Inhibition of mutant RAS-RAF interaction by mimicking structural and dynamic properties of phosphorylated RAS

Undruggability of RAS proteins has necessitated alternative strategies for the development of effective inhibitors. In this respect, phosphorylation has recently come into prominence as this reversible post-translational modification attenuates sensitivity of RAS towards RAF. As such, in this study, we set out to unveil the impact of phosphorylation on dynamics of HRASWT and aim to invoke similar behavior in HRASG12D mutant by means of small therapeutic molecules. To this end, we performed molecular dynamics (MD) simulations using phosphorylated HRAS and showed that phosphorylation of Y32 distorted Switch I, hence the RAS/RAF interface. Consequently, we targeted Switch I in HRASG12D by means of approved therapeutic molecules and showed that the ligands enabled detachment of Switch I from the nucleotide-binding pocket. Moreover, we demonstrated that displacement of Switch I from the nucleotide-binding pocket was energetically more favorable in the presence of the ligand. Importantly, we verified computational findings in vitro where HRASG12D/RAF interaction was prevented by the ligand in HEK293T cells that expressed HRASG12D mutant protein. Therefore, these findings suggest that targeting Switch I, hence making Y32 accessible might open up new avenues in future drug discovery strategies that target mutant RAS proteins

A GLOBAL BRAND IN PUBLIC RELATIONS STUDIES FROM THE POSTCOLONIAL PERSPECTIVE: THE CASE OF ZARA

The term “Postcolonial” was first introduced to the newly rescued communities from colonialism in the 1970s, but in time the meaning of the term has expanded. Nowadays, the arguments put forward in this way are emerging within the context of the First World. In general terms, the notion of postcolonialism, which houses many disciplines, has developed a critical approach against western hegemony. The main problematic that the postcolonial studies deal with is the economic and cultural interventions by the Western countries to the non-Western and the “other” countries. In a sense, the dominant foreign power is to rearrange the production systems of passive countries and to analyze new colonialism, positioned as the “other” to fit in with its political and economic interests. Edward Said, Homi Bhabba and Gayathri Spivak are emerging as important figures in this concept. Looking at the last 20 years, it is possible to say that the workings in the postcolonial area have gained visibility. The most striking of these is the history and anthropology. But its effect has spread rapidly to other fields, especially to scientific. In recent years, postcolonial studies have also been observed in other social areas. Postcolonial work defines itself as a positive theorem, while in the radical sense it defines it as a critique. Although postcolonialism has been given some definitions with different paradigms and different approaches, it is essentially an approach that is based on the search for social rights and justice on a global scale. In other words, it is a manifestation of social attitude

The Effect of Flexible Bronchoscopy on Anxiety in Children

OBJECTIVES: Flexible bronchoscopy (FB) is a semi-invasive diagnostic tool that allows direct visualization of the airways. The use for diagnostic and therapeutic purposes in children is incrasing with the developments in modern anesthesia. Irrespective of the type of the invasive diagnostic procedure, these interventions are known to cause anxiety in patients. The aim of our study was to evaluate the anxiety and depression status in children hospitalized for bronchoscopy and to investigate the effects of FB

Salvia sericeo-tomentosa var. sericeo-tomentosa ve Salvia sericeo-tomentosa var. hatayica taksonlarının polar ekstrelerinin kimyasal içeriği ve antidiyabetik aktivitelerinin belirlenmesi

Lamiaceae familyası üyesi olan Salvia cinsi Türkiye’de 110’u aşkın, dünya genelinde ise 1000'e yakın türle temsil edilmekte olup %50’nin üzerinde endemizm oranı ile ülkemiz için önemli bir gen merkezi konumundadır [1-4]. Türkiye’de “adaçayı” olarak bilinen Salvia türleri soğuk algınlığı, enfeksiyon hastalıkları, diş ve boğaz ağrıları, menstrüal problemler, Alzheimer hastalığında ve diyabete karşı kullanılmaktadır. Salvia cinsine ait türler üzerinde yapılan araştırmalarda, bu türlerin flavonoitler, fenolik asitler, mono-/di-/triterpenoidler içerdiği görülmüştür. Literatürde, Salvia türlerinden elde edilen ekstrelerin ve saf moleküllerinin antimikrobiyal, antioksidan, antikolinesteraz, antidiyabetik, sitotoksik, antialerjik, antiplasmodial ve kardiyovasküler aktiviteleri olduğu tespit edilmiştir [5-7]. Bu çalışmada, Arsuz/Hatay bölgesinden toplanan Salvia sericeo-tomentosa var. sericeotomentosa (SSvST) ve Salvia sericeo-tomentosa var. hatayica (SSvH) taksonlarının kök metanol ekstrelerinin kimyasal içeriği ve antidiyabetik aktivitelerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. SSvST ve SSvH kurutulmuş kökleri sırasıyla diklorometan ve metanol ile soxhlet yöntemi ile ekstre edilip ardından elde edilen metanol ekstrelerinin kimyasal içeriğini tayin etmek amacıyla LC-HRMS çalışması Thermo ORBITRAP Q-EXACTIVE cihazında gerçekleştirilmiştir [8]. Hazırlanan ekstrelerin α-glukozidaz aktiviteleri Bothon ve ark.’nın [9] yöntemiyle yapılmıştır. LC-HRMS analizi sonucunda, SSvST ve SSvH köklerinin metanol ekstrelerinde 13 flavonoid, 8 fenolik asit, 3 diterpen, 1 triterpen, 1 antrakinon ve 4 diğer farklı sınıf moleküller olmak üzere toplamda 30 adet sekonder metabolit içermektedir. 202 SSvST metanol ekstresinde ana bileşikler olarak rosmarinik asit (36464,51 mg/kg), litospermik asit (24219,06 mg/kg), vanilik asit (8463,62 mg/kg), fumarik asit ( 5581,58 mg/kg), salvianolik asit B (5076,29 mg/kg), homogentisik asit (1312,15 mg/kg), hispidulin 7-glikozit (1142,13 mg/kg), kafeik asit (909,11 mg/kg); SSvH metanol ekstresinde ana bileşikler olarak rosmarinik asit (29702,94 mg/kg), litospermik asit (14103,75 mg/kg), vanilik asit (8856,85 mg/kg), fumarik asit (6484,06 mg/kg), salvianolik asit B (3780,72 mg/kg), homogentisik asit (1272,21 mg/kg), hispidulin 7-glikozit (683,24 mg/kg), kafeik asit (836,21 mg/kg) bulunmuştur. SSvST ve SSvH metanol ekstrelerinin anti-diyabetik aktivitesi α-glukozidaz enzim inhibisyon yöntemiyle yapılmış, her iki ekstede α-glukozidaz enzimine karşı akarboz ile kıyaslandığında orta-iyi derece aktivite göstermiştir (sırasıyla %26,81; %21,15). Literatürde, sadece toprak üstü kısmının uçucu yağ ve antimikrobiyal aktivite çalışması [10] yapılmış olan SSvST ve SSvH taksonlarının bu çalışmayla kök metanol ekstrelerinin kimyasal içeriği ve antidiyabetik aktiviteleri belirlenmiştir. Her iki ekstrenin LC-HRMS analizinde majör olarak aynı moleküller tespit edilmiş olmasına rağmen, miktarlarında farklılıklar görülmüştür. Ayrıca, her iki ekstrede de en yüksek yüzde ile rosmarinik asit bulunması ekstrelerdeki antidiyabetik aktiviteyi destekler niteliktedir. Anahtar Kelimeler: Salvia sericeo-tomentosa var. sericeotomentosa; Salvia sericeo-tomentosa var. hatayica; LC-HRMS; antidiyabetik aktivite; α-glukozidaz Kaynaklar 1. Hedge C. Salvia L. Davis PH. In: Flora of Turkey and the East Aegean Islands. Vol.7. Edinburgh: Edinburgh Univ. Press; 1982. 2. Celep F ve Kahraman A. Salvia. Güner A, Aslan S, Ekim T, Vural M ve Babaç MT. Türkiye Bitkileri Listesi (Damarlı Bitkiler), A Checklist of the Flora of Turkey (Vascular Plants). İstanbul: Nezahat Gokyigit Botanik Bahcesi ve Flora Araştirmalari Dernegi Yayini; 2012. 3. Celep F, Dirmenci T, Guner O. Salvia hasankeyfense (Lamiaceae), a new species from Hasankeyf (Batman, South-eastern Turkey). Phytotaxa. 2015; 227(3): 289-294. 4. Özhatay N, Kültür Ş, Gürdal B. Check-list of additional taxa to the supplement flora of Turkey VIII. Istanbul Journal of Pharmacy. 2017; 47(1): 31-46. 5. Wu Y, Ni Z, Shi O, Dong M, Kiyota H, Gu Y, Cong B. Constituents from Salvia Species and Their Biological Activities. Chemical Reviews. 2012; 112: 5967−6026.6. Topçu G, Yücer R, Şenol H. Bioactive Constituents of Anatolian Salvia Species. Georgiev V, Pavlov A. Salvia Biotechnology. Springer International Publishing Ag.; 2018. 7. Baytop T. Türkiye’de Bitkiler ile Tedavi Geçmişte ve Bugün. 2. Basım. Ankara: Nobel Tıp Kitabevleri; 1999. 8. Aydın S, Ertas A, Boga M, Erol E, Toraman GOA, Saygi TK, Halfon B, Topcu G. Di-, and Triterpenoids Isolation and LC-MS Analysis of Salvia marashica Extracts with Bioactivity Studies. Records of Natural Products. 2021; 15(6): 463-475. 9. Bothon FT, Debiton E, Avlessi F, Forestier C, Teulade JC. Sohounhloue D.K. Invitrobiologicaleffects of two anti-diabetic medicinal plants used in Benin as folk medicine. BMC Complementary Alternative Medicine. 2013. 13:51. 10. Tan N, Yazıcı-Tütiniş S, Yeşil Y, Demirci B, Tan E. Antibacterial Activities and Composition of the Essential Oils of Salvia sericeo-tomentosa Varieties. Records of Natural Products. 2017; 11(5): 456-461

Investigatıon Of Seed Yield And Some Quality Characteristics in Linseed Genotypes Grown in Çanakkale Conditions

Son yıllarda meydana gelen iklimsel değişimler yeni bitki türlerinin tarımsal üretimde yaygınlaştırılmasını zorunlu hale getirmiştir. Bu konuda ülkemizde sınırlı alanlarda yetiştiriciliği yapılan keten önemli bir alternatif ürün olma niteliğindedir. Bu çalışmada sekiz keten genotipinin, tohum verimi, kalite özellikleri ve yaklaşık enerji değerleri bakımından karşılaştırılması amaçlanmıştır. Denemeler 2007 ve 2008 yılında Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Dardanos Araştırma ve Uygulama Birimi’nde tesadüf blokları deneme desenine göre yürütülmüştür. Araştırmada kullanılan genotiplerin tek bitki verimi (g), protein (%), yağ (%), karbonhidrat (%), kül (%) ve kuru madde (%) oranının yanı sıra yaklaşık enerji değerleri (kcal) belirlenmiştir. Araştırma bulgularına göre, tek bitki verimi bakımından Flanders (1,20 g/bitki), yağ oranı bakımından Midin (% 38,6) ve yaklaşık enerji değeri bakımından Norman (454,9 kcal), karbonhidrat ve kül içeriği bakımından McGregor (% 9,62 ve % 4,23) genotipleri diğer genotiplerden üstün bulunmuştur. İncelenen özelliklerden bazıları arasında istatistikî açıdan önemli ilişkiler tespit edilmiş ve en yüksek korelasyon yağ oranı ile toplam enerji değeri arasında (r=0,89) bulunmuştur..Recently, global climate changes force to introduce new crop species into agricultural production. For this purpose, linseed, which is gown in a limited area in Turkey, could be an alternative crop. In this study, the aim was to compare eight linseed genotypes for seed yield, quality characteristics and energy values. Experiments were conducted in Çanakkale Onsekiz Mart University, Dardanos Experimental Unit during 2007 and 2008 according to randomized block experimental design. In the study, plant yield (g/plant), protein (%), oil (%), carbohydrate (%), ash (%), dry matter (%) and energy value (kcal) were determined. The results showed that Flanders (1.20 g/plant) for plant yield, Midin (38.6%) for oil ratio, Norman (454.9 kcal) for energy value and McGregor (9.62% and 4.23%, respectively) for carbohydrate and ash ratio had advantages compared to the rest of genotypes. Significant relationships among some investigated characters were also detected. The highest correlation coefficient (r=0.89) was found between oil ratio and total energy value

The role of cholinergic neurons in arcuate nucleus on anxiety behaviour

3rd International Congress of the Turkish-Neuroendocrinology-Society -- JUN 29-JUL 01, 2018 -- Malatya, TURKEYWOS: 000445952400089…Turkish Neuroendocrinol Societ