Swine influenza: clinical, serological, pathological, and virological cross-sectional studies in nine farms in Argentina

Background: Influenza A viruses (IAV) are important pathogens responsible for economic losses in the swine industry and represent a threat to public health. In Argentina, clinical, pathological, and virological findings suggest that IAV infection is widespread among pig farms. In addition, several subtypes of IAV, such as pH1N1, H3N2, δ1H1N1, and δ2H1N2, have been reported. Objectives: To evaluate the infection patterns of influenza virus in nine pig farms in Argentina. Methods: Clinical, serological, pathological, and virological cross-sectional studies were conducted. Results: Clinical and pathological results were characteristic of endemic influenza infection in eight of the nine farms studied. By rRT-PCR, six of the nine farms were positive to influenza. Five IAV were obtained. Genome analysis determined that four of the isolations were pH1N1 and that the remaining one was a reassortant human origin H3N2 virus containing pandemic internal genes. Serological results showed that all farms were positive to influenza A antibodies. Moreover, the hemagglutination inhibition test showed that infection with viruses containing HA′s from different subtypes (pH1, δ1H1, δ2H1, and H3) is present among the farms studied and that coinfections with two or more subtypes were present in 80.5% of positive pigs. Conclusions: Because vaccines against IAV are not licensed in Argentina, these results reflect the situation of IAV infection in non-vaccinated herds. This study provides more information about the circulation and characteristics of IAV in a poorly surveyed region. This study provides more data that will be used to evaluate the tools necessary to control this disease.Facultad de Ciencias Veterinaria

Isolation and characterization of an H9N2 influenza virus isolated in Argentina

As part of our ongoing efforts on animal influenza surveillance in Argentina, an H9N2 virus was isolated from a wild aquatic bird (Netta peposaca), A/rosy-billed pochard/Argentina/CIP051-559/2007 (H9N2) - herein referred to as 559/H9N2. Due to the important role that H9N2 viruses play in the ecology of influenza in nature, the 559/H9N2 isolate was characterized molecularly and biologically. Phylogenetic analysis of the HA gene revealed that the 559/H9N2 virus maintained an independent evolutionary pathway and shared a sister-group relationship with North American viruses, suggesting a common ancestor. The rest of the genome segments clustered with viruses from South America. Experimental inoculation of the 559/H9N2 in chickens and quail revealed efficient replication and transmission only in quail. Our results add to the notion of the unique evolutionary trend of avian influenza viruses in South America. Our study increases our understanding of H9N2 viruses in nature and emphasizes the importance of expanding animal influenza surveillance efforts to better define the ecology of influenza viruses at a global scale.Fil: Xu, Kemin. University of Maryland; Estados UnidosFil: Ferreri, Lucas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Rimondi, Agustina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Olivera, Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Romano, Marcelo. Wildlife Conservation Society; ArgentinaFil: Ferreyra, Hebe. Wildlife Conservation Society; ArgentinaFil: Rago, María Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Uhart, Marcela María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Chen, Hongjun. University of Maryland; Estados UnidosFil: Sutton, Troy. University of Maryland; Estados UnidosFil: Pereda, Ariel Julián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Perez, Daniel R.. University of Maryland; Estados Unido

Évaluation de la pneumonie porcine à l’abattage en utilisant la réaction d’amplification en chaine par la polymérase et l’histopathologie en Argentine

Se realizó la reacción en cadena de polimerasa e histopatología en 81 pulmones recolectados en el matadero de 13 granjas porcinas libres del síndrome reproductivo y respiratorio porcino, y de la infección por el virus de la pseudorabia. La Pasteurella multocida y el Mycoplasma hyopneumoniae fueron los patógenos más comúnmente detectados. La bronconeumonía supurativa y catarral estuvieron presentes en 59 (72.8%) casos.Histopathology and polymerase chain reaction were conducted on 81 lungs collected at slaughter from 13 swine farms free of porcine reproductive and respiratory syndrome virus and pseudorabies virus infection. Pasteurella multocida and Mycoplasma hyopneumoniae were the most common pathogens detected. Suppurative and catarrhal bronchopneumonia was present in 59 (72.8%) cases.L’histopathologie et la réaction d’amplification en chaine par la polymérase ont été réalisées sur 81 poumons récoltés à l’abattoir provenant de 13 fermes porcines exemptes du virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin et d’infection par le virus de la pseudorage. Pasteurella multocida et Mycoplasma hyopneumoniae étaient les agents pathogènes les plus communément détectés. Une bronchopneumonie suppurative et catarrhale était présente dans 59 (72.8%) cas.Fil: Cappuccio, Javier Alejandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Dibárbora, Marina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bessone, Fernando Anibal. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Olivera, Valeria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Lozada, María Inés. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Patología. Cátedra de Patología Especial Veterinaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Alustiza, Fabrisio Eduardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Quiroga, María Alejandra. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Patología. Cátedra de Patología Especial Veterinaria; ArgentinaFil: Pérez, Estefanía Marisol. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Patología. Cátedra de Patología Especial Veterinaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Zielinski, Gustavo Carlos. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; ArgentinaFil: Perfumo, Carlos Juan. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Patología. Cátedra de Patología Especial Veterinaria; ArgentinaFil: Pereda, Ariel Julián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Patobiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pérez, Daniel R.. University of Georgia; Estados Unido

Phylogenetic analysis of bluetongue virus serotype 4 field isolates from Argentina.

Bluetongue (BT) is an insect-transmitted viral disease of ruminant species, which represents a major barrier to the international trade of animals and their products. Bluetongue virus (BTV) has a genome composed of ten linear segments of double-stranded RNA (dsRNA), which code for at least ten different viral proteins. In South America, serological evidence for the presence of BTV has been found in Peru, Argentina, Brazil, Ecuador and Chile. Brazil and Argentina are the only South American countries where BTV has been isolated. In Brazil, only one BTV isolate, serotype 12, has been reported, whereas in Argentina five BTV serotype 4 isolates have been obtained from cattle without clinical signs. Three of these five isolates were isolated during 1999-2001, whereas two of them were obtained as part of the present work. This study describes sequence comparisons and phylogenetic analyses of segments 2, 3, 6, 7 and 10 of the first Argentinean field isolates of BTV. The analysis of segments 2 and 6 resulted in a single cluster of Argentinean sequences into the serotype 4 clade. In addition, the Argentinean sequences grouped within the nucleotype A clade, along with reference strains. The analysis of segments 3, 7 and 10 showed that the Argentinean isolates grouped into the western topotype, indicating that the circulating virus had an African/European origin. Phylogenetic analysis revealed that the Argentinean sequences present a South American genetic identity, suggesting an independent lineage evolution.Fil: Legisa, Danilo Mario. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: González, Fernanda Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: De Stefano, G.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Pereda, Ariel Julián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Dus Santos, María José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Development and validation of a TaqMan-MGB real-time RT-PCR assay for simultaneous detection and characterization of infectious bursal disease virus

Rapid and reliable detection and classification of infectious bursal disease viruses (IBDVs) is of crucial importance for disease surveillance and control. This study presents the development and validation of a real-time RT-PCR assay to detect and discriminate very virulent (vv) from non-vv (classic and variant) IBDV strains. The assay uses two fluorogenic, minor groove-binding (MGB) TaqMan probes targeted to a single nucleotide polymorphism (SNP) embedded in a highly conserved genomic region. The analyti- cal sensitivity of the assay was determined using serial dilutions of in vitro-transcribed RNA. The assay demonstrated a wide dynamic range between 102 and 108 standard RNA copies per reaction. Good repro- ducibility was also detected, with intra- and inter-assay coefficients of variation ranging from 0.13% to 2.23% and 0.26% to 1.92%, respectively. The assay detected successfully all the assessed vv, classical, and variant field and vaccine strains and correctly discriminated all vvIBDV strains from non-vvIBDV strains. Other common avian RNA viruses tested negative, indicating high specificity of the assay. The high sensi- tivity, rapidity, reproducibility, and specificity of the real-time RT-PCR assay make this method suitable for general and genotype-specific detection and quantitation.Fil: Tomás, Gonzalo. Universidad del Uruguay. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Hernández, Martín. Universidad del Uruguay. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Marandino, Ana. Universidad del Uruguay. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Panzera, Yanina. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Maya, Leticia. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Hernández, Diego. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Pereda, Ariel Julián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Banda, Alejandro. Mississippi State University; Estados UnidosFil: Villegas, Pedro. Georgia State University; Estados UnidosFil: Aguirre, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein". Fundación Pablo Cassará. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein"; ArgentinaFil: Pérez, Ruben. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; Urugua

Phylodynamic analysis of avian infectious bronchitis virus in South America

Infectious bronchitis virus (IBV) is a coronavirus of chickens that causes great economic losses to the global poultry industry. The present study focuses on South American IBVs and their genetic relationships with global strains. We obtained full-length sequences of the S1 coding region and N gene of IBV field isolates from Uruguay and Argentina, and performed Phylodynamic analysis to characterize the strains and estimate the time of the most recent common ancestor. We identified two major South American genotypes, which were here denoted South America I (SAI) and Asia/ South America II (A/SAII). The SAI genotype is an exclusive South American lineage that emerged in the 1960s. The A/SAII genotype may have emerged in Asia in approximately 1995 before being introduced into South America. Both SAI and A/SAII genotype strains clearly differ from the Massachusetts strains that are included in the vaccine formulations being used in most South American countries.Fil: Marandino, Ana. Universidad de la República; UruguayFil: Pereda, Ariel Julián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Tomás, Gonzalo. Universidad de la República; UruguayFil: Hernández, Martín. Universidad de la República; UruguayFil: Iraola, Gregorio. Universidad de la República; Uruguay. Instituto Pasteur de Montevideo; UruguayFil: Craig, María Isabel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; ArgentinaFil: Hernández, Diego. Universidad de la República; UruguayFil: Banda, Alejandro. University Of Mississippi; Estados UnidosFil: Villegas, Pedro. University of Georgia; Estados UnidosFil: Panzera, Yanina. Universidad de la República; UruguayFil: Pérez, Ruben. Universidad de la República; Urugua

First isolation of an H1N1 avian influenza virus from wild terrestrial non-migratory birds in Argentina

A type A avian influenza (AI) virus was isolated from dead or severely ill red-winged tinamous (Rhynchotus rufescens) found in a hunting ground in April 2008 in Argentina. The subtype of A/red-winged tinamou/Argentina/MP1/2008 was determined as H1N1 by sequence analysis. The cleavage site of the viral hemagglutinin corresponded to a low pathogenic influenza virus, although the clinical presentation and pathological studies suggest that the virus was pathogenic for red-winged tinamous. Phylogenetic analysis of the viral genome suggested that while the hemagglutinin and neuraminidase genes were related to AIV from North America, the internal genes were most closely related to other South American isolates. These findings support the postulated South American phylogenetic lineage for AIV PB2, PB1, PA, M and NS genes, and suggest that the evolutionary pathways of HA and NA genes involve exchanges between the Northern and Southern hemispheres.Fil: Alvarez, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein". Fundación Pablo Cassará. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein"; ArgentinaFil: Mattiello, Rosana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: Rivailler, Pierre. Centers for Disease Control and Prevention; Estados UnidosFil: Pereda, Ariel Julián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas; ArgentinaFil: Davis, Charles T.. Centers for Disease Control and Prevention; Estados UnidosFil: Boado, Lorena Analía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein". Fundación Pablo Cassará. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein"; ArgentinaFil: D'Ambrosio, Elisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: Aguirre, Sebastian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein". Fundación Pablo Cassará. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein"; ArgentinaFil: Espinosa, Cora. Ministerio de Agricultura, Ganadería, Pesca y Alimento. Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Agroalimentaria; ArgentinaFil: la Torre, Jose Leonardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein". Fundación Pablo Cassará. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein"; ArgentinaFil: Donis, Ruben. Centers for Disease Control and Prevention; Estados UnidosFil: Mattion, Nora Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein". Fundación Pablo Cassará. Instituto de Ciencia y Tecnología "Dr. César Milstein"; Argentin

Análisis del impacto de la miasis por Cochliomyia hominivorax sobre la producción ganadera en Argentina

El término “miasis” se define como la infestación de animales vertebrados con larvas de dípteros, las cuales durante un cierto período se alimentan de los tejidos del hospedador (Zumpt, 1965). De acuerdo a su localización, las miasis se clasifican en cavitarias y cutáneas. Entre los dípteros productores de estas últimas, aquellas especies pertenecientes a la familia Calliphoridae son las de mayor distribución mundial y se incluyen dentro de los géneros Chrysomyia, Cochliomyia, Lucilia, Calliphora y Phornia. Sin embargo, solo un número relativamente pequeño de especies pertenecientes a los tres primeros géneros son considerados como de importancia clínica o económica.Fil: Signorini Porchietto, Marcelo Lisandro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea. - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea; ArgentinaFil: Anziani, Oscar Sergio. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Rossner, Maria Victoria. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Chaco-Formosa. Estación Experimental Agropecuaria Colonia Benítez; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Gamietea, Ignacio J.. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Norte. Estacion Experimental Agropecuaria San Pedro. Agencia de Extension Rural San Pedro.; ArgentinaFil: Micheloud, Juan Francisco. Universidad Católica de Salta; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Salta. Estación Experimental Agropecuaria Salta; ArgentinaFil: Lloberas, Maria Mercedes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Área de Investigación en Producción y Sanidad Animal; ArgentinaFil: Martinez, Norberto Claudio. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estacion Experimental Agropecuaria Reconquista. Agencia de Extension Rural Garabato.; ArgentinaFil: Olmos, Leandro Hipolito. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Salta. Estación Experimental Agropecuaria Salta; ArgentinaFil: Sarmiento, Nestor Fabian. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Corrientes. Estacion Experimental Agropecuaria Mercedes. Agencia de Extension Rural Mercedes.; ArgentinaFil: Abdala, Alejandro Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea. - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea; ArgentinaFil: Callaci, Carlos Rubén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea. - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea; ArgentinaFil: Bresky, Florencia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Chaco-Formosa. Estación Experimental Agropecuaria Colonia Benítez; ArgentinaFil: Zimmer, Patricia Andrea. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Chaco-formosa. Estacion Experimental Agropecuaria El Colorado. Agencia de Extension Rural Formosa.; ArgentinaFil: Da Luz, Miguel Angel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Misiones. Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; ArgentinaFil: Reinladi, Javier A.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucumán-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Quimilí. Agencia de Extensión Rural Quimilí; ArgentinaFil: Pereda, Ariel Julián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Nava, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea. - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Santa Fe. Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Instituto de Investigación de la Cadena Láctea; Argentin