Functional and Molecular Diversity of the Diatom Family Leptocylindraceae

The focus of this PhD project is the functional and molecular diversity of Leptocylindraceae diatom species, the study of which can lead to a better understanding of long standing questions regarding the ecology and evolution of phytoplankton. A wide range of tools, spanning from microscopical observations and physiological measurements to molecular techniques and high throughput sequencing, is utilized during this attempt. The genus Leptocylindrus has been chosen as the main target species due its worldwide and at the same time local importance in the Gulf of Naples and also because of the already extended study of the species in Stazione Zoologica Anton Dohrn (SZN) towards the direction mentioned above. Leptocylindraceae are centric diatoms that occupy a basal position in the diatom phylogeny and are abundant in marine plankton worldwide. In the Gulf of Naples (GoN), five out of the six species are found; L. minimus is known to be absent from the Mediterranean environment. The family shows a morphological conservation but the seasonal patterns between the species differ considerably. Indeed, physiological experiments of two Leptocylindrus species that show contrasting seasonality confirmed their opposed preferences regarding temperature as well as a high intraspecific phenological variability. In addition, the analysis of transcriptomes acquired for the three temperatures of one of them (L. aporus) indicated the possibly important role of transposable elements in response to stress and diatom adaptation. Furthermore, the transcriptomes of all Leptocylindrus species were explored in order to detect basic intra- and interspecific similarities and/or differences. HTS sequencing data from the MareChiara station in GoN and from the Tara expedition in the world’s seas were analyzed in order to assess the actual diversity of this important diatom family. A significant level of intraspecific variability was detected while the distribution of species and populations at spatial and temporal scale supported the functional differences among them that account for their distinct seasonality and their adaptation to different environmental conditions

Direitos Indígenas no Ciberespaço: A conectividade nas margens

Uma preocupação cada vez maior pela promoção e protecção dos direitos humanos está agora inquestionavelmente imbricada nas questões mundiais contemporâneas, e uma das consequências tem sido a ampliação do discurso internacional sobre os direitos humanos, que agora inclui os direitos colectivos e indígenas. À medida que o discurso dos direitos humanos se tem tornado cada vez mais globalizado, os povos indígenas têm procurado partir dos direitos humanos como uma linguagem dentro da qual enquadram os seus movimentos, expressam as suas posições e direccionam as suas acções. Este texto procura analisar como as tecnologias de informação e comunicação têm criado um novo espaço que possibilita a expansão dos direitos indígenas recentemente reconhecidos e como, cada vez mais, se assiste à apropriação da tecnologia por comunidades indígenas como instrumento de acção política e de reafirmação da identidade cultural. Pensando a indigenização das tecnologias de informação e comunicação como exemplo do que se pode designar como a construção cultural da tecnologia, este texto procura também reflectir sobre as dinâmicas da visibilidade/invisibilidade dos povos indígenas na sociedade da informação

Embedded platform for electrical neural stimulation

Tese de mestrado integrado em Engenharia Biomédica e Biofísica, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2015Atualmente, o número de tecnologias baseadas em neuro-estimulação está em crescimento, crescimento este que é promovido pelo facto de a neuro-estimulação ser uma área de investigação de elevado interesse devido às várias áreas de possível aplicação, tais como a terapia e tratamento, reabilitação e próteses. Na área da terapia e tratamentos, a possível aplicação da neuro-estimulação está relacionada com a neuro-regulação de órgãos do corpo humano, aplicação que tem sido vista já no campo dos distúrbios do sistema nervoso, tais como a doença de Parkinson e a epilepsia, no tratamento de dor crónica, no controlo do funcionamento cardíaco {no qual se insere uma das tecnologias mais conhecidas, o pacemaker { e está ainda a ser investigada para o controlo da libertação de insulina e a absorção renal de sais. Na área da reabilitação, a aplicação da neuro-estimulação tem sido vista em casos de lesões na medula espinal onde a utilização da técnica de estimulação eléctrica funcional, ou FES de Funcional Electrical Stimulation, resultou na recuperação de algumas funções motoras e de controlo de certos órgãos. Relativamente à área das próteses, a neuro-estimulação tem um papel muito importante principalmente no desenvolvimento de próteses funcionais, permitindo que estas próteses não só reajam a informação vinda do sistema de nervoso, realizando os movimentos desejados pelo utilizador, como também forneçam informação ao mesmo, permitindo assim que haja um mecanismo de feedback da prótese, aumentando assim a restituição que esta pode dar ao seu utilizador, tanto a nível funcional como emocional. Uma das mais conhecidas próteses que recorrem à neuro-estimulação é o implante coclear que permite uma recuperação parcial da capacidade auditiva recorrendo para isso a um conjunto de microfones no ouvido externo que deteta o som e o transmite à unidade de processamento que por sua vez transforma o som em impulsos eléctricos que são direccionados para eléctrodos no interior da cóclea e que irão estimular os nervos auditivos. A neuro-estimulação é então um procedimento baseado na estimulação de células excitáveis, como os neurónios, recorrendo para isso à utilização de eléctrodos, com o objectivo de iniciar ou inibir um potencial de acção. Esta possibilidade de iniciar um estímulo nervoso através de estímulos externos deve-se ao facto da activação e propagação de um sinal neural ser um fenómeno eletroquímico. Este fator torna possível o desenvolvimento de tecnologias que resultem numa maior, ou menor, recetividade da célula a um estímulo através da promoção de alterações do meio em que estão inseridas as células excitáveis ou de propriedades da membrana das mesmas. O desenvolvimento de tecnologias que recorram à neuro-estimulação está dependente de um estudo profundo dos tipos e estratégias de estimulação de forma a obter a estratégia que seja mais eficaz, segura e eficiente, sendo que esta varia de situação para situação, dependendo de fatores como o local de aplicação e mesmo o resultado que se espera do estímulo. Por estes motivos têm de ser realizados estudos comparativos válidos entre estratégias de estimulação e, para um estudo deste tipo ser valido, os vários estudos devem ser feitos nas mesmas condições com distâncias temporais preferencialmente curtas. Assim sendo, no âmbito da neuro-estimulação recorrendo a estímulos eléctricos, criou-se a necessidade de desenvolver sistemas que permitissem uma mais rápida variação dos parâmetros de estimulação comparativamente à montagem experimental clássica. De forma a cumprir estes requisitos, vários sistemas de rápida configuração de parâmetros tem vindo a ser propostos. O projeto relatado nesta Tese de Mestrado, desenvolvido durante um estágio de seis meses no Centre for Bio-Inspired Technologies, Imperial College London, apresenta-se então como uma plataforma de neuro-estimulação eléctrica para a realização de estudos comparativos tendo em vista a optimização da estratégia de estimulação, com o objectivo de ser uma versão melhorada dos sistemas já disponíveis. Esta plataforma é composta por três principais componentes: uma interface utilizador-sistema, que permite ao utilizador configurar a estimulação como pretende controlando características como o tipo de onda, a amplitude, a duração, a frequência, entre outros; um microcontrolador e uma placa de estimulação, em que o primeiro controla o segundo de acordo com o que foi configurado pelo utilizador sendo que a placa têm a responsabilidade de gerar e aplicar um estímulo eléctrico. O principal objetivo deste projeto era então desenvolver uma plataforma de neuro-estimulação eléctrica capaz de gerar e aplicar uma estimulação eléctrica bipolar com capacidade de equilíbrio de cargas, podendo fazê-lo através de quatro canais de estimulação. Ao mesmo tempo era objetivo que esta fosse pequena, de baixo custo, eficaz, eficiente, de fácil utilização proporcionando um maior leque de possibilidades de configuração comparativamente aos sistemas já desenvolvidos e que pudesse também ser facilmente recriado, alterado e, eventualmente, melhorado. Os resultados obtidos de testes realizados demonstraram que esta plataforma opera corretamente nos dois principais aspetos do seu funcionamento, nomeadamente a capacidade de gerar uma estimulação de acordo com todos os parâmetros tal como configurados pelo utilizador e a capacidade de cumprir os propósitos de equilíbrio de cargas após estimulação, em todos os tipos de ondas definidos. Existem no entanto ainda algumas limitações no funcionamento da plataforma. Estas limitações estão relacionadas com a amplitude máxima de estimulação que o sistema é capaz de aplicar, mais especialmente a amplitude máxima do output do DAC utilizado e também a amplitude máxima que o amplificador operacional escolhido consegue por no seu output; com a existência de algumas imprecisões temporais na aplicação do estímulo, resultantes do tempo de execução de algumas funções por parte do microcontrolador; com o consumo energético e ainda o facto de a ligação entre o computador e o microcontrolador ser feita através de um cabo USB, o que limita a mobilidade que se pode ter durante o trabalho experimental. Comparativamente a plataformas de estimulação eléctrica configuráveis existentes, o sistema aqui desenvolvido apresenta diversas vantagens. Para além de vantagens como baixo custo e facilidade de recriação, esta plataforma tem também um maior número de parâmetros da estimulação que o utilizador pode configurar e também permite uma estimulação através de quatro canais, de três formas diferentes: utilizando apenas um canal, utilizando mais do que um canal ao mesmo tempo ou ainda mais do que um canal de forma sequencial. No entanto, alguns dos sistemas já existentes não apresentam as limitações acima referidas e como tal os desafios futuros desta placa passam por ultrapassar essas limitações.Nowadays, neuro stimulation technologies have grown to reach a wide range of applications including therapy and treatment, rehabilitation and prosthetics and its range continues to grow as it still represents an interesting area of research. Neurostimulation is based on stimulation of excitable cells, such as nerve cells, through the use of electrodes, with the purpose of achieving initiation or inhibition of an action potential. This interaction is possible due to the electrophysiological base of activation and propagation of a neural signal. This neural signal characteristic makes it possible to use external technologies to promote changes in the nerve cell membrane voltage potential or the environment surrounding it, which can lead to the initiation of a neural signal in the cell or simply to a higher, or lower, receptivity of the cell to a stimulus. The use of neuro stimulation technologies in referred areas and future possibility of use in other applications depends on research developments. An important point of this research is the stimulation strategy, more specifically, the characteristics that a stimulation pulse should have to optimize results towards the intended objective and minimize safety risks. The present thesis reports a project developed during an internship at the Centre for Bio-Inspired Technologies, Imperial College London which consists in designing and building a full system for the study of stimulation strategies. This full system includes a user interface in a computer, so that the user can choose the stimulus characteristics, such as waveform and amplitude, and define the intended strategy, such as repetition rate and inter-stimulus increasing or decreasing rate; and a microcontroller for control of stimulus application through a front-end stimulation-output circuit, which will be responsible for generation of programmed current-controlled stimulus. The measurement results verify that the main objectives of this project were accomplished, namely, the capacity to generate a stimulation that meets the parameters as configured by the user and the capacity to carry a charge-balanced stimulation in all the preset waveforms. However, some limitations were also found related namely with the maximum stimulation amplitude, the small time inaccuracy during stimulation, the power consumption and the fact that connection between the computer and microcontroller is done via USB, limiting the mobility of an experimental procedure using this system. The system developed here presents some advantages compared to existing systems, such as low cost, easy to build, higher number of parameters that can be configured and can apply stimulation through four channels and do it either with only one, with two or more at the same time or with two or more sequentially. However some of these existing systems do not present some of the limitations mentioned and the challenge on the future of this platform is to overcome these limitations

Técnicas reconstrutivas em cirurgia oncológica de canídeos e felídeos

Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaActualmente, a doença oncológica é uma das principais causas de morte em canídeos e felídeos. A cirurgia é o método mais antigo e, ainda hoje, de maior sucesso no tratamento de neoplasias, podendo também ser usada como método preventivo, diagnóstico ou paliativo. A necessidade de realizar exéreses tumorais com margens suficientemente amplas para evitar a permanência de doença residual, frequentemente origina defeitos de grandes dimensões cujo encerramento constitui um desafio para o cirurgião. Nas últimas décadas foram desenvolvidas várias técnicas reconstrutivas, o que permitiu assegurar a integridade funcional e cosmética dos doentes oncológicos submetidos a cirurgia ablativa, melhorando assim a sua eficácia. O presente trabalho foi elaborado na sequência de um estágio realizado no Centro de Medicina Veterinária Anjos de Assis – Barreiro (Portugal), entre Setembro de 2008 e Março de 2009, durante o qual foram acompanhados vários casos de medicina interna e cirurgia de animais de companhia. Durante este período foram estudados todos os doentes oncológicos submetidos a cirurgia ablativa (n = 37), com o objectivo de caracterizar pormenorizadamente esta amostra populacional com especial relevância para o tema tratado. Neste grupo, 16% dos doentes (n = 6) foram submetidos a técnicas reconstrutivas após a exérese do tumor. Neste trabalho é apresentada uma revisão das técnicas de Cirurgia Plástica e Reconstrutiva com utilidade em Cirurgia Oncológica. Adicionalmente, é proposto um protocolo experimental para o desenvolvimento de uma nova técnica de enxerto cutâneo para reconstrução facial em felídeos, incluindo a avaliação da sua eficácia clínica comparativamente a uma técnica alternativa já existente.ABSTRACT - RECONSTRUCTIVE TECHNIQUES IN SURGICAL ONCOLOGY IN DOGS AND CATS - Cancer is one of the main causes of death in dogs and cats, nowadays. Surgery is the oldest and still the most successful method of treatment in oncology and can also be used as a method of prevention, diagnosis or palliation. The need for wide resection margins as a way of avoiding leaving residual disease often originates extensive defects, whose closure constitutes a challenge for surgeons. Many reconstructive techniques have been developed in the last decades assuring functional and cosmetic integrity for patients submitted to ablative surgery, thus improving its effectiveness. This work was made following an internship that took place in Centro de Medicina Veterinária Anjos de Assis – Barreiro (Portugal) between September 2008 and March 2009, with several cases of small animal surgery and internal medicine being followed. During this period, all oncological patients submitted to ablative surgery (n = 37) were studied in order to obtain detailed information with special relevance to this subject. In this group, 16% of the patients (n = 6) were submitted to reconstructive techniques after tumor resection. This work presents a review of Plastic and Reconstructive Surgery techniques that can be useful in Surgical Oncology. In addition, it is proposed an experimental protocol for the development of a new cutaneous flap technique for facial reconstruction in the cat, including its clinical evaluation in comparison to an already existing alternative technique

Ultrapassando Vedações e Resgatando Memórias

Neste texto pretende-se refletir sobre a importância das representações visuais na redescoberta e recuperação de histórias do violento passado colonial da Austrália, reinvestindo-as de significado e poder de reflexão e ação. Com este objetivo, exploram-se duas importantes referências: a investigação de Roslyn Poignant sobre o encarceramento de um grupo de indígenas australianos no mundo do espectáculo Ocidental, com a sua recuperação de fotografias do arquivo colonial, e o filme Rabbit-Proof Fence (2002), que lida com o processo histórico que se designou na Austrália por “Gerações Roubadas” – exemplos que procuram romper com o silêncio da memória indígena australiana e resgatá-la

Uma proposta no parque do rio seco : Ajuda

Dissertação de Mestrado Integrado em Arquitetura, com a especialização em Arquitetura apresentada na Faculdade de Arquitetura da Universidade de Lisboa para obtenção do grau de Mestre.N/

Reações adversas gastrointestinais: causas, prevenção e tratamento

Dissertação de mestrado, Ciências Farmacêuticas, Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2015Segunda a Organização Mundial de Saúde uma reação adversa a um medicamento (RAM) é qualquer resposta prejudicial e indesejada a um medicamento que ocorre com doses habitualmente usadas para profilaxia, diagnóstico ou tratamento ou para modificação de funções fisiológicas[ As RAM Gastrointestinais representam 20 a 40% do total de RAMs sendo caracterizada por não apresentar uma causa ou lesão identificável mas sim um conjunto de sintomas como náuseas, vómitos, dispepsia, cólica abdominal, diarreia entre outros. Estas reações estão associadas a outros medicamentos como é o caso de Anti-inflamatórios não esteroides, Bifosfonatos, Antibióticos, Costicoesteroides, opiáceos, entre outros. Sendo a profilaxia e/ou tratamento destas reações associada a antiácidos. De entre os antiácidos os mais utilizado de forma destacada são os Inibidores da bomba de Protões

O impacto da publicidade nas vendas no sector dos sumos e refrigerantes

Neste trabalho pretende-se construir um modelo exploratório, explicativo e preditivo de vendas de algumas marcas de sumos e refrigerantes (Coca Cola, Sumol, Lipton Ice Tea, Compal, Nestea, Fanta, Santal e 7 Up) considerando como variáveis independentes, os investimentos em publicidade above the line e, ainda, outras variáveis consideradas relevantes na literatura. Na explicação e previsão das vendas de diversas marcas de sumos e refrigerantes utilizam-se árvores de regressão, nomeadamente o Algoritmo CART – Classification and Regression Trees. Foram construídas árvores de regressão associadas às diversas marcas referidas com base num conjunto idêntico de variáveis explicativas. Em resultado obteve-se uma boa capacidade preditiva (medida mediante validação cruzada) para os modelos propostos: a proporção de variação das vendas explicada pelas árvores de regressão CART encontra-se entre os 65% e os 90% (com excepção de um caso em que o “R2” é de 58%, correspondente à marca Fanta). No entanto, para 4 marcas, das 8 analisadas, a capacidade preditiva situou-se entre os 80% e os 90%. No sentido de interpretar os resultados foi ainda avaliada a importância relativa das variáveis preditivas nos modelos, importando referir que as variáveis com maior poder explicativo sobre a variável dependente VENDAS, são: as vendas de períodos anteriores (de curto prazo, 1, 2 e 3 meses, mas também de longo prazo, 12 e 24 meses), a distribuição ponderada e o preço médio. Os investimentos em comunicação têm uma importância relativa mais reduzida na previsão das vendas das marcas estudadas. Os resultados obtidos mostraram-se consistentes nas diversas marcas.The main objective of this study is to develop an exploratory model in order to predict and explain soft drinks and juices brands sales. Namely, Coca Cola, Sumol, Lipton Ice Tea, Compal, Nestea, Fanta, Santal and 7 Up sales. Explanatory variables include advertising investments in above the line means and also include additional predictors which were found relevant in the literature. The Algorithm CART – Classification and Regression Trees was found an appropriate methodology to deal with this prediction task. Several Regression Trees were selected: one for each of the referred brands. Models were all based in a similar group of independent variables. Most of the obtained models exhibit a good predictive ability: the proportion of explained sales variance ranges from 65% to 90% (measures were obtained by means of 10-fold cross validation). Fanta regression tree reveal the lowest value of 58% for this measure of fit. Regression Trees of four brands from the eight studied yield upper values from 80% to 90% for proportion of explained sales variance. In order to interpret the results, the relative importance of predictors in the models was evaluated. The independent variables which have a larger explanatory power are: the sales in previous periods (sales corresponding to short term periods of 1, 2 and 3 months before but also long term sales: 12 and 24 months before), the weighted distribution and the average brands’ price. The advertising investments have less importance to explain or predict sales. The obtained results were consistent through all the brands

Diagnóstico e tratamento da drepanocitose: novas metodologias

A hemoglobina é a molécula constituinte dos glóbulos vermelhos, responsável pelo transporte de oxigénio para todo o corpo. Mutações nos genes desta molécula podem resultar em alterações na sua síntese a nível quantitativo ou estrutural, afetando a sua normal função e desencadeando as hemoglobinopatias. Dentro das hemoglobinopatias existem as doenças falciformes que se particularizam pela presença obrigatória da variante hemoglobina S (Hb S). A drepanocitose, tipo de doença falciforme mais grave e incapacitante, é uma doença genética hereditária com transmissão autossómica recessiva. Caracteriza-se pela sua cronicidade, marcada por anemia e hemólise, aumentando a suscetibilidade a infeções e ao surgimento de crises vaso-oclusivas. Atualmente, é notório um crescente interesse na procura de novas terapêuticas para o tratamento deste tipo de doenças. As principais apostas a nível terapêutico recaem sobre a hidroxiureia, transfusões sanguíneas, transplante alogénico de células estaminais hematopoiéticas e a terapia genética. Porém, tendo em conta a gravidade da doença e a insuficiência relativamente às opções terapêuticas curativas, o rastreio e diagnóstico atempados constituem ferramentas valiosas para a prevenção e atuação precoce com o intuito de reduzir complicações clínicas resultantes da drepanocitose. Com a presente dissertação de mestrado pretende-se reunir, através de uma revisão bibliográfica, a mais recente evidência científica sobre a drepanocitose e as novas metodologias de diagnóstico e tratamento. A terapia genética surge como uma abordagem terapêutica promissora que já demonstrou colmatar as limitações terapêuticas anteriormente instituídas. Não obstante, terá de ser demonstrada a sua eficácia e segurança a longo prazo para se tornar no tratamento de eleição para a drepanocitose.Hemoglobin is the constituent molecule of red blood cells, responsible for transporting oxygen throughout the body. Mutations in the genes of this molecule can result in alterations in its synthesis at a quantitative or structural level, affecting its normal function and triggering hemoglobinopathies. Among the hemoglobinopathies are sickle cell diseases, which are characterized by the obligatory presence of variant hemoglobin S (Hb S). Sickle cell disease, the most serious and disabling type of sickle cell disease, is an inherited genetic disease with autosomal recessive transmission. It is characterized by its chronicity, marked by anemia and hemolysis, increasing susceptibility to infections and the onset of vaso-occlusive crises. Currently, there is a growing interest in the search for new therapies for the treatment of this type of disease. The main therapeutic options are hydroxyurea, blood transfusions, allogeneic hematopoietic stem cell transplantation and gene therapy. However, considering the severity of the disease and the insufficiency of curative therapeutic options, timely screening and diagnosis are valuable tools for prevention and early action to reduce clinical complications resulting from sickle cell disease. This master's thesis aims to gather, through a literature review, the most recent scientific evidence on sickle-cell disease and new diagnostic and treatment methodologies. Gene therapy emerges as a promising therapeutic approach that has been shown to overcome previously established therapeutic limitations. Nevertheless, its long-term efficacy and safety will have to be demonstrated to become the treatment of choice for sickle cell disease