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Sequenciamento dos transcritos de Piper nigrum L. infectada com Fusarium solani f.sp.piperis utilizando Plataforma de nova geração.
Neste trabalho nós extraímos o RNA total e isolamos o mRNA de raízes de Piper nigrum L. infectada com o fungo Fusarium solani f.sp. piperis na fase mais severa da infecção, para construção de uma biblioteca de fragmentos utilizando o método RNA-Seq. A biblioteca gerada foi sequenciada utilizando a plataforma de nova geração ?SOLiDTM 3 Plus System? (Applied Biosystems, EUA) produzindo 67.452.415 leituras com 50 pb. As leituras obtidas foram pré-processadas com softwares de Bioinformática para obtenção de leituras de alta qualidade. Para avaliar os dados pré-processados estatisticamente, foi utilizado o software FASTQC. Os resultados obtidos foram leituras com alta qualidade que serão usadas no processo de montagem, a fim de obter uma lista de transcritos de Planta expressos em resposta a infecção pelo patógeno
Estabelecimento de padrão genético molecular para sete cultivares de pimenteira-do-reino Piper nigrum L. (Piperaceae) utilizando microssatélite.
O Brasil, juntamente com países Asiáticos, compõe o grupo dos maiores exportadores de pimenta-do-reino, Piper nigrum L., especiaria mais consumida mundialmente. No Pará, estado com maior produção do país, cultiva-se em torno de quatro cultivares nas áreas de produção. Atualmente a identificação das cultivares plantadas é feita utilizando caracteres morfo-agronômicos. Contudo, há dificuldade de identificação das cultivares utilizadas comercialmente pelos produtores que recebem nomes diversos em áreas de produção. O objetivo desse trabalho foi estabelecer o padrão genético de cultivares de Piper nigrum L. utilizando marcadores moleculares microssatélites. A metodologia utilizada foi extração de DNA de plantas de sete cultivares conservadas no banco de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, amplificação de fragmentos utilizando nove loci microssatelites polimorficos e a genotipagem em gel desnaturante de poliacrilamida corado com prata, Os resultados mostraram diferenças entre as cultivares analisadas com nítidos agrupamentos distintos, sendo o método eficiente para estabelecer padrão genético molecular das cultivares de pimenteira-do-reino
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Performing knowledge requirements analysis for public organisations in a Virtual Learning Environment: a social network analysis approach
This paper describes an application of Social Network Analysis methods for identification of knowledge demands in public organisations. Affiliation networks established in a postgraduate programme were analysed. The course was executed in a distance education mode and its students worked on public agencies. Relations established among course participants were mediated through a virtual learning environment using Moodle. Data available in Moodle may be extracted using knowledge discovery in databases techniques. Potential degrees of closeness existing among different
organisations and among researched subjects were assessed. This suggests how organisations could cooperate for
knowledge management and also how to identify their common interests. The study points out that closeness among
organisations and research topics may be assessed through affiliation networks. This opens up opportunities for applying knowledge management between organisations and creating communities of practice. Concepts of knowledge
management and social network analysis provide the theoretical and methodological basis
Desenvolvimento vegetativo de genótipos superprecoces de milho inoculados com azospirillum brasilense em solos do semiárido.
O milho é uma cultura com grande importância para a região semiárida e tecnologias de baixo custo deve ser desenvolvidas para aumentar a produtividade da cultura na região. O objetivo deste trabalho foi avaliar o desenvolvimento vegetativo de plantas de milho de dois genótipos inoculados com Azospirillum brasilense em vasos com amostras de dois solos do Semiárido. Foram avaliados os genótipos BRS 4103 e BRS Caatingueiro, as estirpes Ab-V5 e Ab-6 em vasos com amostras de um Vertissolo e um Neossolo Flúvico. As bactérias foram crescidas em meio NFb líquido e inoculadas nas sementes de milho no momento do plantio. As plantas foram colhidas aos 40 dias após a emergência e foi avaliada a massa da parte aérea seca, o índice relativo de clorofila e a altura das plantas. As bactérias influenciaram positivamente o desenvolvimento vegetativo dos genótipos em ambos os solos estudados. O genótipo BRS 4103 quando inoculado a estirpe Ab-V6, chegando a apresentar índice relativo de clorofila igual ao apresentado pelo tratamento suplementado com N mineral para as plantas cultivadas em vasos com o amostras do Neossolo flúvico.Fertbio
Distâncias genéticas em equinos (Equus caballus) por meio de marcadores microssatélites.
A raça Marajoara é bastante difundida e utilizada nas fazendas da ilha de Marajó e está sendo mantida em conservação no Banco de Germoplasma Animal da Amazônia Oriental ? BAGAM, da Embrapa Amazônia Oriental, sendo altamente adaptada às condições climáticas e ao relevo que caracterizam essa região. Foram utilizadas amostras da raça Marajoara (54), Puruca (47),Mangalarga (30), Puro Sangue Inglês (47), Árabe (25), Pantaneiro (63) coletados no Brasil e Lusitano (93), Árabe (48), Asturcon (39), Pura Raça Espanhola (60), Puro Sangue Inglês (46), Losino(59), Mallorquina (30), Menorquina (69) e Potoka (27) coletados na Espanha. Foram utilizados 22iniciadores (HTG4, AHT4, HMS7, ASB2, ASB17, HMS6, ASB23, HTG10, HMS3, LEX33, T287, T294,T297, T301, T312, T321, T325, T333, T341, T394, T343 e T344) amplificados pelo método de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos da PCR foram separados em gel desnaturante de poliacrilamida 6%. Foram detectados 236 alelos, com média igual a 7,5 alelos/locus, variando entre 16 e 6 alelos. As médias de Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) e as heterozigosidades observadas (Ho) e esperadas (He), conforme as raças estudadas, foram respectivamente, 0,7610, 0,7873 e 0,7413. A estimativa da estatística F de Wright (1978) mostrou que a variação entre as raças foi maior (Fst 8,1%) do que dentro delas (Fis 0,78%), demonstrando que a diferenciação genética neste estudo foi maior entre as raças do que dentro de cada uma delas. Foram observados poucos desvios em relação ao equilíbrio de Hardy ? Weinberg. A menor distância genética observada foi entre a raça Marajoara e a Puruca seguida da Mangalarga. Os resultados sugerem que a raça Marajoara representa um grupo genético claramente distinto deoutras raças excetuando-se a Puruca que pode ser utilizada como reservatório de genes para esta, com razoável variabilidade genética. Medidas de conservação e manejo devem ser intensificadas nesse importante recurso genético brasileiro a fim de evitar a sua descaracterização e perda de identidade genética
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