10 research outputs found

    Potential limitations of the "Sleeping Beauty" transposon use in gene expression studies

    Get PDF

    Regulation of MCPIP3 protein expression

    No full text
    Białko MCPIP3 należy do rodziny białek MCPIP, posiadającej charakterystyczny motyw palca cynkowego CCCH. Białka te zaangażowane są przede wszystkim w utrzymanie homeostazy układu odpornościowego. Najlepiej scharakteryzowane jest białko MCPIP1, które między innymi dzięki swojej aktywności rybonukleazowej negatywnie reguluje stabilność transkryptów wielu cząsteczek zaangażowanych w odpowiedź immunologiczną. Na temat biologicznych funkcji MCPIP3 wiadomo stosunkowo niewiele, potwierdzono jednak jego udział w regulacji stanu zapalnego naczyń krwionośnych. W niniejszej pracy badano regulację ekspresji białka MCPIP3. W tym celu utworzono konstrukt, w którym 3'UTR Zc3h12c wklonowano do wektora pmirGLO. Badania prowadzono na linii komórkowej U373, którą wybrano doświadczalnie. Wykazano iż stymulacja komórek czynnikami prozapalnymi takimi jak IL-1β, LPS oraz PMA prowadzi do wzrostu ekspresji Zc3h12c. Stabilność mRNA MCPIP3 regulowana jest potranskrypcyjnie przez MCPIP1 oraz TTP. Dowiedziono również, że MCPIP3 wpływa destabilizująco na własny transkrypt. Wykorzystując analizę bioinformatyczną zidentyfikowano w obrębie 3'UTR MCPIP3 sekwencję ARE potencjalnie odpowiedzialną za wiązanie białka TTP. Wprowadzając delecję tego regionu za pomocą mutagenezy ukierunkowanej wykluczono jednak jej udział w destabilizacji transkryptu MCPIP3. Precyzyjna lokalizacja właściwej sekwencji ARE wymaga dalszych eksperymentów.MCPIP3 is a member of MCPIP protein family containing a CCCH-type zinc finger motif. These proteins are involved in maintaining homeostasis of the immune system. MCPIP1 is the best characterized member of this family, which due to its ribonuclease activity negatively regulates stability of many molecules' transcripts involved in the immune response. Biological functions of MCPIP3 are less known, however its contribution to the regulation of vascular inflammation has been confirmed. To investigate the regulation of expression of MCPIP3 genetic construct was created by inserting MCPIP3 3'UTR into pmirGLO vector. Experiments were performed on U373 cell line, which was selected experimentally. It was demonstrated that the stimulation of cells with proinflammatory molecules, such as IL-1β, LPS and PMA leads to the elevated expression of Zc3h12c. MCPIP3 mRNA stability is regulated post-transcriptionally by MCPIP1 and TTP. It was also proved that MCPIP3 destabilizes its own transcript. Using bioinformatics analysis, the ARE sequence was identified within the MCPIP3's 3'UTR, which could be responsible for the TTP binding. Contribution of selected ARE sequence to the destabilization of MCPIP transcript was excluded by introducing a deletion of this region. Precise identification of the correct ARE sequence requires further experiments

    Identification of the length of MCPIP3 mRNA 3'UTR

    No full text
    MCPIP3 jest białkiem z rodziny MCPIP (ang. monocyte chemoattractant protein-induced protein), do której należą także białka MCPIP1, MCPIP2 oraz MCPIP4. MCPIP3 jest stosunkowo słabo zbadanym białkiem. Transkrypt dla białka MCPIP3 charakteryzuje się wyjątkowo długim regionem 3'UTR, który znacznie przewyższa długością region kodujący. Celem niniejszej pracy była identyfikacja długości 3'UTR transkryptu dla białka MCPIP3 z wykorzystaniem metody PCR. Uzyskane wyniki potwierdzają, że region ten rzeczywiście posiada wyjątkową długość (6104 pz). Ma to znaczenie dla dalszych badań nad rodziną białek MCPIP, a w szczególności dla badań nad stabilnością transkryptów dla białek z tej rodziny.MCPIP3 belongs to MCPIP (monocyte chemoattractant protein-induced protein) protein family, which contains also three other members: MCPIP1, MCPIP2 and MCPIP4. MCPIP3 is poorly investigated protein. MCPIP3 mRNA has very long 3'UTR, much longer than coding region. In the present study lenght of 3'UTR of MCPIP3 mRNA was analyzed using PCR technique. Achieved results confirmed, that 3'UTR region has unusuall lenght (6104 bp). Those results are important for further study on MCPIP protein family, especially concerning stability of transcripts of proteins from this family

    Dynamics of the Third Wave of COVID-19 from the Perspective of the Emergency Department in a Large Regional Hospital—Single Center Observational Study

    No full text
    Background: The outbreak of the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic has caused many significant social and economic changes. The consecutive waves of the epidemic in various countries have had dissimilar courses depending on the methods used to combat it. The aim of this study was to determine the dynamics of the third wave of COVID-19 from the perspective of emergency departments (ED). Methods: This was a retrospective review of medical records from ED. The authors have identified the most frequent symptoms. Prognostic factors have been chosen—prognostic scales, length of stay (LOS)—and a number of resources required have been calculated. Results: As the time passed, there were fewer patients and they presented mild symptoms. A statistically significant difference was observed in the median of blood oxygenation measurement (p = 0.00009), CRP level (p = 0.0016), and admission rate. Patients admitted to the hospital required more resources at ED. LOS was shorter in patients discharged home (p < 0.0001). Conclusions: The blood oxygen saturation (SPO2) and CPR levels can be helpful in decision-making regarding medical treatment. The fast-track for patients in good clinical condition may shorten the duration of stay in ED, and reduce the number of required resources

    Molecular mechanisms of ZC3H12C/Reg-3 biological activity and its involvement in Psoriasis pathology

    No full text
    The members of the ZC3H12/MCPIP/Regnase family of RNases have emerged as important regulators of inflammation. In contrast to Regnase-1, -2 and -4, a thorough characterization of Regnase-3 (Reg-3) has not yet been explored. Here we demonstrate that Reg-3 differs from other family members in terms of NYN/PIN domain features, cellular localization pattern and substrate specificity. Together with Reg-1, the most comprehensively characterized family member, Reg-3 shared IL-6, IER-3 and Reg-1 mRNAs, but not IL-1 beta mRNA, as substrates. In addition, Reg-3 was found to be the only family member which regulates transcript levels of TNF, a cytokine implicated in chronic inflammatory diseases including psoriasis. Previous meta-analysis of genome-wide association studies revealed Reg-3 to be among new psoriasis susceptibility loci. Here we demonstrate that Reg-3 transcript levels are increased in psoriasis patient skin tissue and in an experimental model of psoriasis, supporting the immunomodulatory role of Reg-3 in psoriasis, possibly through degradation of mRNA for TNF and other factors such as Reg-1. On the other hand, Reg-1 was found to destabilize Reg-3 transcripts, suggesting reciprocal regulation between Reg-3 and Reg-1 in the skin. We found that either Reg-1 or Reg-3 were expressed in human keratinocytes in vitro. However, in contrast to robustly upregulated Reg-1 mRNA levels, Reg-3 expression was not affected in the epidermis of psoriasis patients. Taken together, these data suggest that epidermal levels of Reg-3 are negatively regulated by Reg-1 in psoriasis, and that Reg-1 and Reg-3 are both involved in psoriasis pathophysiology through controlling, at least in part different transcripts

    How to learn a foreign language? : 45 experts reveal the secrets of effective language learning

    No full text
    Poradnik "Jak nauczyć się języka obcego" jest dostępny dla wszystkich, za darmo i bez ograniczeń. To projekt 100% non profit, edukacyjny, stworzony z myślą o osobach uczących się języka obcego. Poniżej prezentujemy najciekawsze porady od osób, zajmujących się hobbystycznie i profesjonalnie językami obcymi i świetnie im to wychodzi! Poznajcie rady pasjonatów językowych i autorów najciekawszych stron o językach obcych! Wiele "tajemnych" porad i odpowiedzi na pytania dotyczące nauki języków obcych takich jak: Jak szybko nauczyć się języka obcego i czy to w ogóle możliwe? ; Ciekawe sposoby na naukę słownictwa, poprawę czytania/pisania/słuchania ; Jakie są najbardziej efektywne metody & techniki & sposoby nauki języka obcego? ; Polecane strony www / blogi & aplikacje mobilne & metody online i inne interaktywne formy nauki ; Książki & magazyny & wydawnictwa & YouTube/ TV / radio, które warto poznać aby opanować łatwiej język obcy ; Najważniejsze języki obce w 2015 r. - newsy z rynku pracy / edukacji w EU ; Jak zmotywować się do nauki języka

    Jak nauczyć się języka obcego?

    No full text
    <p>Jak szybko nauczyć się języka obcego?; sposóby na naukę słownictwa; poprawę czytania/pisania/słuchania; Jakie są najbardziej efektywne metody & techniki & sposoby nauki języka obcego?; strony www / blogi & aplikacje mobilne; & metody online i inne interaktywne formy nauki języków; Książki & magazyny & wydawnictwa / TV / radio; które warto poznać aby opanować łatwiej język obcy; Jak zmotywować się do nauki języka?</p
    corecore