First report of Zucchini lethal chlorosis virus in Argentina infecting squash crops

Virus species of the genus Orthotospovirus are among the most economically important plant pathogens in the world because they cause severe crop losses, mainly in ornamental and horticultural crops (Pappu et al. 2009). They are exclusively transmitted by thrips. Several species of Orthotospovirus have been reported infecting cucurbits: watermelon silver mottle virus, zucchini lethal chlorosis virus (ZLCV), watermelon bud necrosis virus, melon yellow spot virus, melon severe mosaic virus, and groundnut ringspot virus (Ciuffo et al. 2017; Spadotti et al. 2014). The symptoms caused by ZLCV infection can include chlorosis and systemic necrosis on leaves, apical upward leaf curl, reduction of leaf blade, and fruit malformation (Giampan et al. 2007). The collection of 90 symptomatic leaves of squash from Salta and Jujuy provinces was carried out during early 2016. For an initial assessment of the presence of ZLCV, a plate trapped antibody enzyme-linked immunosorbent assay (Lommel et al. 1982) with antiserum against ZLCV, kindly provided by Jorge A. M. Rezende from the Universidade de São Paulo, Brazil, was performed. Fifty-four of the 90 samples reacted positively to ZLCV-specific antiserum: 18 and 11 positive plants of Cucurbita maxima var. zapallito redondo del tronco and var. zapallo plomo, respectively, 11 positive plants of C. pepo, 11 positive plants of C. ficifolia var. ?cayote?, and three positive plants of C. moschata. Ultrathin sections of leaf samples of naturally infected plants were examined by transmission electron microscopy, and presumable orthotospovirus particles were observed. To confirm the identity of the virus, a one-step reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) assay was carried out on the RNA extracts from squash plants, using ZLCV-specific primers designed to direct amplification of nucleotides (ZLCV-F, ATCATGCTGTCCAGTCTCCT; and ZLCV-R, CCCACATTTTGCACTTGCGA) of the nucleocapsid gene region. The RT-PCR reaction for ZLCV detection consisted of reverse transcription at 46°C for 30 min, followed by denaturation at 94°C for 3 min, and 35 cycles of denaturation at 94°C for 30 s, annealing at 55°C for 45 s, and extension at 72°C for 45 s. Amplicons of the two ZLCV isolates (MK680830 and MK680831) were Sanger sequenced. The consensus sequences were aligned using clustalW and compared with other ZLCV sequences in the public domain using Mega 7 (Kumar et al. 2016). Alignments of the N gene sequences of these ZLCV isolates displayed nucleotide sequence identity above 94% with other ZLCV isolates available at the GenBank database. In addition, the amino acid sequence demonstrated above 97% identity with equivalent regions of S segment of Brazilian ZLCV isolate from Cucumis sativus and squash. The phylogenetic analysis of the identified sequence of ZLCV and other related sequences from GenBank showed a cluster of Argentine isolates close to ZLCV-DF isolate obtained from C. sativus (KU681011). This is the first report of ZLCV outside of Brazil. Although we have not observed the presence of Frankliniella zucchini in the field, which was identified and described as the vector of ZLCV (Riley et al. 2011), as well as virus distribution being limited to Brazil (Nakahara and Monteiro 1999), it would be important to consider the presumable entry of F. zucchini into Argentina.Fil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Cordoba. Estacion Experimental Agropecuaria Marcos Juarez. Agencia de Extension Rural Bell Ville.; ArgentinaFil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Giovani Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentin

Occurrence and characterization of a severe isolate of Watermelon mosaic virus from Argentina

More than 50 viruses have been reported in cucurbit crops worldwide. In Argentina, cucurbit viruses have been associated with important yield losses. The most prevalent and widespread potyvirus is Watermelon mosaic virus (WMV). WMV was detected in Argentina in all cucurbit species with high incidence. In this study, a WMV isolate (WMV 1 SDE FF) was obtained from a naturally infected squash associated with a severe outbreak on melon and squash crops in an important cucurbit growing area in Santiago del Estero province (Argentina), during a survey conducted in November 2012. The fully sequenced WMV 1 SDE FF genome consists of 10,027 nucleotides and shares 96 % nt identity and 98 % aa identity with the French isolates JF273464.1|C07–014 and EU660581.1|FMF00-LL1 of the WMV molecular group 3. Using the recombination detection program RDP4, two statistically significant recombination events were identified: event 1, an 830-nt long recombinant fragment in the putative P1 coding region, and event 2, a 4071-nt recombinant fragment detected across the HC Pro, P3 and CI coding regions. The putative parental sequences detected for event 1 were the EU660586.1| FBR04–37 (major parent) and JF273468.1|C07–284 (minor parent), both from France. Putative parental sequences for event 2 were JX079685.1| WMV-ShanXi (major parent) and HQ384216.1|Dendrobium (minor parent), from China and USA, respectively. To our knowledge, this is the first complete genome of an Argentine WMV isolate. Our results provide evidence that WMV 1 SDE FF is the causal agent of the strong outbreak reported in melon and squash fields in recent years.Inst. Patología VegetalFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Luciani, Cecilia E. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Citrullus lanatus: A new natural host of groundnut ringspot orthotospovirus in Argentina

Los orthotospovirus causan graves daños económicos, siendo una limitación importante para la producción y la calidad en distintos cultivos. Los objetivos de este trabajo fueron identificar el agente causal de los síntomas observados en sandía en lotes de producción de Santiago de Estero y analizar su filogenia. Se realizaron muestreos en lotes de producción de sandía (Citrullus lanatus) durante la campaña 2017/2018 en la provincia de Santiago del Estero. Los resultados de este trabajo mostraron en las muestras de sandía la presencia de viriones característicos del género Orthotospovirus, además fueron positivas a pruebas serológicas y moleculares con reactivos específicos (DAS-ELISA y RTPCR) confirmando la presencia del Groundnut ringspot orthotospovirus (GRSV). Los fragmentos genómicos fueron amplificados, secuenciados y depositados en GenBank, acceso Nº MK680832 y MK680833. El análisis filogenético de las secuencias parciales de nucleótidos de la proteína N mostró que los aislamientos de GRSV provenientes de Argentina (hospedante sandía) fueron agrupados con alto valor de confianza. Estas secuencias se ubicaron en un clúster formado por secuencias del continente americano que se separaron de las de origen africano. Este trabajo constituye el primer reporte de la presencia del GRSV en cultivo de sandía (Citrullus lanatus) en Argentina.Orthotospoviruses cause serious economic damage, being a major limitation for production and quality in different crops. The objectives of this work were to detect the presence of orthotospovirus that are infecting cucurbit crops in the country and analyze its phylogeny. Samples were taken in watermelon (Citrullus lanatus) production lots during 2017/2018 in Santiago del Estero province. The results of this work showed in the watermelon samples showed the presence of characteristic virions of the Orthotospovirus genus, and were positive to serological and molecular tests with specific reagents (DAS-ELISA and RT-PCR) confirming the presence of groundnut ringspot orthotospovirus (GRSV). Genomic fragments were amplified, sequenced and deposited in GenBank, access nº MK680832 and MK680833. Phylogenetic analysis of N-protein nucleotide partial sequences showed that GRSV isolates from Argentina (watermelon host) were grouped into a new group with high bootstrap value. These sequences were placed in a cluster formed by sequences from the American continent that were separated from those that conformed the group of sequences of African origin. This work is the first report of the presence of the GRSV in watermelon (Citrullus lanatus) cultivation in Argentina.Fil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaFil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaFil: Giovani Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentin

Primera secuencia genómica completa de un aislamiento de cowpea mild mottle virus en chía

PosterCowpea mild mottle virus (CPMMV) es un miembro del género Carlavirus conocido por infectar plantas de la familia Fabaceae Solanaceae y, más recientemente, chía Salvia hispanica de la familia Lamiaceae causando pérdidas de rendimiento El objetivo del estudio fue la obtención del genoma completo de un aislamiento de CPMMV de chía para estudios filogenéticos.Instituto de Patología VegetalFil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Brugo Carivali, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Brugo Carivali, Maria Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentin

Variables meteorológicas que influencian la dinámica poblacional de áfidos vectores de Watermelon mosaic virus

La dinámica poblacional de los vectores está determinada por factores climáticos entre otros. El objetivo de este trabajo fue determinar las variables metereológicas que más influenciaban a la población de áfidos vectores de Watermelon mosaic virus (WMV). En el campo se colocaron trampas de agua y pegajosas para el monitoreo de pulgones. El mismo se realizó mensualmente desde la campaña 2013/2014 hasta la campaña 2016/2017. Se obtuvieron registros de las variables meteorológicas y de incidencia de WMV. En el cultivo de melón se detectó mayor porcentaje de infección viral (92%) que en zapallo (86%). En ambos cultivos, se observaron las mayores incidencias al alcanzar la cuarta semana. Con respecto a la variación de la población de vectores en función de variables meteorológicas, se observó que las que más influyeron fueron las precipitaciones acumuladas (PPacum) y las temperaturas medias mínimas (Tmmin), ambas variables con un p-valor <0,05. Se determinó que la población de áfidos disminuye a medida que las PPacum y las variables de temperatura aumentan. En años con mayores precipitaciones, la cantidad de pulgones disminuye a una tasa de 0,58. Se detectó que el mayor número de pulgones se encuentra en las estaciones de primavera y otoño. Se continúan con estudios que permitirán la implementación de sistemas de alarma, con la finalidad de regular las poblaciones de las especies de áfidos que afectan a los cultivos.Fil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; ArgentinaFil: Sosa, M. C.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Mendoza - San Juan. Estación Experimental Agropecuaria San Juan; ArgentinaFil: Brugo Carivali, Maria Florencia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Conci,Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina5to Congreso Argentino de Fitopatología y 59º Reunión APS División CaribeCorrientesArgentinaAsociación Argentina de Fitopatólogo

Comportamiento sanitario de variedades de trigo en la subregión PBN IIN-VN. Campaña 2021-22.

La caracterización sanitaria de variedades de trigo es una información de alta relevancia para la decisión de siembra. Permite conocer y actualizar el comportamiento de los distintos genotipos frente a enfermedades foliares y de la espiga más frecuentes en la región triguera argentina. Las principales enfermedades foliares que afectan al cultivo de trigo son las royas – roya de la hoja o anaranjada (Puccinia triticina Erikss), roya de la gluma o amarilla (Puccinia striiformis f.sp tritici) y roya del tallo o negra (Puccinia graminis) – y las manchas foliares – mancha amarilla (Drechslera tritici repentis), mancha foliar o septoriosis (Zymoseptoria tritici ex Septoria tritici), mancha por alternaria (Alternaria spp) y mancha marrón (Bipolaris sorokiniana) – como enfermedades fúngicas más comunes. A nivel de espigas la enfermedad más importante es fusariosis de la espiga o golpe blanco (Fusarium graminearum Schawe y Fusarium spp.). Las enfermedades bacterianas también son importantes según los años, destacándose Tizón bacteriano (Pseudomonas syringae pv. syringae) y Espiga negra o rayado bacteriano (Xanthomonas campestris pv. Undulosa). La obtención de registros sanitarios es uno de los objetivos que se persigue con la conducción de ensayos en la Red Oficial de Ensayos Comparativos de Variedades de Trigo con participación público- privada y coordinada por el Instituto Nacional de Semillas (INASE) (www.argentina.gob.ar/inase). La campaña 2021-2022 se caracterizó por condiciones ambientales desfavorables para el normal crecimiento de los cultivos y también para el desarrollo epidémico de enfermedades. La presencia de royas fue muy baja (sólo se observaron roya de la hoja y roya amarilla en ensayos con suministro de riego) y en ensayos en secano se observó baja incidencia de roya del tallo en algunas variedades. Se incluye en este informe un cuadro resumen con la actualización del comportamiento sanitario de las variedades, ordenadas por ciclo de crecimiento y grupos de calidad panadera. Se consideró tanto la información de Marcos Juárez como lo relevado en otras subregiones trigueras.EEA Marcos JuárezFil: Alberione, Enrique Javier. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Salines, Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Gómez, Dionisio Tomás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Donaire, Guillermo Manuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Campos, Pablo Eduardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bordenave; Argentin

First report of Xanthomonas prunicola causing bacterial leaf streaks on wheat in Argentina

Since 2018, bacterial-like symptoms, such as leaf streaks were observed on wheat plants (Triticum aestivum L.) in Córdoba province in Argentina, with 1 to 5% of disease incidence. Samples of wheat stem and spike collected in a trial of varieties for summer/autumn sowing in the experimental field of the INTA Marcos Juárez were disinfected, washed and macerated in mortars with sterile distilled water and extracts were streaked on Luria-Bertani (LB) agar. After 48 h incubation at 28 °C, circular, mucoid, convex, and cream colonies were observed and pure cultures were transferred to LB medium for further identification tests. Biochemical tests corroborated the detection of a Gram-negative bacillus. Conventional PCR was performed using DNA isolate from pure cultures and general primers for various species of genera Xanthomonas (Maes 1993) and Pseudomonas (Mulet et al. 2010). An isolate (Arg-1), with cream colored colonies was positive using general primers for Xanthomonas sp (amplified fragment of 444 bp). A bacterial suspension containing 108 CFU mL−1 grown for 48 h on LB medium at 28 °C was injected into three-week-old leaves of wheat plants to fulfill Koch’s postulates. After 5 days, plants showed symptoms of chlorosis, streaks and then necrosis on the leaves. The bacteria were re-isolated from the inoculated plants, showing same symptoms observed in the original plants. Negative control plants, inoculated with sterile water remained without symptoms. The amplified 444 bp fragment described above was sequenced by the Sanger method (GenBank accession OM972662), as well as another 757 bp fragment amplified with universal primers that amplify the partial 16S rDNA gene (GenBank accession OM972661). Analyses of these sequences, as well as the protein profile of the isolate obtained by matrix assisted laser desorption/ionization time of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) Bruker Biotyper, allowed to identify only the genus Xanthomonas. With the purpose of determine the species status, the complete genome of isolate Arg-1 was sequenced using Oxford Nanopore Technologies (ONT). Total gDNA was isolate from pure cultures using a commercial kit (Wizard Genomic DNA Purification Kit, Promega). gDNA library was constructed using Ligation Sequencing Kit (SQK-LSK109) and sequenced using ONT platform on a MinION 1kb device. Raw basecalled sequences were filtered using Filtlong and assembled using Trycycler. The genome was assembled in a single contig comprising 5.410.641 bp with 4740 predicted CDSs and 63.9% GC content. Genome sequence was deposited in GenBank under accession number CP094827 and SRA data SRX14635308. Whole-genome Average Nucleotide Identity (ANI) analysis showed values of ~ 97% against the reference genomes of Xanthomonas prunicola (PHKX01.1, PHKV01.1 and PHKW01.1) and 100% in complete 16S rRNA gene sequences (1547 bp). These findings suggest that a new wheat pathogen within the genus Xanthomonas is present in Argentina, as well as was reported in Uruguay and USA (Clavijo et al. 2021). To our knowledge, this is the first report of X. prunicola affecting wheat in Argentina and the first complete genome registered for this specie. Accurate and specific diagnostics are required for the detection of X. prunicola in wheat crops to implement correct prevention and control strategies to this disease, avoiding the dissemination in lots where it has not yet been found.Instituto de Patología VegetalFil: Martino, Julia Andrea. Fondo para la Investigación Científica y Tecnológica (FONCYT); ArgentinaFil: Martino, Julia Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Alberione, Enrique Javier. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Bainotti, Carlos Tomas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Marquez, Nathalie. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Marquez, Nathalie. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Tolocka, Patricia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Tolocka, Patricia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Salines, Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Gomez, Dionisio Tomas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Donaire, Guillermo Manuel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); ArgentinaFil: Alemandri, Vanina Maria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Alemandri, Vanina Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFyMA); Argentin

Comportamiento sanitario de variedades de trigo en las subregiones PBN IIN-VN y POS IIN-IIS - Campaña 2021-22 : detección de WSMV (Wheat Streak Mosaic Virus) en algunos ambientes

La caracterización sanitaria de variedades de trigo es una información de alta relevancia para la decisión de siembra. Permite conocer y actualizar el comportamiento de los distintos genotipos frente a enfermedades foliares y de la espiga más frecuentes en la región triguera argentina. Las principales enfermedades foliares que afectan al cultivo de trigo son las royas – roya de la hoja o anaranjada (Puccinia triticina Erikss), roya de la gluma o amarilla (Puccinia striiformis f.sp tritici) y roya del tallo o negra (Puccinia graminis) – y las manchas foliares – mancha amarilla (Drechslera tritici repentis), mancha foliar o septoriosis (Zymoseptoria tritici ex Septoria tritici), mancha por alternaria (Alternaria spp) y mancha marrón (Bipolaris sorokiniana) – como enfermedades fúngicas más comunes. A nivel de espigas la enfermedad más importante es fusariosis de la espiga o golpe blanco (Fusarium graminearum Schawe y Fusarium spp.). La obtención de registros sanitarios es uno de los objetivos que se persigue con la conducción de ensayos en la Red Oficial de Ensayos Comparativos de Variedades de Trigo con participación público- privada y coordinada por el Instituto Nacional de Semillas (INASE) (www.argentina.gob.ar/inase). La campaña pasada se caracterizó por condiciones ambientales que resultaron favorables al buen crecimiento de los cultivos, pero no al desarrollo epidémico de enfermedades. Si bien se hicieron presente tanto roya amarilla como roya de la hoja su inicio fue retrasado y su desarrollo fue lento. Hacia el final del ciclo del cultivo los niveles de infección observados fueron moderados. Se incluye en este informe un cuadro resumen con la actualización del comportamiento sanitario de las variedades, ordenadas por ciclo de crecimiento y grupos de calidad panadera.EEA PergaminoFil: Alberione, E. J. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Salines, N. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Pozzi, E. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Gomez, D. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Fraschina, J. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Bainotti, C. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Donaire, G. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Formica, M. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Salines, J. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Campos, P. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Bordenave; ArgentinaFil: Manlla, A. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Oliveros; ArgentinaFil: Schutt, L.S. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuarias Paraná; ArgentinaFil: Rodriguez, A. V. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Manfredi; ArgentinaFil: Lanzillotta, J. J. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Departamento Trigo; ArgentinaFil: Couretot, L. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Pergamino. Fitopatología; ArgentinaFil: Corries, F. Criadero KLEIN; ArgentinaFil: Gómez Montenegro, Brenda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Alemandri, V. M. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentin

Identificación, caracterización y epidemiología de virus que afectan a cucurbitáceas en Argentina

Tesis (Doctor en Ciencias Agropecuarias) – UNC- Facultad de Ciencias Agropecuarias, 2020Las enfermedades virales, se consideran los principales factores limitantes en la producción de cucurbitáceas, las cuales causan significativas pérdidas en el rendimiento. En Argentina, fueron detectados dentro de los géneros Potyvirus, watermelon mosaic virus (WMV), papaya ringspot virus (PRSV) y zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) y dentro del Cucumovirus, cucumber mosaic virus (CMV). El objetivo de esta tesis fue identificar y caracterizar virus que afectan a cucurbitáceas, conocer su epidemiología y procesos evolutivos. Para ello, en el Capítulo 1 se presenta la descripción del cultivo de cucurbitáceas, su producción, comercialización y los principales patógenos que lo afectan. En el Capítulo 2 se informan las virosis emergentes, tales como un inédito potyvirus denominado cucurbit vein bandig virus (CVBV), y dos tospovirus: zucchini lethal chlorosis virus (ZLCV) el cual no estaba reportado en Argentina y groundnut ringspot virus (GRSV) que fue detectado en el cultivo de sandía. El Capítulo 3 muestra la incidencia relativa, la distribución de los virus WMV, ZYMV, PRSV y CMV y su relación con variables bio-meteorológicas. En esta misma sección se estudia la curva de progreso de la enfermedad de WMV, su relación con los vectores de virus tales como los pulgones y las variables meteorológicas. La variabilidad genética de los potyvirus (WMV y ZYMV) y su relación con los procesos evolutivos, se estudian en el Capítulo 4. Por último, en el Capítulo 5 se presentan las conclusiones generales de cada sección. La importancia de este trabajo de tesis fue haber contribuido a generar conocimientos acerca de la incidencia, prevalencia y distribución geográfica de los virus presentes, así como su relación con variables meteorológicas, detectar virosis emergentes y realizar estudios de evolución genética de los virus más relevantes detectados hasta la actualidad para el cultivo de cucurbitáceas.Viral diseases are considered the main limiting factors in the production of cucurbits, which cause significant yield losses. In Argentina, were detected within the genera Potyvirus, watermelon mosaic virus (WMV), papaya ringspot virus (PRSV) and zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) and within the Cucumovirus, cucumber mosaic virus (CMV). The objective of this thesis was to identify and characterize viruses that affect Cucurbitaceae, to know their epidemiology and evolutionary processes. To this end, Chapter 1 presents a description of the cucurbit crops, its production, commercialization and the main pathogens that affect it. In Chapter 2, emerging viruses are reported, such as an unpublished potyvirus called cucurbit vein bandig virus (CVBV), and two tospoviruses: zucchini lethal chlorosis virus (ZLCV) which was not reported in Argentina and groundnut ringspot virus (GRSV) which was detected in watermelon cultivation. Chapter 3 shows the relative incidence, distribution of WMV, ZYMV, PRSV and CMV viruses and their relationship with bio-meteorological variables. In this same section, the disease progress curve of WMV, its relationship with virus vectors such as aphids and meteorological variables is studied. The genetic variability of potyvirus (WMV and ZYMV) and its relationship with evolutionary processes are studied in Chapter 4. Finally, the general conclusions of each section are presented in Chapter 5. The importance of this thesis work was to have contributed to generate knowledge about the incidence, prevalence and geographical distribution of the viruses present, as well as their relationship with meteorological variables, to detect emerging viruses and to carry out genetic evolution studies of the most relevant viruses detected so far for cucurbit crops.Fil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentina.Fil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Argentina.Fil: Perotto, María Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Investigación Patología Vegetal "Ing. Agr. Sergio Fernando Nome"; Argentina.Fil: Perotto, María Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Unidad de Fitopatología Y Modelización Agrícola; Argentina.Fil: Perotto, María Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Centro Científico Tecnológico (CCT Córdoba). Unidad de Fitopatología Y Modelización Agrícola; Argentina.Fil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Unidad de Fitopatología Y Modelización Agrícola; Argentina.Fil: Conci, Vilma Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Centro Científico Tecnológico (CCT Córdoba). Unidad de Fitopatología Y Modelización Agrícola; Argentina

Identification and characterization of a new potyvirus infecting cucurbits

A new potyvirus, tentatively named cucurbit vein banding virus (CVBV), was identified in crops of cucurbits in San Pedro (Buenos Aires, Argentina). The complete genome sequences of two isolates of CVBV were obtained by next-generation sequencing (Illumina). The genomic RNA consisted of 9968 and 9813 nucleotides, respectively, and displayed typical potyvirus organization. The percentage identity for these two genome sequences, using BLASTn, was 77% to sweet potato virus c and 73% to tomato necrotic stunt virus. BLASTx analysis of the complete polyprotein showed that the most closely related virus is plum pox virus, with 48% amino acid sequence identity for both isolates. Sequence comparisons and phylogenetic analyses indicate that CVBV belongs to a previously undescribed species in genus Potyvirus.Fil: Perotto, Maria Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Pozzi, Elizabeth Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Mitidieri, Mariel Silvina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Norte. Estación Experimental Agropecuaria San Pedro; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentin