Metodologia para validação de ontologias: o caso ORBIS_MC

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Educação. Programa de Pós-graduação em Ciência da InformaçãoO desenvolvimento científico e tecnológico vem trazendo em seu escopo novas estruturas de conteúdos. Relações de toda ordem montam teias que ligam dados, informações, pessoas e locais em um mesmo ambiente não mais físico. A velocidade determinante deste novo século tem gerado inquietações acerca da nova situação que envolve todas as áreas do conhecimento. Grandes volumes de conteúdos precisam ser recuperados com rapidez e precisão atendendo às expectativas dos usuários. Sistemas de Recuperação de Informação são desenvolvidos na tentativa de solucionar esta questão. A pesquisa se insere no universo das linguagens aplicadas nesses sistemas e sua motivação é fruto da leitura e reflexão de estudos anteriores sobre o tema, envolvendo aspectos da sua estrutura, conceitos, relacionamentos e variações. Abordando a linguagem natural e suas novas formas de representação, são estudadas as ontologias de um Sistema de Recuperação de Informações que utiliza a tecnologia KMAI . Esta tecnologia adota técnicas de inteligência artificial e ontologias como forma de recuperação da informação em documentos não-estruturados disponíveis em mídias escritas: jornais, revistas e sites eletrônicos com código aberto. O sistema-alvo de estudo, desenvolvido para o Observatório Regional Base de Indicadores de Sustentabilidade Metropolitano de Curitiba- ORBIS_MC, busca estruturar informações que vão subsidiar políticas públicas de desenvolvimento para a região metropolitana por meio de monitoramento, recuperação e composição da base do conhecimento sobre Saúde Ambiental, Saúde Humana e Violência Urbana na Região Metropolitana de Curitiba. O sistema conta com um dicionário de termos construído por especialistas nas áreas definidas como objeto de representação. A presente pesquisa propõe uma metodologia de validação das ontologias que integram este dicionário, considerando os critérios lingüísticos que reflitam o uso da língua no contexto comunicativo, visto que se trata de uma linguagem utilizada para recuperar conteúdos cuja função é comunicar. Apoiando-se no estudo de publicações já reconhecidas nas áreas de Ciência da Informação e Lingüística, foram sistematizadas recomendações sobre o estabelecimento das relações semânticas entre os termos, a fim de definir critérios de validação de ontologias sob o ponto de vista lingüístico. Esses critérios foram aplicados em um "corpus" de 28 termos e 163 relações semânticas. O resultado da análise apresenta 82,21% de relações semânticas consideradas consistentes e 17,79% inadequadas. Para este último conjunto, foram tecidas recomendações. A aplicação de uma metodologia de fundamentação lingüística sob a perspectiva do uso foi a obtenção de uma ontologia atualizada, tanto no seu aspecto lexical como semântico, aumentando a eficiência de recuperação da informação

The Acceptability and Feasibility of Implementing a Bio-Behavioral Enhanced Surveillance Tool for Sexually Transmitted Infections in England: Mixed-Methods Study.

BACKGROUND: Sexually transmitted infection (STI) surveillance is vital for tracking the scale and pattern of epidemics; however, it often lacks data on the underlying drivers of STIs. OBJECTIVE: This study aimed to assess the acceptability and feasibility of implementing a bio-behavioral enhanced surveillance tool, comprising a self-administered Web-based survey among sexual health clinic attendees, as well as linking this to their electronic health records (EHR) held in England's national STI surveillance system. METHODS: Staff from 19 purposively selected sexual health clinics across England and men who have sex with men and black Caribbeans, because of high STI burden among these groups, were interviewed to assess the acceptability of the proposed bio-behavioral enhanced surveillance tool. Subsequently, sexual health clinic staff invited all attendees to complete a Web-based survey on drivers of STI risk using a study tablet or participants' own digital device. They recorded the number of attendees invited and participants' clinic numbers, which were used to link survey data to the EHR. Participants' online consent was obtained, separately for survey participation and linkage. In postimplementation phase, sexual health clinic staff were reinterviewed to assess the feasibility of implementing the bio-behavioral enhanced surveillance tool. Acceptability and feasibility of implementing the bio-behavioral enhanced surveillance tool were assessed by analyzing these qualitative and quantitative data. RESULTS: Prior to implementation of the bio-behavioral enhanced surveillance tool, sexual health clinic staff and attendees emphasized the importance of free internet/Wi-Fi access, confidentiality, and anonymity for increasing the acceptability of the bio-behavioral enhanced surveillance tool among attendees. Implementation of the bio-behavioral enhanced surveillance tool across sexual health clinics varied considerably and was influenced by sexual health clinics' culture of prioritization of research and innovation and availability of resources for implementing the surveys. Of the 7367 attendees invited, 85.28% (6283) agreed to participate. Of these, 72.97% (4585/6283) consented to participate in the survey, and 70.62% (4437/6283) were eligible and completed it. Of these, 91.19% (4046/4437) consented to EHR linkage, which did not differ by age or gender but was higher among gay/bisexual men than heterosexual men (95.50%, 722/756 vs 88.31%, 1073/1215; P<.003) and lower among black Caribbeans than white participants (87.25%, 568/651 vs 93.89%, 2181/2323; P<.002). Linkage was achieved for 88.88% (3596/4046) of consenting participants. CONCLUSIONS: Implementing a bio-behavioral enhanced surveillance tool in sexual health clinics was feasible and acceptable to staff and groups at STI risk; however, ensuring participants' confidentiality and anonymity and availability of resources is vital. Bio-behavioral enhanced surveillance tools could enable timely collection of detailed behavioral data for effective commissioning of sexual health services

Elementos epistemológicos na construção da estrutura curricular do núcleo de formação geral dos cursos de ciência da informação da UFSC

A relação entre epistemologia e estrutura curricular se estabelece a partir dos estudos nos quais a obtenção do conhecimento é preservada. Na Ciência da Informação alguns elementos são amplamente discutidos, tais como: a interdisciplinaridade, a relação com a tecnologia da informação e a inserção social. O presente estudo se propõe a analisar a estrutura curricular do Núcleo de Formação Geral, comum aos cursos de Arquivologia, Biblioteconomia e Ciência da Informação que são ofertados pelo Departamento de Ciência da Informação da UFSC, sob a perspectiva da tecnologia da informação. Utiliza a pesquisa qualitativa como forma de abordagem do problema, uma vez que os dados foram coletados diretamente dos documentos existentes e classificados para uma análise interpretativa do pesquisador, do ponto de vista dos procedimentos técnicos se apoia na pesquisa bibliográfica para levantamento dos referenciais teóricos que foram escolhidos de forma intencional pela relevância já consagrada na área e, do ponto de vista dos objetivos, se caracteriza como uma pesquisa exploratória e descritiva. Como resultado foi possível identificar que a relação epistemológica dessas áreas se mantém preservada

Characteristics and sexual health service use of MSM engaging in chemsex: results from a large online survey in England.

BACKGROUND: Chemsex, the use of select psychoactive drugs to enhance sexual experience, typically among men who have sex with men (MSM), is associated with sexual behaviours with higher STI risk. Understanding patterns of chemsex among MSM as well as the characteristics and sexual health service engagement of chemsex participants is important for developing interventions. METHODS: Between 5/2016 to 5/2017, 3933 MSM completed an online survey, recruited in sexual health clinics (SHCs) in England (n=421) and via four social networking/dating apps (n=3512). We described patterns of chemsex in the past year and used multivariable logistic regression to investigate differences in demographics and sexual behaviours by chemsex history. We described history of SHC attendance and STI test in the past year among app-recruited chemsex participants. RESULTS: Chemsex in the past year was reported by 10% of respondents; 19% of SHC-recruited and 9% of app-recruited. Among chemsex participants, 74% had used ≥2 chemsex drugs. In the multivariable model, MSM engaging in chemsex had a raised odds of being HIV-positive (adjusted OR (aOR): 3.6; 95% CI 2.1 to 6.1), aged 30-44 (aOR 1.5 vs <30 years; 95% CI 1.0 to 2.1), being born outside the UK and having engaged in higher risk sexual behaviours in the past 3 months. Chemsex participants also had higher odds of condomless anal sex with partners of different or unknown HIV status, but only among HIV-negative/untested. In the past year, 66% of app-recruited chemsex participants had attended a SHC and 81% had had an STI test. CONCLUSION: One in 10 MSM recruited through community and clinical settings across England had engaged in chemsex in the past year. Those that did appear to be at greater STI risk but engaged more actively with sexual health services. This highlights the need and opportunity for chemsex-related services in SHCs and robust referral pathways to drug treatment services

A percepção discente e o mercado de trabalho: o caso do curso de Arquivologia na Universidade Federal de Santa Catarina

La profesión de archivista se inserta en el mercado de trabajo a lo largo de la historia y su importancia es evidente considerando que todas las sociedades producen documentos y construyen su historia. El curso de Archivología de la UFSC fue implantado en 2010-1 y pretende formar profesionales para actuar en el mercado catarinense con sus singularidades. La investigación pretendió verificar cuál es la percepción de los discentes en cuanto a formación y actuación profesional, considerando las transformaciones que pueden ocurrir durante las etapas de formación. La investigación se clasifica como cualitativa y tuvo como universo ocho alumnos de la primera fase y cinco alumnos de la octava fase en curso en 2017. Como resultados se concluyó que sólo cuestiones puntuales de actuación profesional divergen entre los alumnos, siendo que uniformemente todos tienen conocimiento del mismo, hacer del archivista y del mercado de trabajo posible.A profissão de arquivista se insere no mercado de trabalho ao longo da história e sua importância é evidente considerando que todas as sociedades produzem documentos e constroem a sua história. O curso de Arquivologia da UFSC foi implantado em 2010-1 e pretende formar profissionais para atuarem no mercado catarinense com suas singularidades. A pesquisa pretendeu verificar qual a percepção dos discentes quanto a formação e atuação profissional, considerando as transformações que podem ocorrer durante os estágios de formação. A pesquisa se classifica como qualitativa e teve como universo oito alunos da primeira fase e cinco alunos da oitava fase em curso em 2017. Como resultados concluiu-se que apenas questões pontuais de atuação profissional divergem entre os alunos, sendo que uniformemente todos têm conhecimento do fazer do arquivista e do mercado de trabalho possível.The profession of archivist has entered the labor market throughout history and its importance is evident considering that all societies produce documents and build their history. The UFSC Archivology course was implemented in 2010-1 and intends to train professionals to work in the market of Santa Catarina with its singularities. The research aimed to verify the perception of the students regarding the training and professional performance, considering the transformations that may occur during the training stages. The research is classified as qualitative and had as a universe eight students of the first phase and five students of the eighth phase in course in 2017. As results it was concluded that only occasional questions of professional performance diverge among the students, being that uniformly all have knowledge of the make the archivist and job market possible

A Tale of Two States: What We Learn from California and Texas

Teen birth rates and teen pregnancy prevention strategies vary widely across individual states in the US, which has the highest overall teen birth rate among developed nations. California and Texas, the two most populous states currently accounting for a quarter of all teen births, have taken very different approaches to addressing adolescent reproductive health. This case study examines the racial/ethnic composition and socioeconomic factors of these two states from 1981 to 2008. State programs and policies implemented between 1991 and 2008 as well as changes in access to contraception and public–private partnerships are discussed. Based on the lessons learned from California, a similar multifaceted campaign in Texas may be effective in reducing teen births

Projeto Ontolegis: o desenvolvimento de conteúdos de legislação baseado em ontologias para o exercício da cidadania de minorias étnicas em Santa Catarina

O Projeto Ontolegis demonstra a necessidade de facilitar o acesso a informações para a sociedade, independente da sua formação, classe social ou etnia. O objetivo será garantir o acesso das populações concentradas em minorias étnicas, tais como os indígenas de Santa Catarina, mais especificamente a tribo xokleng, além do fortalecimento da rede de pesquisa conjunta estabelecida em projetos anteriores. O aplicativo a ser utilizado está baseado no sistema de análise de informações na Internet denominado Ontosyn, que possibilita pesquisas contextualizadas. A ferramenta é desenvolvida com a última geração das tecnologias digitais de tratamento textual baseadas em Inteligência Artificial, com destaque para a Engenharia de Ontologias além da utilização do modelo tecnológico da UNL (Universal Networking Language). Esta tecnologia, além de permitir a realização de consultas com grandes volumes de texto agrega grande diferencial na nova era da internet, onde semântica e ontologias trabalham juntas para incrementar o processo de busca de informações relevantes em documentos digitais multilíngues que é a opção da representação e recuperação dos conteúdos através da linguagem UNL (Universal Networking Language). A utilização destes componentes permite ao Ontolegis ativar uma sistemática completamente inovadora na localização de documentos, por considerar o contexto do assunto que está sendo pesquisado.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

Improving our understanding of the disproportionate incidence of STIs in heterosexual-identifying people of black Caribbean heritage: findings from a longitudinal study of sexual health clinic attendees in England.

OBJECTIVE: In England, people of black minority ethnicities are at elevated risk of STI diagnosis, especially those of black Caribbean (BC) heritage. Understanding the factors that predict STI acquisition in this population is key to inform prevention measures. We examined the differences in predictors of incident STI diagnoses across ethnic groups in people attending sexual health clinics (SHCs). METHODS: Responses from an attitudinal and behavioural survey run in 16 English SHCs (May-September 2016) were linked to routinely collected national surveillance data on bacterial STI or trichomoniasis diagnoses. Cox proportional hazards models investigated the relationship between participant characteristics and rate of incident STI in the 18 months after survey completion for all heterosexual participants (N=2940) and separately for heterosexual BC (N=484) and white British/Irish (WBI, N=1052) participants. RESULTS: We observed an overall STI incidence of 5.7 per 100 person-years (95% CI 5.1 to 6.5). STI incidence was higher in participants of BC ethnicity (BC, 12.1 per 100 person-years, 95% CI 9.7 to 15.1; WBI, 3.2 per 100 person-years, 95% CI 2.4 to 4.2), even in adjusted analysis (BC adjusted HR (aHR), 2.60, p<0.001, compared with WBI). In models stratified by ethnicity, having had two or more previous STI episodes in the past year was the strongest predictor of incident STI for both BC (aHR 5.81, p<0.001, compared with no previous episodes) and WBI (aHR 29.9, p<0.001) participants. Aside from younger age (aHR 0.96 for increasing age in years, p=0.04), we found no unique predictors of incident STI for BC participants. CONCLUSIONS: Incident STI diagnoses among SHC attendees in England were considerably higher in study participants of BC ethnicity, but we found no unique clinical, attitudinal or behavioural predictors explaining the disproportionate risk. STI prevention efforts for people of BC ethnicity should be intensified and should include tailored public health messaging to address sexual health inequalities in this underserved population

Choosing and Maintaining Programs for Sex Education in Schools: The CHAMPSS Model

Background: Despite effective solutions to reduce teen birth rates, Texas teen birth rates are among the highest in the nation. School districts can impact youth sexual behavior through implementation of evidence-based programs (EBPs); however, teen pregnancy prevention is a complex and controversial issue for school districts. Subsequently, very few districts in Texas implement EBPs for pregnancy prevention. Additionally, school districts receive little guidance on the process for finding, adopting, and implementing EBPs. Purpose: The purpose of this report is to present the CHoosing And Maintaining Programs for Sex education in Schools (CHAMPSS) Model, a practical and realistic framework to help districts find, adopt, and implement EBPs. Methods: Model development occurred in four phases using the core processes of Intervention Mapping: 1) knowledge acquisition, 2) knowledge engineering, 3) model representation, and 4) knowledge development. Results: The CHAMPSS Model provides seven steps, tailored for school-based settings, which encompass phases of assessment, preparation, implementation, and maintenance: Prioritize, Asses, Select, Approve, Prepare, Implement, and Maintain. Advocacy and eliciting support for adolescent sexual health are also core elements of the model. Conclusion: This systematic framework may help schools increase adoption, implementation, and maintenance for EBPs

Overexpressed Somatic Alleles are Enriched in Functional Elements in Breast Cancer.

Asymmetric allele content in the transcriptome can be indicative of functional and selective features of the underlying genetic variants. Yet, imbalanced alleles, especially from diploid genome regions, are poorly explored in cancer. Here we systematically quantify and integrate the variant allele fraction from corresponding RNA and DNA sequence data from patients with breast cancer acquired through The Cancer Genome Atlas (TCGA). We test for correlation between allele prevalence and functionality in known cancer-implicated genes from the Cancer Gene Census (CGC). We document significant allele-preferential expression of functional variants in CGC genes and across the entire dataset. Notably, we find frequent allele-specific overexpression of variants in tumor-suppressor genes. We also report a list of over-expressed variants from non-CGC genes. Overall, our analysis presents an integrated set of features of somatic allele expression and points to the vast information content of the asymmetric alleles in the cancer transcriptome