Random regression models for growth trait in Guzerá cattle

O objetivo do presente trabalho foi estimar componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos para características de pesos do nascimento ao sobreano (550 dias de idade) para bovinos da raça Guzerá, por meio de modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais (machos e fêmeas) nascidos entre 1993 e 2011 e pertencentes a dez fazendas de sete estados brasileiros. O modelo de melhor ajuste considerou os efeitos genéticos aditivos diretos e maternos e os de ambiente permanente do animal ajustado usando polinômios ortogonais de Legendre de quarta, terceira e segunda ordem, respectivamente. As maiores estimativas de herdabilidade diretas foram observadas para os pesos ao nascimento (0,88) e ao sobreano (0,70). As correlações genéticas foram de moderada a alta magnitude, mantendo-se elevada mesmo com o aumento da distância entre as idades.The aim of this study was to estimate (co)variance components and genetic parameters from birth to yearling weight (550 days of age) in Guzerá cattle, using random regression models. Data set from animals (male and female) born between 1993 and 2011 belonging to ten farms in seven Brazilian States were used. The best-fit model considering direct and maternal genetic effect and permanent environmental animal effect were adjusted by fourth, third, and second order, respectively, using orthogonal polynomials of Legendre. The higher estimated values of direct heritability were observed in birth (0.88) and yearling weight (0.70). The genetic correlations were moderate to high magnitude, remaining up even with the increase in the ages gap

Genetic analysis for visual scores of bovines with the linear and threshold bayesian models

O objetivo deste trabalho foi comparar as estimativas de parâmetros genéticos obtidas em análises bayesianas uni-característica e bi-característica, em modelo animal linear e de limiar, considerando-se as características categóricas morfológicas de bovinos da raça Nelore. Os dados de musculosidade, estrutura física e conformação foram obtidos entre 2000 e 2005, em 3.864 animais de 13 fazendas participantes do Programa Nelore Brasil. Foram realizadas análises bayesianas uni e bi-características, em modelos de limiar e linear. De modo geral, os modelos de limiar e linear foram eficientes na estimação dos parâmetros genéticos para escores visuais em análises bayesianas uni-características. Nas análises bi-características, observou-se que: com utilização de dados contínuos e categóricos, o modelo de limiar proporcionou estimativas de correlação genética de maior magnitude do que aquelas do modelo linear; e com o uso de dados categóricos, as estimativas de herdabilidade foram semelhantes. A vantagem do modelo linear foi o menor tempo gasto no processamento das análises. Na avaliação genética de animais para escores visuais, o uso do modelo de limiar ou linear não influenciou a classificação dos animais, quanto aos valores genéticos preditos, o que indica que ambos os modelos podem ser utilizados em programas de melhoramento genético.The objective of this work was to compare the estimates of genetic parameters obtained in single-trait and two-trait bayesian analyses, under linear and threshold animal models, considering categorical morphological traits of bovines of the Nelore breed. Data of musculature, physical structure and conformation were obtained between years 2000 and 2005, from 3,864 bovines of the Nelore breed from 13 participant farms of the Nelore Brazil Program. Single-trait and two-trait bayesian analyses were performed under linear and threshold animal models. In general, the linear and threshold models were efficient in estimating genetic parameters for visual scores under single-trait bayesian analyses. In the two-trait analyses, it was observed that: using continuous and categorical data, the threshold model provided greater estimates of genetic correlation than those of the linear model; with categorical data, the heritability estimates were similar. One major advantage of the linear models was its smaller requirements in the analyses processing time. In the genetic evaluation of animals for visual scores, the use of the linear or threshold model did not influence the classification of the animals, based on their predicted breeding values, which suggests that both models can be used in genetic improvement programs

Association between MUC1 gene polymorphism and expected progeny differences in Nelore cattle (Bos primigenius indicus)

MUC1 is a heavily glycosylated mammalian transmembrane protein expressed by mucosal secretory tissues for both protection against microbial infection and lubrication. An important characteristic of MUC1 is its variable number of tandem repeats (VNTR) containing several sites for O-glycosylation. VNTR length has been associated with many human diseases and with certain economically important traits in domestic ruminants. The aim of the present study was to correlate the length of MUC1 gene VNTR with expected progeny differences (EPDs) obtained for growth, fertility and carcass traits. Five alleles were identified, with alleles containing short VNTRs being more frequent than those with long, thereby demonstrating that Brazilian Nelore cattle are characterized by high frequencies in short MUC1 VNTRs. Statistical analyses revealed there to be no significant association between VNTR length and EPDs for weight at 120 days (W120 ), scrotal circumference at 365 (SC 365 ) and 450 (SC 450 ) days, age at first calving (AFC), and rib eye area (REA)

Características reprodutivas como causa de variação na produção de leite

Foram analisados registros de produção de 864 vacas da raça holandesa, criadas em Pindamonhangaba, SP, coletados entre 1962 e 1978, com o objetivo de verificar as influências da duração da gestação, do intervalo entre partos que precede a lactação e do período de serviço da lactação em curso sobre as produções de leite e gordura. As médias não ajustadas das produções de leite, gordura e porcentagem de gordura para 2.987 observações em 318 dias de lactação e duas ordenhas foram: 4.456 ± 28kg (CV = 34%); 165,0 ± 1,1kg (CV = 32%) e 3,60±0,01% (CV =11%) respectivamente. As médias para as variáveis continuas independentes foram: 278 ± 0,6 dias, 438 ± 2,1 dias e 160 ± 2,0 dias para o período de gestação (PG), intervalo entre partos (IEP), e período de serviço (PS) respectivamente. As análises de variância, efetuadas pelo método dos quadrados mínimos, incluíram no modelo estatístico além das características reprodutivas já mencionadas, os seguintes efeitos: sexo da progênie, mês e ano de parição, idade da vaca e duração da lactação (efeitos linear, quadrático e cúbico). Houve influência significativa de todos os efeitos incluídos no modelo, com exceção do sexo da progênie e do período de gestação. As equações linear e quadrática foram as que melhor descreveram o efeito do IEP sobre as produções de leite e de gordura, enquanto as equações quadrática e cúbica evidenciaram o efeito do PS sobre a produção de leite. De modo geral, verificou-se um aumento nas produções com o prolongamento do IEP que precede a lactação até cerca dos 400 dias e do PS da lactação em curso, ocorrendo um incremento até 150 dias, não mostrando a partir daí qualquer tendência definida

Parâmetros genéticos para características de crescimento em zebu de corte

Los bovinos de origen indiano (Bos indicus) están distribuidos casi exclusivamente en las regiones tropicales del globo terráqueo debido, principalmente, a su gran adaptabilidad a las altas temperaturas, resistencia a la alta incidencia de ecto y endoparásitos y pobres condiciones de manejo y alimentación. Estas características son determinadas por la coloración del pelaje y la piel, conformación, capacidad genética para conservar el equilibrio térmico y para la utilización de pastos y forrajes con mayor eficiencia.  El potencial para ganancia genética en características económicamente importantes de los animales domésticos, como bovinos de carne, resulta altamente dependiente de la magnitud de las varianzas y covarianzas genéticas y de las heredabilidades de las características consideradas en la selección. Los parámetros genéticos son necesarios para predecir las respuestas directa y correlacionada a la selección, en la elaboración de índices de selección y en la predicción del valor genético de los animales. El objetivo de esta revisión es hacer un levantamiento acerca de publicaciones sobre la variabilidad genética de caracteres de crecimiento en poblaciones bovinas de origen indiano, proporcionando valores ponderados de los estimados de parámetros genéticos, los cuales podrán auxiliar en la proyección de programas de selección en regiones tropicales.Bovines of Indian origin (Bos indicus) are distributed almost exclusively in the tropical regions of the globe, mainly due to their great adaptability to high temperatures, resistance to the high incidence of ecto and endoparasites and poor handling and feeding conditions. These characteristics are determined by the color of the coat and skin, conformation, genetic capacity to preserve thermal balance and to use pastures and forages more efficiently. The potential for genetic gain in economically important characteristics of domestic animals, such as beef cattle, is highly dependent on the magnitude of the genetic variances and covariances and the heritability of the characteristics considered in the selection. Genetic parameters are necessary to predict the direct and correlated responses to selection, in the elaboration of selection indices and in the prediction of the genetic value of animals. The objective of this review is to make a survey about publications on the genetic variability of growth traits in bovine populations of Indian origin, providing weighted values ​​of the estimates of genetic parameters, which may help in the projection of selection programs in tropical regions.Os bovinos de origem indiana (Bos indicus) distribuem-se quase exclusivamente nas regiões tropicais do globo, principalmente devido a sua grande adaptabilidade a altas temperaturas, resistência à alta incidência de ecto e endoparasitas e más condições de manejo e alimentação. Essas características são determinadas pela cor da pelagem e da pele, conformação, capacidade genética de preservar o equilíbrio térmico e de utilizar pastagens e forragens de forma mais eficiente. O potencial de ganho genético em características economicamente importantes de animais domésticos, como bovinos de corte, é altamente dependente da magnitude das variâncias e covariâncias genéticas e da herdabilidade das características consideradas na seleção. Parâmetros genéticos são necessários para predizer as respostas diretas e correlacionadas à seleção, na elaboração de índices de seleção e na predição do valor genético dos animais. O objetivo desta revisão é fazer um levantamento das publicações sobre a variabilidade genética de caracteres de crescimento em populações bovinas de origem indígena, fornecendo valores ponderados das estimativas de parâmetros genéticos, que podem auxiliar na projeção de programas de seleção em regiões tropicais

Características reprodutivas como causa de variação na produção de leite

Foram analisados registros de produção de 864 vacas da raça holandesa, criadas em Pindamonhangaba, SP, coletados entre 1962 e 1978, com o objetivo de verificar as influências da duração da gestação, do intervalo entre partos que precede a lactação e do período de serviço da lactação em curso sobre as produções de leite e gordura. As médias não ajustadas das produções de leite, gordura e porcentagem de gordura para 2.987 observações em 318 dias de lactação e duas ordenhas foram: 4.456 ± 28kg (CV = 34%); 165,0 ± 1,1kg (CV = 32%) e 3,60±0,01% (CV =11%) respectivamente. As médias para as variáveis continuas independentes foram: 278 ± 0,6 dias, 438 ± 2,1 dias e 160 ± 2,0 dias para o período de gestação (PG), intervalo entre partos (IEP), e período de serviço (PS) respectivamente. As análises de variância, efetuadas pelo método dos quadrados mínimos, incluíram no modelo estatístico além das características reprodutivas já mencionadas, os seguintes efeitos: sexo da progênie, mês e ano de parição, idade da vaca e duração da lactação (efeitos linear, quadrático e cúbico). Houve influência significativa de todos os efeitos incluídos no modelo, com exceção do sexo da progênie e do período de gestação. As equações linear e quadrática foram as que melhor descreveram o efeito do IEP sobre as produções de leite e de gordura, enquanto as equações quadrática e cúbica evidenciaram o efeito do PS sobre a produção de leite. De modo geral, verificou-se um aumento nas produções com o prolongamento do IEP que precede a lactação até cerca dos 400 dias e do PS da lactação em curso, ocorrendo um incremento até 150 dias, não mostrando a partir daí qualquer tendência definida

Efeito de diferentes modelos sobre as estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos para pesos até a desmama em gado nelore

v. 14,n. 2, p.151-158, abr./jun. 2013.Submitted by Marlene Santos ([email protected]) on 2013-08-01T21:49:10Z No. of bitstreams: 1 13571-105721-2-PB.pdf: 352262 bytes, checksum: c10dd3b2930fb1ffe21d0bf5b2740416 (MD5)Approved for entry into archive by Claudia Moura ([email protected]) on 2013-08-09T19:17:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 13571-105721-2-PB.pdf: 352262 bytes, checksum: c10dd3b2930fb1ffe21d0bf5b2740416 (MD5)Made available in DSpace on 2013-08-09T19:17:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 13571-105721-2-PB.pdf: 352262 bytes, checksum: c10dd3b2930fb1ffe21d0bf5b2740416 (MD5) Previous issue date: 2013-06CAPES/CNPq; Programa de Apoio às Publicações Periódicas Científicas (PROAPUPEC) da UFGWe used actual and adjusted weights to 120 d and 210 d of age of 72,731 male and female Nellore calves born in 40 PMGRN - Nellore Brazil herds from 1985 to 2005 aiming to compare the effect of different definitions of contemporary groups on estimates of (co)variance and genetic parameters. Four models, each one with a different structure of contemporary group (CG), were compared using the Akaike Information Criterion (AIC), the Bayesian Information Criterion (BIC), and the Consistent Akaike Information Criterion (CAIC). (Co)variance estimates were obtained using a derivative-free restricted maximum likelihood procedure. Estimates of (co)variances and genetic parameters were similar for the four models considered. However, the BIC and CAIC indicated that the most appropriate model for this Nellore population was the one that considered CG to be random, and sex of calf to be fixed and separate from CG, in which CG was defined as the group of calves born in the same herd, year, season of birth (trimester), and undergone the same management. _______________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT _______________________________________________________________________________________________________________________ Com o objetivo de se comparar o ajustamento de modelos com diferentes definições de grupos contemporâneos sobre as estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos para pesos padronizados e reais aos 120 e 210 dias de idade, analisaram-se dados de 72.731 bezerros Nelore, machos e fêmeas, nascidos de 1985 a 2005 em 40 rebanhos integrantes do PMGRN - Nelore Brasil. Foram comparados quatro modelos incluindo diferentes estruturas de grupos contemporâneos (CG), julgados pelos critérios de informação de Akaike, Bayesiano e modificado de Akaike. As estimativas foram obtidas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas. As estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos foram similares entre os modelos, porém os critérios de informação (BIC, CAIC) indicaram que o modelo mais adequado é o que considera o grupo contemporâneo como efeito aleatório, sendo este constituído pela concatenação dos efeitos de rebanho, ano de nascimento, grupo de manejo e efeito sazonal de trimestre de nascimento, e com efeito do sexo do bezerro independente do CG

Effects of age at first calving, gestation length and dry period on milk yield in a Gyr herd

Relationships of several reproductve traits and milk yield were studied in 716 Gyr cows at Sant'Ana da Serra farm, Mococa, State of São Paulo, a humid tropical climate region. Mean age at first calving was 49.8 +/- 0.4 months, with a coeficient of cariation (C. V.) of 20.8%. Only year of parturition significantly affected age at first calving (P < 0.01). Heritability, estimated from paternal half-sib correlations, was 0.91 +/- 0.20, a value considered unrealistically high. Overall mean gestation length was 287.7 +/- 0.5 days (C. V. = 3.3%) for 419 observations, with month and year of parturition having significant effects. Heritability estimate was 0.30 +/- 0.14. Overall mean dry period for 1.276 observations was 238 +/- 3 days (C. V. = 48%); repeatability estimate was 0.19 +/- 0.06. Estimated annual genetic trend for dry period was -0.6 days, phenotypic trend was 11.5 days, and environmental trend, 12.1 days. Month and year of parturition and cow age had no significant effect on dry period. Highest milk yield was obtained at fourth lactation. The gross correlation between milk yield and gestation period was 0.11, and between previous dry period and subsequent milk yield, 0.16. Normal gestations of 285 to 290 days were associated with higher milk yields. Milk yield increased as dry period advanced from 30 to 390 days, and declined as dry period continued beyond 390 days. Delays in first mating and a more extensive dry period decreased reproductive efficiency in the herd studied.Visando detectar a influência de alguns caracteres reprodutivos sobre a produção leiteira de vacas Gir, foram estudadas 716 vacas da Fazenda Sant'Ana da Serra, localizada em Mococa, SP, em região de clima tropical úmido. A média da idade ao primeiro parto foi de 49,8 +/- 0,4 meses, com um coeficiente de variação (C. V.) de 20,8%. Apenas o efeito de ano da parição influenciou significativamente (P < 0,01) a idade ao primeiro parto. A estimativa de herdabilidade foi de 0,91 +/- 0,20, considerada irrealista. A média para o período de gestação foi de 287,7 +/- 0,5 dias (C. V. = 3,3%), para 419 observações havendo influência significativa de mês e ano do parto. A estimativa de herdabilidade foi 0,30 +/- 0,14. A média geral do período seco, para 1.276 observações foi de 238 +/- 3 dias (C. V. = 48%). O coeficiente de repetibilidade foi 0,19 +/- 0,06. A tendência genética anual estimadas para o período seco foi de -0,6 dias; a fenotípica foi de 11,5 dias e a ambiente, de 12,1 dias. Não houve significância dos efeitos de mês e ano do parto, e idade da vaca sobre o período seco. A maior produção de leite foi obtida na quarta lactação. A correlação entre produção de leite e período de gestação foi de 0,11 enquanto que entre o período seco anterior e a subsequente produção de leite foi de 0,16. Observou-se que entre as gestações normais, entre 285 e 290 dias, estavam associadas às melhores produções de leite. A produção leiteira aumentou à medida que se alongava o período seco de 30 até 390 dias, decaindo novamente com o seu alongamento. O atraso nas primeiras cobrições e o período seco mais extenso diminuem a eficiência reprodutiva no rebanho estudado