов нейраминидазы и нуклеопротеина штаммов вируса гриппа А Н1N1 и Н7N9 на доменовый состав этих протеинов и, таким образом, на свойства данных штаммов.Вступ. На сьогодні вірус грипу є основною причиною захворюваності людей будь-якого віку. Грип щорічно призводить до смерті значної кількості населення та завдає суттєвого економічного збитку. Вірулентність і патогенність цього вірусу значною мірою зумовлені наявністю в нього нейрамінідази та нуклеопротеїну, які забезпечують вірусну адгезію на клітині-хазяїні й реплікацію. Генетичний моніторинг є важливим ключовим елементом епідеміологічного спостереження, яке включає в себе раннє виявлення та ідентифікацію сезонних (циркулюючих) вірусів грипу, а також вірусів грипу нових підтипів, які можуть викликати пандемію. Для запобігання пандеміям необхідна інформація про молекулярно-генетичний аналіз зразків вірусів грипу, рівень колективного імунітету, чутливість до противірусних препаратів, антигенні характеристики вірусу.
Мета дослідження – визначити молекулярно-генетичний поліморфізм генів нейрамінідази та нуклеопротеїну штамів вірусу пташиного грипу А H1N1 і H7N9 та його вплив на структуру доменів кодованих протеїнів біоінформатичними методами.
Методи дослідження. Було проаналізовано нуклеотидні послідовності генів нейрамінідази та нуклеопротеїну штамів вірусу грипу А Н1N1 і Н7N9, а також визначено домени продуктів цих генів за допомогою кластерного аналізу та програми DELTA-BLAST.
Результати й обговорення. За результатами дослідження, визначено поліморфізм і генетичні дистанції між алелями генів нейрамінідази та нуклеопротеїну штамів вірусу грипу А Н1N1 і Н7N9. Показано тип і локалізацію мутацій. Визначено домени продуктів досліджуваних нуклеотидних послідовностей. Показано роль і вплив мутацій у нуклеотидних послідовностях алелів досліджуваних генів на поліморфізм нейрамінідази та нуклеопротеїну.
Висновки. Визначено поліморфізм генів нейрамінідази та нуклеопротеїну. Показано відсутність впливу поліморфізму нуклеотидних послідовностей генів нейрамінідази та нуклеопротеїну штамів вірусу грипу А Н1N1 і Н7N9 на доменовий склад цих протеїнів і, таким чином, на властивості даних штамів
Олігархічний лобізм як відображення репутації політичної партії
Похило І. Д. Олігархічний лобізм як відображення репутації політичної партії / І. Д. Похило, О. В. Буряченко, С. П. Годний // S.P.A.C.E. Society, Politics, Administration in Central Europe : електронний науково-практичний журнал / редкол.: Д. В. Яковлев (голов. ред.), К. М. Вітман (заст. голов. ред.), Д. Ю. Дворніченко (відп. секр.) [та ін.] ; НУ «ОЮА». – Одеса, 2017. – Вип. 5. – C. 28-32.Стаття присвячена аналізу лобізму як об’єктивного явища суспільної практики. Зроблено спробу відповісти на ряд актуальних питань: наскільки адекватним є зв’язок між інтересами політичних партій і громадянського суспільства? Якою мірою репутація політичної партії залежить від сутності та важливості тих питань, які вона
лобіює? Визначається, що однією із сутнісних ознак політичного лобіювання став фаворитизм державних урядовців під час ухвалення рішень на користь окремих бізнесменів. З’ясовано сутність олігархічного лобіювання як системи взаємостосунків влади і великого капіталу. Визначено, що основою формування позитивної репутації
сучасних політичних партій є ступінь та можливість їх впливу на розв’язання найважливіших проблем суспільства і держави.Статья посвящена анализу лоббизма как объективного явления общественной жизни. Сделана попытка ответить на ряд актуальных вопросов: насколько адекватной является связь между интересами политических партий и гражданского общества? В какой степени репутация политической партии зависит от сущности и важности тех вопросов, которые она лоббирует? Определено, что одной
из сущностных характеристик политического лоббирования стал фаворитизм государственных чиновников при принятии решений в пользу отдельных бизнесменов.
Выяснена сущность олигархического лоббирования как системы взаимоотношений власти и крупного капитала. Показано, что основой формирования положительной репутации современных политических партий является степень и возможность их влияния на решение важнейших проблем общества и государства.The article is devoted to the analysis of lobbyism as an objective phenomenon of social practice. An attempt is made to answer a number of topical issues: How relevant is the link between the interests of political parties and civil society? To what extent does the reputation of a political party depend on the nature and importance of the issues it lobbies? It is determined that one of the essential signs of political lobbying was the favoritism of state officials in making decisions in favor of individual businessmen. The essence of oligarchic lobbying,
as a system of relations between power and large capital, is found out. It is determined that the basis of the formation of a positive reputation of modern political parties is the degree and the possibility of their influence on solving the most important problems of society and the state
Iteration method in linear elasticity of random structure composites containing heterogeneities of noncanonical shape
New Numerical Simulation by the FEM of Residual Stresses in Random Structure Elastically Homogeneous Composites
We consider a linearly elastic composite medium, which consists of a homogeneous matrix containing statistically inhomogeneous random set of noncanonical inclusions. The elastic properties of the matrix and the inclusions are the same, but the stress-free strains are different. The new general volume integral equation (VIE) proposed by Buryachenko (2010a, 2010b) is implemented. This equation is obtained by a centering procedure without any auxiliary assumptions such as, e.g., effective field hypothesis implicitly exploited in the known centering methods. The results of this abandonment are quantitatively estimated for some modeled composite with homogeneous fibers of nonellipsoidal shape. Some new effects are detected that are impossible in the framework of a classical background of micromechanics
Inhomogeneity of the first and second statistical moments of stresses inside the heterogeneities of random structure matrix composites
a b s t r a c t In this paper linearly thermoelastic composite media are treated, which consist of a homogeneous matrix containing a statistically homogeneous random set of heterogeneities. Effective properties (such as compliance, thermal expansion, stored energy) as well as the first statistical moments of stresses in the phases are estimated for the general case of nonhomogeneity of the thermoelastic inclusion properties. The micromechanical approach is based on the generalization of the ''multiparticle effective field'' method (MEFM, see for references Buryachenko, Appl. Mech. Rev
Random residual stresses in elasticity homogeneous medium with inclusions of noncanonical shape
We consider a linearly elastic composite medium, which consists of a homogeneous matrix containing a statistically
inhomogeneous random set of noncanonical inclusions. The elastic properties of the matrix and the inclusions are
the same, but the stress-free strains are different. The new general volume integral equation (VIE) is proposed. These equations are obtained by a centering procedure without any auxiliary assumptions such as the effective field hypothesis
implicitly exploited in the known centering methods. The results of this abandonment are quantitatively estimated for some modeled composite with homogeneous fibers of nonellipsoidal shape. New effects are detected that are impossible within the framework of a classical background of micromechanics
Computational Analytical Micromechanics: Linear Elastic FEA of random structure composites reinforced by heterogeneities of non canonical shape
FEA in elasticity of random structure composites reinforced by heterogeneities of non canonical shape
One considers linearly elastic composite media, which consist of a homogeneous matrix containing a statistically
homogeneous random set of aligned homogeneous heterogeneities of non canonical shape.
Effective elastic moduli as well as the first statistical moments of stresses in the phases are estimated.
The explicit new representations of the effective moduli and stress concentration factors are expressed
through some building block described by numerical solution for one heterogeneity inside the infinite
medium subjected to homogeneous remote loading. The method uses as a background a new general
integral equation proposed in Buryachenko (2010a,b), which incorporates influence of stress inhomogeneity
inside the inclusion on the effective field and makes it possible to reconsider basic concepts of
micromechanics such as effective field hypothesis, quasi-crystalline approximation, and the hypothesis
of ‘‘ellipsoidal symmetry’’. The results of this reconsideration are quantitatively estimated for some modeled
composite reinforced by aligned homogeneous heterogeneities of non canonical shape. Some new
effects are detected that are impossible in the framework of a classical background of micromechanics