pUC 119 vektörü ile random nohut (Cicer arietinum L.) genom kütüphanesinin hazırlanması

Bu çalışmada, FLIP 84-92C nohut (Cicer arietinum L.) çeşidinin genom kütüphanesi hazırlanmıştır. Öncelikle, nohut genomik DNAʼsı izole edilip hydroshear ile mekanik olarak parçalara ayrılmış, daha sonra DNA fragmanları pUC119 klonlama vektörlerine aktarılmıştır. Elde edilen rekombinant pUC119 vektörlerinin taşıyıcı organizma Esherichia coliʼye transforme edilmesinin ardından kütüphanede yer alan hedef DNAʼlar Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile çoğaltılmıştır. Sonuç olarak, bu çalışma ile nohut genomunu 7 defa kavrayan ve ortalama hedef DNA büyüklükleri 3 kb olan 672 klondan oluşan nohut genom kütüphanesi elde edilmiştir. Bu çalışmanın amacı, ileride yüksek çözünürlüğe sahip genetik linkaj haritalarının oluşturulması için kütüphanede yer alan her bir klonum prob olarak hizmet vermesidir

Crosstalk between autophagy and dna repair systems

Autophagy and DNA repair are two essential biological mechanisms that maintain cellular homeostasis. Impairment of these mechanisms was associated with several pathologies such as premature aging, neurodegenerative diseases, and cancer. Intrinsic or extrinsic stress stimuli (e.g., reactive oxygen species or ionizing radiation) cause DNA damage. As a biological stress response, autophagy is activated following insults that threaten DNA integrity. Hence, in collaboration with DNA damage repair and response mechanisms, autophagy contributes to the maintenance of genomic stability and integrity. Yet, connections and interactions between these two systems are not fully understood. In this review article, current status of the associations and crosstalk between autophagy and DNA repair systems is documented and discussed

Preparation and characterization of nanoporous powders from bentonite by hydrochloric acid leaching and using as bleaching earth

A calcium bentonite (CaB) was leached by hydrochloric acid (HCl) solutions to improve the adsorptive properties such as nanoporosity, acidity, and decoloration power. The mass ratio of HCl/CaB was changed between zero and 1.00 according the anhydrous CaB + HCl mixture. Different powders were obtained from the heating of the aqueous mixtures at 90 degrees C for 16 h under a reflux condenser. The raw CaB and obtained powders were investigated by different methods such as X-ray diffraction, chemical analyses, adsorption, pH-metry, and tintometry techniques. A calcium rich-smectite (CaS) are found in the CaB as major clay mineral, whereas illite (I) and metahalloysite (MH) as minor ones. The impurities are opal-A (OA), opal-CT (OCT), quartz (Q), calcite (C), orthoclase (O), and clinoptilolite (CLN). The fraction of the dissolved cations from the C, CaS, I, and CLN increases with the increasing of HCl concentration. The remaining K+ and Al3+ cations are located in the undissolved orthoclase. An amorphous silica OA (SiO2 center dot nH(2)O) remained at the end of completed leaching. The gradual increase in the adsorptive properties, acidity, and bleaching power is due to the formation of new nanopores. Gradual decrease after their maxima is caused from the degradation of the layered structure for clay minerals. The maximum bleaching power tentatively intensifies with the increasing of the used powder mass

Cultural Encounters in The Ottoman World and Their Artistic Reflections:in Honor of Prof. Dr. Filiz Yenişehirlioğlu

Prof. Dr. Filiz Yenişehirlioğlu kurucu dekan olarak görev aldığı Başkent Üniversitesi Güzel Sanatlar Tasarım ve Mimarlık Fakültesi'ni üniversitenin rektörü Prof. Dr. Mehmet Haberal'm desteği ile üniversitenin 10. yılma rastlayan 2006'da kurar. Görsel Sanatlar ve Tasarım Bölümü'nün kuruluşunu takiben Iç Mimarlık ve Çevre Tasarımı bölümleri ardından da Sanat Tarihi ve Müzecilik Bölümü 2006'da akademik faaliyetlerine başlar. Ayrıca Müzik Bölümü ve üniversite öğrencilerinin geneline açık kültür ve sanatla ilgili farklı içerikli dersler sunan Güzel Sanatlar Birimi oluşturulur. Prof. Dr. Yenişehirlioğlu, Kültür ve Sanat Araştırmaları Merkezi adı altında farklı alanlarda projelerin yürütüldüğü bir merkezi de faaliyete geçirir. Yenişehirlioğlu'nun kurduğu fakültenin vizyonu çağdaş eğitimin vazgeçilmezi tasarımın, kültür ve toplumun yaşanılan mekân ile bütünleşik olduğu görüşüyle disiplinler arası bir programla öğrenciyi mezun etmeyi hedefler. Bu bağlamda Yenişehirlioğlu estetik, yaratıcı drama ve görsel kültürün değişik uygulamalarının yer aldığı bir program oluşturmayı amaçlar. Farklı ülkelerden çalıştaylar yapmaya gelen bilim insanlarının katılımlarıyla dolup taşan derslikler geç saatlere dek süren akademik çalışmalar, Güzel Sanatlar Birimi'nin sıklıkla düzenlediği kaliteli sergiler Yenişehirlioğlu'nun kurucu dekanlığı döneminde hız kazanır. Farklı disiplinlerden gelen bilim insanlarının birlikte olduğu Güzel Sanatlar Tasarım ve Mimarlık Fakültesi bünyesine öğretim üyesi kimliğimle 2005 yılında katılma fırsatını yakaladım. Bu süreçte yakından tanıma şansına sahip olduğum Filiz Yenişehirlioğlu hocam bitmez tükenmez enerjisi ve bilime çağdaş bakış açısı ile kendisinden çok şey öğrendiğim bir bilim insanıdır. Yenişehirlioğlu ile ortak paydada buluştuğum en önemli konu, tek bir alanda uzmanlaşan ve yaşamını bu alanda sürdüren, farklı alanların örtüştüğü bilgileri kullanamayan bireyler yetiştirmeye olan itirazımdı. Bunun yerine, üniversite kavramıyla asıl içinin doldurulması gerekenin ise farklı alan tecrübeleri ile yoğrulan, yeniyi üretebilen, kendini tanıyan birey olma kavramına, bir başka ifadeyle birey yetiştirme programına dahil olmaya duyduğumuz inançtı. Yenişehirlioğlu'nun kültür ve sanata yaygın bakış açısı aktif olarak yurtiçi ve dışında farklı oluşumlarla projeler yapmasını sağlamıştır. 1989 yılında T.C. Dışişleri Bakanlığı ile ortak çalışma sonucu yayınlanan Yurtdışındaki Osmanlı Mimari Eserleri üzerine bir kitap hazırlayan Yenişehirlioğlu ardından Tekfur Sarayı kazıları ile Eyüp Çömlekçiler Projesi'ni hayata geçirmiş, Topkapı Çini Projesi ile çalışmalarını sürdürmüştür. Yenişehirlioğlu'nun, sanatın ve içinde üretildiği toplumun irdelenmesi üzerine sayısız akademik çalışmaları­nın dışında Tübitak ve dergi hakemlikleri de mevcuttur. Ayrıca UNESCO Türkiye kültür varlıkları komisyon ve ASTAD SCOTT üyelikleri yanı sıra Ankara Mimarlar Derneği, Uçan Süpürge ve yerel yönetimlerle kültür envanteri gibi ortak çalışmaları da mevcuttur. 1991'de Fransız Kültür Bakanlığı Kültür Şövalyeliği ünvanına layık görülen Yenişehirlioğlu 1992 yılında iki ayrı ödül daha alır. Bunlardan ilki İtalya'da alanında ünlü kadın profosyonellere verilen "Adelaide Ristori" Ödülü diğeri ise Hacettepe Ünversitesi Senatosu'nun Bilim Ödülü'dür. Bu ödülleri 2006'da "Türkiye ve Yunanistan Arasında Mübadeleden Kalan Ortak Kültür Mirasının Korunması" Projesi ile Europa Nostra Ödülü takip eder. Sonuç olarak, bilimde ilerlemek "yeni'nin peşinde koşmakla sağlanır. Bunun en güzel örneği Prof. Dr. Filiz Yenişehirlioğlu hocamızdır