Study of IDO1 gene expression in histological variants of colorectal carcinoma.

pre-print477 K

Relaciones genotipo-fenotipo en líneas celulares de melanoma humano / María del Carmen Turpín Sevilla; director, José Carlos García-Borrón Martínez.

Tesis-Universidad de Murcia.Consulte la tesis en: BCA. GENERAL. ARCHIVO UNIVERSITARIO. TM 3924

Study of IDO1 gene expression in histological variants of colorectal carcinoma.

Conventional carcinomas (CCs) which represent most colorectal carcinomas (CRCs) have no alteration in microsatellite instability (MSI) and are classified as microsatellite stable tumors (MSS) while tumors with high-grade of microsatellite instability (MSI-H) has been associated with proximal-located sporadic CRC showing MLH1 promoter methylation and BRAF mutation. MSI-H tumors present more lymphocytic infiltrate than CCs. MSI-H tumors are considered as one end-point of the so-called serrated polyp pathway. In contrast, another CRC from this pathway, the serrated adenocarcinoma (SAC), which is more frequently KRAS mutated, usually microsatellite stable (MSS) and has no lymphocytic infiltrate, is associated with a bad prognosis. Patients with MSI-H tumors have been reported to get some benefits from immunotherapy treatments while CC and SACs patients do not obtain any benefits. These differences are believed to be due to the differences in the microsatellite instability (MSS or MSI tumors). The aim of this study is to determine the IDO gene expression in the different subtypes of colorectal carcinomas.pre-print133 K

Opiniones de profesores y alumnos sobre un programa integral online en medicina durante el confinamiento por COVID-19.

Introducción La crisis por COVID-19 supuso en marzo del 2020 el cierre de las universidades del país, con interrupción total de actividad presencial. Para afrontar el último cuatrimestre 2019/20 en confinamiento, nuestra Facultad de Medicina elaboró y aplicó un programa docente íntegramente online con un enfoque «autorregulativo» (enfocado en el aprendizaje autónomo del alumno). Este estudio presenta las opiniones de profesores y alumnos. Métodos Las características educativas del Programa online ante COVID-19 (POLAC), para primero y segundo cursos, estructuración, organización de la intervención y resultados académicos, han sido descritos en otro trabajo. Este estudio mediante encuestas online, explora opiniones de profesores y alumnos tras su desarrollo. Dos investigadores codificaron temática e independientemente las respuestas abiertas obtenidas, clasificándolas en categorías. Resultados Respondieron los ocho profesores implicados y un número variable por asignatura de alumnos, recibiéndose 234 cuestionarios (17%). Los alumnos destacan de positivo la optimización de recursos docentes utilizados, la utilidad de las herramientas online, especialmente autoevaluaciones y sistema de gestión de dudas. El desarrollo de las prácticas y aspectos propios de la presencialidad se destacaron como negativos. La dedicación de los profesores recibió comentarios, tanto positivos como negativos. Los profesores resaltaron la potenciación de la autonomía del alumno, la utilidad de las herramientas online y la necesidad adicional de presencialidad. Conclusión Globalmente, los comentarios positivos y negativos están en línea con las fortalezas y debilidades tanto de la enseñanza online como de enfoques docentes «autorregulativos». Se precisan estudios de diseños más robustos para comprobar el alcance real de estos resultados.post-print333 K

Global methylome scores correlate with histological subtypes of colorectal carcinoma and show different associations with common clinical and molecular features

Abstract Background: The typical methylation patterns associated with cancer are hypermethylation at gene promoters and global genome hypomethylation. Aberrant CpG island hypermethylation at promoter regions and global genome hypomethylation have not been associated with histological colorectal carcinomas (CRC) subsets. Using Illumina’s 450 k Infinium Human Methylation beadchip, the methylome of 82 CRCs were analyzed, comprising different histological subtypes: 40 serrated adenocarcinomas (SAC), 32 conventional carcinomas (CC) and 10 CRCs showing histological and molecular features of microsatellite instability (hmMSI-H), and, additionally, 35 normal adjacent mucosae. Scores reflecting the overall methylation at 250 bp, 1 kb and 2 kb from the transcription starting site (TSS) were studied. Results: SAC has an intermediate methylation pattern between CC and hmMSI-H for the three genome locations. In addition, the shift from promoter hypermethylation to genomic hypomethylation occurs at a small sequence between 250 bp and 1 Kb from the gene TSS, and an asymmetric distribution of methylation was observed between both sides of the CpG islands (N vs. S shores). Conclusion: These findings show that different histological subtypes of CRC have a particular global methylation pattern depending on sequence distance to TSS and highlight the so far underestimated importance of CpGs aberrantly hypomethylated in the clinical phenotype of CRCs