ETIOLOGIJA I ANTIBIOTSKA OSJETLJVOST UZROČNIKA INFEKCIJA MOKRAĆNOG SUSTAVA U BOLESNIKA STARIJE ŽIVOTNE DOBI LIJEČENIH TIJEKOM 2018. GODINE U KLINICI ZA INFEKTOLOGIJU KLINIČKOG BOLNIČKOG CENTRA SPLIT.

Objectives: To investigate the most common etiology of bacteria causing urinary tract infection (UTI) and their antibiotic sensitivity in older patients aged 65 years or above. Materials and methods: From January 2018 until December 2018, 107 patients aged 65 years and above were treated for urinary tract infections at the Clinic of Infectology of the University Hospital in Split. We included patients with the diagnosis acute cystitis, prostatocystitis, acute cystopyelitis, acute pyelonephritis and urosepsis, which were diagnosed on the basis of clinical evaluation and laboratory diagnostics. The study was conducted as an observational retrospective study. Medical data were retrieved by reviewing the history of medical records stored in the archive of the Clinic of Infectology, University Hospital in Split. Results: The largest number of patients (26,2%) were found in the age group 80 years and above. Urosepsis with 37,4% and pyelonephritis actua with 36,4% were the most frequent encountered diagnosis of patients with urinary tract infections treated in the Infectology department in 2018. E.coli (50,5%) was the most common isolated bacteria causing UTIs, in second place was Proteus mirabilis (15%), followed by Pseudomonas aeruginosa (11,2%), Klebsiella pneumonia (9,4%). E.coli resistance to ampicillin was the highest with 51,9%, followed by fluoroquinolones with 27,8%. High sensitivity to carbapenems with no isolated organsim resistant to it and to nitrofurantoin with 94,1% sensitivity was established. Almost all isolated bacteria in our study were showing sensitivity rates of over 80% to carbapenems. Conclusions: The most common isolated pathogen causing urinary tract infection in older patients visiting the Clinic of Infectology in 2018 was E.coli with 50,5%. Sensitivity of E.coli was 100% to carbapenems, 94,1% to nitrofurantoin, and above 75% for amoxicillin-clavulanic acid, all 4 generations of cephalosporins and aminoglycosides. 27,8% resistance rate to fluoroquinolones preclude their use as first line agents for pyelonephritis, until antibiotic sensitivity has not been established. Nitrofurantoin represents an appropriate first-line agent to treat cystitis in our patient sample and carbapenems, 4th generation cephalosporins or amoxicillin-clavulanic acid should be considered as first-line agents for pyelonephritisNaslov: Etiologija i antibiotska osjetljvost uzročnika infekcija mokraćnog sustava u bolesnika starije životne dobi liječenih tijekom 2018. godine u Klinici za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split. Ciljevi: Istražiti najčešće bakterijske uzroničnike infekcija mokraćnog sustava i njihovu osjetljivost na antibiotike u starih bolesnika životne dobi od 65 i više godina. Materijali i metode: Od siječnja do prosinca 2018.godine na Klinici za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split liječeno je 107 bolesnika u dobi od 65 i više godina zbog infekcije mokraćnog sustava (IMS). U istraživanje su uključeni bolesnici s dijagnozom akutnog cistitisa, akutnog pijelonefritisa i urospese. Dijagnoza se temeljila na kliničkoj evaluaciji i laboratorijskog dijagnostici. Istraživanje je provedeno kao opservacijska retrospektivna studija. Medicinski podaci dobiveni su pregledom povijesti bolesti pohranjenih u arhivi Klinike za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split Rezultati: Najveći broj bolesnika (26,2%) bio je dobnoj skupini od 80 i više godina. U 2018. godini zbog IMS liječeno je nešto više ženskih (54,2%) nego muških bolesnika (45,8%) u dobi do 65 i više godina. Urosepsa sa 37,4% i akutni pijelonefritis sa 36,7% bile su najčešće dijagnoze. Najčeše izoliran uzročnik IMS bila je E.coli (50,5%), na drugom mjestu je bio Proteus mirabilis (15%), a potom Pseudomonas aeruginosa (11,2%) i Klebsiella pneumonia (9,4%). E.coli bila je najčešće rezistentna na ampicilin sa 51,9%, a potom na fluorokinolone sa 27,8%. Utvrđena je visoka osjetljivost E.coli na karbapeneme, bez ijednog rezistentnog izolata, te na nitrofurantoin na koji je bilo osjetljivo 94,1% izolata. Gotovo sve druge izolirane bakterije pokazale su osjetljivost na karbapeneme od preko 80%. Zaključci: Sa 50,5% E.coli bila je najčešće izolirani uzročnik IMS u starijih bolesnika koji su 2018. godine liječeni na Klinici za infektologiju. Slijedili su je P.mirabilis sa 15% na drugom i P.aeruginosa sa 11,2% na trećem mjestu. Osjetljivost E.coli na karbapeneme bila je 100%, na nitrofurantoin 94,1%, te preko 75% na amoksicilin-klavulanat, na sve 4 generacije cefalosporina i na aminoglikozide. Rezistenija E.coli na flurokinolone od 27,8% isključuje ih kao antibiotike prvog izbora za pijelonefritis dok se ne utvrdi osjetljivost uzročnika na antibiotike. Srećom nitrofurantoin je odgovarajući lijek prvog izbora za liječenje cistitisa i u naših bolesnika.Pijelonefritis i urosepsa, infekcije koje su bile češće u našoj bolnici, trebalo bi empirijski liječiti amoksicilin-klavulanatom, trećom ili četvrtom generacijom cefalosporina, ili u težoj prezentaciji bolesti karbapenemima kao poduzanim lijekvima prije nego se odredi antibiogram i prema njemu prilagodi terapija

ETIOLOGIJA I ANTIBIOTSKA OSJETLJVOST UZROČNIKA INFEKCIJA MOKRAĆNOG SUSTAVA U BOLESNIKA STARIJE ŽIVOTNE DOBI LIJEČENIH TIJEKOM 2018. GODINE U KLINICI ZA INFEKTOLOGIJU KLINIČKOG BOLNIČKOG CENTRA SPLIT.

Objectives: To investigate the most common etiology of bacteria causing urinary tract infection (UTI) and their antibiotic sensitivity in older patients aged 65 years or above. Materials and methods: From January 2018 until December 2018, 107 patients aged 65 years and above were treated for urinary tract infections at the Clinic of Infectology of the University Hospital in Split. We included patients with the diagnosis acute cystitis, prostatocystitis, acute cystopyelitis, acute pyelonephritis and urosepsis, which were diagnosed on the basis of clinical evaluation and laboratory diagnostics. The study was conducted as an observational retrospective study. Medical data were retrieved by reviewing the history of medical records stored in the archive of the Clinic of Infectology, University Hospital in Split. Results: The largest number of patients (26,2%) were found in the age group 80 years and above. Urosepsis with 37,4% and pyelonephritis actua with 36,4% were the most frequent encountered diagnosis of patients with urinary tract infections treated in the Infectology department in 2018. E.coli (50,5%) was the most common isolated bacteria causing UTIs, in second place was Proteus mirabilis (15%), followed by Pseudomonas aeruginosa (11,2%), Klebsiella pneumonia (9,4%). E.coli resistance to ampicillin was the highest with 51,9%, followed by fluoroquinolones with 27,8%. High sensitivity to carbapenems with no isolated organsim resistant to it and to nitrofurantoin with 94,1% sensitivity was established. Almost all isolated bacteria in our study were showing sensitivity rates of over 80% to carbapenems. Conclusions: The most common isolated pathogen causing urinary tract infection in older patients visiting the Clinic of Infectology in 2018 was E.coli with 50,5%. Sensitivity of E.coli was 100% to carbapenems, 94,1% to nitrofurantoin, and above 75% for amoxicillin-clavulanic acid, all 4 generations of cephalosporins and aminoglycosides. 27,8% resistance rate to fluoroquinolones preclude their use as first line agents for pyelonephritis, until antibiotic sensitivity has not been established. Nitrofurantoin represents an appropriate first-line agent to treat cystitis in our patient sample and carbapenems, 4th generation cephalosporins or amoxicillin-clavulanic acid should be considered as first-line agents for pyelonephritisNaslov: Etiologija i antibiotska osjetljvost uzročnika infekcija mokraćnog sustava u bolesnika starije životne dobi liječenih tijekom 2018. godine u Klinici za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split. Ciljevi: Istražiti najčešće bakterijske uzroničnike infekcija mokraćnog sustava i njihovu osjetljivost na antibiotike u starih bolesnika životne dobi od 65 i više godina. Materijali i metode: Od siječnja do prosinca 2018.godine na Klinici za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split liječeno je 107 bolesnika u dobi od 65 i više godina zbog infekcije mokraćnog sustava (IMS). U istraživanje su uključeni bolesnici s dijagnozom akutnog cistitisa, akutnog pijelonefritisa i urospese. Dijagnoza se temeljila na kliničkoj evaluaciji i laboratorijskog dijagnostici. Istraživanje je provedeno kao opservacijska retrospektivna studija. Medicinski podaci dobiveni su pregledom povijesti bolesti pohranjenih u arhivi Klinike za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split Rezultati: Najveći broj bolesnika (26,2%) bio je dobnoj skupini od 80 i više godina. U 2018. godini zbog IMS liječeno je nešto više ženskih (54,2%) nego muških bolesnika (45,8%) u dobi do 65 i više godina. Urosepsa sa 37,4% i akutni pijelonefritis sa 36,7% bile su najčešće dijagnoze. Najčeše izoliran uzročnik IMS bila je E.coli (50,5%), na drugom mjestu je bio Proteus mirabilis (15%), a potom Pseudomonas aeruginosa (11,2%) i Klebsiella pneumonia (9,4%). E.coli bila je najčešće rezistentna na ampicilin sa 51,9%, a potom na fluorokinolone sa 27,8%. Utvrđena je visoka osjetljivost E.coli na karbapeneme, bez ijednog rezistentnog izolata, te na nitrofurantoin na koji je bilo osjetljivo 94,1% izolata. Gotovo sve druge izolirane bakterije pokazale su osjetljivost na karbapeneme od preko 80%. Zaključci: Sa 50,5% E.coli bila je najčešće izolirani uzročnik IMS u starijih bolesnika koji su 2018. godine liječeni na Klinici za infektologiju. Slijedili su je P.mirabilis sa 15% na drugom i P.aeruginosa sa 11,2% na trećem mjestu. Osjetljivost E.coli na karbapeneme bila je 100%, na nitrofurantoin 94,1%, te preko 75% na amoksicilin-klavulanat, na sve 4 generacije cefalosporina i na aminoglikozide. Rezistenija E.coli na flurokinolone od 27,8% isključuje ih kao antibiotike prvog izbora za pijelonefritis dok se ne utvrdi osjetljivost uzročnika na antibiotike. Srećom nitrofurantoin je odgovarajući lijek prvog izbora za liječenje cistitisa i u naših bolesnika.Pijelonefritis i urosepsa, infekcije koje su bile češće u našoj bolnici, trebalo bi empirijski liječiti amoksicilin-klavulanatom, trećom ili četvrtom generacijom cefalosporina, ili u težoj prezentaciji bolesti karbapenemima kao poduzanim lijekvima prije nego se odredi antibiogram i prema njemu prilagodi terapija

ETIOLOGIJA I ANTIBIOTSKA OSJETLJVOST UZROČNIKA INFEKCIJA MOKRAĆNOG SUSTAVA U BOLESNIKA STARIJE ŽIVOTNE DOBI LIJEČENIH TIJEKOM 2018. GODINE U KLINICI ZA INFEKTOLOGIJU KLINIČKOG BOLNIČKOG CENTRA SPLIT.

Objectives: To investigate the most common etiology of bacteria causing urinary tract infection (UTI) and their antibiotic sensitivity in older patients aged 65 years or above. Materials and methods: From January 2018 until December 2018, 107 patients aged 65 years and above were treated for urinary tract infections at the Clinic of Infectology of the University Hospital in Split. We included patients with the diagnosis acute cystitis, prostatocystitis, acute cystopyelitis, acute pyelonephritis and urosepsis, which were diagnosed on the basis of clinical evaluation and laboratory diagnostics. The study was conducted as an observational retrospective study. Medical data were retrieved by reviewing the history of medical records stored in the archive of the Clinic of Infectology, University Hospital in Split. Results: The largest number of patients (26,2%) were found in the age group 80 years and above. Urosepsis with 37,4% and pyelonephritis actua with 36,4% were the most frequent encountered diagnosis of patients with urinary tract infections treated in the Infectology department in 2018. E.coli (50,5%) was the most common isolated bacteria causing UTIs, in second place was Proteus mirabilis (15%), followed by Pseudomonas aeruginosa (11,2%), Klebsiella pneumonia (9,4%). E.coli resistance to ampicillin was the highest with 51,9%, followed by fluoroquinolones with 27,8%. High sensitivity to carbapenems with no isolated organsim resistant to it and to nitrofurantoin with 94,1% sensitivity was established. Almost all isolated bacteria in our study were showing sensitivity rates of over 80% to carbapenems. Conclusions: The most common isolated pathogen causing urinary tract infection in older patients visiting the Clinic of Infectology in 2018 was E.coli with 50,5%. Sensitivity of E.coli was 100% to carbapenems, 94,1% to nitrofurantoin, and above 75% for amoxicillin-clavulanic acid, all 4 generations of cephalosporins and aminoglycosides. 27,8% resistance rate to fluoroquinolones preclude their use as first line agents for pyelonephritis, until antibiotic sensitivity has not been established. Nitrofurantoin represents an appropriate first-line agent to treat cystitis in our patient sample and carbapenems, 4th generation cephalosporins or amoxicillin-clavulanic acid should be considered as first-line agents for pyelonephritisNaslov: Etiologija i antibiotska osjetljvost uzročnika infekcija mokraćnog sustava u bolesnika starije životne dobi liječenih tijekom 2018. godine u Klinici za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split. Ciljevi: Istražiti najčešće bakterijske uzroničnike infekcija mokraćnog sustava i njihovu osjetljivost na antibiotike u starih bolesnika životne dobi od 65 i više godina. Materijali i metode: Od siječnja do prosinca 2018.godine na Klinici za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split liječeno je 107 bolesnika u dobi od 65 i više godina zbog infekcije mokraćnog sustava (IMS). U istraživanje su uključeni bolesnici s dijagnozom akutnog cistitisa, akutnog pijelonefritisa i urospese. Dijagnoza se temeljila na kliničkoj evaluaciji i laboratorijskog dijagnostici. Istraživanje je provedeno kao opservacijska retrospektivna studija. Medicinski podaci dobiveni su pregledom povijesti bolesti pohranjenih u arhivi Klinike za infektologiju Kliničkog bolničkog centra Split Rezultati: Najveći broj bolesnika (26,2%) bio je dobnoj skupini od 80 i više godina. U 2018. godini zbog IMS liječeno je nešto više ženskih (54,2%) nego muških bolesnika (45,8%) u dobi do 65 i više godina. Urosepsa sa 37,4% i akutni pijelonefritis sa 36,7% bile su najčešće dijagnoze. Najčeše izoliran uzročnik IMS bila je E.coli (50,5%), na drugom mjestu je bio Proteus mirabilis (15%), a potom Pseudomonas aeruginosa (11,2%) i Klebsiella pneumonia (9,4%). E.coli bila je najčešće rezistentna na ampicilin sa 51,9%, a potom na fluorokinolone sa 27,8%. Utvrđena je visoka osjetljivost E.coli na karbapeneme, bez ijednog rezistentnog izolata, te na nitrofurantoin na koji je bilo osjetljivo 94,1% izolata. Gotovo sve druge izolirane bakterije pokazale su osjetljivost na karbapeneme od preko 80%. Zaključci: Sa 50,5% E.coli bila je najčešće izolirani uzročnik IMS u starijih bolesnika koji su 2018. godine liječeni na Klinici za infektologiju. Slijedili su je P.mirabilis sa 15% na drugom i P.aeruginosa sa 11,2% na trećem mjestu. Osjetljivost E.coli na karbapeneme bila je 100%, na nitrofurantoin 94,1%, te preko 75% na amoksicilin-klavulanat, na sve 4 generacije cefalosporina i na aminoglikozide. Rezistenija E.coli na flurokinolone od 27,8% isključuje ih kao antibiotike prvog izbora za pijelonefritis dok se ne utvrdi osjetljivost uzročnika na antibiotike. Srećom nitrofurantoin je odgovarajući lijek prvog izbora za liječenje cistitisa i u naših bolesnika.Pijelonefritis i urosepsa, infekcije koje su bile češće u našoj bolnici, trebalo bi empirijski liječiti amoksicilin-klavulanatom, trećom ili četvrtom generacijom cefalosporina, ili u težoj prezentaciji bolesti karbapenemima kao poduzanim lijekvima prije nego se odredi antibiogram i prema njemu prilagodi terapija

In-depth cell-free DNA sequencing reveals genomic landscape of Hodgkin's lymphoma and facilitates ultrasensitive residual disease detection

Background: Individualization of treatment in Hodgkin's lymphoma is necessary to improve cure rates and reduce treatment side effects. Currently, it is hindered by a lack of genomic characterization and sensitive molecular response assessment. Sequencing of cell-free DNA is a powerful strategy to understand the cancer genome and can be used for extremely sensitive disease monitoring. In Hodgkin's lymphoma, a high proportion of cell-free DNA is tumor-derived, whereas traditional tumor biopsies only contain a little tumor-derived DNA. Methods: We comprehensively genotype and assess minimal residual disease in 121 patients with baseline plasma as well as 77 follow-up samples from a subset of patients with our targeted cell-free DNA sequencing platform. Findings: We present an integrated landscape of mutations and copy number variations in Hodgkin's lymphoma. In addition, we perform a deep analysis of mutational processes driving Hodgkin's lymphoma, investigate the clonal structure of Hodgkin's lymphoma, and link several genotypes to Hodgkin's lymphoma phenotypes and outcome. Finally, we show that minimal residual disease assessment by repeat cell-free DNA sequencing, as early as a week after treatment initiation, predicts treatment response and progression-free survival, allowing highly improved treatment guidance and relapse prediction. Conclusions: Our targeted cell-free DNA sequencing platform reveals the genomic landscape of Hodgkin's lymphoma and facilitates ultrasensitive detection of minimal residual disease. Funding: Mildred Scheel School of Oncology Aachen-Bonn-Cologne-Düsseldorf MD Research Stipend, Next Generation Sequencing Competence Network grant 423957469, Deutsche Krebshilfe grant 70112502, Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) grant EN 179/13-1, the HL MRD consortium, and the Frau-Weiskam und Christel Ruranski-Stiftung