Evaluation du pouvoir disjonctif des variables catégorielles impliquées dans la sélection du palmier à huile (Elaeis guineensis jacq.) en Côte d’Ivoire

En amélioration génétique du palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.), les variables catégorielles constituent une part majoritaire de l’information utilisée pour différencier, les populations de géniteurs issus du programme de sélection récurrente réciproque (SRR). Le pouvoir disjonctif de ces variables a été testé sur 134 géniteurs sélectionnés issus des populations du premier, deuxième et troisième cycle de SRR. Les variables catégorielles utilisées pour différencier ces populations sont celles qui ont permis d’avoir des informations sur les origines géographiques et les généalogies parentales des géniteurs. L’analyse factorielle de l’ensemble de ces variables catégorielles, a permis de déterminer le pouvoir disjonctif de chacun des deux principaux critères de divergences des populations de géniteurs sélectionnes. Le critère "origine géographique" a représenté 14 % d’expression de disjonction totale des populations de géniteurs sélectionnés. Le critère "généalogie parentale" a représenté 70 % d’expression de disjonction totale des populations de géniteurs sélectionnés. L’utilisation de ces deux critères de différenciation des populations de géniteurs sélectionnées peut constituer une bonne alternative à l’utilisation des données moléculaires dans les études de la diversité des populations de palmier à huile en sélection.Mots-clés : Palmier à huile, sélection, variable catégorielle, disjonction de populatio

Urinary tract infection among pregnant women at Bobo-Dioulasso: epidemiological and bacteriological aspects

Urinary tract infections are the first infections in pregnant women and can cause serious complications during pregnancy. In order to improve its management in low income country like Burkina Faso, we conducted a prospect cross-sectional study, to describe its epidemiological and biological aspects in pregnant women at Souro Sanou hospital at Bobo-Dioulasso (Burkina Faso).Epidemiologically, the frequency of urinary tract infection was 27.5% and affected mostly 21 to 30 years pregnant women. Bacteriologically, the main isolates found were: E. coli, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermis, Serratia, Acinetobacter, Enterobacter and Candida. The 81 isolates showed a good sensitivity to cephalosporin (C3G), aminoglycosides, oxacillin and erythromycin. These antibiotics are recommended for pregnant women before urinary cytobacteriological exam.Keywords: Antibiotic, Bobo-Dioulasso, E. coli, pregnant woman, urinary tract infection, urinary cytobacteriological exa

Studies on estimation of heterosis for striga resistance in maize test crosses in Mali

Open Access ArticleHeterosis for yield, secondary traits and Striga resistance was estimated in maize test crosses generated from fifteen inbred lines and three testers using line by tester analysis. Hybrids, testcrosses and parents were evaluated for two years at Agricultural Research Institute, Sotuba and Sanankoroba, to identify combinations expressing high hybrid vigor in Mali under Striga- infested and Striga-free conditions. Under Striga-free condition TZISTR106/TZISTR1230, TZISTR106/TZISTR1223 and TZISTR1033/ TZISTR1223 appeared as the best hybrids combinations with respect to grain yield, while combinations TZISTR1207/TZISTR1226, TZISTR106 /TZISTR112,TZISTR106 / TZISTR113 and TZISTR106/ TZISTR1028 showed positive mid parent heterosis for grain yield and negative mid parent heterosis for Striga related traits under Striga infestation. These hybrids are worthy for further utilization

Evaluation of the antimicrobial susceptibility testing process in clinical microbiology laboratories at Niamey, Niger

Background: Risk assessment is the means of identifying and evaluating potential errors or problems that may occur in testing process. The aim of this study was to perform risk assessment of antimicrobial susceptibility testing (AST) process in clinical microbiology laboratories of Niamey, Niger Republic.Methodology: We conducted a descriptive cross-sectional study from October 1 to December 31, 2019, to evaluate AST performance in seven clinical microbiology laboratories at Niamey, the capital city of Niger republic. The evaluation focused on the determination of the criticality index (CI) of each critical point (frequency of occurrence of anomalies, severity of the process anomaly, and detectability of the anomaly during the process) in the AST process and the performance of the AST through an observation sheet using two reference strains; Escherichia coli ATCC 25922 and Staphylococcus aureus ATCC 29213.Results: The criticality index (CI) was greater than 6 for most of the critical points related to material, medium, equipment, method and labour for the AST process in all the laboratories. A range of 18-100% errors on the inhibition zone diameters of the reference strains were observed. Major and/or minor categorization (Sensitive S, Intermediate I and Resistance R) discrepancies were found at all the laboratories for either one or both reference strains. The antibiotics most affected by the S/I/R discrepancies were trimethoprim (100%), vancomycin (100%), amoxicillin (80%) and amoxicillin + clavulanic acid (70%).Conclusion: This study showed a deficiency in the control of critical control points that impacts the performance of the AST reported by the laboratories in Niger. Corrective actions are needed to improve the performance of AST in clinical microbiology laboratories in Niger.   French title: Evaluation du processus de réalisation de l’antibiogramme dans les laboratoires d’analyses de biologie médicale de la ville de Niamey, Niger Contexte: L'évaluation des risques est le moyen d'identifier et d'évaluer les erreurs ou les problèmes potentiels qui peuvent survenir dans le processus de test. L'objectif de cette étude était de réaliser une évaluation des risques du processus d'antibiogramme (ABG) dans les laboratoires de microbiologie clinique de Niamey, en République du Niger.Méthodologie: Nous avons mené une étude transversale descriptive du 1er octobre au 31 décembre 2019 pour évaluer la performance des ABG dans sept laboratoires de microbiologie clinique à Niamey, capitale de la république du Niger. L'évaluation a porté sur la détermination de l'indice de criticité (IC) de chaque point critique (fréquence d'apparition des anomalies, gravité de l'anomalie du processus et détectabilité de l'anomalie au cours du processus) dans le processus et la performance des AGB à travers une fiche d'observation en utilisant deux souches de référence; Escherichia coli ATCC 25922 et Staphylococcus aureus ATCC 29213.Résultats: L'indice de criticité était supérieur à 6 pour la plupart des points critiques liés au matériel, au milieu, à l'équipement, à la méthode et à la main-d'oeuvre pour le processus AST dans tous les laboratoires. Une fourchette d'erreurs de 18 à 100% sur les diamètres des zones d'inhibition des souches de référence a été observée. Des écarts de catégorisation majeurs et/ou mineurs (Sensible: S, Intermédiaire: I et Résistance: R) ont été constatés dans tous les laboratoires pour l'une ou les deux souches de référence. Les  antibiotiques les plus touchés par les écarts S/I/R étaient la triméthoprime (100%), la vancomycine (100%), l'amoxicilline (80%) et l'amoxicilline + acide clavulanique (70%).Conclusion: Cette étude a montré une déficience dans le contrôle des points de contrôle critiques qui a un impact sur la performance de l'antibiogramme rapportée par les laboratoires au Niger. Des actions correctives sont nécessaires pour améliorer la performance des ABG dans les laboratoires de microbiologie clinique au Niger

H7N9 T-cell epitopes that mimic human sequences are less immunogenic and may induce Treg-mediated tolerance

Avian-origin H7N9 influenza is a novel influenza A virus (IAV) that emerged in humans in China in 2013. Using immunoinformatics tools, we identified several H7N9 T cell epitopes with T cell receptor (TCR)-facing residues identical to those of multiple epitopes from human proteins. We hypothesized that host tolerance to these peptides may impair T helper response and contribute to the low titer, weak hemagglutination inhibiting (HI) antibody responses and diminished seroconversion rates that have been observed in human H7N9 infections and vaccine trials. We found that the magnitude of human T effector responses to individual H7N9 peptides was inversely correlated with the peptide\u27s resemblance to self. Furthermore, a promiscuous T cell epitope from the hemagglutinin (HA) protein suppressed responses to other H7N9 peptides when co-administered in vitro. Along with other highly ‘human-like’ peptides from H7N9, this peptide was also shown to expand FoxP3+ regulatory T cells (Tregs). Thus, H7N9 may be camouflaged from effective human immune response by T cell epitope sequences that avert or regulate effector T cell responses through host tolerance

A Cross-Sectional Study to Assess HPV Knowledge and HPV Vaccine Acceptability in Mali

Despite a high prevalence of oncogenic human papilloma virus (HPV) infection and cervical cancer mortality, HPV vaccination is not currently available in Mali. Knowledge of HPV and cervical cancer in Mali, and thereby vaccine readiness, may be limited. Research staff visited homes in a radial pattern from a central location to recruit adolescent females and males aged 12–17 years and men and women aged ≥18 years (N = 51) in a peri-urban village of Bamako, Mali. Participants took part in structured interviews assessing knowledge, attitudes, and practices related to HPV, cervical cancer, and HPV vaccination. We found low levels of HPV and cervical cancer knowledge. While only 2.0% of respondents knew that HPV is a sexually transmitted infection (STI), 100% said they would be willing to receive HPV vaccination and would like the HPV vaccine to be available in Mali. Moreover, 74.5% said they would vaccinate their child(ren) against HPV. Men were found to have significantly greater autonomy in the decision to vaccinate themselves than women and adolescents (p = 0.005), a potential barrier to be addressed by immunization campaigns. HPV vaccination would be highly acceptable if the vaccine became widely available in Bamako, Mali. This study demonstrates the need for a significant investment in health education if truly informed consent is to be obtained for HPV vaccination. Potential HPV vaccination campaigns should provide more information about HPV and the vaccine. Barriers to vaccination, including the significantly lower ability of the majority of the target population to autonomously decide to get vaccinated, must also be addressed in future HPV vaccine campaigns

Utilisation des facteurs climatiques pour la surveillance de la fréquence des occurrences de méningite/ paludisme à Bamako

Objectif : Notre travail consiste à : Déterminer les périodes de risque pour la méningite et le paludisme à Bamako; Etablir une corrélation entre : - d’une part les paramètres météorologiques (température de l’air, humidité relative de l’air, pluviométrie, insolation et vitesse du vent) et la fréquence des occurrences de paludisme ; - d’autre part les mêmes paramètres pour la méningite. Méthode : Nous avons fait une étude rétrospective de l’évolution du paludisme et de la méningite en fonction de la variation des paramètres météorologiques (température de l’air, humidité relative de l’air, pluviométrie, insolation et vitesse du vent) à Bamako. Résultats : Le paludisme, rare au 1er et 2èm trimestres, est très fréquent au 3è trimestre et au 4è trimestre. Quant à la méningite elle est fréquente au premier semestre et rare pendant le reste de l’année. La fréquence du paludisme est liée à la température moyenne de l’air, à la grande humidité de l’air, à la pluviométrie abondante, à la faible insolation et à la faible vitesse du vent. La fréquente de la méningite est liée à la haute température de l’air, à la faible humidité de l’air, à la faible pluviométrie, à la forte insolation et à la grande vitesse du vent. Conclusion : La fréquence du paludisme est liée à la grande humidité, et à la faible insolation. Quant à la méningite, sa fréquence est liée à la haute température, à la grande vitesse du vent et à la forte insolation

Further Confirmation of Broadly Conserved, Highly Immunogenic Cross-Clade HIV CTL Epitopes for Inclusion in the GAIA HIV Vaccine

Poster Presentation From AIDS Vaccine 2012 Boston, MA, USA. 9-12 September 201

Dynamics of antigenemia and transmission intensity of Wuchereria bancrofti following cessation of mass drug administration in a formerly highly endemic region of Mali

Background After seven annual rounds of mass drug administration (MDA) in six Malian villages highly endemic for Wuchereria bancrofti (overall prevalence rate of 42.7%), treatment was discontinued in 2008. Surveillance was performed over the ensuing 5 years to detect recrudescence. Methods Circulating filarial antigen (CFA) was measured using immunochromatographic card tests (ICT) and Og4C3 ELISA in 6–7 year-olds. Antibody to the W. bancrofti infective larval stage (L3) antigen, Wb123, was tested in the same population in 2012. Microfilaraemia was assessed in ICT-positive subjects. Anopheles gambiae complex specimens were collected monthly using human landing catch (HLC) and pyrethrum spray catch (PSC). Anopheles gambiae complex infection with W. bancrofti was determined by dissection and reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) of mosquito pools. Results Annual CFA prevalence rates using ICT in children increased over time from 0% (0/289) in 2009 to 2.7% (8/301) in 2011, 3.9% (11/285) in 2012 and 4.5% (14/309) in 2013 (trend χ 2  = 11.85, df =3, P = 0.0006). Wb123 antibody positivity rates in 2013 were similar to the CFA prevalence by ELISA (5/285). Although two W. bancrofti-infected Anopheles were observed by dissection among 12,951 mosquitoes collected by HLC, none had L3 larvae when tested by L3-specific RT-PCR. No positive pools were detected among the mosquitoes collected by pyrethrum spray catch. Whereas ICT in 6–7 year-olds was the major surveillance tool, ICT positivity was also assessed in older children and adults (8–65 years old). CFA prevalence decreased in this group from 4.9% (39/800) to 3.5% (28/795) and 2.8% (50/1,812) in 2009, 2011 and 2012, respectively (trend χ 2  = 7.361, df =2, P = 0.0067). Some ICT-positive individuals were microfilaraemic in 2009 [2.6% (1/39)] and 2011 [8.3% (3/36)], but none were positive in 2012 or 2013. Conclusion Although ICT rates in children increased over the 5-year surveillance period, the decrease in ICT prevalence in the older group suggests a reduction in transmission intensity. This was consistent with the failure to detect infective mosquitoes or microfilaraemia. The threshold of ICT positivity in children may need to be re-assessed and other adjunct surveillance tools considered