Molecular epidemiology of Listeria monocytogenes isolated from different sources in Brazil

Listeria monocytogenes is an important foodborne pathogen that primarily affects pregnant women, neonates, the elderly and immune-compromised individuals, and it may cause abortion, septicemia, and meningitis. From the 13 capsular groups described, serotypes 4b, 1/2b and 1/2a are most closely related to human infection. For this reason, serotyping has limited value as an epidemiological tool; thus, improved discriminatory typing methods are required to enhance knowledge of L. monocytogenes contamination and infection. The aim of this study was to characterize the genetic diversity of L. monocytogenes isolates in the pork processing industry in Sao Paulo, Brazil and human infection isolates by ERICPCR and single enzyme AFLP. Serotypes 1/2c and 4b were frequent among isolates from pork and slaughterhouse/market environments, whereas serotypes 4b and 1/2a were observed among human isolates. ERIC-PCR and AFLP revealed 34 and 31 distinct profiles, respectively, which had tendencies of separation according to serogroup and isolate origin. The genetic profiles from slaughterhouse and market environments suggest the possibility of different sources of Listeria contamination in the environment, although in certain cases, continuous contamination caused by the persistence of clonal strains is also a possibility.Listeria monocytogenes é um importante patógeno de origem alimentar que afeta principalmente grávidas, neonatos, idosos e indivíduos imunocomprometidos, e pode causar abortamento, septicemia e meningite. Dos 13 grupos capsulares descritos, os sorotipos 4b, 1/2b e 1/2a são os mais relacionados à infecção humana. Por esta razão, a sorotipagem possui valor limitado como ferramenta epidemiológica e, dessa forma, métodos mais discriminatórios são necessários para melhorar o conhecimento sobre a contaminação e a infecção por L. monocytogenes. O objetivo deste estudo foi caracterizar a diversidade genética de isolados de L. monocytogenes da indústria de processamento de carne suína no Estado de São Paulo, Brasil, e compará-los a isolados de casos de infecção humana através do ERIC-PCR e AFLP com uma única enzima. Os sorotipos 1/2c e 4b foram frequentes em carne suína e ambientes de abatedouros e mercados, enquanto os sorotipos 4b e 1/2a foram observados nos isolados de humanos. ERIC-PCR e AFLP resultaram em 34 e 31 perfis distintos, respectivamente, com uma tendência a separar de acordo com o sorogrupo e a origem do isolado. Os perfis genéticos de ambiente dos abatedouros e mercados sugerem a possibilidade de diferentes origens de contaminação por Listeria nos ambientes estudados, porém, em alguns casos, é possível que ocorra a persistência de cepas clonais causando contaminação contínua

Tipagem molecular de Clostridium perfringens isolados de suínos em abatedouros do estado de São Paulo, Brasil

Clostridium perfringens is an anaerobic Gram-positive bacterium known as common pathogen for humans, for domestic and wildlife animals. Although infections caused by C. perfringens type C and A in swine are well studied, just a few reports describe the genetic relationship among strains in the epidemiological chain of swine clostridioses, as well as the presence of the microorganism in the slaughterhouses. The aim of the present study was to isolate C. perfringens from feces and carcasses from swine slaughterhouses, characterize the strains in relation to the presence of enterotoxin, alpha, beta, epsilon, iota and beta-2 toxins genes, using polymerase chain reaction (PCR) and comparing strains by means of Pulsed field gel electrophoresis (PFGE). Clostridium perfringens isolation frequencies in carcasses and finishing pig intestines were of 58.8% in both types of samples. According to the polymerase chain reaction assay, only alfa toxin was detected, being all isolates also negative to enterotoxin and beta2 toxin. Through PFGE technique, the strains were characterized in 35 pulsotypes. In only one pulsotype, the isolate from carcass sample was grouped with fecal isolate of the same animal, suggesting that the risk of cross-contamination was low. Despite the high prevalence of C. perfringens in swine carcasses from the slaughterhouses assessed, the risk of food poisoning to Brazilian pork consumers is low, since all strains were negative to cpe-gene, codifying enterotoxin

Genotypic Characterization of Yersinia enterocolitica Biotype 4/O:3 Isolates from Pigs and Slaughterhouses Using SE-AFLP, ERIC-PCR, and PFGE

Made available in DSpace on 2015-09-21T17:25:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) christiane_reis_etal_IOC_2013.pdf: 9747161 bytes, checksum: 0b937f29eb74ff98a20ce4ac00bacd5e (MD5) Previous issue date: 2013Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil / Faculdades Metropolitanas Unidas (FMU). Faculdade de Medicina Veterinária. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Saúde Pública. Laboratório de Saúde Pública. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil / Faculdades Metropolitanas Unidas (FMU). Faculdade de Medicina Veterinária. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Zoonoses Bacterianas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Zoonoses Bacterianas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Saúde Pública. Laboratório de Saúde Pública. São Paulo, SP, BrasilUniversidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil.Yersinia enterocolitica is a foodborne pathogen that causes illness in humans and animals. The biotype 4/O:3 has been commonly associated with yersiniosis and is characterized by the presence of chromosomal and extra-chromosomal virulence genes.Molecular typing methods have been successfully used to characterize Y. enterocolitica genetic heterogeneity and to study the epidemiology of the bacteria from different origins. In this study, 320 Y. enterocolitica biotype 4/O:3 isolates originating in pigs and slaughterhouses were characterized according to the virulence profile, and 61 isolates were typified through SE-AFLP, ERIC-PCR, and PFGE techniques. The majority of the isolates originated from pigs, and the predominant virulence profile was ail+ virF+ rfbC+ ystA+, representing 83.4% of the tested isolates. All of the Y. enterocolitica 4/O:3 isolates were positive for at least ystA gene.The SE-AFLP and ERIC-PCR patterns were highly homogeneous. The SE-AFLP was more discriminative than the ERIC-PCR and tended to cluster isolates according to the slaughterhouse. Despite the limited genetic diversity of Y. enterocolitica 4/O:3, PFGE was shown to be the most discriminative technique considering one band of difference. Fattening pigs proved to be an important reservoir of Y. enterocolitica biotype 4/O:3 carrying virulence genes

Epidemiologia molecular de Listeria monocytogenes isoladas de diferentes fontes no Brasil

Listeria monocytogenes é um importante patógeno de origem alimentar que afeta principalmente grávidas, neonatos, idosos e indivíduos imunocomprometidos, e pode causar abortamento, septicemia e meningite. Dos 13 grupos capsulares descritos, os sorotipos 4b, 1/2b e 1/2a são os mais relacionados à infecção humana. Por esta razão, a sorotipagem possui valor limitado como ferramenta epidemiológica e, dessa forma, métodos mais discriminatórios são necessários para melhorar o conhecimento sobre a contaminação e a infecção por L. monocytogenes. O objetivo deste estudo foi caracterizar a diversidade genética de isolados de L. monocytogenes da indústria de processamento de carne suína no Estado de São Paulo, Brasil, e compará-los a isolados de casos de infecção humana através do ERIC-PCR e AFLP com uma única enzima. Os sorotipos 1/2c e 4b foram frequentes em carne suína e ambientes de abatedouros e mercados, enquanto os sorotipos 4b e 1/2a foram observados nos isolados de humanos. ERIC-PCR e AFLP resultaram em 34 e 31 perfis distintos, respectivamente, com uma tendência a separar de acordo com o sorogrupo e a origem do isolado. Os perfis genéticos de ambiente dos abatedouros e mercados sugerem a possibilidade de diferentes origens de contaminação por Listeria nos ambientes estudados, porém, em alguns casos, é possível que ocorra a persistência de cepas clonais causando contaminação contínua

Virulence Genes and Antimicrobial Resistance Profiles of Pasteurella multocida Strains Isolated from Rabbits in Brazil

Pasteurella multocida is responsible for a wide range of diseases in domestic animals. In rabbits, the agent is related to nasal discharge, pneumonia, otitis media, pyometra, orchitis, abscess, and septicemia. One hundred and forty rabbits with respiratory diseases from four rabbitries in São Paulo State, Brazil were evaluated for the detection of P. multocida in their nasal cavities. A total of twenty-nine animals were positive to P. multocida isolation, and 46 strains were selected and characterized by means of biochemical tests and PCR. P. multocida strains were tested for capsular type, virulence genes, and resistance profile. A total of 45.6% (21/46) of isolates belonged to capsular type A, and 54.34% (25/46) of the isolates were untypeable. None of the strains harboured toxA or pfhA genes. The frequency of the other twenty genes tested was variable, and the data generated was used to build a dendrogram, showing the relatedness of strains, which were clustered according to origin. Resistance revealed to be more common against sulfonamides and cotrimoxazole, followed by erythromycin, penicillin, and amoxicillin

Phenotypic and Genotypic Characterization of Atypical Listeria monocytogenes and Listeria innocua Isolated from Swine Slaughterhouses and Meat Markets

Made available in DSpace on 2015-06-17T12:05:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1914 bytes, checksum: 7d48279ffeed55da8dfe2f8e81f3b81f (MD5) cristhiane_reisetal_IOC_2014.pdf: 1395482 bytes, checksum: a489c60b6b4c13da2fef70955f3a9d03 (MD5) Previous issue date: 2014Universidade de São Paulo. Faculdade de Saúde Pública. Laboratório Prática de Saúde Pública. Faculdade de Medicina Veterinária. Laboratório de Sanidade Suína e Virologia. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária. Laboratório de Sanidade Suína e Virologia. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária. Laboratório de Sanidade Suína e Virologia. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária. Laboratório de Sanidade Suína e Virologia. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária. Laboratório de Sanidade Suína e Virologia. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária. Laboratório de Sanidade Suína e Virologia. São Paulo, SP, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Zoonoses Bacterianas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Zoonoses Bacterianas, Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Saúde Pública. Laboratório Prática de Saúde Pública. São Paulo, SP, Brasil.Universidade de São Paulo. Faculdade de Saúde Pública. Laboratório Prática de Saúde Pública. São Paulo, SP, Brasil.In the last decade, atypical Listeria monocytogenes and L. innocua strains have been detected in food and the environment. Because of mutations in the major virulence genes, these strains have different virulence intensities in eukaryotic cells. In this study, we performed phenotypic and genotypic characterization of atypical L. monocytogenes and L. innocua isolates obtained from swine slaughterhouses and meat markets. Forty strains were studied, including isolates of L. monocytogenes and L. innocua with low-hemolytic activity. The isolates were characterized using conventional phenotypic Listeria identification tests and by the detection and analysis of L. monocytogenes-specific genes. Analysis of 16S rRNA was used for the molecular identification of the Listeria species. The L. monocytogenes isolates were positive for all of the virulence genes studied. The atypical L. innocua strains were positive for hly, plcA, and inlC. Mutations in the InlC, InlB, InlA, PI-PLC, PC-PLC, and PrfA proteins were detected in the atypical isolates. Further in vitro and transcriptomic studies are being developed to confirm the role of these mutations in Listeria virulence