Diversidade genética da soja entre períodos e entre programas de melhoramento no Brasil.

O objetivo deste trabalho foi detectar os efeitos do melhoramento sobre a diversidade do germoplasma da soja cultivada nas três ultimas décadas, por meio da comparação de seis programas de melhoramento e períodos de lançamento de cultivares, utilizando locos microssatélites. Em relação aos programas de melhoramento, todos os locos apresentaram diferenças significativas em suas distribuições alélicas. Alguns locos eram compostos de alelos exclusivos em alguns programas de melhoramento, enquanto outros foram compostos sempre dos mesmos alelos em maior freqüência para todos os programas. A AMOVA indicou maior porção da variância devido a cultivares dentro de programas e somente 5,3% (p0,05). Os resultados sugerem que o germoplasma de soja utilizado em programas de melhoramento no Brasil manteve nível constante de diversidade genética nos últimos 30 anos, além de relativa heterogeneidade de determinados programas.Nome correto do quarto autor ARANTES, N. E

Obtenção de marcadores moleculares por meio de PCR-RFLP de genes relacionados com qualidade em café.

A qualidade de bebida do café é fator fundamental para sua comercialização, pois agrega valor ao produto, garantindo maior competitividade e melhores preços no mercado. A composição química do café é um dos fatores que determinam a qualidade da bebida. Seu sabor e seu aroma são resultantes da presença combinada de vários constituintes, dentre os quais os ácidos clorogênicos, os diterpenos e os açúcares. O objetivo deste trabalho foi buscar polimorfismos a partir de PCR-RFLP utilizando primers baseados em sequências ESTs de genes relacionados com a qualidade de bebida. Para isso foi utilizado o DNA de uma população F2 formada a partir da autofecundação de um híbrido interespecífico de Coffea arabica e C. canephora. Os resultados revelaram um total de doze marcas polimórficas na população. Dentre essas marcas, quatro foram obtidas através da presença e da ausência da amplificação dos genes. Oito combinações polimórficas foram obtidas através da clivagem do produto de PCR por quatro enzimas de restrição (TaqI, BsuRI, RsaI e HhaI). Com a validação dos polimorfismos encontrados nos amplicons, essas marcas estão sendo utilizadas para trabalhos de mapeamento na população de arabustas com objetivo de identificar QTLs relacionados à concentração de compostos como cafeína, ácidos clorogênicos, diterpenos, açúcares, bem como de proteases

Construção de um mapa genético a partir de uma população F2 derivada do cruzamento entre Coffea arabica e C. canephora e Sua utilidade para qualidade de bebida.

Mapas genéticos com base em marcadores moleculares têm sido desenvolvidos em grande número de plantas como uma estratégia eficaz para seleção assistida pelo marcador. No presente estudo, marcadores AFLP e SSR foram utilizados para construção de um mapa genético em uma população F2 criada a partir da autofecundação do híbrido F1 do cruzamento entre Coffea arabica e Coffea canephora. Foram identificados 349 marcadores AFLP e 50 alelos SSR segregantes em 90 plantas F2. Para construção do mapa, apenas marcas em dose única e segregação 3:1 no F2 foram consideradas (248 marcadores AFLP e SSR 27 alelos, ou 68,9% dos marcadores polimórficos). Cento e sessenta e nove marcadores foram mapeados (155 AFLP e 14 SSR). Trinta e sete grupos ligação correspondentes a um total de 1011 cM foram obtidos, com uma distância média entre as marcas de 5,98 cm e 4,6 marcadores por grupo de ligação. Quarenta e seis marcadores associados a características agronômicas de interesse foram encontrados, dos quais, dezenove foram associados com teor de açúcar, oito de cafeína, oito para CGA, um para a cafeína e CGA e dez para a produção total por planta. A análise baseada em marcadores de dose única permitiu obter informação de QTL putativo associado à qualidade de bebida do café e produtividade. Marcadores adicionais serão incluídos a este trabalho para maior cobertura do genoma café

Genome analysis to identify SNPs associated with oil content and fatty acid components in soybean

The nutritional value, flavor and stability of soybean oil are determined by its five dominant fatty acids: saturated palmitic and stearic, monounsaturated oleic, and polyunsaturated linoleic and linolenic acids. Identifying molecular markers or quantitative trait loci associated with these components has the potential to facilitate the development of improved varieties and thus improve soybean oil content and quality. In this study, we used the BARCSoySNP6K BeadChip array to conduct a genome analysis of diverse soybean accessions evaluated for 2 years under Brazilian field conditions. The results demonstrated high broad-sense heritability, suggesting that the soybean genotype panel could be useful for oil trait breeding programs. Moreover, the range of oil trait variation among the plant introductions (PIs) was superior to that among the Brazilian cultivars in this study, indicating that a PI population could be used to find genes controlling these traits. The genome analysis showed that the genetic structure of the soybean germplasm comprised two main genetic groups, and it revealed linkage disequilibrium decay of approximately 300 kb. A total of 19 single-nucleotide polymorphism (SNP) loci on ten different chromosomes significantly associated with palmitic acid, oleic acid and total oil contents were discovered. Analysis of the SNP annotations revealed enzymes associated with several oil-related physiological metabolisms. Loci and specific alleles in our soybean panel that contributed to lower palmitic acid contents and higher oleic acid and total oil contents were identified. Overall, this genome analysis confirmed previous findings and identified SNP markers that may be useful to rapidly improve oil traits in soybean2153CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal e Nível SuperiorCNPQ - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFAPESP – Fundação de Amparo à Pesquisa Do Estado De São PauloNão temNão tem2016/01823-

ISOLATION AND CHARACTERISTICS OF EIGHT NOVEL POLYMORPHIC MICROSATELLITE LOCI IN LIPPIA ALBA (VERBENACEAE)

Premise of the study: A set of eight microsatellite (simple sequence repeat [SSR]) markers for Lippia alba, an important medicinal and cosmetic plant, was developed to aid studies of genetic diversity and to define efficient strategies for breeding programs. Methods and Results: Using a (CT)(8)- and (GT)(8)-enriched library, a total of 11 SSR loci were developed and optimized in L. alba. Of the 11 loci, eight were found to be polymorphic after screening 61 accessions from two populations. The parameters used to characterize loci were expected heterozygosity (H-e) and number of alleles. A total of 44 alleles were identified, with an average of 5.5 alleles per loci, which were moderately to highly informative according to H-e. Conclusions: These new SSR markers have potential for informing genetic diversity, allele mining, and mapping studies and will be used to generate information for breeding programs of L. albaFundacao de Amparo a Pesquisa do Estado da Sao Paulo (FAPESP)Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado da Sao Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico (CNPq)Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico (CNPq)Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES)Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES