Avaliação de genótipos de cana-de-açúcar para início de safra na microrregião Centro de Pernambuco

As diferentes respostas dos genótipos de cana-de-açúcar (Saccharum spp.), em relação à produtividade, quando submetidos a mudanças nos diferentes ciclos de colheita, representam problema para os agricultores e grande desafio para os melhoristas, sendo de interesse comum a identificação e obtenção de variedades que apresentem como características alta produtividade agroindustrial, ampla estabilidade, longevidade e excelente viabilidade econômica em sua exploração comercial. Objetivou-se, com este trabalho, avaliar o desempenho agroindustrial de 11 clones e 15 variedades de cana-de-açúcar, na microrregião canavieira da Zona Centro de Pernambuco, considerando-se os cultivos de cana planta, soca e ressoca, e eleger os genótipos mais produtivos. O experimento foi conduzido na área agrícola da Usina Petribú, município de Lagoa de Itaenga. Utilizou-se o delineamento experimental de blocos casualizados, com quatro repetições. Foram avaliadas as variáveis toneladas de pol por hectare (TPH), toneladas de cana por hectare (TCH), fibra (FIB), pol % corrigida (PCC), pureza (PZA), teor de sólidos solúveis (BRIX) e açúcar total recuperável (ATR). Pela análise de variância, foram detectadas diferenças significativas entre os genótipos, indicando variabilidade genética. A alta estimativa da herdabilidade média para a variável TCH indicou elevada possibilidade de êxito na seleção, baseando-se neste importante componente de produção. Por meio da análise econômica, constata-se que as variedades RB92579 e RB93509 apresentam melhor desempenho para colheita no início da safra

Adaptabilidade e estabilidade fenotípica de cultivares de alface do grupo crespa em cultivo hidropônico Adaptability and phenotypic stability of crisp lettuce cultivars in hydroponics

Considerando as diferentes estações climáticas em que a alface é cultivada durante o ano, é de se esperar a ocorrência de uma elevada interação genótipo x ambiente. Em função disto, neste trabalho estudou-se o desempenho produtivo, adaptabilidade e estabilidade fenotípica de seis cultivares de alface do grupo crespa (Deisy, Elba, Sabrina, Summer Green, Vera e Verônica), em sistema hidropônico NFT, instalado em casa-de-vegetação, na Universidade de Marília (SP). Foram conduzidos nove ensaios em três épocas (outono: Out n; inverno: Inv n e; primavera: Pri n), em delineamento inteiramente casualizado, com quatro repetições, avaliando-se quatro plantas por parcela. Ocorreram diferenças significativas entre ambientes (épocas de semeadura). Verificou-se que, de maneira geral, os três plantios realizados no outono apresentaram valores médios de produtividade (Out1 = 3,1; Out2 = 5,3 e; Out3 = 4,6 kg m²) superiores aos realizados no inverno (Inv1 = 3,6; Inv2 = 3,5 e; Inv = 3,7 kg m²) e primavera (Pri1 = 4,0; Pri2 = 3,6 e; Pri3 = 3,2 kg m²). Embora a interação cultivares x ambientes também tenha sido significativa, para produtividade, à exceção dos ambientes Inv3 e Pri1, não ocorreram diferenças significativas entre as cultivares dentro de cada época de plantio e, para número de folhas por planta, ocorreram diferenças significativas entre as cultivares somente no ambiente Out3. As cultivares Deyse e Verônica foram as únicas a mostrarem adaptabilidade a todos ambientes estudados para produtividade; todas as cultivares apresentaram instabilidade para essa mesma característica. Para o número de folhas por planta, somente a cultivar Summer Green apresentou comportamento altamente previsível (estável), no entanto, mostrou-se adaptada somente aos ambientes desfavoráveis.<br>Considering the climatic seasons in which lettuce is cultivated, probably a high interaction genotype x environment could be obtained. The yield, adaptability and phenotypic stability of six lettuce cultivars of the crisp group (Deyse, Elba, Sabrina, Summer Green, Vera and Verônica) were evaluated, on hydroponic 'NFT'. Nine experiments were carried out in three seasons (autumn= Out n, winter= Inv n and spring= Pri n), in a completely randomized design with four replications, evaluating four plants in each teatment. There occurred significant differences among environments (sowing date). Planting in autumn presented higher yield (Out1 = 3,1; Out2 = 5,3 and; Out3 = 4,6 kg m²) than winter (Inv1 = 3,6; Inv2 = 3,5 and; Inv = 3,7 kg m²) or spring (Pri1 = 4,0; Pri2 = 3,6 and; Pri3 = 3,2 kg m²). Although the significant differences in the interaction cultivars x environment for yield, except for Inv3 and Pri1, there were no significant differences among cultivars in each planting season. Significant differences were found among cultivars only in Out3, for the number of leaves in each plant. Cultivars Deyse and Verônica were the only ones well adapted in both environments for yield, the other cultivars being unstable. Only Summer Green presented behavior highly previsible (stable) for number of leaves per plant, nevertheless, showed adaptability only in unfavorable environments

Genome-Wide Search for Gene-Gene Interactions in Colorectal Cancer

Genome-wide association studies (GWAS) have successfully identified a number of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with colorectal cancer (CRC) risk. However, these susceptibility loci known today explain only a small fraction of the genetic risk. Gene-gene interaction (GxG) is considered to be one source of the missing heritability. To address this, we performed a genome-wide search for pair-wise GxG associated with CRC risk using 8,380 cases and 10,558 controls in the discovery phase and 2,527 cases and 2,658 controls in the replication phase. We developed a simple, but powerful method for testing interaction, which we term the Average Risk Due to Interaction (ARDI). With this method, we conducted a genome-wide search to identify SNPs showing evidence for GxG with previously identified CRC susceptibility loci from 14 independent regions. We also conducted a genome-wide search for GxG using the marginal association screening and examining interaction among SNPs that pass the screening threshold (p<10(-4)). For the known locus rs10795668 (10p14), we found an interacting SNP rs367615 (5q21) with replication p = 0.01 and combined p = 4.19×10(-8). Among the top marginal SNPs after LD pruning (n = 163), we identified an interaction between rs1571218 (20p12.3) and rs10879357 (12q21.1) (nominal combined p = 2.51×10(-6); Bonferroni adjusted p = 0.03). Our study represents the first comprehensive search for GxG in CRC, and our results may provide new insight into the genetic etiology of CRC

Identification of Genetic Susceptibility Loci for Colorectal Tumors in a Genome-Wide Meta-analysis

BACKGROUND & AIMS: Heritable factors contribute to the development of colorectal cancer. Identifying the genetic loci associated with colorectal tumor formation could elucidate the mechanisms of pathogenesis. METHODS: We conducted a genome-wide association study that included 14 studies, 12,696 cases of colorectal tumors (11,870 cancer, 826 adenoma), and 15,113 controls of European descent. The 10 most statistically significant, previously unreported findings were followed up in 6 studies; these included 3056 colorectal tumor cases (2098 cancer, 958 adenoma) and 6658 controls of European and Asian descent. RESULTS: Based on the combined analysis, we identified a locus that reached the conventional genome-wide significance level at less than 5.0 × 10(-8): an intergenic region on chromosome 2q32.3, close to nucleic acid binding protein 1 (most significant single nucleotide polymorphism: rs11903757; odds ratio [OR], 1.15 per risk allele; P = 3.7 × 10(-8)). We also found evidence for 3 additional loci with P values less than 5.0 × 10(-7): a locus within the laminin gamma 1 gene on chromosome 1q25.3 (rs10911251; OR, 1.10 per risk allele; P = 9.5 × 10(-8)), a locus within the cyclin D2 gene on chromosome 12p13.32 (rs3217810 per risk allele; OR, 0.84; P = 5.9 × 10(-8)), and a locus in the T-box 3 gene on chromosome 12q24.21 (rs59336; OR, 0.91 per risk allele; P = 3.7 × 10(-7)). CONCLUSIONS: In a large genome-wide association study, we associated polymorphisms close to nucleic acid binding protein 1 (which encodes a DNA-binding protein involved in DNA repair) with colorectal tumor risk. We also provided evidence for an association between colorectal tumor risk and polymorphisms in laminin gamma 1 (this is the second gene in the laminin family to be associated with colorectal cancers), cyclin D2 (which encodes for cyclin D2), and T-box 3 (which encodes a T-box transcription factor and is a target of Wnt signaling to β-catenin). The roles of these genes and their products in cancer pathogenesis warrant further investigation