Interakce mezi epiteliálními a imunitními buňkami v mnohovrstvém modelu střevní homeostázy

The intestinal immune system is constantly faced with a vast variety of foreign antigens from food and commensal microbiota on top of intestinal self-antigens. To prevent pathology, the immune system developed multiple mechanisms to tolerate these harmless antigens. These mechanisms use a collaboration of thymic T-cell selection and intestinal homeostatic processes. At the same time, intestinal microbiota must be tightly controlled to prevent its overgrowth, which can lead to pathology. Thus, the intestinal immune system must use a combination of tolerogenic and immunogenic responses and keep them in equilibrium. In this thesis I first provide an overview of the current state of knowledge of these processes and then I present several original studies in which I have participated. First and foremost, in the study that is central to this thesis, we have shown that IL-17-mediated stimulation of Paneth cell antimicrobial functions is one of the important mechanisms of immune-mediated control of commensal microbiota and its perturbation results in intestinal pathology susceptibility. Additionally, I have participated in several other studies, which in combination extend the view of intestinal homeostasis, integrating intestine-specific processes with thymic T-cell selection and reactions to pathobionts....(CZ) Střevní imunitní systém musí neustále čelit obrovskému množství cizorodých antigenů z potravy a komenzální mikroflóry, mimo střevních tělu vlastních antigenů. Imunitní systém vyvinul množství mechanismů pro toleranci těchto neškodných antigenů, aby předešel patologii. Tyto mechanismy využívají spolupráce selekce T-buněk v brzlíku s homeostatickými mechanismy ve střevě. Zároveň je však nutno kontrolovat střevní mikroflóru, která by jinak mohla přerůstat, což může vést k patologii. Proto musí imunitní systém střeva využívat kombinaci tolerogenních a imunogenních odpovědí a udržovat je v rovnováze. V této disertační práci nejdříve shrnuji přehled současného stavu poznání těchto procesů a dále představím několik originálních studií kterých jsem se účastnil. V první řadě, v centrální studii této práce jsme ukázali, že IL-17 zprostředkovaná stimulace antimikrobiálních funkcí Panetových buněk je jedním z důležitých imunitních mechanismů kontroly střevní mikroflóry a porušení tohoto mechanismu vede k náchylnosti ke střevní patologii. Dále jsem se účastnil několika dalších studií, které společně rozšiřují pohled na střevní homeostázu a integrují procesy specifické pro střevo se selekcí T-buněk v brzlíku a reakcemi na pathobionty. Jedna z těchto prací identifikovala nový mechanismus, který zajišťuje...Katedra buněčné biologieDepartment of Cell BiologyFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Gated communities and residential separation in Prague

The thesis focuses on gated communities (GCs) as an example of residential separation in today's Prague. The GCs are a new specific phenomenon characterising the society in present post-industrial cities. It is a type of residence where high social status population concentrates behind walls and fences. The number of GCs grows more or less globally which results in increased experts' interest in GCs. This type of residence occurs also in Czechia, primarily in Prague. Experts' interest in the subject in our environment is, however, not as high as in other post-communist countries. This thesis follows up with previous studies and assesses in detail if - in context of the post-industrial transformation - the high social status population is separated in Prague GCs and why such type of residence appears. The document also partly focuses on the development and situation of residential separation and the consequences of GCs formation. It is based on several quantitative (data analysis, questionnaire survey) and qualitative (interviews) research methods. It turns up that on one hand the level of residential segregation and separation in Prague decreases, on the other hand we can see that the number of specific separated locations such as the GCs where the high social status population concentrates grows....Práce se věnuje uzavřeným rezidenčním areálům (gated communities) jako příkladu rezidenční separace v současné Praze. Uzavřené rezidenční areály jsou novým specifickým jevem charakterizujícím společnost v současných postindustriálních městech. Jedná se o typ bydlení, kde se za zdmi a ploty koncentruje především sociálně silné obyvatelstvo. Prakticky na celém světě roste počet těchto uzavřených areálů a paralelně s tím se zvyšuje i zájem odborné veřejnosti o tyto areály. Tento typ bydlení vzniká i v Česku, a to především v Praze. Odborný zájem o toto téma v našem prostředí nicméně stále není tak velký jako v jiných postsocialistických státech. Tato práce navazuje na předcházející studie a v kontextu postindustriální transformace hlouběji hodnotí, zda dochází v pražských uzavřených rezidenčních areálech k separaci sociálně silného obyvatelstva a proč tento typ bydlení vzniká. Částečně je pozornost věnována také vývoji a stavu rezidenční separace a důsledkům vzniku uzavřených areálů. Práce vychází z několika kvantitativních (analýza dat, dotazníkové šetření) a kvalitativních (rozhovory) výzkumných metod. Ukazuje se, že na jedné straně v Praze klesá úrovně rezidenční segregace a separace. Na druhé straně je patrné, že roste počet specifických separovaných lokalit, jako jsou především uzavřené...Department of Social Geography and Regional Develop.Katedra sociální geografie a region. rozvojeFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Gated communities: residetial separation and privatisation of public space in Czechia

Předkládaná diplomová práce se věnuje problematice gated communities, to znamená extrémní formě residenční separace. Gated communities se stávají novým a specifickým fenoménem v současných globalizujicích se městech. Počet těchto objektů na celém světě rapidně roste a v poslední době tento fenomén dorazil i do Česka, kde však odborná ani laická debata, týkající se problematiky gated communities, není příliš rozvinutá. Hlavním cílem práce je přispět k této diskuzi a být ustavující empirickou studií pro český vědecký diskurz. Tato studie chce pomoci k celkovému poznání gated communities. Text je zaměřen především na zhodnocení vývoje výstavby, vlastností, prostorového rozšíření, příčin vzniku a důsledků gated communities v Praze, tedy v městě s nejvyšší koncentrací gated communities v Česku (celkem zde můžeme nalézt 59 těchto objektů). Jejich masivní výstavba začala v posledních čtyřech až pěti letech, kdy gated communities přestaly být dostupné pouze pro nejbohatší vrstvu obyvatel. Oproti jiným státům jsou lokalizovány především ve vnitřním městě a liší se i v základní příčině vzniku: v mnoha státech způsobuje jejich výstavbu strach z kriminality. Pražské gated communities vznikají z jiného důvodu - a sice na straně nabídky, tedy u developerů, kteří se v nabitém konkurenčním prostředí snaží nabídnout nové...The diploma thesis is focused on the phenomenon of gated communities which represent the extreme form of residential separation. Gated communities are becoming the new and specific sign in present-day globalizing cities. The number of objects of gated communities is growing quickly all over the world, and now this issue appeared in the Czech Republic. But common or expert debate concerning the topic is not developed here. The main aim of this piece of work is to contribute to this debate, and at the same time, to be the constitutive empirical research applied to the Czech scientific discourse. This study intends to help with the overall recognition of gated communities. The work is primarily aimed at evaluation of development of housing construction, features, territorial extension, causes of formation and consequences of gated communities in the capital Prague. It means in the place with the highest concentration of gated communities in the Czech Republic; 59 of these objects were found there. Extensive construction began four or five years ago; since then gated communities have been available not only for the richest class. Compared to other countries, gated communities are localized mainly in the inner city, and there is a difference in the cause of formation: in these states it is the fear of...Department of Social Geography and Regional Develop.Katedra sociální geografie a region. rozvojeFaculty of SciencePřírodovědecká fakult

Gated communities and residential separation in Prague

Práce se věnuje uzavřeným rezidenčním areálům (gated communities) jako příkladu rezidenční separace v současné Praze. Uzavřené rezidenční areály jsou novým specifickým jevem charakterizujícím společnost v současných postindustriálních městech. Jedná se o typ bydlení, kde se za zdmi a ploty koncentruje především sociálně silné obyvatelstvo. Prakticky na celém světě roste počet těchto uzavřených areálů a paralelně s tím se zvyšuje i zájem odborné veřejnosti o tyto areály. Tento typ bydlení vzniká i v Česku, a to především v Praze. Odborný zájem o toto téma v našem prostředí nicméně stále není tak velký jako v jiných postsocialistických státech. Tato práce navazuje na předcházející studie a v kontextu postindustriální transformace hlouběji hodnotí, zda dochází v pražských uzavřených rezidenčních areálech k separaci sociálně silného obyvatelstva a proč tento typ bydlení vzniká. Částečně je pozornost věnována také vývoji a stavu rezidenční separace a důsledkům vzniku uzavřených areálů. Práce vychází z několika kvantitativních (analýza dat, dotazníkové šetření) a kvalitativních (rozhovory) výzkumných metod. Ukazuje se, že na jedné straně v Praze klesá úrovně rezidenční segregace a separace. Na druhé straně je patrné, že roste počet specifických separovaných lokalit, jako jsou především uzavřené...The thesis focuses on gated communities (GCs) as an example of residential separation in today's Prague. The GCs are a new specific phenomenon characterising the society in present post-industrial cities. It is a type of residence where high social status population concentrates behind walls and fences. The number of GCs grows more or less globally which results in increased experts' interest in GCs. This type of residence occurs also in Czechia, primarily in Prague. Experts' interest in the subject in our environment is, however, not as high as in other post-communist countries. This thesis follows up with previous studies and assesses in detail if - in context of the post-industrial transformation - the high social status population is separated in Prague GCs and why such type of residence appears. The document also partly focuses on the development and situation of residential separation and the consequences of GCs formation. It is based on several quantitative (data analysis, questionnaire survey) and qualitative (interviews) research methods. It turns up that on one hand the level of residential segregation and separation in Prague decreases, on the other hand we can see that the number of specific separated locations such as the GCs where the high social status population concentrates grows....Katedra sociální geografie a region. rozvojeDepartment of Social Geography and Regional Develop.Faculty of SciencePřírodovědecká fakult

The effect of feeding wheat with purple pericarp on the growth of carp

This study assessed and compared the influence of feeding wheat with purple pericarp (variety Konini) and standard coloured wheat (red variety Bohemia) on the growth characteristics of fingerling carp (Cyprinus carpio L.) of the "Amurský lysec" line. The total content of anthocyanins converted to cyanidin 3-glucoside in the control Bohemia wheat was 24.95 mg.kg-1 and in the Konini purple wheat 41.70 mg.kg-1. Two experimental variants for feed were evaluated: dipped wheat grain and crushed wheat grain. The feed dose for wheat was 1.5% of the fish stock weight and for natural food (frozen Chironomid larvae) was 0.2% of fish stock weight to all variants. Growth parameters (body length, body weight, Fulton's condition factor and feed conversion ratio) of the fish were evaluated after one month of administration. The feed consumption and physico-chemical parameters (temperature, oxygen saturation, pH, N-NH4 +, N-NO2-, N-NO3- and Cl-) of the environment were observed. During the feeding test, no major differences in food consumption among variations feeding on either wheat and on Chironomid larvae were noted. Satisfying results for mas and length gain were achieved in V2 wheat with purple pericarp (Konini variety - dipped grain), where the average total body length was 156.56 mm and the average unit mass was 60.81 g. In this variant, higher values of the parameters were achieved compared to the control group (100.6%, resp. 104.2%). A positive impact of wheat with purple pericarp on the evaluated parameter of fish condition factor was demonstrated. This trend was confirmed in all variants. No effect was demonstrated for mechanical disruption of kernels on the level of utilization of nutrients. In further experiments on growth characteristics we would like to determine antioxidant parameters in the blood and liver of fry

A Modular and Adaptive System for Business Email Compromise Detection

The growing sophistication of Business Email Compromise (BEC) and spear phishing attacks poses significant challenges to organizations worldwide. The techniques featured in traditional spam and phishing detection are insufficient due to the tailored nature of modern BEC attacks as they often blend in with the regular benign traffic. Recent advances in machine learning, particularly in Natural Language Understanding (NLU), offer a promising avenue for combating such attacks but in a practical system, due to limitations such as data availability, operational costs, verdict explainability requirements or a need to robustly evolve the system, it is essential to combine multiple approaches together. We present CAPE, a comprehensive and efficient system for BEC detection that has been proven in a production environment for a period of over two years. Rather than being a single model, CAPE is a system that combines independent ML models and algorithms detecting BEC-related behaviors across various email modalities such as text, images, metadata and the email's communication context. This decomposition makes CAPE's verdicts naturally explainable. In the paper, we describe the design principles and constraints behind its architecture, as well as the challenges of model design, evaluation and adapting the system continuously through a Bayesian approach that combines limited data with domain knowledge. Furthermore, we elaborate on several specific behavioral detectors, such as those based on Transformer neural architectures

Epidemiologie, prevence a léčba kolorektálního karcinomu dle dostupných českých a mezinárodních dat

Nádory tlustého střeva a konečníku patří mezi nejčastější onkologické diagnózy. V České republice je každoročně nově diagnostikováno téměř 8 500 pacientů s kolorektálním karcinomem a přibližně 3 900 osob tomuto onemocnění každým rokem podlehne. Celková prevalence přesáhne v roce 2012 hranici 55 000 osob. Společenské, etické i ekonomické důsledky vyplývající z takto vysoké zátěže jsou zřejmé. Publikace „Epidemiologie, prevence a léčba kolorektálního karcinomu dle dostupných českých a mezinárodních dat“ přináší ucelený přehled epidemiologické a léčebné zátěže české populace touto chorobou a věnuje se krátkodobým a dlouhodobým predikcím dalšího vývoje. Situace je rovněž hodnocena v mezinárodním srovnání, neboť v hodnotách incidence a mortality kolorektálního karcinomu obsazuje ČR přední příčky evropských i světových statistik. Z mezinárodních studií však také vyplývá pozitivní poznatek, že většině nádorů tlustého střeva a konečníku lze předejít účinnou prevencí. Kromě primární prevence je zde hlavním nástrojem organizovaný populační screening, který je založen na testech krvácení do stolice a na kolonoskopii. Otázkám prevence a výsledkům screeningu kolorektálního karcinomu jsou v publikaci věnovány zvláštní kapitoly. Ačkoli nejnovější data dokládají rostoucí výkonnost českého screeningu, celkově dosažené pokrytí populace bohužel stále není dostatečné. To platí pro včasný záchyt kolorektálního karcinomu obecně, neboť v ČR je setrvale téměř 50 % nových onemocnění diagnostikováno v pokročilých klinických stadiích, a tedy s výrazně sníženou šancí na vyléčení nebo dlouhodobé přežití pacienta. Publikace rovněž hodnotí přežití dosahované u českých pacientů jakožto zásadní ukazatel výsledků léčebné péče, u kterého v posledních 15 letech zaznamenáváme statisticky významné zlepšení. Pravděpodobnost 5letého relativního přežití je u včasně diagnostikovaného kolorektálního karcinomu v klinickém stadiu i vyšší než 88%. Tato čísla opět potvrzují nutnost účinné prevence a posílení screeningu tohoto preventabilního onemocnění. V tomto směru má publikace ambici informovat odbornou i laickou veřejnost, a proto věnuje značný prostor přehledu dostupných informačních zdrojů.The book aims to inform expert and general public about epidemiology of colorectal carcinoma in the Czech Republic and priorities resulting from high population burden for prevention, diagnostics, and treatment of this severe disease. A number of invited experts assess selected information sources that representatively describe performance and quality of preventive programmes and results of CRC treatment in the Czech Republic

Complete mitochondrial genomes and nuclear ribosomal RNA operons of two species of Diplostomum (Platyhelminthes: Trematoda): a molecular resource for taxonomy and molecular epidemiology of important fish pathogens

© 2015 Brabec et al. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly credited. The Creative Commons Public Domain Dedication waiver (http:// creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/) applies to the data made available in this article, unless otherwise stated. The attached file is the published version of the article