Diversity within Borrelia burgdorferi sensu lato genospecies in Switzerland by recA gene sequence

A total of 874 Ixodes ricinus ticks were collected in Switzerland to investigate the genetic diversity of the Borrelia population. We integrated to the RT-PCR method the DNA sequence analysis of a 162-bp fragment of the recA gene. Five genospecies were detected: Borrelia afzelii, Borrelia burgdorferi s.s., Borrelia garinii, Borrelia valaisiana, and Borrelia lusitaniae. A heterogeneous distribution was observed within the B. burgdorferi s.l. genospecies. The most prevalent and diverse genospecies found in Switzerland was Borrelia afzelii, which might suggest a rapid evolution of this genospecie

Global Genetic Structure and Molecular Epidemiology of Encapsulated Haemophilus influenzae

A collection of 2,209 isolates of six polysaccharide capsule types of Haemophilus influenzoe, including 1,975 serotype b isolates recovered in 30 countries was characterized for electrophoretically demonstrable allele profiles at 17 metabolic enzyme loci. Two hundred eighty distinct multilocus genotypes were distinguished, and cluster analysis revealed two primary phylogenetic divisions. The population structure of encapsulated H. influenzae is clonal. Currently, most of the invasive disease worldwide is caused by serotype b strains of nine clones, Strains producing serotype c, e, and f capsules belong to single divisions and have no close genetic relationships to strains of other serotypes, Serotype a and b strains occur in both primary phylogenetic divisions, probably as a result of transfer and recombination of serotype-specific sequences of the cap region between clonal lineages. A close genetic relatedness between serotype d isolates and some strains of serotypes a and b was identified, There are strong patterns of geographic variation, on an intercontinental scale, in both the extent of genetic diversity and the clonal composition of populations of encapsulated strains, The analysis suggests that the present distribution of clones is, in part, related to patterns of racial or ethnic differentiation and historical demographic movements of the human host population

Attività dell'Istituto cantonale batteriosierologico (IBS)

L'activité de l'IBS à Lugano se déroule en 4 secteurs principaux: le diagnostic microbiologique, l'expertise, l'enseignement et la recherche. L'IBS traite par année environ 50'000 échantillons cliniques provenant d'hôpitaux, de cliniques et de cabinets médicaux, et sur lesquels sont réalisées des analyses de bactériologie, de mycologie, de parasitologie et de sérologie. Ainsi l'IBS est dans une situation privilégiée pour contribuer à la surveillance épidémiologique des maladies transmissibles chez l'homme. De plus, l'Institut est reconnu par l'OFSP comme laboratoire de confirmation pour le SIDA pour la Suisse italienne. L'activité d'expertise est exercée en faveur des secteurs privé et public. On peut par exemple mentionner la détermination de l'activité antibactérienne de nouvelles molécules mises au point par l'industrie pharmaceutique, ou les analyses bactériologiques de l'eau du Lac de Lugano, effectuées pour la Commission internationale pour la protection des eaux italo-suisses. En plus de l'activité d'enseignement exercée par le directeur et le directeur-adjoint à l'Université de Genève, l'IBS organise ou participe à des cours post-gradués pour les étudiants de l'Université de Genève, aussi en collaboration avec l'EPFL, le Polytechnique de Milan et l'Institut d'hydrobiologie de Pallanza (Italie). Par ailleurs, des étudiants en sciences, en médecine humaine et vétérinaire accomplissent régulièrement leurs travaux de diplôme ou de doctorat à l'Institut. Enfin, l'IBS organise les travaux pratiques pour l'Ecole cantonale de laborants médicaux, ainsi que des cours de formation continue pour les enseignants en sciences du Canton. En outre, la gestion et la coordination du Centre de biologie alpine de Piora est confiée à l'Institut. Concernant la recherche, deux voies principales sont developpées à l'Institut: l'écologie microbienne et la génétique des populations bactériennes. Les recherches réalisées en écologie microbienne (Aeromonas, Legionella, Yersinia) ont abouti notamment à la création, auprès de l'Institut en 1990, du "Laboratoire d'écologie microbienne" de l'Université de Genève. Les recherches réalisées dans le domaine de la génétique des populations (Shigella, Campylobacter. Listeria, Borrelia) en collaboration avec des instituts suisses et étrangers ont aboutis à de nombreuses publications dans des revues internationales

Presence of potentially pathogenic Babesia sp. for human in Ixodes ricinus in Switzerland

We have designed and performed a new PCR method based on the 18S rRNA in order to individuate the presence and the identity of Babesia parasites. Out of 1159 Ixodes ricinus (Acari: Ixodidae) ticks collected in four areas of Switzerland, nine were found to contain Babesia DNA. Sequencing of the short amplicon obtained (411-452 bp) allowed the identification of three human pathogenic species: Babesia microti, B. divergens, for the first time in Switzerland, Babesia sp. EU1. We also report coinfections with B. sp. EU1-Borrelia burgdorferi sensu stricto and Babesia sp. EU1-B. afzelii

Formulation and characterisation of synthetic glycolipids-loaded liposomes to target Helicobacter pylori

Ce travail traite de la formulation et de la caractérisation de liposomes porteurs de glycolipides synthétiques, en vue du ciblage d une bactérie : Helicobacter pylori. Après avoir passé en revue les différents systèmes à temps de résidence gastrique prolongé, il décrit la synthèse et l utilisation de néoglycolipides de type "ancre-espaceur-sucre ", constitué respectivement du cholestérol, du tétra-éthylène glycol et enfin du fucose (ou N-acétylglucosamine). Ont été étudiées dans ce travail l organisation supramoléculaire des néoglycolipides seuls en fonction de leur état d hydratation, les altérations de la bicouche liposomale suite à l incorporation du néoglycolipide, l accessibilité des sucres à la surface des liposomes, la variation du pH intraliposomal en fonction de pH externes acides, et enfin, l interaction de quatre formulations de liposomes contenant ou non les néoglycolipides avec 2 souches d H. pyloriThis thesis is about the formulation and characterisation of synthetic glycolipids-loaded liposomes in order to target a bacterium: Helicobacter pylori. Gastroretentive systems are first reviewed. Secondly, the synthesis and use of the system anchor-spacer-sugar , i.e. cholesterol, tetraethylene glycol and fucose (or N-acetylglucosamine) respectively, are described. During this work, we studied the neoglycolipids supramolecular organization in function of their hydration rate, the alteration of the liposomale bilayer following the neoglycolipid incorporation, the accessibility of the sugar moieties at the liposomes surface, the intraliposomal pH variation in function of acidic external pH, and finally, the interaction between four liposomal formulations bearing or not neoglycolipids with two strains of H. pyloriLYON1-BU.Sciences (692662101) / SudocSudocFranceF