Applying Hierarchical Clustering to Broad Absorption Line Profiles for Quasar Classification

The region immediately surrounding an actively accreting supermassive black hole at the centre of a massive galaxy, the accretion disk, produces an enormous amount of radiation resulting in a luminous, short-lived phenomenon called a quasar. About 20% of quasars show broad, blue-shifted absorption features in their UV spectra, indicative of an outflowing wind from the accretion disk. These winds can remove angular momentum from the accretion disk, thereby contributing to the growth of the central black hole. Understanding these winds will help us to better constrain the details of how black holes grow during the quasar phase. The structures of the absorption features are sensitive to the properties (ionization state, velocity profile, and thickness) of the winds. Consequently, the broad absorption line profiles of these objects show great diversity in depth and velocity width. Using a sample of 1,084 broad absorption line quasar spectra from the Sloan Digital Sky Survey, we apply an agglomerative hierarchical clustering algorithm to group spectra by similar C IV absorption line shapes. For each cluster, we compose median spectra and compare the shapes of the C IV broad absorption lines with the properties of prominent, broad emission lines. In agreement with results in the literature, low-velocity, deep troughs are found preferentially in objects for which the radiation from the accretion disk is more energetic. The link between broad absorption line properties and those of emission lines holds promise for allowing us to constrain the structure and dynamics of the outflowing winds

Inhibition of Neuroepithelial Patched-Induced Apoptosis by Sonic Hedgehog

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Dependence receptors: between life and death

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Dependence receptors: mechanisms of an announced death.

Present adress Chantal Thibert : Université Joseph Fourrier, Grenoble F-38042, France, INSERM U836, Grenoble Institut des Neurosciences, Team 2 Neurodegenerescence and PlasticityInternational audienceDependence receptors form a family of functionally related receptors which are all able to induce two completely opposite intracellular signals depending on the availability of their ligand. Indeed, in its presence, they mediate a positive, classical signal transduction of survival, differentiation or migration but without it, they trigger a negative signal which leads to cell death. The molecular mechanisms involved in triggering cell death in the absence of ligand are starting to be unravelled: dependence receptors are recruited at well-defined domains at the plasma membrane, they trigger cell death through a monomeric form, they are cleaved by caspases and they recruit a caspase activating complex

Mise au point de la transgenèse chez le ver à soie Bombyx mori L et perspectives d'applications

La transgenèse est une méthode puissante pour étudier la fonction de gènes ou pour conférer des traits génétiques utiles à des organismes. Au cours de ma thèse, j'ai testé l'aptitude du transposon piggyBac (découvert chez le lépidoptère Trichoplusia ni) à intégrer des gènes dans les chromosomes de cellules d'insectes en culture. J'ai ensuite appliqué ce système à l'intégration stable et transmissible à la descendance d'un gène d'intérêt dans le génome du ver à soie Bombyx mori L. Ce système utilise deux vecteurs; l'un véhicule un gène d'intérêt (le gène rapporteur gfp sous le contrôle du promoteur du gène de l'actine cytoplasmique BmA3) placé entre les extrémités inversées répétées de l'éléments piggyBac ; l'autre est un vecteur assistant non-autonome qui code la transposase de piggyBac sous le contrôle du même promoteur. La co-injection des deux vecteurs dans l'œuf au stade préblastodermique aboutit à la transformation de gamètes chez environ 2% des individus injectés. L'analyse de l'ADN génomique des larves transgéniques a révélé que l'expression de la fluorescence résultait d'insertions souvent multiples du transgène ; celui-ci est par ailleurs hérité de façon mendélienne au cours des générations. J'ai donc pu montrer que ce système est efficace pour la transformation germinale du ver à soie. J'ai donc pu montrer que ce système est efficace pour la transformation germinale du ver à soie. J'ai entrepris d'exploiter la transgenèse pour inhiber par interférence d'ARN l'expression de gènes fortement exprimés dans la glande séricigène. L'application au gène codant la Fibroine, la protéine majoritaire de la soie, si elle est réalisable, permettrait de substituer cette protéine par des protéines d'intérêt textile et pharmaceutique.LYON1-BU.Sciences (692662101) / SudocSudocFranceF

Morphogens and cell survival during development

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Functions of LKB1 in neural crest development: The story unfolds

International audienceNeural crest cells (NCCs) are highly motile, multipotent, embryonic cells that delaminate from the dorsal edges of the neural tube. NCCs follow stereotypical long-range migratory pathways to reach target organs during development, where they give rise to multiple derivatives. The identification of reservoirs of neural crest stem cells that persist to adulthood has recently aroused renewed interest in the biology of NCCs. In this context, several recent studies have demonstrated the essential role of the metabolic kinase LKB1 in NCC establishment. This review surveys how LKB1 governs the formation and maintenance of several neural crest derivatives, including facial bones, melanocytes, Schwann cells, and the enteric nervous system. We also detail the underlying molecular mechanisms that involve downstream effectors of LKB1, in particular the contribution of the AMPK-mTOR signaling pathway to both polarity and metabolic processes. Collectively, these recent discoveries open promising perspectives for new therapeutic applications for the treatment of neural crest disorders

Même l’effet Warburg est oxydable

Au cours du développement tumoral, les cellules malignes reprogramment leur métabolisme pour répondre à la demande en biosynthèses conditionnant l’augmentation de leur biomasse et pour s’adapter aux propriétés de leur microenvironnement. Les avancées récentes de la recherche ont révélé l’étonnante flexibilité des cellules cancéreuses qui alternent entre un métabolisme glycolytique aérobie (appelé effet Warburg) et un métabolisme oxydatif en fonction de leurs conditions de développement, une plasticité métabolique requérant une mutualisation de leurs ressources énergétiques. Dans cette revue, nous présentons ces nouvelles découvertes et discutons d’un modèle décrivant la tumeur comme un écosystème métabolique évolutif tout en insistant sur les applications thérapeutiques qui en découlent