Fungal diversity notes 1512-1610: taxonomic and phylogenetic contributions on genera and species of fungal taxa

This article is the 14th in the Fungal Diversity Notes series, wherein we report 98 taxa distributed in two phyla, seven classes, 26 orders and 50 families which are described and illustrated. Taxa in this study were collected from Australia, Brazil, Burkina Faso, Chile, China, Cyprus, Egypt, France, French Guiana, India, Indonesia, Italy, Laos, Mexico, Russia, Sri Lanka, Thailand, and Vietnam. There are 59 new taxa, 39 new hosts and new geographical distributions with one new combination. The 59 new species comprise Angustimassarina kunmingense, Asterina lopi, Asterina brigadeirensis, Bartalinia bidenticola, Bartalinia caryotae, Buellia pruinocalcarea, Coltricia insularis, Colletotrichum flexuosum, Colletotrichum thasutense, Coniochaeta caraganae, Coniothyrium yuccicola, Dematipyriforma aquatic, Dematipyriforma globispora, Dematipyriforma nilotica, Distoseptispora bambusicola, Fulvifomes jawadhuvensis, Fulvifomes malaiyanurensis, Fulvifomes thiruvannamalaiensis, Fusarium purpurea, Gerronema atrovirens, Gerronema flavum, Gerronema keralense, Gerronema kuruvense, Grammothele taiwanensis, Hongkongmyces changchunensis, Hypoxylon inaequale, Kirschsteiniothelia acutisporum, Kirschsteiniothelia crustaceum, Kirschsteiniothelia extensum, Kirschsteiniothelia septemseptatum, Kirschsteiniothelia spatiosum, Lecanora immersocalcarea, Lepiota subthailandica, Lindgomyces guizhouensis, Marthe asmius pallidoaurantiacus, Marasmius tangerinus, Neovaginatispora mangiferae, Pararamichloridium aquisubtropicum, Pestalotiopsis piraubensis, Phacidium chinaum, Phaeoisaria goiasensis, Phaeoseptum thailandicum, Pleurothecium aquisubtropicum, Pseudocercospora vernoniae, Pyrenophora verruculosa, Rhachomyces cruralis, Rhachomyces hyperommae, Rhachomyces magrinii, Rhachomyces platyprosophi, Rhizomarasmius cunninghamietorum, Skeletocutis cangshanensis, Skeletocutis subchrysella, Sporisorium anadelphiae-leptocomae, Tetraploa dashaoensis, Tomentella exiguelata, Tomentella fuscoaraneosa, Tricholomopsis lechatii, Vaginatispora flavispora and Wetmoreana blastidiocalcarea. The new combination is Torula sundara. The 39 new records on hosts and geographical distribution comprise Apiospora guiyangensis, Aplosporella artocarpi, Ascochyta medicaginicola, Astrocystis bambusicola, Athelia rolfsii, Bambusicola bambusae, Bipolaris luttrellii, Botryosphaeria dothidea, Chlorophyllum squamulosum, Colletotrichum aeschynomenes, Colletotrichum pandanicola, Coprinopsis cinerea, Corylicola italica, Curvularia alcornii, Curvularia senegalensis, Diaporthe foeniculina, Diaporthe longicolla, Diaporthe phaseolorum, Diatrypella quercina, Fusarium brachygibbosum, Helicoma aquaticum, Lepiota metulispora, Lepiota pongduadensis, Lepiota subvenenata, Melanconiella meridionalis, Monotosporella erecta, Nodulosphaeria digitalis, Palmiascoma gregariascomum, Periconia byssoides, Periconia cortaderiae, Pleopunctum ellipsoideum, Psilocybe keralensis, Scedosporium apiospermum, Scedosporium dehoogii, Scedosporium marina, Spegazzinia deightonii, Torula fici, Wiesneriomyces laurinus and Xylaria venosula. All these taxa are supported by morphological and multigene phylogenetic analyses. This article allows the researchers to publish fungal collections which are important for future studies. An updated, accurate and timely report of fungus-host and fungus-geography is important. We also provide an updated list of fungal taxa published in the previous fungal diversity notes. In this list, erroneous taxa and synonyms are marked and corrected accordingly

Pervasive gaps in Amazonian ecological research

Biodiversity loss is one of the main challenges of our time, and attempts to address it require a clear understanding of how ecological communities respond to environmental change across time and space. While the increasing availability of global databases on ecological communities has advanced our knowledge of biodiversity sensitivity to environmental changes, vast areas of the tropics remain understudied. In the American tropics, Amazonia stands out as the world's most diverse rainforest and the primary source of Neotropical biodiversity, but it remains among the least known forests in America and is often underrepresented in biodiversity databases. To worsen this situation, human-induced modifications may eliminate pieces of the Amazon's biodiversity puzzle before we can use them to understand how ecological communities are responding. To increase generalization and applicability of biodiversity knowledge, it is thus crucial to reduce biases in ecological research, particularly in regions projected to face the most pronounced environmental changes. We integrate ecological community metadata of 7,694 sampling sites for multiple organism groups in a machine learning model framework to map the research probability across the Brazilian Amazonia, while identifying the region's vulnerability to environmental change. 15%–18% of the most neglected areas in ecological research are expected to experience severe climate or land use changes by 2050. This means that unless we take immediate action, we will not be able to establish their current status, much less monitor how it is changing and what is being lost

Micobactérias diagnosticadas em gatos domésticos no sertão da Paraíba

RESUMO: Descrevem-se dois casos de infecção por Mycobacterium sp. em gatos domésticos no sertão da Paraíba, Nordeste do Brasil. Os animais apresentavam emagrecimento progressivo, dispneia, tosse e linfadenomegalia generalizada em um dos casos, com evolução clínica de um e sete meses, respectivamente. Macroscopicamente as lesões estavam restritas aos linfonodos superficiais e/ou profundos e parênquima pulmonar, caracterizadas por nódulos multifocais ou multifocais a coalescentes, amarelados, irregulares que ao corte apresentavam áreas multifocais a coalescentes amareladas, friáveis e caseosa, além de áreas multifocais brancacentas e firmes. Histologicamente, verificou-se linfadenite e pneumonia granulomatosa caracterizada por áreas centrais de necrose e mineralização central circundadas por macrófagos, células epiteliais e tecido conjuntivo fibroso. No primeiro caso havia ainda hepatite granulomatosa discreta e aleatória. Em ambos os casos, foram visualizados bacilos álcool-ácido resistentes livres e no citoplasma de macrófagos na coloração de Ziehl-Neelsen. Houve imunomarcação para Mycobacterium sp. no citoplasma de macrófagos em ambos os casos. Na PCR, identificou-se apenas o gênero Mycobacterium no Caso 1 e Mycobacterium bovis no Caso 2. O diagnóstico de infecção por Mycobacterium sp. nos felinos foi realizado com base nos achados anatomopatológicos e imuno-histoquímica. Pela PCR foi realizado o diagnóstico etiológico de micobacteriose no Caso 1 e tuberculose por M. bovis no Caso 2. O diagnóstico das doenças causadas por micobactérias em felinos, principalmente aquelas em que M. bovis esteja envolvido, é de extrema importância para a saúde pública, destacando o potencial zoonótico desta espécie, pois muitos animais infectados podem ser assintomáticos ou apresentarem sinais clínicos inespecíficos

Características epidemiológicas, clínico-patológicas e morfotintoriais de quatorze casos de nocardiose em cães

RESUMO: Este artigo descreve os aspectos epidemiológicos, clínicos, patológicos e características morfotintoriais em quatorze casos de nocardiose em cães. Para isso foi realizado um estudo retrospectivo durante o período de janeiro de 2005 a dezembro de 2015 e selecionados os casos sugestivos de nocardiose. A identificação e caracterização do agente foi realizada através de técnicas histoquímicas especiais de Metenamina nitrato de prata de Grocott (GMS), Ziehl-Neelsen modificado, coloração de Gram do tipo Brown-Brenn modificado e Giemsa. Foram afetados predominantemente filhotes e em doze casos havia associação com o vírus da cinomose canina (VCC). Os sinais clínicos variaram de alterações respiratórias, neurológicas e cutâneas, relacionadas principalmente à infecção concomitante pelo VCC. Macroscopicamente haviam áreas multifocais a coalescentes, branco-amareladas, firmes, elevadas na superfície e que se aprofundavam ao corte, por vezes com material purulento, entremeadas por áreas avermelhadas irregulares afetando principalmente pulmões, linfonodos, fígado, rins e encéfalo. As lesões cutâneas foram observadas predominantemente nas regiões cervical e inguinal e variaram de supurativas a piogranulomatosas. No exame histopatológico a lesão era caracterizada principalmente por inflamação piogranulomatosa, porém em algumas áreas havia predomínio de inflamação necrossupurativa, e frequentemente eram observados macrófagos epitelioides, formando aglomerados de forma radiada, muitas vezes lembrando pseudorosetas. Nas técnicas histoquímicas foram observadas estruturas filamentosas, ramificadas, não septadas, medindo aproximadamente 1µm de espessura, impregnadas na coloração de prata, coradas em vermelho no Ziehl-Neelsen modificado, em azul na coloração de Gram do tipo Brown-Brenn modificado e fracamente rósea pálido no Giemsa. A nocardiose deve ser considerada em animais jovens que apresentam sinais respiratórios e neurológicos progressivos, bem como em lesões cutâneas com envolvimento do subcutâneo e linfonodos regionais. Deve ser investigado ainda um provável fator predisponente, como a infecção pelo vírus da cinomose canina e hemoparasitoses. O diagnóstico foi estabelecido através do exame histopatológico baseando-se na morfologia da bactéria e suas características histoquímicas, distinguindo principalmente de outros agentes bacterianos e fúngicos, constituindo uma importante ferramenta para o diagnóstico, quando não é possível a coleta do material para cultivo e isolamento do agente