Genotyping melanoma in Colombia

Introducción: El melanoma presenta una elevada heterogeneidad clonal que sigue un patrón geográfico. Con el adveni-miento de los inhibidores específicos del BRAF, se han realizado múltiples esfuerzos para explorar el genotipo de estas neo-plasias a nivel mundial, documentando las alteraciones puntuales V600E y V600K en cerca del 50% de los afectos nacidos en los Estados Unidos, Europa occidental y Australia. Pocos estudios han evaluado la presencia de alteraciones en el BRAF y en el KIT en población hispana, encontrando una frecuencia entre el 39 y 77%, y 0%, respectivamente.Materiales y métodos: Se exploró en 81 pacientes la presencia de mutaciones en el BRAF (V600E/V600K), NRAS (exones 1 y 2) y cKIT (exones 9 y 11) usando técnicas de secuenciación y RT-PCR (COBAS), previa confirmación de la histología y microdisección.Resultados: El promedio de edad fue de 53 años (DE ±14,5) y el 59% tenía más de 50 años al momento del diagnóstico; 47 casos (58%) eran mujeres y el resto hombres. Según el origen del melanoma, el 39,5% presentaba tumores originados en piel crónicamente expuesta a la luz solar, el 19,8% no fueron tipificables, el 19,8% tenía neoplasias lentiginosas acrales, el 7,4% tenía primarios de mucosas y el 1,2% tumores uveales. En general, la representación tumoral en el tejido embebido en parafina fue buena (80%), el sitio para la toma de la muestra fue en la gran mayoría la piel (42%), los ganglios (26%) y el pulmón (9,8%). En el 70% de los casos, el estado tumoral fue mayor que 3 y en el 30% fue imposible obtener la infor-mación concerniente a este ítem. La frecuencia de mutaciones en BRAF fue 24,7% (n = 20), para cKIT fue del 4,9% (n = 4) y para NRAS fue del 6,1% (n = 5). El 69,4% (36 casos evaluables) tuvo un KI67 mayor al 20%, hallazgo que fue mayor en los pacientes con lesiones originadas en piel crónicamente expuesta (p = 0,052) y entre los mutados del BRAF (p = 0,048).Conclusiones: El perfil mutacional de los pacientes colombianos con melanoma es diferente al descrito previamente en la literatura, en especial para BRAF. Estos hallazgos son concordantes con una mayor prevalencia de lesiones originadas en mu-cosas y del tipo lentiginoso acral.Introduction: Melanoma has high clonal heterogeneity which follows a geographical pattern. The advent of therapy involv-ing BRAF-specific inhibitors has enabled many efforts at exploring these neoplasias’ genotype around the world, document-ing V600E and V600K alterations in about 50% of affected patients born in the USA, Western Europe and Australia. Few studies have evaluated the presence of alterations in the BRAF and KIT in the Hispanic population, finding a frequency be-tween 39 and 77%, and 0%, respectively.Materials and methods: 81 patients were explored for BRAF (V600E/V600K), NRAS (exons 1 and 2) and cKIT (exons 9, 11, 13 and 17) mutations using sequencing and RT-PCR (COBAS) techniques, following confirmation of histology and micro-dissection.Results: The patients were aged 53 years old on average (SD±14,5) and 59% were older than 50 when diagnosed; 47 cases (58%) were female. When ascertaining the origin of the patients’ melanomas 39,5% of the tumours were found in skin which had been chronically exposed to sunlight, 19,8% could not be typed, 19,8% were acral-lentiginous melanomas, 7,4% were primary mucosal melanomas and 1,2% were uveal tumours. Tumour representation in paraffin-embedded tissue was good (80%), the site from which the sample was taken was usually the skin (42%), lymph nodes (26%) and the lungs (9.8%). Tumour stage was greater than 3 in 70% of the cases; however, information concerning this item could not be obtained for 30% of the patients. BRAF mutation frequency was 24,7% (n = 20), 4,9% (n = 4) for cKIT and 6,1% (n = 5) for NRAS. 69,4% (36 evaluable cases) had greater than 20% KI67; this finding was greater in patients suffering lesions in chronically-exposed skin (p = 0,052) and in those carrying a BRAF mutation (p = 0,048).Conclusions: The mutational profile of Colombian melanoma patients reported in this study differ with that described previ-ously, especially for BRAF; however, such findings did agree with greater prevalence of mucosal and acral-lentiginous lesions