Bayesian testing of many hypotheses ×\times many genes: A study of sleep apnea

Substantial statistical research has recently been devoted to the analysis of large-scale microarray experiments which provide a measure of the simultaneous expression of thousands of genes in a particular condition. A typical goal is the comparison of gene expression between two conditions (e.g., diseased vs. nondiseased) to detect genes which show differential expression. Classical hypothesis testing procedures have been applied to this problem and more recent work has employed sophisticated models that allow for the sharing of information across genes. However, many recent gene expression studies have an experimental design with several conditions that requires an even more involved hypothesis testing approach. In this paper, we use a hierarchical Bayesian model to address the situation where there are many hypotheses that must be simultaneously tested for each gene. In addition to having many hypotheses within each gene, our analysis also addresses the more typical multiple comparison issue of testing many genes simultaneously. We illustrate our approach with an application to a study of genes involved in obstructive sleep apnea in humans.Comment: Published in at http://dx.doi.org/10.1214/09-AOAS241 the Annals of Applied Statistics (http://www.imstat.org/aoas/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org

Mesleki stresin iş tatminine etkisi: örgütsel desteğin aracılık rolü

Bu çalışma, “mesleki stres – iş tatmini ilişkisinde örgütsel desteğin aracılık rolü üstlendiğine” ilişkin görüşe deneysel destek sağlamak amacıyla yapılmıştır. Amaca ulaşmayı sağlayacak veriler, Türkiye’deki kürsü hakimleri ve savcılarının hedeflenen ana kütle (evren), yaklaşık 9000 hakim ve savcıyı barındıran bir sosyal paylaşım sitesinin üyeleri ise erişilebilen ana kütle (evreni) oluşturmuştur. “Seçtiği evren itibarıyla ilk çalışmalar arasında olduğu iddiası”, “benzer evren üzerinde çalışılacak başka araştırmalara alt yapı oluşturulabilme potansiyeli” ile “tanımlayıcı ve tümevarımsal istatistik tekniklerinin kullanılmış olması” çalışmanın özgünlüğüne ilişkin işaretler olarak kabul edilmektedir. Araştırmacı tarafından geliştirilen “mesleki stres ve örgütsel destek” ölçekleri ile “Minnesota İş Tatmini ölçeği” internet ortamında yayınlanarak erişilebilen evrenden veri toplanmıştır. Değerlendirmeye alınan 393 anket formunun erişilebilir evreni temsil şartlarını sağladığı değerlendirilmektedir. Ölçeklerin geçerlilik ve güvenilirlik koşullarını sağladıkları, keşfedici faktör analizi, doğrulayıcı faktör analizi ve cronbach alpha analizi ile ortaya konulmuştur. Daha sonra katılımcıların ölçeklerden aldıkları ortalama puanlar hesaplanmıştır. Son olarak da temel hipotezi sınamak için önce çoklu doğrusal regresyon analizi ve yol analizi yapılarak aracılık etkisi aranmıştır. Analiz sonuçlarına göre “örgütsel desteğin, mesleki stres – iş tatmini ilişkisinde aracı değişken olduğu” yönündeki temel hipotezi destekleyici bulgular elde edilmiştir

Primary psoas muscle abscess diagnosed and treated during pregnancy: case report and literature review.

BACKGROUND: Primary psoas muscle abscess is rare and can be difficult to diagnose, particularly during pregnancy. CASE: To our knowledge, this is the first case of primary psoas muscle abscess diagnosed during pregnancy. Clinical investigation did not reveal any infection spreading from adjacent structures. Surgical drainage and simultaneous Cesarean delivery of the infant, combined with appropriate antibiotics, enabled a cure. CONCLUSION: The possibility of psoas muscle abscess should be taken into account when investigating lower back pain during pregnancy if conventional approaches are unsatisfactory

Bayesian testing of many hypothesis x many genes: a study of sleep apnea

To access publisher full text version of this article. Please click on the hyperlink in Additional Links fieldSubstantial statistical research has recently been devoted to the analysis of large-scale microarray experiments which provide a measure of the simultaneous expression of thousands of genes in a particular condition. A typical goal is the comparison of gene expression between two conditions (eg. diseased vs. non-diseased) to detect genes which show differential expression. Classical hypothesis testing procedures have been applied to this problem and more recent work has employed sophisticated models that allow for the sharing of information across genes.However,many recent gene expression studies have an experimental design with several conditions that requires an even more involved hypothesis testing approach. In this paper, we use a hierarchical Bayesian model to address the situation where there are many hypotheses that must be simultaneously tested for each gene. In addition to having many hypotheses within each gene, our analysis also addresses the more typical multiple comparison issue of testing many genes simultaneously. We illustrate our approach with an application to a study of genes involved in obstructive sleep apnea in humans

Reply to Comment by Jonathan J. Rhodes on ‘‘Modeling of the Interactions between Forest Vegetation, Disturbances, and Sediment Yields’’

Rhodes [2005] brings up some excellent points in his comments on the work of Istanbulluoglu et al. [2004]. We appreciate the opportunity to respond because it is likely that other readers will also wonder how they can apply the relatively simple analysis to important policy questions. Models necessarily reduce the complexity of the problem to make it tractable and synthesize some diverse sources of information. It may be helpful at times for readers to understand the high dimension of the complexity sacrificed in order to obtain the synthesis and the reasons for reducing the complexity in a particular manner. Rhodes [2005] comments on three things: (1) the omission of roads and landings from the analysis; (2) the implicit assumption that fire does not occur with harvesting; and (3) the overestimation of water repellency. We will respond to each of these, clarifying and elaborating on the basis for our modeling choices

Ücret tatmininin yaşam tatminini belirleyici etkisi var mı? Elazığ banka çalışanları örneği

iddiasına deneysel destek sağlamaktır. Ücret tatmini ile yaşam tatmini arasındaki ilişkiyi irdeleyen bir çalışmaya rastlanamamıştır. Ücret tatmininin yaşam tatmininin üzerindeki etkisini ortaya koymayı amaçlayan bu çalışma ile alanda yapılacak çalışmalara yeni bir bakış açısının kazandırılabileceği ve bilgi birikimine katkı sağlanabileceği ümit edilmektedir. Çalışmanın amacını gerçekleştirmek üzere Elazığ İl Merkezi’nde faaliyet göstermekte olan bankaların çalışanlarından veri toplanmıştır. Araştırma teorik çerçeve ile desteklenmiş bir tanımlayıcı araştırma niteliğindedir. Veri toplama aracı olarak, anket kullanılmıştır. Anketin içeriğinde demografik sorular, Diener’e ait “Yaşam Tatmini Ölçeği” ve araştırmacılara ait “Ücret Tatmini Ölçeği” yer almıştır. Toplanan ham verilere, SPSS 21.0 Programı aracılığıyla frekans dağılımı, aritmetik ortalama, standart sapma, faktör, güvenirlik, regresyon, f ve t analizleri uygulanmıştır. Araştırma sonucunda, katılımcıların genel olarak ücret tatmin düzeylerinin ve yaşam tatmini düzeylerinin oldukça vasat seviyede olduğu tespit edilmiştir. Kullanılan ölçeklerden alınan ortalama puanların bazı demografik değişkenlere göre anlamlı düzeyde farklı olduğu görülmüştür. Ücret tatmininin yaşam tatmini üzerindeki etkisi ise istatistiksel açıdan anlamlı, pozitif yönde ve vasat düzeyde bulunmuştur

Örgütsel bağlılığın belirleyicisi olarak liderlik: sağlık çalışanları örneği

liderlik davranışlarının işletmelerindeki insan kaynaklarının örgütsel bağlılıklarını artırmada etkili olduğu pek çok araştırma sonucunda ortaya koyulmuştur. Bu çalışmada, çalışanların liderlik algıları ile örgütsel bağlılıkları arasındaki ilişkinin incelenmesi amaçlanmıştır. Bu doğrultuda, öncelikle yönetsel ve Dönüşümcü liderlik tarzları ve örgütsel bağlılık kavramı alt boyutlarıyla kısaca incelenerek konunun kavramsal çerçevesi oluşturulmaya çalışılmıştır. Çalışmanın araştırma kısmında ise; Tunceli ve Malatya devlet hastanelerinde görev yapan toplam 148 yardımcı sağlık personelinden (ebe, hemşire, sağlık memuru, biyolog, laborant, röntgen teknisyeni ve diyetisyen) toplanan veriler, istatistikî analize tabii tutulmuştur. Araştırmanın sonucunda; “Yöneticilerin sergiledikleri liderlik tarzları çalışanların bağlılıklarını gerçekten etkiler mi?” şeklinde belirlenmiş olan sorunun cevabının “evet” olduğu ortaya çıkmıştır. Liderlik tarzlarından özellikle dönüşümcü liderliğin örgütsel bağlılık üzerinde güçlü bir etkisinin olduğu belirlenmiştir. Araştırma sonuçlarının ve önerilerin, özellikle sağlık işletmeleri yöneticilerine, liderlik tarzlarının birlikte çalıştıkları insan kaynağının örgütsel bağlılıklarını daha fazla artırma noktasında faydalı olacağına inanılmaktadır

Kurum imajının kurum kimliği açısından açıklanabilirliği: İnönü Üniversitesi Turgut Özal Tıp Merkezi örneği

Çalışma; “kurum imajının kurum kimliği açısından açıklanabilir olup olmadığını” ortaya koymak üzere gerçekleştirilmiştir. Araştırmanın çalışma evreni, İnönü Üniversitesi Tıp Fakültesi Turgut ÖZAL Tıp Merkezi’nden ayakta tedavi hizmeti alan hastalar ve hasta yakınlarından meydana gelmektedir. Örneklem, tesadüfi yöntemle belirlenen 184 kişiden oluşmaktadır. Çalışma, yazın tarama ve gözlem sonucunda oluşturulan anketin uygulanmasıyla tamamlanmıştır. Değerlendirme sonucunda, örnek gurubunun hem kurum kimliğine ilişkin algıları hem de kurum imajına ilişkin algıları yüksek bulunmuştur. Ayrıca kurum kimliği ile kurum imajı arasında pozitif yönde ve güçlü bir korelasyon tespit edilmiştir (r = 0,784). İki değişken arasındaki çoklu regresyon modeline göre de kurum imajının %71,2’sinin kurum kimliğini oluşturan faktörlerce açıklanabildiği ortaya konulmuştur

Yöneticiler açısından etkin zaman yönetimi tekniklerinin değerlendirilmesi

Zaman; anında tüketilme ve depolanmama gibi özelliklerinin yanında, hiçbir şeyin ikame edemediği eşsiz bir kaynaktır. Bu eşsiz kaynağın kullanılması da çok büyük ölçüde hassasiyet gerektirmektedir. Yönetici sıfatına sahip olan kişilerin zamanı etkin bir şekilde yönetebilmeleri sayesinde örgüt, amaçlarına ulaşabilme seviyesini de yükseltir. Zamanın yüksek düzeyde etkin olarak yönetildiği örgütlerde yöneticiler, öncelik vermeleri gereken düşünme ve stratejik işler gibi konulara daha çok vakit ayırabileceklerdir. Bu şekilde elde edilen zaman da, hem kısa vadede hem de uzun vadede örgütün etkinliğini güvence altına almak için önemli bir kaynak olacaktır. Yöneticilerin bu konuda yapmaları gerekenler ise; zaman kayıplarına düşmemek ve bireysel donanımlarını bu doğrultuda dizayn etmektir. Çalışmada analitik yöntem uygulanmıştır. Konu ile ilgili literatür taraması yapılarak bilgiler tamamlanmış ve elde edilen veriler neticesinde etkin zaman yönetimi tekniklerinin yöneticiler açısından bir değerlendirilmesi yapılmıştır