Epidemiología del tomato spotted wilt virus en el contexto de la virosis de papa en el sudeste bonaerense y Argentina.

Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias Agrarias, de la Universidad Nacional de Mar del Plata, en octubre de 2021El Sudeste Bonaerense es la principal región productora de papa para consumo, industria y semilla en Argentina. Las virosis afectan el rendimiento y la calidad de los tubérculos de la papa. La transmisión de los virus es mediante insecto-vector y papa-semilla utilizados en la propagación vegetativa. Los objetivos planteados en esta tesis son: contribuir al conocimiento de las virosis de papa en Argentina; determinar las características de la translocación de tomato spotted wilt virus (TSWV) en papa cv Innovator y establecer los parámetros epidemiológicos de TSWV en papa en la región del Sudeste Bonaerense. Se realizó una revisión bibliográfica sistemática de virus que infectan papa en América del Sur y Argentina. Se calculó la incidencia de potato virus Y (PVY), potato leafroll virus (PLRV), potato virus X (PVX) y TSWV y la presencia de infecciones mixtas para papa consumo-industria y papa-semilla desde 2013 al 2019 en el Sudeste Bonaerense. Además, en el área diferenciada de producción de papa-semilla de esta región se analizó el progreso del nivel de infección de estos virus desde 1985 al 2020. Se evaluó el porcentaje de infección de TSWV en el cv. Innovator a partir de distintos tejidos del tubérculo. Se estimó la incidencia de TSWV, su distribución espacial, y número de especies de trips a lo largo de un ensayo de papa cv. Innovator. En los estudios realizados en esta tesis se detectaron en los reportes 34 especies virales infectando papa en América del Sur y 12 en Argentina, siendo Buenos Aires y Jujuy las regiones con mayor diversidad. Se identificó que PVY, PLRV, potato virus S (PVS) y PVX están presentes en todos los países de América del Sur y en la mayoría de las regiones productoras de Argentina. También, hay especies virales que solo se identificaron en determinados países. Los valores de incidencia de PVY, PLRV, PVX y TSWV fluctuaron en papa con destino consumo-industria y semilla durante cinco campañas en el Sudeste Bonaerense. PVY tuvo la mayor incidencia en ambos tipos de producción. Los valores más altos de incidencia de TSWV fueron del 0,9% para papa consumo-industria y del 2,3% para papa-semilla. Se reportaron por primera vez infecciones mixtas que involucran al TSWV combinado con PVY y PLRV. En el área diferenciada de producción de papa-semilla del Sudeste Bonaerense se observó una disminución de los niveles de infección para todos los virus desde el 1985 al 2020. El porcentaje de detección de TSWV de la planta infectada al tubérculo ( 89 %) fue mayor que el del tubérculo a las plantas progenie ( 40,5 %). Además, se detectó una distribución uniforme de TSWV en los tejidos del tubérculo. La curva de progreso de la enfermedad para TSWV en el cultivo de papa cv. Innovator en el Sudeste Bonaerense se ajustó a un modelo logístico con un progreso policíclico de la enfermedad. Se comprobó que TSWV posee un patrón espacial aleatorio al comienzo del cultivo relacionado al inóculo del virus presente en la papa-semilla. Después de la floración se detectó un patrón agregado relacionado al aumento de la población de Frankliniella occidentalis. Los resultados que surgen de este trabajo contribuyen al diseño de estrategias para el manejo integrado de las enfermedades ocasionadas por virus en papa.The Southeast of Buenos Aires province is the main producing area of potato for fresh consumption, industry and seed production in Argentina. Viral diseases affect tuber yield and quality. Viruses are transmitted through insect vectors and seed tubers used for vegetative propagation. The aims of this thesis are to contribute to the knowledge of potato viral diseases in Argentina; to determine the characteristics of tomato spotted wilt virus (TSWV) translocation in potato cv. Innovator and to establish the epidemiological parameters of TSWV in potato in the Southeastern area of Buenos Aires. A systematic literature review about potato-infecting viruses in South America and Argentina was conducted. Incidence of potato virus Y (PVY), potato leaf roll virus (PLRV), potato virus X (PVX), and TSWV was calculated, and the presence of mixed infections was determined in potato for fresh consumption-industry and seed production in Southeastern Buenos Aires between 2013 and 2019. In addition, infection level progress of these viruses was analyzed in the area selected for exclusive seed-potato production between 1985 and 2020. TSWV infection percentage was evaluated in the cv. Innovator using different tuber tissues. Incidence and spatial distribution of TSWV, and number of thrips species were estimated in a trial involving potato cv. Innovator. In the studies carried out in this thesis, a total of 34 virus species infecting potato were reported in South America and 12 in Argentina, with Buenos Aires and Jujuy provinces showing the highest diversity. PVY, PLRV, potato virus S (PVS) and PVX were found to be present in all South American countries and in most of the producing regions in Argentina. In addition, some viral species were identified only in certain countries. The incidences values of PVY, PLRV, PVX and TSWV fluctuated in potato for fresh consumption-industry and seed production during five crop seasons in the southeast of Buenos Aires. PVY had the highest incidence in both production types. The highest TSWV incidence values were 0.9% for fresh consumption-industry potato production and 2.3 % for seed potato production. Mixed infections involving TSWV were first reported in combination with PVY and PLRV. A decrease in the infection levels of all the viruses was observed in the area selected for exclusive seed-potato production in the southeast of Buenos Aires between 1985 and 2020. The percentage of TSWV infection from infected potato cv. Innovator to tuber ( 89%) was higher than that from tuber to the progeny plant ( 40.5 %). Moreover, a uniform TSWV distribution in tuber tissues was detected. Disease progress curve for TSWV in potato cv. Innovator crop in southeastern Buenos Aires fitted a logistic model with a polycyclic disease progress. TSWV was found to have a random spatial pattern at the start of the crop cycle related to the virus inoculum present in the seed tubers. After flowering, an aggregated patter related to the increase in the Frankliniella occidentalis population was detected. The results of this work contribute to the design of integrated disease management strategies of viral disease in potato.EEA BalcarceFil: Salvalaggio, Andrea Eugenia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina

Isolation of streptomycetes causing common scab from 3-years old potato samples from South America

In this paper, we aimed at assessing the best conditions for the isolation of actinobacteria from old potato samples. A set of media and pretreatments were tested. The optimal were chosen for the isolation of actinobacteria from potatoes from Peru, Chile and Argentina. Isolates were tested on the presence of thaxtomin phytotoxin by amplification of the respective gene. Phylogenetic position of strains was compared with their geographical origin, pathogenic potential and existence of common scab (CS) symptoms on potato sample. We demonstrated that RNAlater can be successfully used for the long-term preservation of potato peel for subsequent isolation of actinobacteria on R2A medium. Many streptomycetes were thaxtomin-positive, though they are distantly-related to described pathogens causing CS. Genus Nocardia was first reported to be thaxtomin-positive. Potentially pathogenic strains were isolated not only from infected potato but also from those lacking CS symptoms. Some strains from scabby potatoes were thaxtomin-negative.EEA BalcarceFil: Rapoport, Daria. Charles University in Prague. Faculty opf Science, República Checa. Crop Research Institute, Laboratory of Epidemiology and Ecology of Microorganisms, República Checa.Fil: Patrmanova, T. Crop Research Institute, Laboratory of Epidemiology and Ecology of Microorganisms, República Checa.Fil: Kopecky, J. Crop Research Institute, Laboratory of Epidemiology and Ecology of Microorganisms, República Checa.Fil: Mareckova, M. Crop Research Institute, Laboratory of Epidemiology and Ecology of Microorganisms, República Checa. Czech University of Life Sciences, Faculty of Agrobiology, Food, and Natural Resources, Department of Microbiology, República Checa.Fil: Clemente, Gladys. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina.Fil: Salvalaggio, Andrea Eugenia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina

Situación de las virosis del cultivo de papa en el Sudeste Bonaerense

En el sudeste de la provincia de Buenos Aires se encuentra la principal región productora de papa de la Argentina. La papa que se produce tiene tres destinos: el mercado fresco, la industria y la producción de semilla, la cual se realiza en un área diferenciada. El cultivo de papa se establece a través de la propagación vegetativa y, como consecuencia, los tubérculos infectados se convierten en una vía de transmisión de virus. El objetivo fue determinar la incidencia de Potato virus Y (PVY), Potato leaf roll virus (PLRV), Potato virus X (PVX) y Tomato spotted wilt virus (TSWV) y la ocurrencia de infecciones mixtas entre estos virus en áreas de producción de papa para consumo e industria y papa-semilla del sudeste de Buenos Aires durante las campañas 2013-2014 a la 2018-2019. Otro objetivo fue analizar el progreso de los niveles de infección para estos virus y la tendencia de las categorías de certificación de papa-semilla fiscalizadas por el Instituto Nacional de semillas (INASE) en el área diferenciada en los últimos 35 años. En este estudio se trabajó con datos procedentes de tubérculos de papa de 107 lotes de consumo e industria recolectados según protocolo y 41 lotes de papa-semilla muestreados al azar por técnicos oficiales del INASE para su fiscalización. Los tubérculos fueron brotados y analizados mediante DAS-ELISA para detección de PVY, PLRV, PVX y TSWV. Se estimó la incidencia de cada virus, incidencia relativa entre estos y frecuencias de infecciones simples y mixtas para ambas categorías y para cada campaña. Se analizaron los niveles de infección de PVY, PLRV, PVX y TSWV del área diferenciada de producción de papa-semilla y su relación con las categorías de certificación. PVY resultó el virus con mayor incidencia mientras que PLRV y TSWV fueron los de menor incidencia tanto para la producción de papa destinada a consumo e industria como para papa-semilla. Se observó fluctuación interanual de los valores de incidencia para PVY, PLRV y TSWV en ambas categorías. Se reportó por primera vez infecciones mixtas entre PVY, PLRV y TSWV. Las infecciones mixtas más frecuentes fueron entre TSWV con PVY o PLRV. Se observó una disminución de los niveles de infección para PVY, PLRV, PVX y TSWV y una mejora en la tendencia de las categorías de certificación de papa-semilla para todos los virus en los últimos 35 años. Actualmente, las categorías de papa-semilla son Inicial iii para PVY e Inicial i para PLRV, PVX y TSWV. Desde 2010 no se detecta PVX en papa-semilla. Cabe señalar que la acción integrada de entidades públicas, privadas y productores que adoptaron el protocolo de la Mesa Provincial de papa logró que esta área diferenciada del sudeste de Buenos Aires se destaque por su excelencia sanitaria. No obstante, para la región de producción de papa para consumo e industria se deberían fortalecer las medidas de control de PVY y TSWV.The main potato producing area of Argentina is located in the southeast of Buenos Aires province. Potato is cropped for three purposes: fresh market, and industry and seed production; the latter is performed in a differentiated area. Potato crop is established through vegetative propagation; consequently, infected tubers become a route of virus transmission. The objective of this work was to determine the incidence of Potato virus Y (PVY), Potato leaf roll virus (PLRV), Potato virus X (PVX) and Tomato spotted wilt virus (TSWV), and the occurrence of mixed infections among these viruses in areas of potato production for fresh market, industry, and potato-seed of the southeast of Buenos Aires between the 2013-2014 and the 2018-2019 crop seasons. Another objective was to analyze the progress of the infection levels of these viruses and the trend of the potato-seed categories regulated by the “Instituto Nacional de Semillas” (INASE), produced in the differentiated area in the last 35 years. Data were collected from potato tubers corresponding to 107 plots destined for fresh market and industry, following sampling protocols, and from 41 potatoseed plots, which were randomly sampled by official INASE technicians for their control. These tubers were then sprouted and analyzed by DAS-ELISA for the detection of PVY, PLRV, PVX and TSWV. The incidence of each virus, relative incidence between them and frequencies of single and mixed infections were estimated for both categories and each season. Infection level of PVY, PLRV, PVX and TSWV of the differentiated potato-seed production area was analyzed. PVY was the virus with the highest incidence, whereas PLRV and TSWV had the lowest incidence in the production for fresh market, industry and potato-seed categories. Incidence values of PVY, PLRV and TSWV fluctuated among years in both categories. PVY, PLRV and TSWV mixed infection percentages were low, with double infections being more frequent than triple ones for both categories. TSWV co-infecting with PVY or PLRV were the most frequent mixed infections. This is the first report of mixed infections between PVY, PLRV and TSWV in potato in Argentina. The infection level for PVY, PLRV, PVX and TSWV decreased in the potato-seed differentiated area throughout the seasons. At the same time, there was an improvement in the trend of potato-seed certification categories regulated by INASE for all viruses in the last 35 years. Currently, the potato-seed category is at Initial III infection level for PVY and Initial I for PLRV, PVX and TSWV. PVX has not been detected since 2010 in potato seeds. It should be noted that the integrated action of public and private organizations and producers that adopted the protocol of the Provincial Potato Board made this differentiated area of the southeast of Buenos Aries stand out for its sanitary excellence. In the region where potato is produced for the fresh market and industry, PVY and TSWV control measures should be strengthened.EEA BalcarceFil: Salvalaggio, Andrea Eugenia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Salvalaggio, Andrea Eugenia. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible (IPADS Balcarce). Ecofisiología de Cultivos y Productos Agrícolas BalcarceFil: Bruno, Cecilia Inés. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Cátedra Estadística y Biometría; ArgentinaFil: Bruno, C. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Huarte, Marcelo Atilio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Lopez Lambertini, Paola Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentin

Balance de la campaña de girasol 2022/23: conceptos aprendidos y algunos recaudos para la cosecha

Reflexionamos sobre la presente campaña del cultivo de girasol y aspectos relevantes a considerar a la cosecha, relacionados a la heterogeneidad de los cultivos.EEA BalcarceFil: Edwards Molina, Juan Pablo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina.Fil: Divito, Guillermo. Asociación Argentina de Productores en Siembra Directa; Argentina.Fil: Tourn, Santiago. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina.Fil: Salvalaggio, Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina.Fil: Berardo, Bautista. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina

Morfología, grupos de compatibilidad vegetativa, patogenicidad y patrones moleculares de Fusarium spp. aislados de ajo y cebolla

Tesis para obtener el grado de Magíster Scientiae en Producción Vegetal, orientación Fitopatología, de la Universidad Nacional de Mar del Plata, en septiembre de 2009La podredumbre basal que afecta cebolla y ajo es una enfermedad importante en las zonas productoras de Argentina. F. oxysporum f. sp. cepae se cita como el principal agente causal pero otras especies de Fusarium también producen esta enfermedad. Ochenta y un aislamientos de Fusarium spp. provenientes de localidades productoras de las provincias de Mendoza, San Juan, Buenos Aires y Río Negro se caracterizaron por macro y micromorfología sobre los medios APD y AHC. Cincuenta y un aislamientos se identificaron como F. oxysporum, 16 como F. proliferatum, 7 como F. verticillioides, 5 como F. solani, uno como F. compactum y uno como Fusarium sp. F. oxysporum fue la especie más frecuentemente aislada tanto en cebolla como en ajo. Se determinó que la tasa de crecimiento diario de las colonias en APD fue significativamente diferente entre aislamientos, siendo el promedio de la tasa de los aislamientos de cebolla significativamente mayor que el de los de ajo. Se estableció además, una amplia variabilidad entre aislamientos y entre especies. Con 48 aislamientos de cebolla se comprobó la patogenicidad a través de la inoculación artificial de raíces de cebolla con suspensiones de 107 conidios/ml. Estos ensayos evidenciaron variabilidad significativa entre aislamientos y especies. La patogenicidad de 21 aislamientos de ajo se probó en plantas por inmersión de raíces con suspensiones de 107 conidios/mL y en dientes por inoculación en una herida con una suspensión de 5 x 106 conidios/ml. Se halló variabilidad entre aislamientos pero no entre especies y se determinó una asociación significativa entre los dos métodos empleados. F. oxysporum, F. proliferatum, F. verticillioides, F. so/ani, F.compactum y Fusarium sp. resultaron patógenos en cebolla mientras que F. oxysporum, F. verticillioides y F. proliferatum además lo fueron tanto en plantas como en bulbos de ajo. Se realizaron pruebas de complementación de mutantes auxotróficos de F. oxysporum obtenidos en PDC y MMC. Como resultado de este estudio se determinó que 28 aislamientos pertenecieron a 7 grupos de compatibilidad vegetativa (GCV), el resto fue miembro de un único GCV. Además 5 aislamientos fueron autoincompatibles. Estos resultados indican que F. oxysporum corresponde a la forma especial cepae aunque con gran variabilidad entre aislamientos. No se encontró asociación entre el GCV con el origen, ni con el nivel de patogenicidad del aislamiento. Por la técnica de ERIC-PCR se generaron patrones de bandas polimórficos en todas las especies de Fusarium. Esta técnica detectó variabilidad genética dentro de las especies de manera eficiente, pero no fue útil para diferenciar especies. El alto grado de diversidad observado con ERIC-PCR en F. oxysporum coincidió con los resultados obtenidos por la técnica de GCV. F. verticillioides exhibió la mayor variabilidad genética en cambio F. proliferatum manifestó baja variabilidad. Independientemente del origen tres aislamientos de F. solani tuvieron el mismo patrón de bandas. Este trabajo representa la primer referencia en Argentina, de F. verticillioides como agente causal de podredumbre basal de cebolla en San Juan y de ajo en Mendoza. También se cita a F. compactum en cebolla, en Río Negro.Basal rot that affect both onion and garlic, is an importan! disease from different growing areas of Argentina. F. oxysporum f. sp. cepae was cited like the principal agent causal but other species of Fusarium are know producing this disease too. Eighty one isolations of Fusarium coming from Mendoza, San Juan, Buenos Aires and Río Negro, were characterized by macro and micro morphology on PDA and CLA. Fifty one isolates were identified as F. oxysporum, 16 as F proliferatum, 7 as F. verticillioides, 5 as F. solani, one as F. compactum and one Fusarium sp. F. oxysporum was the one most frequently isolated as !he causal agent for basal rot in onion and garlic. Diary growth rate were determined on PDA and differences were found among isolates, the average growth rate of isolates from onion was significantly greater !han !hose from garlic. high variability was determined between the isolates and among species. Pathogenicity was verified trough inoculations of root of onion plan! through 48 isolates from that vegetable were soaked in a suspension of 107 conidia per milliliter. This test proved variability between isolations and species. The pathogenicity of 21 isolates from garlic was tested by soaked of the roo! from garlic with a suspension of 107 conidia per milliliter and in injured garlic cloves by inoculation with suspension of 5 x 106 conidia per milliliter. Variability was found among isolates but not by species. Furthermore a significant association was determined testing the pathogenicity of the isolates on garlic plants and cloves. F. oxysporum, F. proliferatum, F. verticil/ioides, F. solani, F.compactum and Fusarium sp. were pathogen on onion whereas F. oxysporum, F. verticillioides and F. proliferatum showed pathogenicity on garlic plants and bulbs. By means of auxotrophic mutants from F. oxysporum obtained on PDC and MMC, complementation test were made. lt was determined that 28 isolates belonged to 7 VCG, meanwhile the remaining isolates were single member of a group. Moreover 5 isolates were self-incompatible. These result showed that F. oxysporum can belong to a special form cepae even though a substantial amount of variations among isolates. Association between VCG by source or by pathogenicity level was not found. Polymorphic patterns of band from each isolates were generated by ERI-PCR in all Fusarium species. This technique was enable to assess variability in the species, but not was helpful among them. A diversity degree was found by ERIC-PCR in F. oxysporum the results was the same that were obtain by VCG. F. verticillioides showed high genetic variability by ERIC-PCR technique it was opposite with F. proliferatum that sowed low variability. lndependently about the origin three isolates of F. solani from Mendoza, San Juan and Buenos Aires have got the same pattern of bands. Finally, it was reported at first time in Argentina, that F. verticillioides caused basal rot on onion from San Juan and on garlic from Mendoza and too for F. compactum on onion from Rio Negro.EEA La ConsultaFil: Salvalaggio, Andrea Eugenia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; Argentin

Temporal and spatial dynamics of Tomato spotted wilt virus and its vector in a potato crop in Argentina

The nature of spatial and temporal dynamics of Tomato spotted wilt virus (TSWV) and its vector in a potato crop cv. Innovator without insecticide application is analysed. Seed tuber was analysed for the presence of TSWV as a source of initial inoculum. The presence of plants with symptoms of TSWV was evaluated by visual observation and DAS-ELISA analysis to confirm the virus infection. Thrips species were collected from leaves and inflorescences and identified under stereomicroscope. The distribution of symptomatic plants and thrips species was recorded five times at 14 days intervals. The initial seed tuber infection was of 1.1%. Disease incidence was 0% at 29 days after planting (DAP), 0.2% at 43 DAP, 2.2% at 56 DAP, 11.6% at 70 DAP and 14.6% at 84 DAP. The progress of the disease was adequately described by a Logistic model [y=0.15/(1+1205372.93 × exp (−0.22 × DAP))]. Thrips vector species identified as resident in the crop during the whole cycle were Thrips tabaci (n=423), Frankliniella occidentalis (n=141) and as occasional species, F. schultzei (n=34) and F. gemina (n=5) were found. At 43 and 56 DAP a random distribution pattern was observed and the thrips species found were T. tabaci (n=188) and F. occidentalis (n=105). An aggregated pattern was determined at 70 and 84 DAP. Spatial patterns of the disease spread suggest a polycyclic epidemic with TSWV secondary spread in the potato crop. Multiple control measures were deduced from these epidemiological results like virus testing in tubers, removal of external virus infection sources and thrips control.EEA BalcarceFil: Salvalaggio, Andrea Eugenia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Lopez Lambertini, Paola Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Cendoya, Maria Gabriela. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Huarte, Marcelo Atilio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentin