Expression of cancer-associated genes in prostate tumors

Background: Prostate cancer is one of the most common male cancers in Western countries and takes the third place in morbidity in Ukraine. It is a highly heterogeneous disease. Aim: To analyze relative expression levels of the TGFB1, IL1B, FOS, EFNA5, TAGLN, PLAU, and EPDR1 genes in malignant and non-malignant prostate tissues. Materials and Methods: Total RNA was isolated from 16 prostate adenomas, 37 prostate adenocarcinomas, and 29 conventionally normal prostate tissues. To analyze relative gene expression levels the quantitative real-time polymerase chain reaction was performed. Results: The significant alterations in the relative expression levels were found in all analyzed sample groups for 4 genes: FOS, EFNA5, IL1B, and TGFB1. We have found that FOS and EFNA5 were more frequently overexpressed in carcinomas with Gleason score ≤ 7, compared with adenomas. On contrary, PLAU expression levels were decreased more frequently in prostate cancers, compared with conventionally normal tissues. Noteworthy, we found positive correlation between IL1B expression level and PSA (for patients with slight PSA increase, no more than 20.0 ng/ml). Conclusion: The EFNA5, FOS, IL1B, PLAU, and TGFB1 genes that showed significant expression alterations in prostate tumors, compared with conventionally normal prostate tissue, may play role in prostate cancer development and should be further investigated

Detection of prostate specific ETS fusion transcripts in cancer samples

Aim. To detect ETS fusion transcripts in Ukrainian population and to analyze a possible relationship between the ETS fusion transcripts and clinical characteristics of prostate cancer. Methods. Quantitative PCR (q-PCR) was used to analyze the expression of six fusion transcripts at the mRNA level. The amplified products were analyzed by gel electrophoresis and direct sequencing. We analyzed 37 fresh frozen samples of prostate cancer tissues, 37 paired conventionally normal prostate tissue samples and 20 samples of adenomas. Results. Six ETS fusion transcripts of TMPRSS2 with ERG, ETV1, ETV4, ETV5 were analyzed. Only one out of six fusion ETS transcripts was detected in a cohort of 37 Ukrainian patients with prostate adenocarcinoma. The frequency of detection of the TMPRSS2-ERG fusion transcript in prostate cancer tissues was 56.8 %. The TMPRSS2-ERG expression was also detected in 16 normal prostate tissue samples (43.2 %) and in 4 prostate adenoma samples (20 %). No correlation was found between the frequency of the TMPRSS2-ERG in carcinoma samples and clinical characteristics of the samples. However, an analysis of relative gene expression in all the investigated groups has shown the altered TMPRSS2-ERG expression in some groups with different Gleason scores of prostate adenocarcinoma compared to adenomas and normal tissue samples. The most elevatedTMPRSS2-ERG expression was found in the prostate adenocarcinoma group with the Gleason score > 7. Conclusions. We detected the TMPRSS2-ERG fusion transcript (EF194202.1) in prostate tumor samples as adenocarcinoma (the frequency was 56.8 %) with different Gleason score and some paired normal prostate tissues as adenoma samples in our group of Ukrainian population. The obtained results show that the TMPRSS2-ERG fusion transcript is present at early stages of cancer development. In the further studies we plan to test whether the TMPRSS2-ERG fusion transcript can be used as a diagnostic marker of prostate cancer development.Мета. Виявити типи злитих транскриптів в українській популяції та проаналізувати можливий зв›язок між наявніс-тю злитих транскриптів ETS та клінічними характеристиками раку передміхурової залози. Методи. Кількісний ПЛР (q-PCR) використовували для аналізу експресії 6 злитих транскриптів на рівні мРНК. Ампліфіковані продукти перевіряли за допомогою гель-електрофорезу та секвенуванням. Нами було проаналізовано 37 свіжо заморожених зразків тканин раку передміхурової залози, 37 парних до них умовно нормальних зразків тканини передміху-рової залози та 20 зразків аденоми. Результати. Нами було проаналізовано 6 злитих транскриптів ETS: злиття TMPRSS2 з ERG, ETV1, ETV4, ETV5. У вибірці із 37 пацієнтів з аденокарциномою передміхурової залози було виявлено лише один з шести злитих транскриптів. Частота детекції злитого транскрипту TMPRSS2-ERG в тканинах раку передміхурової залози становила 56,8 %. Експресія TMPRSS2-ERGтакож була виявлена у 16 зразках умовно нормальних тканин передміхурової залози (43,2 %) та у 4 зразках аденоми передміхурової залози (20 %). Не було виявлено кореляції між частотою TMPRSS2-ERG та клінічними характеристиками пухлин у зразках карцином. Проте аналіз відносної експресії генів у всіх досліджених групах показав змінену експресію TMPRSS2-ERG у деяких групах з різними показниками ступеня Глісона в зразках аденокарцином порівняно з аденомами та зразками умовно нормальних тканин. Найбільш висока експресія TMPRSS2-ERG була виявлена в групі аденокарцином передміхурової залози з оцінками ступеня Глісона > 7. Висновки. У нашій досліджуваній групі населення України нами було детектовано злитий транскрипт TMPRSS2-ERG (EF194202.1) у пухлинних зразках передміхурової зало-зи як аденокарцином (частота 56,8 %) з різним ступенем Глісона та парним до них умовно нормальних тканинах передміхурової залози, так і в зразках аденом. Отримані результати показують, що злитий транскрипт TMPRSS2-ERG присутній вже на ранніх стадіях розвитку ракового захворювання. У подальших дослідженнях ми плануємо перевірити, чи може злитий транскрипт TMPRSS2-ERG бути використаний як діагностичний маркер утворення злитих транскриптів та можливого розвиток раку передміхурової залози.Цель. Выявить типы слитых транскриптов в украинской популяции и проанализировать возможную связь между наличием слитых транскриптов ETS и клиническими характеристиками рака простаты. Методы. Количественный ПЦР (q-PCR) использовали для анализа экспрессии 6 слитых транскриптов на уровне мРНК. Амплифицированные продукты проверяли с помощью гель-электрофореза и секвенированием. Нами были проанализированы 37 свежо замороженных образцов тканей рака простаты, 37 парных к ним условно нормальных образцов ткани простаты и 20 образцов аденомы. Результаты. Нами были проанализированы 6 слитых транскриптов ETS: слияние TMPRSS2 с ERG, ETV1, ETV4, ETV5. В выборке из 37 пациентов с аденокарциномой простаты было выявлено лишь один из шести слитых транскриптов. Частота детекции слитного транскрипта TMPRSS2-ERG в тканях рака простаты составляла 56,8 %. Экспрессия TMPRSS2-ERG также была обнаружена в 16 образцах условно нормальных тканей простаты (43,2 %) и в 4 образцах аденомы простаты (20 %). Не было обнаружено корреляции между частотой TMPRSS2-ERG и клиническими характеристиками опухолей в образцах карцином. Однако анализ относительной экспрессии генов во всех исследованных группах показал измененную экспрессию TMPRSS2-ERG в некоторых группах с различными показателями степени Глисона в образцах аденокарцином по сравнению с аденомы и образцами условно нормальных тканей. Наиболее высокая экспрессия TMPRSS2-ERG была обнаружена в группе аденокарцином простаты по оценкам степени Глисона > 7. Выводы. В нашей исследуемой группе населения Украины нами было детектируемого слитый транскрипт TMPRSS2-ERG (EF194202.1) в опухолевых образцах простаты как аденокарцином (частота 56,8 %) с разной степенью Глисона и парным к ним условно нормальных тканях простаты, так и в образцах аденом. Полученные результаты показывают, что слитый транскрипт TMPRSS2-ERG присутствует уже на ранних стадиях развития ракового заболевания. В дальнейших исследованиях мы планируем проверить, может ли слитый транскрипт TMPRSS2-ERG быть использован как диагностический маркер образования слитых транскриптов и возможного развитие рака простаты

Причини інвалідності населення україни внаслідок захворювань сечостатевої системи та шляхи їх зменшення

The article represents the results of analysis of Ukrainian population disability due to diseases of urogenital system, which indicate improvement in urological care effectiveness during recent years, although the number of people who annually go on disability remains high. Such improvement is mainly caused by implementation of organ-sparing surgery into routine practice in patients with renal trauma, urinary tract abnormalities, hydronephrosis, initial stages of kidney cancer, urinary stone disease, etc., thus avoiding situations when functioning kidney is removed, which leads to disability level decrease.В статье представлены результаты анализа инвалидности населения Украины вследствие заболеваний мочеполовой системы, которые указывают на улучшение эффективности урологической помощи за последние годы, однако количество людей, которые ежегодно выходят на инвалидность, остается большим. Улучшить эти показатели можно благодаря внедрению в практику органосохраняющих операций при травматических повреждениях или аномалиях развития мочевыводящих путей, гидронефрозе, начальных стадиях рака почки, мочекаменной болезни и др., тем самым исключая ситуации, при которых может быть удалена функционирующая почка, что приведет к уменьшению инвалидизации населения и улучшения качества их жизни.У статті представлені результати аналізу інвалідності населення України внаслідок захворювань сечостатевої системи, які вказують на поліпшення ефективності урологічної допомоги за останні роки, однак кількість людей, які щорічно виходять на інвалідність, залишається великим. Поліпшити ці показники можна завдяки впровадженню в практику органозберігаючих операцій при травматичних ушкодженнях або аномаліях розвитку сечовивідних шляхів, гідронефрозі, початкових стадіях раку нирки, сечокам'яної хвороби та ін., Тим самим виключаючи ситуації, при яких може бути видалена функціонуюча нирка, що призведе до зменшення інвалідизації населення і поліпшення якості їхнього життя

Мультифакторний аналіз параметрів, що впливають на вибір методу оперативного лікування хворих на локалізований нирково-клітинний рак (НКР)

Objective. To increase the effectiveness of treatment the patients with localized RCC on the basis of determining the main clinical and nephrometric criteria that affect the choice of surgical treatment. Маterials and methods. Results of a retrospective analysis of treatment of 903 patients with localized RCC (T1–T2 N0 M0), which evaluated nephrometric, clinical parameters. Patients are divided into two groups depending on the type of treatment: the group of partial nephrectomy (PN) – 658 patients, the group of radical nephrectomy (RN) – 245. Results. A multivariate analysis of the main clinical, anatomical and nephrometrical criterias by the method of the neural network prediction model found that the most valid indicators affecting the choice of indications for PN or RN was: tumor size, localtion, the volume of functioning renal parenchyma. Nomograms and an electronic calculator developed on this basis make it possible to accurately predict the choice of surgical treatment method for patients (sensitivity 85,5% (95% CI 81,3–89,0%) and specificity 85.5% (95% CI 82,3–88,3%)). Conclusion. In case of polar and lateral location of RCC, the indication for PN was the volume of functioning renal parenchyma of more than 58% and 67%, respectively. In case of hilar location of RCC, the main indication for PN was the tumor size of less than 38 mm.Цель. Повысить эффективность лечения больных локализированным ПКР на основе определения основных клинических и нефрометрических критериев, влияющих на выбор тактики оперативного лечения. Материалы и методы исследования. Ретроспективный анализ результатов лечения 903 больных локализированным ПКР (T1–T2 N0 M0), которым проведена оценка нефрометрических, клинических параметров. Пациенты разделены на две группы в зависимости от вида проводимого лечения: группа резекции почки (РП) – 658 больных, группа нефрэктомии (НЭ) – 245. Результаты. Проведенный мультифакторный анализ основных клинических и анатомо-топографических критериев методом нейросетевой модели прогнозирования установил, что наиболее валидными показателями, влияющими на выбор показаний к РП или НЭ, является локализация опухоли, объем функционирующей паренхимы почки и размеры ПКР. Разработанные на этой основе номограммы и электронный калькулятор позволяют максимально точно спрогнозировать выбор метода оперативного лечения у больных (чувствительность 85,5% (95% СI 81,3–89,0%) и специфичность 85,5% (95% CI 82,3–88,3%)). Выводы. При полярном и латеральном расположении ПКР показанием к проведению РП является объем функционирующей паренхимы почки более 58% и 67% соответственно. При медиальном расположении ПКР основным показанием к проведению РП является размер опухоли менее 38 мм.Мета. Підвищити ефективність лікування хворих на локалізований НКР на основі визначення основних клінічних та нефрометричних критеріїв, що впливають на вибір тактики оперативного лікування. Матеріали і методи дослідження. Ретроспективний аналіз результатів лікування 903 хворих на локалізований НКР (T1–T2 N0 M0), яким проведено оцінку нефрометричних і клінічних паратерів. Пацієнти розподілені на дві групи залежно від виду проведеного лікування: група резекції нирки (РН) – 658 хворих, група нефректомії (НЕ) – 245. Результати. Проведений мультифакторний аналіз основних клінічних та анатомо-топографічних критеріїв методом нейромережевої моделі прогнозування встановив, що найбільш валідними показниками, впливаючими на вибір показань до РН або НЕ є локалізація пухлини, об’єм функціонуючої паренхіми нирки та розміри НКР. Розроблені на цій основі номограми та електронний калькулятор дозволяють максимально точно спрогнозувати вибір методу оперативного лікування у хворих (чутливість 85,5% (95% ВІ 81,3–89,0%) та специфічність 85,5% (95% ВІ 82,3–88,3%)). Висновки. При полярному та латеральному розташуванні НКР показанням до проведення РН є об’єм функціонуючої паренхіми нирки більше 58 та 67% відповідно. При медіальному розташуванні НКР основним показанням до проведення РН є розмір пухлини менше 38 мм

Detection of prostate specific ETS fusion transcripts in cancer samples

Aim. To detect ETS fusion transcripts in Ukrainian population and to analyze a possible relationship between the ETS fusion transcripts and clinical characteristics of prostate cancer. Methods. Quantitative PCR (q-PCR) was used to analyze the expression of six fusion transcripts at the mRNA level. The amplified products were analyzed by gel electrophoresis and direct sequencing. We analyzed 37 fresh frozen samples of prostate cancer tissues, 37 paired conventionally normal prostate tissue samples and 20 samples of adenomas. Results. Six ETS fusion transcripts of TMPRSS2 with ERG, ETV1, ETV4, ETV5 were analyzed. Only one out of six fusion ETS transcripts was detected in a cohort of 37 Ukrainian patients with prostate adenocarcinoma. The frequency of detection of the TMPRSS2-ERG fusion transcript in prostate cancer tissues was 56.8 %. The TMPRSS2-ERG expression was also detected in 16 normal prostate tissue samples (43.2 %) and in 4 prostate adenoma samples (20 %). No correlation was found between the frequency of the TMPRSS2-ERG in carcinoma samples and clinical characteristics of the samples. However, an analysis of relative gene expression in all the investigated groups has shown the altered TMPRSS2-ERG expression in some groups with different Gleason scores of prostate adenocarcinoma compared to adenomas and normal tissue samples. The most elevatedTMPRSS2-ERG expression was found in the prostate adenocarcinoma group with the Gleason score > 7. Conclusions. We detected the TMPRSS2-ERG fusion transcript (EF194202.1) in prostate tumor samples as adenocarcinoma (the frequency was 56.8 %) with different Gleason score and some paired normal prostate tissues as adenoma samples in our group of Ukrainian population. The obtained results show that the TMPRSS2-ERG fusion transcript is present at early stages of cancer development. In the further studies we plan to test whether the TMPRSS2-ERG fusion transcript can be used as a diagnostic marker of prostate cancer development.Мета. Виявити типи злитих транскриптів в українській популяції та проаналізувати можливий зв›язок між наявніс-тю злитих транскриптів ETS та клінічними характеристиками раку передміхурової залози. Методи. Кількісний ПЛР (q-PCR) використовували для аналізу експресії 6 злитих транскриптів на рівні мРНК. Ампліфіковані продукти перевіряли за допомогою гель-електрофорезу та секвенуванням. Нами було проаналізовано 37 свіжо заморожених зразків тканин раку передміхурової залози, 37 парних до них умовно нормальних зразків тканини передміху-рової залози та 20 зразків аденоми. Результати. Нами було проаналізовано 6 злитих транскриптів ETS: злиття TMPRSS2 з ERG, ETV1, ETV4, ETV5. У вибірці із 37 пацієнтів з аденокарциномою передміхурової залози було виявлено лише один з шести злитих транскриптів. Частота детекції злитого транскрипту TMPRSS2-ERG в тканинах раку передміхурової залози становила 56,8 %. Експресія TMPRSS2-ERGтакож була виявлена у 16 зразках умовно нормальних тканин передміхурової залози (43,2 %) та у 4 зразках аденоми передміхурової залози (20 %). Не було виявлено кореляції між частотою TMPRSS2-ERG та клінічними характеристиками пухлин у зразках карцином. Проте аналіз відносної експресії генів у всіх досліджених групах показав змінену експресію TMPRSS2-ERG у деяких групах з різними показниками ступеня Глісона в зразках аденокарцином порівняно з аденомами та зразками умовно нормальних тканин. Найбільш висока експресія TMPRSS2-ERG була виявлена в групі аденокарцином передміхурової залози з оцінками ступеня Глісона > 7. Висновки. У нашій досліджуваній групі населення України нами було детектовано злитий транскрипт TMPRSS2-ERG (EF194202.1) у пухлинних зразках передміхурової зало-зи як аденокарцином (частота 56,8 %) з різним ступенем Глісона та парним до них умовно нормальних тканинах передміхурової залози, так і в зразках аденом. Отримані результати показують, що злитий транскрипт TMPRSS2-ERG присутній вже на ранніх стадіях розвитку ракового захворювання. У подальших дослідженнях ми плануємо перевірити, чи може злитий транскрипт TMPRSS2-ERG бути використаний як діагностичний маркер утворення злитих транскриптів та можливого розвиток раку передміхурової залози.Цель. Выявить типы слитых транскриптов в украинской популяции и проанализировать возможную связь между наличием слитых транскриптов ETS и клиническими характеристиками рака простаты. Методы. Количественный ПЦР (q-PCR) использовали для анализа экспрессии 6 слитых транскриптов на уровне мРНК. Амплифицированные продукты проверяли с помощью гель-электрофореза и секвенированием. Нами были проанализированы 37 свежо замороженных образцов тканей рака простаты, 37 парных к ним условно нормальных образцов ткани простаты и 20 образцов аденомы. Результаты. Нами были проанализированы 6 слитых транскриптов ETS: слияние TMPRSS2 с ERG, ETV1, ETV4, ETV5. В выборке из 37 пациентов с аденокарциномой простаты было выявлено лишь один из шести слитых транскриптов. Частота детекции слитного транскрипта TMPRSS2-ERG в тканях рака простаты составляла 56,8 %. Экспрессия TMPRSS2-ERG также была обнаружена в 16 образцах условно нормальных тканей простаты (43,2 %) и в 4 образцах аденомы простаты (20 %). Не было обнаружено корреляции между частотой TMPRSS2-ERG и клиническими характеристиками опухолей в образцах карцином. Однако анализ относительной экспрессии генов во всех исследованных группах показал измененную экспрессию TMPRSS2-ERG в некоторых группах с различными показателями степени Глисона в образцах аденокарцином по сравнению с аденомы и образцами условно нормальных тканей. Наиболее высокая экспрессия TMPRSS2-ERG была обнаружена в группе аденокарцином простаты по оценкам степени Глисона > 7. Выводы. В нашей исследуемой группе населения Украины нами было детектируемого слитый транскрипт TMPRSS2-ERG (EF194202.1) в опухолевых образцах простаты как аденокарцином (частота 56,8 %) с разной степенью Глисона и парным к ним условно нормальных тканях простаты, так и в образцах аденом. Полученные результаты показывают, что слитый транскрипт TMPRSS2-ERG присутствует уже на ранних стадиях развития ракового заболевания. В дальнейших исследованиях мы планируем проверить, может ли слитый транскрипт TMPRSS2-ERG быть использован как диагностический маркер образования слитых транскриптов и возможного развитие рака простаты

EXPRESSION OF CANCER-ASSOCIATED GENES IN PROSTATE TUMORS

Background: Prostate cancer is one of the most common male cancers in Western countries and takes the third place in morbidity in Ukraine. It is a highly heterogeneous disease. Aim: To analyze relative expression levels of the TGFB1, IL1B, FOS, EFNA5, TAGLN, PLAU, and EPDR1 genes in malignant and non-malignant prostate tissues. Materials and Methods: Total RNA was isolated from 16 prostate adenomas, 37 prostate adenocarcinomas, and 29 conventionally normal prostate tissues. To analyze relative gene expression levels the quantitative real-time polymerase chain reaction was performed. Results: The significant alterations in the relative expression levels were found in all analyzed sample groups for 4 genes: FOS, EFNA5, IL1B, and TGFB1. We have found that FOS and EFNA5 were more frequently overexpressed in carcinomas with Gleason score ≤ 7, compared with adenomas. On contrary, PLAU expression levels were decreased more frequently in prostate cancers, compared with conventionally normal tissues. Noteworthy, we found positive correlation between IL1B expression level and PSA (for patients with slight PSA increase, no more than 20.0 ng/ml). Conclusion: The EFNA5, FOS, IL1B, PLAU, and TGFB1 genes that showed significant expression alterations in prostate tumors, compared with conventionally normal prostate tissue, may play role in prostate cancer development and should be further investigated