Systematic and Evolutionary Insights Derived from mtDNA COI Barcode Diversity in the Decapoda (Crustacea: Malacostraca)

Background: Decapods are the most recognizable of all crustaceans and comprise a dominant group of benthic invertebrates of the continental shelf and slope, including many species of economic importance. Of the 17635 morphologically described Decapoda species, only 5.4% are represented by COI barcode region sequences. It therefore remains a challenge to compile regional databases that identify and analyse the extent and patterns of decapod diversity throughout the world. Methodology/Principal Findings: We contributed 101 decapod species from the North East Atlantic, the Gulf of Cadiz and the Mediterranean Sea, of which 81 species represent novel COI records. Within the newly-generated dataset, 3.6% of the species barcodes conflicted with the assigned morphological taxonomic identification, highlighting both the apparent taxonomic ambiguity among certain groups, and the need for an accelerated and independent taxonomic approach. Using the combined COI barcode projects from the Barcode of Life Database, we provide the most comprehensive COI data set so far examined for the Order (1572 sequences of 528 species, 213 genera, and 67 families). Patterns within families show a general predicted molecular hierarchy, but the scale of divergence at each taxonomic level appears to vary extensively between families. The range values of mean K2P distance observed were: within species 0.285% to 1.375%, within genus 6.376% to 20.924% and within family 11.392% to 25.617%. Nucleotide composition varied greatly across decapods, ranging from 30.8 % to 49.4 % GC content. Conclusions/Significance: Decapod biological diversity was quantified by identifying putative cryptic species allowing a rapid assessment of taxon diversity in groups that have until now received limited morphological and systematic examination. We highlight taxonomic groups or species with unusual nucleotide composition or evolutionary rates. Such data are relevant to strategies for conservation of existing decapod biodiversity, as well as elucidating the mechanisms and constraints shaping the patterns observed.FCT - SFRH/BD/25568/ 2006EC FP6 - GOCE-CT-2005-511234 HERMESFCT - PTDC/MAR/69892/2006 LusomarBo

Crustáceos del Mediterráneo (Decápodos macruros) Nephrops norvegicus Linné, var. Meridionalis

1 pageEl Dr. ZARIQUIEY presenta un treball del seu pare titulat Crustáceos del Mediterráneo (Decápodos macruros) Nephrops norvegicus Linné, var. Meridionali

Publicaciones del Instituto de Biología Aplicada. Tomos 8-9

[Tomo 8] Materiales para la hidrobiología de la Isla de Ibiza, por R. Margalef. Sobre la biología de las Sacjitta del plancton del Levante español, por M. Massuti Oliver. Sobre la microfauna de las aguas dulces de diversos países extraeuropeos, por Vicenz Brehm. Contribución al estudio de lostintínidos del plancton de las costas de Castellón (Mediterráneo occidental), por Miguel Duran. Plancton recogido por los Laboratorios Costeros, II. - Plancton de Blanes desde octubre de 1949 hasta junio de 1950, por E. Morales. Datos para el estudio del ciclo biológico de Zicrona coerulea L., por E. Balcells R. Un sincárido del género Parabathynella en las Baleares, por R. Margalef. Nota complementaria al artículo "Algunos crustáceos interesantes de las aguas dulces y salobres de España, por Ramón Margalef. Peces notables del litoral de Blanes, II, por P. Arte. Nota sobre la talla y la evolución sexual de las sardinas de la Costa Brava(septiembre de 1949 a septiembre de 1950) por Carlos Bas y Enrique Morales. Nota sobre los peces costeros jóvenes capturados "a l'art" durante los meses de agosto y septiembre de 1950 en el litoral de Blanes, por Manuel Rubio. El ciclo biológico de Dicranura vinula, L. y Smerinthus populi, L., en el Vallés oriental (Barcelona), por F. Balcells R. Análisis polínico del aire de Barcelona, I, por Pedro Montserrat. La pesca marítima en Castellón. - Rendimiento por unidad de esfuerzo (1945-1949) y consideraciones biométricas de las especies de interés comercial, por B. Andreu y J. Rodríguez Roda.[Tomo 9] Diversidad de especies en las comunidades naturales, por R. Margalef. Observaciones sobre la sardina (Sardina pilchardus, Walb.) de la costa vizcaína (Octubre - noviembre 1950), por M. G. Larrañeta. Plancton recogido por los Laboratorios Costeros, III. - Fitoplancton de las costas de Castellón durante el año 1950, por R. Margalef. Globigerina "ratio". — Su distribución y complejidad en los mares Terciarios alrededor de la Meseta Castellana, por Guillermo Colom. Ciclo anual del fitoplancton marino en la costa NE. de la Península Ibérica, por R. Margalef. Sobre la puesta de la anchoa Engraulis encrasicholus L. en el Levante español, por A. Planas y F. Vives. Decápodos españoles. IV. — Sobre el género Porcellana Lamarck, 1801, por Ricardo Zariquiey Alvarez. Comprobación de rendimiento lácteo durante los años 1946 a 1949. — Correlación entre el peso vivo y la productividad por José Ferrer Palaus y José Valle Arribas. . . Sobre la utilización directa de un agua de mar cualquiera como agua patrón auxiliar para la determinación de la clorinidad de las aguas marinas, por R. Toll, J. M.ª Valles y F. Saiz. Sobre el empleo como disolución standard para la determinación de la clorinidad de las aguas del mar, de una disolución de cloruro sódico de igual Cl/1 litro que el del agua internacional, por R. Toll y J. M.a Vallés. Datos para una crítica del significado de la media vertebral de las poblaciones de la sardina (Sardina pilchardus Walb.) por J. Rodríguez-Roda, M. G. Larrañeta, R. Margalef y B. Andreu. Estudio comparativo del ciclo sexual, engrasamiento y repleción estomacal de la sardina, alacha y anchoa del mar Catalán, acompañado de relación de pescas de huevos planctónicos de estas especies, por B. Andreu y J. Rodríguez-Roda. Datos climáticos del puerto de Castellón (1949-1950) y térmicos de las águás costeras superficiales (marzo 1950-marzo 1951), en relación con la pesca, por B. Andreu y J. Rodríguez-Roda. Observaciones sobre Triops (= Apus) cancriformis de una localidad catalana, por Ramón Margalef. Sobre Gammarus interesantes de España, por R. Margalef.Peer reviewe