Characterization of the Arachis (Leguminosae) D genome using fluorescence in situ hybridization (FISH) chromosome markers and total genome DNA hybridization

Chromosome markers were developed for Arachis glandulifera using fluorescence in situ hybridization (FISH) of the 5S and 45S rRNA genes and heterochromatic 4'-6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) positive bands. We used chromosome landmarks identified by these markers to construct the first Arachis species ideogram in which all the homologous chromosomes were precisely identified. The comparison of this ideogram with those published for other Arachis species revealed very poor homeologies with all A and B genome taxa, supporting the special genome constitution (D genome) of A. glandulifera. Genomic affinities were further investigated by dot blot hybridization of biotinylated A. glandulifera total DNA to DNA from several Arachis species, the results indicating that the D genome is positioned between the A and B genomesFil: Robledo Dobladez, Germán Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Gossypium Ekmanianum (Malvaceae), a wild cotton from Dominican Republic

Se confirma la observación de Ekman sobre la ondición  de silvestre de Gossypium ekmanianum y se corrige su país de origenThe remark «perfectly wild» made by Ekman for Gossypium Ekmanianum is confirmed and its country of origin is correctedFil: Krapovickas, Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Números cromosómicos de especies de Mimosa (Leguminosae) de Paraguay

In the present study the chromosome numbers of Mimosa xanthocentra subsp. subsericea var. subsericea, M. balansae, M. chacoensis, M. rojasiiall with 2n=26 and M. lupinoides with 2n=52 are reported for the first time. The 2n=52 of M. somnians subsp. viscida vara viscida and of M. somnians subsp. somnians var. somnians are new and differ from the 2n=26 published before for M. somnians var. somniansof Argentina. M. debiliswith 2n=26 also differs from the numbersreported previously for M. debilis var. debilis from Argentina with 2n=52. The 2n=26 of M. bimucronata var. adenocarpa coincides with the reported number for M. bimucronata var.bimucronata, and the number of M. polycarpa var. spegazzinii with 2n=26 is confirmed.En el presente estudio el número de cromosomas de la subsp Mimosa xanthocentra. subsericea var. subsericea, M. balansae, M. chacoensis, M. rojasii todos con 2n = 26 y M. lupinoides con 2n = 52 ha sido reportado en primer término. El 2n = 52 de M. somnians subsp. viscida var. viscida y de M. somnians subsp. somnians var. somnians son nuevas y diferentes de las 2n = 26 publicados antes para M. somnians var. somnians de Argentina. M. debilis con 2n = 26 también difiere de las cifras reportadas previamente para M. debilis var. debilis de Argentina con 2n = 52. El 2n = 26 de adenocarpa M. bimucronata var. coincide con la cifra reportada para M. bimucronata var. bimucronata, y el número de M. polycarpa var. spegazzinii con 2n = 26 se confirm

La citogenética molecular revela un heteromorfismo cromosómico numérico y estructural poco común en Zephyranthes brachyandra (Amaryllidaceae)

Background and aims: Zephyranthes brachyandra belongs to a tribe of ornamental Amaryllidaceae native of South America, whose genera circumscription and phylogenetic relationships are still unclear. Cytologically, Z. brachyandra is a tetraploid whose chromosomes are of similar size and morphology, hindering the identification of its 2n = 24 chromosomes. The aim of this study was to investigate the stability of the many CMA+ and DAPI+ bands and the occurrence of B chromosomes by a cytomolecular approach.M&M: For this investigation we conducted a cytomolecular analysis with CMA/DAPI staining and fluorescence in situ hybridization with 5S and 35S rDNA probes, and the TTTAGGG telomeric probe.Results: In the present work, a cytomolecular analysis of Z. brachyandra, revealed a large and variable number of CMA+ and DAPI+ heterochromatic bands and 5S and 35S rDNA sites, and a regular distribution of the TTTAGGG telomeric sequences. In addition, one individual was monotrisomic with 2n = 24, and another one had a B chromosome. Both numerical and structural chromosome alterations were clearly characterized by CMA/DAPI bands and rDNA sites.Conclusions: Comparing the present data with the cytological data for other species of Zephyranthes, it becomes clear that a cytomolecular approach is fundamental to the understanding of the chromosome variation and cytotaxonomy of the group.Introducción y objetivos: Zephyranthes brachyandra pertenece a una tribu de Amaryllidaceae ornamentales nativa de América del Sur, cuya circunscripción de géneros y relaciones filogenéticas aún no están claras. Citológicamente, Z. brachyandra es un tetraploide cuyos cromosomas son de tamaño y morfología similar, lo que dificulta la identificación de sus 2n = 24 cromosomas. El objetivo de este estudio fue investigar la estabilidad de las numerosas bandas CMA+ y DAPI+ y la aparición de cromosomas B mediante un enfoque citomolecular. M&M: Para esta investigación realizamos un análisis citomolecular con tinción CMA/ DAPI e hibridación fluorescente in situ con sondas de ADNr 5S y 35S, y la sonda telomérica TTTAGGG. Resultados: En el presente trabajo se realizaron varios análisis citomoleculares de Z. brachyandra, que revelaron un número alto y variable de bandas heterocromáticas CMA+ y DAPI+ y de sitios de ADNr 5S y 35S, además de una distribución típica de las secuencias teloméricas TTTAGGG. Además, un individuo era monotrisómico con 2n = 24 y otro tenía un cromosoma B. Las alteraciones cromosómicas tanto numéricas como estructurales se caracterizaron claramente por bandas CMA / DAPI y sitios de ADNr. Conclusión: Al comparar los datos actuales con la literatura citológica de otras especies del género Zephyranthes, queda claro que un enfoque citomolecular es fundamental para la comprensión de la variación cromosómica y la citotaxonomía del grupo.Fil: Nascimento, Tiago. Universidade Federal de Pernambuco; BrasilFil: Baez, Jesica Mariana. Universidade Federal de Pernambuco; BrasilFil: Gongalves, Raquel. Universidade Federal de Pernambuco; BrasilFil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Guerra, Marcelo. Universidade Federal de Pernambuco; Brasi

Cytological features of penaut genome

The genus Arachis is composed of 82 species (Krapovickas and Gregory 1994; Valls and Simpson 2005; Valls et al 2013; Santana and Valls 2015) mainly distributed within a large region of South America, which extends from the eastern foothills of the Andes Mountains in Bolivia and northern Argentina to the Atlantic coast in Brazil, and from the southern limit of the Amazonian rainforest towards the northern coast of La Plata River in Uruguay. Based on morphology, cross-compatibility, viability of the hybrids, geographic distribution and cytogenetics, the Arachis species have been arranged in nine taxonomic sections: Trierectoides, Erectoides, Procumbentes, Rhizomatosae, Heteranthae, Caulorrhizae, Extranervosae, Triseminatae and Arachis (Krapovickas and Gregory 1994; Fernández and Krapovickas 1994; Lavia 1996; Valls and Simpson 2005). Cross compatibility, karyotypic and meiotic analysis also allowed the identification and description of six different genomes within the section Arachis: namely A, B, D, F, K and G (Smartt et al 1978; Stalker 1991; Robledo and Seijo 2008, 2010; Robledo et al 2009; Silvestri et al 2015). The genomic constitution of the remaining species of the genus, in the absence of comprehensive cytogenetic and molecular analysis, is less precise and have been traditionally assigned on the basis of the subgeneric divisions, that is: Am (Heteranthae), C (Caulorrhizae), E (Trierectoides, Erectoides and Procumbentes), Ex (Extranervosae), T (Triseminatae) and R (Rhizomatosae) (Smartt and Stalker 1982). Classical and modern molecular cytogenetics revealed a huge variability within and among species of different sections. These studies provided important information about the complexity of the peanut genome, and were very useful to unravel the taxonomy of the genus and to establish relationships among the wild species with the cultivated peanut. Here we present an update of the cytological information on Arachis species, and some examples in which the use of chromosome markers were decisive to understand critical and long lasting problems in the genus.Fil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Samoluk, Sergio Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Ortiz, Alejandra Marcela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Silvestri, María Celeste. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Chalup, Laura María Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Robledo Dobladez, Germán Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Lavia, Graciela Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Cromosomas de Malváceas

Chromosome numbers are reported for 50 collections of Malvaceae from Argentina, Bolivia,Brasil, Chile, Mexico and Paraguay representing 17 genera and 40 species. First chromosomecounts are reported for the following 28 species: Cienfuegosia conciliata 2n=20, Hibiscusstriatus 2n=52, H. adscensionis 2n=72, Phragmocarpidium Heringeri 2n=50, Malachra radiata2n=56, Pavonia Friesii 2n=56, P. fruticosa 2n=56, P. subrotunda 2n=56, Monteiroa Reitzii2n=20, Tarasa nototrichoides 2n=10, Tropidococcus pinnatipartitus 2n=24, Chstaria disssecta2n=12, Gaya Bordasii 2n=12, Pseudabutilon cinereum 2n=16, Abutilon fluviatile 2n=16, A.laxum 2n=16, Wissadula Fadyenii 2n=14, Sida vespertina 2n=14, S. Glaziovii 2n=28, S.glomerata 2n=14, S. hirsutissima 2n=28, S. planicaulis 2n=28, S. Rodrigoi 2n=28, S. ulmifolia2n=28, S. Hatschbachii 2n=42, S. Reitzii 2n=42, S. aggregata 2n=16, S. rufescens 2n=32En este trabajo se presentan los números cromosómicos de 50 accesiones de Malvaceae deArgentina, Bolivia, Brasil, Chile, México y Paraguay, las mismas representan 17 géneros y 40especies. Para las siguientes 28 especies se presenta el número cromosomico por primeravez: Cienfuegosia conciliata 2n=20, Hibiscus striatus 2n=52, H. adscensionis 2n=72,Phragmocarpidium Heringeri 2n=50, Malachra radiata 2n=56, Pavonia Friesii 2n=56, P.fruticosa 2n=56, P. subrotunda 2n=56, Monteiroa Reitzii 2n=20, Tarasa nototrichoides 2n=10,Tropidococcus pinnatipartitus 2n=24, Cristaria disssecta 2n=12, Gaya Bordasii 2n=12,Pseudabutilon cinereum 2n=16, Abutilon fluviatile 2n=16, A. laxum 2n=16, Wissadula Fadyenii2n=14, Sida vespertina 2n=14, S. Glaziovii2n=28, S. glomerata 2n=14, S. hirsutissima 2n=28,S. planicaulis 2n=28, S. Rodrigoi, 2n=28, S. ulmifolia 2n=28, S. Hatschbachii 2n=42, S. Reitzii2n=42, S. aggregata 2n=16, S. rufescens 2n=3

Structure and comparative analysis of the mitochondrial genomes of Liolaemus lizards with different modes of reproduction and ploidy levels

Liolaemus is the most specious genus of the Squamata lizards in South America, presenting exceptional evolutionary radiation and speciation patterns. This recent diversification complicates the formal taxonomic treatment and the phylogenetic analyses of this group, causing relationships among species to remain controversial. Here we used Next-Generation Sequencing to do a comparative analysis of the structure and organization of the complete mitochondrial genomes of three differently related species of Liolaemus and with different reproductive strategies and ploidy levels. The annotated mitochondrial genomes of ca. 17 kb are the first for the Liolaemidae family. Despite the high levels of sequence similarity among the three mitochondrial genomes over most of their lengths, the comparative analyses revealed variations at the stop codons of the protein coding genes and the structure of the tRNAs among species. The presence of a non-canonical dihydrouridine loop is a novelty for the pleurodonts iguanians. But the highest level of variability was observed in two repetitive sequences of the control region, which were responsible for most of the length heterogeneity of the mitochondrial genomes. These tandem repeats may be useful markers to analyze relationships of closely related species of Liolaemus and related genera and to conduct population and phylogenetic studies.Fil: Valdes, José Julian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Samoluk, Sergio Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Abdala, Cristian Simón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; ArgentinaFil: Baldo, Juan Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; ArgentinaFil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentin

Arachis inflata: Una nueva especie de Arachis (Fabaceae) del Genoma B

Se han realizado grandes esfuerzos para coleccionar germoplasma del género Arachis en Sudamérica, sin embargo, aún quedan muchas regiones subexploradas. Bajo la hipótesis de que estas tienen poblaciones/especies nuevas y diversas de Arachis, se realizaron nuevas expediciones en Bolivia a partir del año 2000 con el objetivo de incrementar la documentación de la diversidad de este género. Como primer resultado de estas exploraciones, en este trabajo se describe formalmente una nueva especie de la sección Arachis perteneciente al genoma B. Arachis inflata es una especie afín a A. magna y A. ipaënsis, aunque se distingue claramente de ellas, y de todas las demás especies del género, por presentar un tipo de fruto distinto. El mismo presenta epicarpo liso, con aspecto ampollado, debido a la presencia de cámaras de aire en el mesocarpo.Great efforts have been done to collect germplasm of the Arachis genus in South America, however, many regions still remain underexplored. Under the hypothesis that these regions have new and diverse populations/species of Arachis, several expeditions were carried out since 2000 in Bolivia, to increase the documentation of the genus diversity. As a first result of these explorations, a new species of section Arachis with B genome is formally described. Arachis inflata is closely related to A. magna and A. ipaënsis, but it can be clearly distinguished from them, and from any other species of the genus, for having a type of fruit with a completely distinct morphology. The fruit has a smooth epicarp, but shows a bullated aspect, due to the presence of air chambers in the mesocarp.Fil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Atahuachi, Margoth. Universidad Mayor de San Simon Bolivia; BoliviaFil: Simpson, Charles E.. Texas A&M University; Estados UnidosFil: Krapovickas, Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Arachis inflata: A New B Genome species of Arachis (Fabaceae)

Great efforts have been done to collect germplasm of the Arachis genus in South America, however, many regions still remain underexplored. Under the hypothesis that these regions have new and diverse populations/species of Arachis, several expeditions were carried out since 2000 in Bolivia, to increase the documentation of the genus diversity. As a first result of these explorations, a new species of section Arachis with B genome is formally described. Arachis inflata is closely related to A. magna and A. ipaënsis, but it can be clearly distinguished from them, and from any other species of the genus, for having a type of fruit with a completely distinct morphology. The fruit has a smooth epicarp, but shows a bullated aspect, due to the presence of air chambers in the mesocarp