Alleles of the α1 immunoglobulin gene 3′ enhancer control evolution of IgA nephropathy toward renal failure

Alleles of the α1 immunoglobulin gene 3′ enhancer control evolution of IgA nephropathy toward renal failure.BackgroundIgA nephropathy is the most common glomerular disease. Mechanisms leading to its occurrence and controlling the evolution of the disease remain largely unknown. Various genetic factors have been found, mostly implicating immunologically relevant genes (IgH, TCR, human lymphocyte antigen, and complement loci). A regulatory region recently identified downstream, the α1 gene of the IgH locus, was a likely candidate for the control of IgA1 production in patients. Alleles of this region, differing by size, sequence, and orientation of the α1 hs1,2 transcriptional enhancer, were first identified through Southern blot hybridization.MethodsWe established a polymerase chain reaction (PCR) method suitable for routine testing that amplifies minisatellites within the α1 hs1,2 enhancer, with variable numbers of tandem repeats (VNTR) defining the two alleles. This assay allowed the typing of 104 patients with IgAN and 83 healthy volunteers. Results from typing of α1 hs1,2 alleles were compared with long-term clinical outcome in patients. Enhancer alleles were compared in a luciferase reporter gene assay.ResultsThe α1 hs1,2 alleles do not constitute a predictive factor for IgA nephropathy, since similar allelic frequencies were observed in healthy individuals and in unrelated European patients. In contrast, among patients, homozygosity for the weakest enhancer allele (AA genotype) was significantly correlated with a milder form of the disease, whereas the allele B was associated with severe evolution. The minisatellite region within the α1 hs1,2 enhancer carried potential transcription factor-binding sites, and its duplication increased the transcriptional strength of the α1 hs1,2 allele B over that of allele A.ConclusionAltogether, these alleles may constitute a risk factor for the prognosis of IgA nephropathy

Technical and economic feasibility of centralized facilities for solar hydrogen production via photocatalysis and photoelectrochemistry

Photoelectrochemical water splitting is a promising route for the renewable production of hydrogen fuel. This work presents the results of a technical and economic feasibility analysis conducted for four hypothetical, centralized, large-scale hydrogen production plants based on this technology. The four reactor types considered were a single bed particle suspension system, a dual bed particle suspension system, a fixed panel array, and a tracking concentrator array. The current performance of semiconductor absorbers and electrocatalysts were considered to compute reasonable solar-to-hydrogen conversion efficiencies for each of the four systems. The U.S. Department of Energy H2A model was employed to calculate the levelized cost of hydrogen output at the plant gate at 300 psi for a 10 tonne per day production scale. All capital expenditures and operating costs for the reactors and auxiliaries (compressors, control systems, etc.) were considered. The final cost varied from $1.60–$10.40 per kg H2 with the particle bed systems having lower costs than the panel-based systems. However, safety concerns due to the cogeneration of O_2 and H_2 in a single bed system and long molecular transport lengths in the dual bed system lead to greater uncertainty in their operation. A sensitivity analysis revealed that improvement in the solar-to-hydrogen efficiency of the panel-based systems could substantially drive down their costs. A key finding is that the production costs are consistent with the Department of Energy's targeted threshold cost of $2.00–$4.00 per kg H_2 for dispensed hydrogen, demonstrating that photoelectrochemical water splitting could be a viable route for hydrogen production in the future if material performance targets can be met

Lattara (Lattes, Hérault). La zone 1 : Rapport de fouille programmée 2015

Dans la partie nord-est du site, la fouille de la zone 1 (délimitée par un caisson de palplanches destiné à pouvoir travailler sous le niveau de la nappe phréatique) a débuté en 1983 avec pour objectif d’atteindre les niveaux de fondation de Lat¬tara, dont la chronologie est à ce jour fixée au tout début du Ve s. av. J.-C. Les travaux ont été menés à terme en 2015, et le substrat atteint sur l’ensemble de la zone, permettant de disposer d’une nouvelle fenêtre sur les niveaux de la première moitié du Ve s. av. J.-C., période qui se décompose ici en trois phases distinctes, couvrant respectivement les environs de -500 (phase 1T), le premier quart du Ve s. av. n. ère (phase 1S) et le deuxième quart de ce même siècle (phase 1R). La phase 1S, partiellement entrevue en 2014 où elle apparaissait comme l’état le plus ancien, s’est en fait avérée faire suite à une phase antérieure (1T) qui renouvelle sensiblement la problématique liée aux premiers temps de Lattara. En effet, les résultats inédits obtenus à l’issue de ce programme complètent ceux obtenus jusque là par les travaux menés dans la zone 27, dans la partie méri¬dionale du site et publiés dans le tome 22 de la série Lattara (Lebeaupin 2014). La problématique relative aux origines du comptoir protohistorique de Lattara et du rôle joué par les Étrusques s’avère en effet centrale pour pouvoir comprendre les mécanismes ayant conduit à la création de ce point d’interface avec la Méditer-ranée, ses liens avec l’établissement voisin de La Cougourlude et son évolution dans un contexte d’intégration rapide à la sphère d’influence massaliète. La phase la plus ancienne (v. 500-480 av. J.-C.) témoigne d’une implantation sur ce qui se présentait alors comme une étroite langue de sable limoneux issue d’une progradation du delta du Lez, émergeant d’à peine quelques dizaines de centimètres au-dessus du niveau marin. Sur ce paléosol, une division de l’espace est opérée, via la délimitation de parcelles, matérialisées dans un premier par des structures légères de type palissade ou enclos. Rapidement, des apports de matériaux sont réalisés afin d’aménager des axes de circulation parfaitement orthonormés (N/S-E/O) qui reprennent les tracés antérieurs. Dans l’un de ces lots ainsi constitués, une maison en torchis de plan monoabsidial précédée d’un auvent a été mise au jour. Strictement orientée E-O, son état de conservation exceptionnel, dû notamment à la préservation des bases poteaux en bois imbibés d’eau, a permis de restituer un plan original dans le contexte du Midi de la Gaule. Avec une mise en oeuvre et une division de l’espace très régulières, cet édifice appelle la comparaison avec des modèles connus à la même époque en Étrurie, dans des contextes d’habitat rural. Le mobilier céramique associé à cette phase affiche une consonance étrusque très forte. La céramique non tournée indigène, bien que présente, est néanmoins largement minoritaire face aux productions tournées. Parmi celles-ci, on note à la fois la part importante des céramiques communes étrusques (vases à cuire et mortiers) et celle du bucchero nero. Les amphores, qui représentent de loin la plus grande partie du mobilier, sont presque exclusivement étrusques. Cette division régulière de l’espace, qui témoigne d’un schéma d’organisation préétabli qui renvoie à des mécanismes connus dans le contexte d’une entreprise coloniale, synonyme de fondation ex nihilo, est reprise et modifiée durant la phase suivante (v. 480-470 av. J.-C). Il est possible que le rempart archaïque, daté de manière lâche dans le premier quart du Ve s. av. J.-C. et considéré jusque-là comme ayant été construit dès l’origine, n’ait en fait été édifié que durant cette deuxième phase. À ce moment, un chantier de construction est mis en oeuvre, avec un quartier d’habitation dont le schéma, partiellement restitué à partir des mesures observées dans notre fenêtre d’étude, semble montrer qu’il était alors bien adossé au rempart, côté Est, ou séparé de ce dernier par une venelle. Des maisons à plusieurs pièces sont édifiées sur des soubassements en pierre avec des élévations en terre massive ou en adobe. Le fait singulier est que ce chantier de construction soit resté inachevé, un abandon soudain assorti d’un incendie partiel marquant en effet la fin de cette séquence. Chronologiquement, cette rupture est contemporaine de celle observée dans la zone 27 (incendie du quartier étrusque situé de ce côté), autrement dit aux environs de -475. Le tracé incomplet des murs, la présence d’amas de matériaux de construction, la présence de banquettes en bauge inachevées ou encore l’ab¬sence de niveaux de sols bien définis et associés à des structures domestiques, témoignent de l’état d’inachèvement de ce chantier, de fait initié peu de temps auparavant. Dans la partie orientale de la zone de fouille, un appentis en matériaux légers interprété comme un « campement » au milieu de la zone en construction a été incendié, piégeant ainsi un ensemble mobilier où, à côté d’amphores vinaires, l’on retrouve une batterie de vaisselle étrusque particulièrement abondante (bucchero nero et céramique commune) parmi laquelle plusieurs vases servent de support à des graffites en langue étrusque interprétés comme des marques de propriété. L’ensemble de ces observations ne laisse a priori guère de doute quant à l’identité des bâtisseurs. Plus généralement, la place éventuelle accordée à une composante indigène reste difficile à évaluer. Le seul critère de la présence de céramique non tournée est, en effet, à lui seul insuffisant pour autoriser l’hypothèse d’une population mixte. Le mobilier de cette phase montre cependant des évolutions sensibles au regard de celui de la phase précédente. Les céramiques non tournées sont ainsi bien plus nombreuses, représentant près de la moitié d’un répertoire de vaisselle qui tend par ailleurs à se diversifier, avec notamment une proportion désormais significative de céramiques à pâte claire. Autant l’abondance d’une vaisselle de table et de cuisine importées (bucchero nero et céramique commune) semble donc caractéristique des premiers temps de l’installation, autant rapide¬ment une partie des besoins (notamment en termes de préparation et de cuisson des aliments) se voit assurée par des productions locales, sans que cela ne pré¬juge a priori d’une réelle évolution de la population établie sur place. La relative abondance des pâtes claires, principalement représentées par des vases liés à la boisson, conjuguée à une présence significative de vases attiques, est également caractéristique de cette phase. Si un plan d’urbanisme a été conçu dès le départ, les différents quartiers de Lattara n’ont été que progressivement bâtis. Ce chantier a pu s’étaler sur plu¬sieurs mois ou années, expliquant l’apparent décalage observé entre la zone 1 et la zone 27. Ceci étant, dans cette dernière, les fouilleurs avaient déjà émis l’hypothèse d’une occupation de courte durée, soulignant le fait que « il y a bien eu une vie dans ces bâtiments, mais elle a pu ne durer que quelques années, voire quelques mois ; la prolonger sur un quart de siècle paraît excessif » (Lebeaupin, p. 326). On note à ce propos que le faciès mobilier défini de ce côté (phase 27 I1-12) s’apparente bien plus à celui de la phase 1S (de fait calée sur l’intervalle 480-470 av. J.-C.) qu’à celui de la phase 1T. Plus encore, dans cette même zone 27, un paléosol anthropisé (phase 27I3) a été entrevu sous les bâtiments étrusques bâtis à cet endroit. La rareté du mobilier recueilli, conjuguée à l’absence de structures, n’avait toutefois pas alors permis d’individualiser une phase d’occupation réellement antérieure. Il apparaît désormais que, non seulement ce premier état est bel et bien dé¬fini, mais également qu’il semble recouvrir une plage de temps significative, de l’ordre de plusieurs années. La maison absidiale mise au jour dans la zone 1 a ainsi livré une succession de sols associée à plusieurs réfections du foyer central qui, a minima, témoignent d’une certaine durée d’occupation. Les données fournies par la zone 1 nous donnent ainsi l’image d’un site pleinement investi durant les premières années du Ve s. av. J.-C., période durant laquelle est donc opérée une division de l’espace habitable et l’installation d’édifices conçus comme étant à la fois temporaires et non soumis à la contrainte d’un bâti mitoyen. Ce n’est que dans un second temps qu’un vaste programme de construction de tradition méditerranéenne est initié, avec des îlots implantés selon une trame orthonormée. En l’état, laissant de côté la question indigène, l’hypothèse envisagée un temps d’un site mixte caractéristique d’un emporion, où différents quartiers auraient pu abriter des populations différentes, et notamment des marchands méditerranéens autres que des Étrusques (en l’occurrence des Grecs), tend à s’estomper devant celle d’une installation fondamentalement tyrrhénienne (Gailledrat 2015). Plusieurs questions demeurent néanmoins en suspens. Il s’agit en premier lieu des variations de faciès céramique observées entre les deux zones, car en dépit du faciès très «étrusque» de l’ensemble lié à l’un des ensembles fouillés, le mobilier de cette zone pris dans sa globalité accuse un certain nombre d’originalités, liées notamment à une représentation significative de la vaisselle grecque (céramiques à pâte claire et attique). Par ailleurs, les différences architecturales observées entre les zones 1 et 27 s’expliquent peut-être par un simple décalage chronologique ou des fonctionnalités différentes, mais elles invitent également à envisager l’existence de modèles urbanistiques et culturels distincts. Aucun argument ne permet toutefois d’exclure le bâti de la zone 1 des référents tyrrhéniens en la matière. L’autre question non résolue concerne l’éventualité d’une installation encore plus ancienne, déjà envisagée depuis longtemps au vu des mobiliers - encore une fois étrusques - plus anciens (VIe s. av. J.-C.) trouvés de manière erratique en différents points du site (Py 2009, p. 49). L’endroit consistait-il alors en un simple débarcadère précédant géographiquement l’important site indigène sis à La Cougourlude, ou bien abritait-il déjà un habitat permanent ? À l’image de la zone 27, la zone 1 n’a pas livré de niveaux archéologiques antérieurs à -500, mais dans un cas comme dans l’autre, force est de reconnaître que l’on se trouve en périphérie du site, pour ainsi dire au contact de la lagune. L’hypothèse d’une occupation antérieure, dans ce cas plutôt localisée vers le centre de ce qui se présentait alors comme une presqu’île, demeure d’autant plus à vérifier que plusieurs indices, révélés en particulier par le schéma d’implantation mis en place durant la phase 1T, semblent aller dans ce sens

Relationships between Regional Radiation Doses and Cognitive Decline in Children Treated with Cranio-Spinal Irradiation for Posterior Fossa Tumors

Pediatric posterior fossa tumor (PFT) survivors who have been treated with cranial radiation therapy often suffer from cognitive impairments that might relate to IQ decline. Radiotherapy (RT) distinctly affects brain regions involved in different cognitive functions. However, the relative contribution of regional irradiation to the different cognitive impairments still remains unclear. We investigated the relationships between the changes in different cognitive scores and radiation dose distribution in 30 children treated for a PFT. Our exploratory analysis was based on a principal component analysis (PCA) and an ordinary least square regression approach. The use of a PCA was an innovative way to cluster correlated irradiated regions due to similar radiation therapy protocols across patients. Our results suggest an association between working memory decline and a high dose (equivalent uniform dose, EUD) delivered to the orbitofrontal regions, whereas the decline of processing speed seemed more related to EUD in the temporal lobes and posterior fossa. To identify regional effects of RT on cognitive functions may help to propose a rehabilitation program adapted to the risk of cognitive impairment

The Science Performance of JWST as Characterized in Commissioning

This paper characterizes the actual science performance of the James Webb Space Telescope (JWST), as determined from the six month commissioning period. We summarize the performance of the spacecraft, telescope, science instruments, and ground system, with an emphasis on differences from pre-launch expectations. Commissioning has made clear that JWST is fully capable of achieving the discoveries for which it was built. Moreover, almost across the board, the science performance of JWST is better than expected; in most cases, JWST will go deeper faster than expected. The telescope and instrument suite have demonstrated the sensitivity, stability, image quality, and spectral range that are necessary to transform our understanding of the cosmos through observations spanning from near-earth asteroids to the most distant galaxies.Comment: 5th version as accepted to PASP; 31 pages, 18 figures; https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1538-3873/acb29

Immunoglobulin heavy chain genes nuclear Matrix Attachment Regions (MARsEµ) are regulators of Somatic Hypermutation

International audienc

Immunoglobulin gene remodeling relies on intricate enhancer/transcription crosstalk

International audienc

Régulation de l'expression des chaînes lourdes d'immunoglobulines (structure de la région 3' flanquante du locus)

LIMOGES-BU Sciences (870852109) / SudocSudocFranceF